##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.lowPi.2d.R.3.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24187092
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	75-150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.43320887852082	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.72685641581055	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.88779672231784	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.837855373436376	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.710558590507695	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.703424909451705	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.69943493000316	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.845840335001824	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.83109693385216	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.80363001058581	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.807584764633965	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.813688780776125	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.80780642005248	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.7939458203574	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.79272231651494	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.72610582537165	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.63715454507719	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.59721402639061	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
55-59	34.586725555928766	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.55994062452815	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.53934780584619	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.51352088130314	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.48941694456709	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.46703315219071	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.43873085743063	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.41499676753047	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.37856679785641	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.33864095841651	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.28523983617876	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.24859906982149	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.19667822555075	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
120-124	34.15843815899605	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.10907287933209	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.04941837123389	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.00194265878376	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	33.96779833365846	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	33.97547950009595	35.0	34.0	37.0	28.4	39.0
150	34.910707584918036	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	8.0
22	244.0
23	3002.0
24	21005.0
25	84567.0
26	216880.0
27	397235.0
28	586697.0
29	765608.0
30	954403.0
31	1195215.0
32	1518792.0
33	1986833.0
34	2727151.0
35	4231403.0
36	8436289.0
37	1061748.0
38	12.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.27472835510776	11.04211701018047	15.441657889257627	38.24149674545414
2	22.18979026253184	13.201566110984942	36.85532177615564	27.753321850327573
3	21.210294667588094	17.918103814494387	28.277099121287247	32.59450239663027
4	26.079537002437913	25.671410052688454	22.296203403122377	25.952849541751256
5	25.529836590444155	31.156526542269674	24.42343184873908	18.890205018547093
6	19.07717576113789	36.58063091214498	25.966135799135042	18.376057527582084
7	15.993746570220003	24.829550296073762	40.289382990821494	18.887320142884743
8	18.49953545400482	24.479787866700274	31.624373797290584	25.396302882004324
9	19.63724493390351	23.3655891430229	32.563828334021856	24.433337589051735
10-14	20.284438698558912	29.33250667597016	27.068396412387084	23.314658213083845
15-19	20.42175718356269	28.05797222630591	27.88822247717811	23.632048112953292
20-24	20.581412072189973	28.20829463939905	27.608207936761765	23.602085351649215
25-29	20.560266011794145	28.392660297293865	27.491254419964083	23.555819270947907
30-34	20.55909339563751	28.101615530029218	27.513935072318695	23.82535600201458
35-39	20.641577601021936	28.08559784728738	27.54924961199801	23.723574939692668
40-44	20.70082032134617	28.13039402346696	27.46920881177088	23.69957684341599
45-49	20.781901883877417	27.90958202075829	27.439729595448703	23.868786499915593
50-54	20.899640383876637	27.887873521654715	27.51595490028928	23.696531194179368
55-59	20.900765713965164	27.90532905881587	27.44611534052812	23.747789886690846
60-64	20.857838032630667	27.81413147115383	27.43372672575713	23.894303770458375
65-69	20.962082113126137	27.72315029697508	27.519028352588105	23.79573923731068
70-74	21.07150291181547	27.6775977726818	27.485445015754863	23.765454299747866
75-79	21.09536149158186	27.57232253596858	27.472807197472136	23.85950877497742
80-84	21.14409805484051	27.55765805105633	27.457855693560525	23.84038820054264
85-89	21.119947982508844	27.561340414553946	27.5154677268575	23.80324387607971
90-94	21.11354776714994	27.455832090400605	27.466513913889585	23.964106228559864
95-99	21.211895243606627	27.360878973440585	27.57845057018877	23.848775212764014
100-104	21.26691978547462	27.412643362103463	27.445659110459143	23.87477774196278
105-109	21.22824194851378	27.26610495701808	27.524098030587325	23.98155506388082
110-114	21.30620783417817	27.230542004381817	27.603412131415862	23.85983803002415
115-119	21.349975349931206	27.252056605611063	27.562109395598704	23.835858648859023
120-124	21.307330411527083	27.16609339538745	27.561993216900184	23.96458297618529
125-129	21.349810866474726	27.09266890692179	27.6248279736963	23.932692252907188
130-134	21.42106810112516	27.196083169743673	27.52243745123673	23.860411277894432
135-139	21.409745905419324	27.0608196479698	27.606420797985194	23.92301364862568
140-144	21.455355096147095	26.988681112207598	27.74050938379015	23.815454407855157
145-149	21.06265234757245	27.16996142704739	27.823361550514857	23.9440246748653
150	20.97576963947535	25.77826391934206	28.537889103341264	24.708077337841335
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.5
7	0.5
8	0.0
9	0.5
10	1.5
11	6.0
12	13.0
13	21.0
14	42.0
15	81.5
16	167.5
17	355.5
18	668.0
19	1254.0
20	2348.5
21	3990.5
22	6287.0
23	10003.5
24	15875.5
25	24434.0
26	36128.5
27	50916.0
28	68768.5
29	95623.0
30	129611.0
31	163906.0
32	197966.5
33	236806.5
34	277863.5
35	325150.5
36	397214.0
37	494359.0
38	611876.0
39	758220.0
40	925334.5
41	1090196.5
42	1258503.5
43	1430427.5
44	1571460.5
45	1656492.5
46	1679344.5
47	1636987.5
48	1544182.0
49	1413815.0
50	1247859.5
51	1067873.5
52	888646.5
53	712867.0
54	552035.0
55	416731.5
56	313016.0
57	235162.0
58	176088.5
59	130751.0
60	92284.5
61	64965.0
62	47291.5
63	32804.5
64	22602.5
65	17928.0
66	16043.0
67	12145.0
68	7213.5
69	4678.5
70	3805.0
71	2978.0
72	2252.5
73	1360.0
74	686.0
75	223.5
76	59.0
77	41.5
78	18.5
79	2.5
80	0.5
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.5
88	0.5
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.5
94	0.5
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.8604964995378527E-4
3	2.894105665947771E-5
4	4.134436665639673E-5
5	4.9613239987676075E-5
6	6.615098665023476E-5
7	1.8604964995378527E-4
8	1.4883971996302822E-4
9	1.1576422663791084E-4
10-14	1.885303119531691E-4
15-19	3.1173652458923133E-4
20-24	2.2243269261141438E-4
25-29	3.067752005904637E-4
30-34	8.533477277880284E-4
35-39	9.567086444290203E-4
40-44	0.001047666251073093
45-49	9.137105031063676E-4
50-54	5.548414005288441E-4
55-59	4.002134692339203E-4
60-64	2.6708460860032287E-4
65-69	3.291011585849179E-4
70-74	3.5308089124562805E-4
75-79	2.670846328937018E-4
80-84	2.7700749939509007E-4
85-89	3.580431656013559E-4
90-94	3.4316005076552683E-4
95-99	2.844519051695562E-4
100-104	4.2998761048583333E-4
105-109	2.8362801443347407E-4
110-114	2.3401541964810995E-4
115-119	2.3153703620537196E-4
120-124	2.3484784642168084E-4
125-129	1.3892659638794653E-4
130-134	1.7118232264492136E-4
135-139	1.596156732468352E-4
140-144	1.381708360598976E-4
145-149	1.5354107823665393E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
74-75	1.0
76-77	2.0
78-79	5.0
80-81	12.0
82-83	18.0
84-85	19.0
86-87	13.0
88-89	24.0
90-91	27.0
92-93	47.0
94-95	34.0
96-97	44.0
98-99	43.0
100-101	64.0
102-103	51.0
104-105	57.0
106-107	42.0
108-109	64.0
110-111	86.0
112-113	95.0
114-115	95.0
116-117	108.0
118-119	126.0
120-121	136.0
122-123	159.0
124-125	172.0
126-127	224.0
128-129	221.0
130-131	337.0
132-133	453.0
134-135	604.0
136-137	995.0
138-139	2790.0
140-141	5929.0
142-143	10344.0
144-145	77784.0
146-147	778710.0
148-149	1468068.0
150-151	2.1839089E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	51.05048773675599
#Duplication Level	Percentage of total
1	39.70071247397934
2	10.395432276597266
3	6.354876423494289
4	4.4318091857328445
5	3.2541776653595837
6	2.625819946314419
7	2.248070210895885
8	1.845125682701253
9	1.6526394652599319
>10	18.28046458778404
>50	4.343100706525768
>100	4.282046685781758
>500	0.35158302619182813
>1k	0.23414166338160733
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	2.8941056659477707E-5	0.0	0.0	2.3566288994146133E-4	3.307549332511738E-5
2	0.0	1.1162978997227116E-4	0.0	8.268873331279345E-6	0.0022036547427859454	5.374767665331574E-5
3	4.134436665639673E-6	1.1576422663791083E-4	0.0	8.268873331279345E-6	0.003295146022514819	8.268873331279346E-5
4	1.2403309996919019E-5	1.240330999691902E-4	0.0	8.268873331279345E-6	0.004833156462132777	9.09576066440728E-5
5	3.307549332511738E-5	1.2816753663482986E-4	0.0	1.2403309996919019E-5	0.006098294081818517	9.09576066440728E-5
6	3.7209929990757054E-5	1.2816753663482986E-4	0.0	1.2403309996919019E-5	0.007334490644844779	1.0336091664099182E-4
7	4.54788033220364E-5	1.6124302995994724E-4	0.0	1.2403309996919019E-5	0.008525208404549005	1.0749535330663148E-4
8	5.374767665331574E-5	1.6124302995994724E-4	0.0	1.2403309996919019E-5	0.010766073077325708	1.240330999691902E-4
9	6.615098665023476E-5	1.6124302995994724E-4	0.0	1.2403309996919019E-5	0.014172848889812798	1.2816753663482986E-4
10-11	1.0129369830817198E-4	1.6744468495840674E-4	0.0	1.653774666255869E-5	0.018768275243671292	1.6744468495840672E-4
12-13	1.4470528329738855E-4	1.6951190329122658E-4	0.0	2.0672183328198364E-5	0.02283862814099355	1.9225130495224477E-4
14-15	1.5297415662866788E-4	1.777807766225059E-4	0.0	2.0672183328198364E-5	0.0275332809748274	2.0258739661634396E-4
16-17	1.9018408661942494E-4	1.777807766225059E-4	0.0	2.0672183328198364E-5	0.03240158014861812	2.0258739661634396E-4
18-19	2.14990706613263E-4	1.8604964995378527E-4	0.0	2.0672183328198364E-5	0.036352034382636816	2.0258739661634396E-4
20-21	2.8114169326349777E-4	2.3979732660710102E-4	0.0	2.0672183328198364E-5	0.0399448598450777	2.0878905161480346E-4
22-23	3.6589764490911104E-4	2.4599898160556055E-4	0.0	2.0672183328198364E-5	0.04398627168574048	2.2325957994454233E-4
24-25	4.1344366656396726E-4	2.501334182712002E-4	0.0	2.0672183328198364E-5	0.048594101349595895	2.27394016610182E-4
26-27	4.7132577988292265E-4	2.5220063660402005E-4	0.0	2.27394016610182E-5	0.05308409956848058	2.335956716086415E-4
28-29	4.981996182095806E-4	2.563350732696597E-4	0.0	2.4806619993838037E-5	0.05781596233230518	2.501334182712002E-4
30-31	5.312751115346979E-4	2.563350732696597E-4	0.0	2.4806619993838037E-5	0.06244239696115597	2.7287281993221843E-4
32-33	5.870900065208335E-4	2.687383832665787E-4	0.0	3.7209929990757054E-5	0.06672567334675868	3.2248605991989443E-4
34-35	6.201654998459509E-4	2.7080560159939855E-4	0.0	4.7546021654856234E-5	0.07038878423251543	3.493598982465523E-4
36-37	6.387704648413294E-4	2.728728199322184E-4	0.0	5.374767665331574E-5	0.0739712736032922	3.6589764490911104E-4
38-39	6.69778739833627E-4	2.832089115963176E-4	0.0	5.374767665331574E-5	0.07860390988714144	3.679648632419309E-4
40-41	6.966525781602848E-4	2.8734334826195727E-4	0.0	6.408376831741493E-5	0.08182877048634041	3.679648632419309E-4
42-43	7.028542331587443E-4	2.9767943992605643E-4	0.0	6.615098665023476E-5	0.08504742943054089	3.762337365732102E-4
44-45	7.276608531525824E-4	3.1008274992297543E-4	0.0	6.82182049830546E-5	0.08938445349279689	3.8450260990448954E-4
46-47	7.917446214699973E-4	3.1008274992297543E-4	0.0	7.028542331587443E-5	0.09332250441681869	3.9070426490294904E-4
48-49	8.124168047981957E-4	3.204188415870746E-4	0.0	7.028542331587443E-5	0.0971695977341964	4.0724201156550776E-4
50-51	8.310217697935742E-4	3.2662049658553415E-4	0.0	7.028542331587443E-5	0.10127095890651096	4.155108848967871E-4
52-53	8.930383197781693E-4	3.2662049658553415E-4	0.0	7.028542331587443E-5	0.10543020219214447	4.1757810322960693E-4
54-55	9.447187780986651E-4	3.28687714918354E-4	0.0	7.028542331587443E-5	0.10870674324966391	4.217125398952466E-4
56-57	9.757270530909629E-4	3.3902380658245315E-4	0.0	7.235264164869428E-5	0.11313059048189836	4.361830682249855E-4
58-59	9.98466454751981E-4	3.576287715778317E-4	0.0	8.682316997843314E-5	0.11732704369752263	4.4651915988908465E-4
60-61	0.0010501469130724769	3.6589764490911104E-4	0.0	9.09576066440728E-5	0.1206697357416923	4.506535965547243E-4
62-63	0.001085289624730414	3.762337365732102E-4	0.0	9.09576066440728E-5	0.12434524993744597	4.506535965547243E-4
64-65	0.0011142306813898917	3.824353915716697E-4	0.0	9.09576066440728E-5	0.12979237024442625	4.5272081488754415E-4
66-67	0.0011349028647180902	4.031075748998681E-4	0.0	9.09576066440728E-5	0.1339764201500536	4.54788033220364E-4
68-69	0.001176247231374487	4.217125398952466E-4	0.0	9.09576066440728E-5	0.13675476158936345	4.67191343217283E-4
70-71	0.001225860471362163	4.382502865578053E-4	0.0	9.922647997535215E-5	0.13936152390704926	4.7959465321420204E-4
72-73	0.001275473711349839	4.42384723223445E-4	0.0	9.922647997535215E-5	0.14229904115798625	4.919979632111211E-4
74-75	0.0013064819863421366	4.54788033220364E-4	0.0	1.0956257163945133E-4	0.14579057292211894	4.981996182095806E-4
76-77	0.0013436919163328936	4.630569065516433E-4	4.134436665639673E-6	1.13697008305091E-4	0.14829397432316377	5.002668365424004E-4
78-79	0.0013850362829892903	4.630569065516433E-4	4.134436665639673E-6	1.4470528329738855E-4	0.1507663674492163	5.023340548752203E-4
80-81	0.001413977339648768	4.67191343217283E-4	4.134436665639673E-6	1.4470528329738855E-4	0.15348269233854156	5.106029282064996E-4
82-83	0.0014470528329738855	4.692585615501028E-4	4.134436665639673E-6	1.4677250163020838E-4	0.15603984141623972	5.126701465393194E-4
84-85	0.0015256071296210392	4.7959465321420204E-4	4.134436665639673E-6	1.5090693829584805E-4	0.1584564196473061	5.168045832049591E-4
86-87	0.0016144975179322922	4.8786352654548137E-4	4.134436665639673E-6	1.5297415662866788E-4	0.1604678230851398	5.209390198705988E-4
88-89	0.0016641107579199682	4.899307448783013E-4	4.134436665639673E-6	1.5297415662866788E-4	0.16255778081962063	5.209390198705988E-4
90-91	0.001678581286249707	5.044012732080401E-4	4.134436665639673E-6	1.5297415662866788E-4	0.1653981388089151	5.292078932018781E-4
92-93	0.001732328962903023	5.126701465393194E-4	4.134436665639673E-6	1.5297415662866788E-4	0.16828397560153158	5.416112031987971E-4
94-95	0.0018150176962158163	5.126701465393194E-4	4.134436665639673E-6	1.5297415662866788E-4	0.17146542461574132	5.478128581972566E-4
96-97	0.0019039080845270693	5.230062382034186E-4	4.134436665639673E-6	1.5297415662866788E-4	0.17379311245849646	5.519472948628963E-4
98-99	0.0019535213245147455	5.333423298675178E-4	4.134436665639673E-6	1.5504137496148772E-4	0.17590580959463833	5.540145131957161E-4
100-101	0.0020052017828352414	5.395439848659773E-4	4.134436665639673E-6	1.5710859329430755E-4	0.17825003518405602	5.540145131957161E-4
102-103	0.0020382772761603587	5.416112031987971E-4	4.134436665639673E-6	1.5710859329430755E-4	0.18016221214191436	5.581489498613558E-4
104-105	0.002083756079482395	5.416112031987971E-4	4.134436665639673E-6	1.5710859329430755E-4	0.181979297056463	5.643506048598153E-4
106-107	0.0021292348828044314	5.416112031987971E-4	4.134436665639673E-6	1.5710859329430755E-4	0.18362893728605323	5.664178231926351E-4
108-109	0.002205721961118765	5.478128581972566E-4	4.134436665639673E-6	1.5710859329430755E-4	0.18531372022730142	5.705522598582749E-4
110-111	0.0022698057294361805	5.560817315285359E-4	4.134436665639673E-6	1.5710859329430755E-4	0.18690961278023832	5.726194781910947E-4
112-113	0.002327687842755136	5.643506048598154E-4	4.134436665639673E-6	1.5710859329430755E-4	0.18852617751650344	5.746866965239145E-4
114-115	0.002362830554413073	5.705522598582749E-4	4.134436665639673E-6	1.5710859329430755E-4	0.1903163885927254	5.788211331895542E-4
116-117	0.0024083093577351093	5.850227881880137E-4	4.134436665639673E-6	1.6124302995994724E-4	0.19193708776565616	5.829555698551939E-4
118-119	0.0024827292177166233	6.118966265146715E-4	4.134436665639673E-6	1.6951190329122658E-4	0.1934626948952772	5.829555698551939E-4
120-121	0.0025695523876950567	6.118966265146715E-4	4.134436665639673E-6	1.819152132881456E-4	0.1950503185748828	5.829555698551939E-4
122-123	0.002714257670992445	6.160310631803112E-4	4.134436665639673E-6	1.819152132881456E-4	0.19648290087952697	5.829555698551939E-4
124-125	0.0028093497143021574	6.201654998459509E-4	4.134436665639673E-6	1.819152132881456E-4	0.19813874276411567	5.829555698551939E-4
126-127	0.002852761299291374	6.263671548444104E-4	4.134436665639673E-6	1.819152132881456E-4	0.19978218133870745	5.829555698551939E-4
128-129	0.0029127106309431495	6.325688098428699E-4	4.134436665639673E-6	1.8398243162096544E-4	0.20112380603670751	5.891572248536534E-4
130-131	0.0029850632725918437	6.42904901506969E-4	4.134436665639673E-6	1.9225130495224477E-4	0.20237654034639635	5.912244431864732E-4
132-133	0.0030739536609030965	6.44972119839789E-4	4.134436665639673E-6	1.943185232850646E-4	0.20354245148610672	5.912244431864732E-4
134-135	0.0032269278175317646	6.44972119839789E-4	4.134436665639673E-6	1.943185232850646E-4	0.2046256738925043	6.015605348505724E-4
136-137	0.0034026413758214504	6.491065565054286E-4	4.134436665639673E-6	1.943185232850646E-4	0.20564274531225168	6.077621898490319E-4
138-139	0.0034150446858183694	6.656443031679873E-4	4.134436665639673E-6	1.984529599507043E-4	0.20680452201529642	6.077621898490319E-4
>>END_MODULE
