##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.lowPi.2d.S.1.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24135576
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	65-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.50086283418303	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.84521608268226	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.99542550797213	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.965353302527355	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.83355354767585	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.80622086665758	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.80131926414352	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.95690241658206	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.941381966603984	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.916933550705394	35.0	34.0	37.4	31.6	39.0
15-19	34.9170401982534	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
20-24	34.920997543211726	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.917505917405904	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.894235977629044	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.895463866286015	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.82597039324854	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.726060202582275	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.688842006505254	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.678698846880636	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.64780978088113	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.631652300438176	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.60386902241759	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
75-79	34.58227097637041	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.552034057019476	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.53542187610411	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.50789397140767	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.4690619383186	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.43093172349337	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.373158180024305	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.34247771733689	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.287920391246416	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.251468831933025	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
125-129	34.189073948778514	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.14108639273418	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.083838005057444	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.05691366542979	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.05651846781795	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	34.983899471306536	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	12.0
22	285.0
23	3434.0
24	23321.0
25	90973.0
26	222173.0
27	389597.0
28	561656.0
29	725576.0
30	905717.0
31	1131832.0
32	1444805.0
33	1896170.0
34	2614446.0
35	4061944.0
36	8525419.0
37	1538210.0
38	6.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.7917871941403	10.994293237501356	15.401182055899557	37.81273751245879
2	23.166614309571223	12.646020155009596	35.7961401150453	28.39122542037389
3	21.860943460861325	17.110919802827066	27.8194161942932	33.20872054201841
4	26.969268719600624	24.572925993754197	21.859358537653822	26.598446748991357
5	26.98432454541778	30.195440190179074	23.843118173145957	18.977117091257185
6	20.0459537635002	36.077698453618076	25.339693739910118	18.53665404297161
7	16.891661436478444	24.238906103716662	39.58454351353631	19.28488894626858
8	19.333065181189973	24.070648974591506	30.945324971229166	25.650960872989355
9	20.161807729416996	22.982256180600583	32.025858609697	24.830077480285418
10-14	21.099708121744968	28.585181495651824	26.55430938233234	23.76080100027087
15-19	21.345347653631485	27.561945912853542	27.211791611297052	23.880914822217918
20-24	21.33862132504384	27.564062416901592	27.085156198455163	24.012160059599413
25-29	21.22815008685713	27.820574678546905	26.739063050718944	24.21221218387702
30-34	21.285480305650424	27.64478597851182	26.91086867725558	24.158865038582185
35-39	21.499934407505624	27.360847311006463	26.890816244501835	24.24840203698608
40-44	21.66999097588847	27.394324670793946	26.71260732187738	24.223077031440205
45-49	21.931014960670343	27.321554786715534	26.664003905640644	24.08342634697348
50-54	21.9175143638739	27.554055786282593	26.53409285690509	23.99433699293841
55-59	21.817460210261284	27.450458648163572	26.689022399955846	24.043058741619294
60-64	22.070213351146315	27.301313824504515	26.405964066235928	24.222508758113243
65-69	21.909556983817893	27.39264841177337	26.60678270001775	24.09101190439098
70-74	22.2726958968218	27.121617522017168	26.554267852737667	24.051418728423368
75-79	22.088828672195138	27.06044894085848	26.525403049660483	24.3253193372859
80-84	22.364202506023524	26.971145257212747	26.572119156873214	24.09253307989051
85-89	22.195114877307617	26.976388460403516	26.603694440225194	24.224802222063673
90-94	22.225792920388596	26.72141792432473	26.560848376007694	24.491940779278977
95-99	22.455448234344352	26.782705796185667	26.736688499111366	24.02515747035861
100-104	22.43803115184832	26.539270548699406	26.79238080792425	24.230317491528023
105-109	22.500636090017313	26.5163114827076	26.70076681496834	24.282285612306747
110-114	22.402360243672764	26.542326451040566	26.70583357383048	24.349479731456185
115-119	22.55937212798997	26.7630092910269	26.562899467919866	24.114719113063266
120-124	22.467593605336234	26.58108522269033	26.632645441388597	24.318675730584836
125-129	22.85053356092394	26.538355628145467	26.565371045936136	24.045739764994455
130-134	22.514425755326855	26.73782606590277	26.47251875056681	24.275229428203566
135-139	22.674887376602637	26.523672970057255	26.496912468137058	24.304527185203053
140-144	22.621214136887655	26.36465812080792	26.77854533956715	24.235582402737272
145-149	22.117969837619448	26.550787602669363	27.06559752888532	24.26564503082587
150	21.83192152945943	25.236936876691647	27.7380787824892	25.193062811359724
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	1.0
9	1.5
10	1.5
11	6.0
12	10.0
13	10.5
14	16.5
15	50.0
16	111.0
17	245.0
18	565.0
19	1004.0
20	1642.5
21	2665.0
22	4509.0
23	7383.0
24	11849.0
25	18156.0
26	25534.0
27	36522.5
28	56479.5
29	83729.0
30	114301.5
31	143796.5
32	173677.5
33	209039.5
34	244301.0
35	289446.0
36	356561.0
37	426326.5
38	492960.0
39	590054.0
40	727273.5
41	880398.5
42	1035604.0
43	1185148.0
44	1318823.0
45	1423832.5
46	1505414.5
47	1535882.5
48	1491524.5
49	1441399.0
50	1365911.0
51	1228387.0
52	1057199.0
53	905921.0
54	763930.0
55	634065.5
56	547448.0
57	460145.0
58	380768.0
59	309759.5
60	238848.5
61	167049.0
62	96621.0
63	53566.5
64	34534.5
65	22157.5
66	14796.0
67	7125.5
68	3182.0
69	2004.0
70	1544.5
71	1362.0
72	1284.0
73	962.5
74	513.5
75	167.0
76	46.5
77	31.5
78	14.5
79	2.5
80	2.0
81	1.5
82	0.5
83	0.5
84	0.5
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.5744393255831145E-4
3	4.9719136597361504E-5
4	2.0716306915567294E-5
5	3.314609106490767E-5
6	4.9719136597361504E-5
7	2.1544959192189986E-4
8	9.943827319472301E-5
9	7.04354435129288E-5
10-14	1.392135824726122E-4
15-19	1.8644676224010564E-4
20-24	1.5081471434532991E-4
25-29	3.2980360609583133E-4
30-34	7.723039218123487E-4
35-39	7.979921423876522E-4
40-44	9.778096864147762E-4
45-49	9.405203339667551E-4
50-54	5.394526320813723E-4
55-59	3.3974743341530364E-4
60-64	2.8754233998807405E-4
65-69	3.215170939866393E-4
70-74	3.612924345215054E-4
75-79	2.6434021205123216E-4
80-84	3.02458572207932E-4
85-89	3.7620943045339435E-4
90-94	3.646092979348529E-4
95-99	2.9831768217900386E-4
100-104	4.5825175298904646E-4
105-109	3.1655239373854063E-4
110-114	2.4446040904424954E-4
115-119	2.4280588133852833E-4
120-124	2.378370820628593E-4
125-129	1.4005335170833307E-4
130-134	1.682351737449171E-4
135-139	1.6741861799627315E-4
140-144	1.625100425609656E-4
145-149	1.7065119897716064E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
64-65	1.0
66-67	0.0
68-69	1.0
70-71	1.0
72-73	1.0
74-75	3.0
76-77	11.0
78-79	10.0
80-81	10.0
82-83	16.0
84-85	16.0
86-87	24.0
88-89	27.0
90-91	31.0
92-93	27.0
94-95	29.0
96-97	44.0
98-99	48.0
100-101	70.0
102-103	75.0
104-105	60.0
106-107	86.0
108-109	88.0
110-111	104.0
112-113	127.0
114-115	110.0
116-117	106.0
118-119	111.0
120-121	174.0
122-123	159.0
124-125	225.0
126-127	244.0
128-129	256.0
130-131	366.0
132-133	492.0
134-135	647.0
136-137	1111.0
138-139	2437.0
140-141	5921.0
142-143	9303.0
144-145	71473.0
146-147	756277.0
148-149	1422680.0
150-151	2.1862574E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.58526465034157
#Duplication Level	Percentage of total
1	34.5213066670583
2	8.562788959851186
3	4.858925046114308
4	3.4712329519921465
5	2.4954516174927464
6	1.9827967570946365
7	1.6318833277018674
8	1.4659073713703132
9	1.154378089963239
>10	14.643956785442693
>50	4.980492107672523
>100	11.155590918164448
>500	4.171692018993726
>1k	4.59093288287622
>5k	0.27010187199718544
>10k+	0.042562626214562464
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	3.314609106490767E-5	0.0	4.143261383113458E-6	4.640452749087074E-4	3.314609106490767E-5
2	4.143261383113458E-6	1.1186805734406338E-4	0.0	8.286522766226917E-6	0.002510816398166756	4.143261383113459E-5
3	2.4859568298680752E-5	1.1601131872717685E-4	0.0	1.2429784149340376E-5	0.004922194523138789	5.8005659363588426E-5
4	7.04354435129288E-5	1.2844110287651723E-4	0.0	1.6573045532453833E-5	0.007101550010656469	5.8005659363588426E-5
5	8.286522766226918E-5	1.3258436425963067E-4	0.0	2.0716306915567294E-5	0.008298952550376259	6.214892074670188E-5
6	1.0772479596094993E-4	1.3258436425963067E-4	0.0	2.0716306915567294E-5	0.010159276911394201	7.04354435129288E-5
7	1.4501414840897104E-4	1.6573045532453835E-4	0.0	2.0716306915567294E-5	0.012152185636671774	7.04354435129288E-5
8	2.5688220575303445E-4	1.6573045532453835E-4	0.0	2.0716306915567294E-5	0.01598884567743484	7.457870489604226E-5
9	3.231743878828498E-4	1.698737167076518E-4	0.0	2.0716306915567294E-5	0.01923716260179579	7.872196627915571E-5
10-11	3.666786324055411E-4	1.7194534739920853E-4	0.0	2.2787937607124025E-5	0.033330466196456215	1.056531652693932E-4
12-13	4.163977690029026E-4	1.7816023947387873E-4	0.0	2.4859568298680752E-5	0.043527032460298445	1.1186805734406338E-4
14-15	4.74403428366491E-4	1.8644676224010564E-4	0.0	2.4859568298680752E-5	0.05116099155868499	1.263694721849605E-4
16-17	5.179076728891824E-4	1.926616543147758E-4	0.0	2.9002829681794213E-5	0.05584080529091164	1.3672762564274414E-4
18-19	6.090594233176784E-4	2.0094817708100275E-4	0.0	2.9002829681794213E-5	0.059569740535713754	1.3672762564274414E-4
20-21	9.964543626387868E-4	2.2787937607124023E-4	0.0	2.9002829681794213E-5	0.06270411777203908	1.3672762564274414E-4
22-23	0.0013527748415865443	2.3409426814591044E-4	0.0	2.9002829681794213E-5	0.06586749783804621	1.408708870258576E-4
24-25	0.0014397833306319268	2.465240522952508E-4	0.0	2.9002829681794213E-5	0.06891486658532617	1.4501414840897104E-4
26-27	0.0014977889899955154	2.485956829868075E-4	0.0	2.9002829681794213E-5	0.07144847092110004	1.553723018667547E-4
28-29	0.0016407315077129297	2.5066731367836425E-4	0.0	2.9002829681794213E-5	0.07448548151492221	1.7194534739920853E-4
30-31	0.0018851839293166238	2.52738944369921E-4	0.0	3.5217721756464394E-5	0.07773379843928316	1.9059002362321908E-4
32-33	0.0019721924183620063	2.52738944369921E-4	0.0	4.143261383113458E-5	0.08075216435688132	2.175212226134566E-4
34-35	0.0020405562311833787	2.52738944369921E-4	0.0	5.3862397980474965E-5	0.08378917495070348	2.1959285330501333E-4
36-37	0.0020799172143229562	2.52738944369921E-4	0.0	6.214892074670188E-5	0.08648643811111034	2.2166448399657003E-4
38-39	0.0020944186291638536	2.5688220575303445E-4	0.0	8.286522766226918E-5	0.0893846494485982	2.2373611468812677E-4
40-41	0.0021089200440047506	2.5688220575303445E-4	0.0	8.700848904538263E-5	0.09212541685352775	2.2787937607124023E-4
42-43	0.0021213498281540907	2.651687285192614E-4	0.0	8.700848904538263E-5	0.09483303816739241	2.2787937607124023E-4
44-45	0.0021379228736865446	2.7759851266860174E-4	0.0	9.115175042849609E-5	0.09768774526035756	2.320226374543537E-4
46-47	0.0021586391806021118	2.817417740517152E-4	0.0	9.115175042849609E-5	0.10232819800944465	2.3823752952902388E-4
48-49	0.0021710689647514523	2.8381340474327194E-4	0.0	9.322338112005282E-5	0.1052077646707085	2.4238079091213732E-4
50-51	0.0021980001637416898	2.98314819584169E-4	0.0	9.529501181160955E-5	0.10826134831006312	2.52738944369921E-4
52-53	0.002235289516189711	3.024580809672825E-4	2.071630691556729E-6	1.0358153457783648E-4	0.11104561995951537	2.52738944369921E-4
54-55	0.0022518625617221648	3.045297116588392E-4	4.143261383113458E-6	1.0565316526939321E-4	0.11299295280957869	2.548105750614777E-4
56-57	0.0023015816983195264	3.128162344250661E-4	4.143261383113458E-6	1.0772479596094993E-4	0.11510601611496656	2.5688220575303445E-4
58-59	0.002380303664598682	3.231743878828498E-4	4.143261383113458E-6	1.1601131872717685E-4	0.117459388580575	2.610254671361479E-4
60-61	0.002577108580296571	3.397474334153036E-4	4.143261383113458E-6	1.201545801102903E-4	0.11960559797702777	2.610254671361479E-4
62-63	0.002670331961416624	3.52177217564644E-4	4.143261383113458E-6	1.263694721849605E-4	0.12215163209695099	2.6516872851926134E-4
64-65	0.002684833376257521	3.583921096393142E-4	4.143261383113458E-6	1.3672762564274414E-4	0.12502084060475704	2.6516872851926134E-4
66-67	0.002707621313864645	3.7082189378865454E-4	4.143261383113458E-6	1.408708870258576E-4	0.12769738745824835	2.6516872851926134E-4
68-69	0.002726265990088656	3.915382007042219E-4	4.143261383113458E-6	1.429425177174143E-4	0.12963229052416236	2.7345525128548827E-4
70-71	0.0027428390356211097	4.2054103038601605E-4	4.143261383113458E-6	1.4501414840897104E-4	0.13188829634726762	2.7345525128548827E-4
72-73	0.0027573404504620067	4.308991838437997E-4	4.143261383113458E-6	1.4501414840897104E-4	0.13356631720742856	2.7345525128548827E-4
74-75	0.002784271649452244	4.308991838437997E-4	4.143261383113458E-6	1.4501414840897104E-4	0.13527955578934597	2.7345525128548827E-4
76-77	0.0028091312177509252	4.308991838437997E-4	4.143261383113458E-6	1.4501414840897104E-4	0.136723482381361	2.7759851266860174E-4
78-79	0.002831919155358049	4.308991838437997E-4	4.143261383113458E-6	1.5330067117519798E-4	0.1381466926664605	2.7759851266860174E-4
80-81	0.002846420570198946	4.3918570661002665E-4	4.143261383113458E-6	1.5330067117519798E-4	0.13959061925847555	2.7759851266860174E-4
82-83	0.0028754233998807407	4.4332896799314007E-4	4.143261383113458E-6	1.5330067117519798E-4	0.1412541387037956	2.7759851266860174E-4
84-85	0.002916856013711875	4.4332896799314007E-4	4.143261383113458E-6	1.553723018667547E-4	0.14302331131438503	2.7967014336015847E-4
86-87	0.002950002104776783	4.578303828340372E-4	4.143261383113458E-6	1.6365882463298162E-4	0.1446101804241175	2.8381340474327194E-4
88-89	0.002974861673075463	4.5990201352559394E-4	4.143261383113458E-6	1.6780208601609506E-4	0.14616804670416816	2.879566661263854E-4
90-91	0.002993506349299474	4.5990201352559394E-4	4.143261383113458E-6	1.698737167076518E-4	0.14813609586114707	2.900282968179421E-4
92-93	0.003024580809672825	4.6197364421715067E-4	4.143261383113458E-6	1.698737167076518E-4	0.14988662379551249	2.900282968179421E-4
94-95	0.003086729730419527	4.6818853629182087E-4	8.286522766226917E-6	1.7401697809076526E-4	0.1516371517298779	2.9417155820105555E-4
96-97	0.003165451696698683	4.7647505905804775E-4	8.286522766226917E-6	1.7401697809076526E-4	0.15314944213471432	2.98314819584169E-4
98-99	0.0032669616005849625	4.909764738989449E-4	8.286522766226917E-6	1.8023187016543546E-4	0.15433234325959322	3.0038645027572576E-4
100-101	0.003374686396545912	4.97191365973615E-4	8.286522766226917E-6	1.8644676224010564E-4	0.15568718973187134	3.024580809672825E-4
102-103	0.003416119010377047	5.013346273567285E-4	8.286522766226917E-6	1.905900236232191E-4	0.1568369447656853	3.024580809672825E-4
104-105	0.003436835317292614	5.013346273567285E-4	8.286522766226917E-6	1.926616543147758E-4	0.15783547075901566	3.024580809672825E-4
106-107	0.0034637665162828516	5.05477888739842E-4	8.286522766226917E-6	1.9473328500633255E-4	0.1587822059850571	3.024580809672825E-4
108-109	0.003480339561815305	5.137644115060689E-4	8.286522766226917E-6	2.0301980777255948E-4	0.1598635972060497	3.024580809672825E-4
110-111	0.003523843806337997	5.179076728891824E-4	8.286522766226917E-6	2.1130633053878642E-4	0.16093877353496766	3.024580809672825E-4
112-113	0.0036439983864482873	5.261941956554093E-4	8.286522766226917E-6	2.1544959192189986E-4	0.1622045398875088	3.024580809672825E-4
114-115	0.0036792161082047515	5.344807184216361E-4	8.286522766226917E-6	2.2166448399657003E-4	0.16351795374595576	3.024580809672825E-4
116-117	0.0037475799210261234	5.427672411878631E-4	8.286522766226917E-6	2.2787937607124023E-4	0.16446676060268875	3.024580809672825E-4
118-119	0.003803513949698155	5.551970253372035E-4	8.286522766226917E-6	2.320226374543537E-4	0.16530577103276922	3.024580809672825E-4
120-121	0.003938169944649342	5.676268094865439E-4	8.286522766226917E-6	2.403091602205806E-4	0.16614892472423282	3.024580809672825E-4
122-123	0.004149476275188128	5.676268094865439E-4	8.286522766226917E-6	2.485956829868075E-4	0.167012794722612	3.045297116588392E-4
124-125	0.004253057809765965	5.676268094865439E-4	1.0358153457783645E-5	2.485956829868075E-4	0.1678932377665236	3.0660134235039596E-4
126-127	0.004290347162213987	5.676268094865439E-4	1.2429784149340376E-5	2.485956829868075E-4	0.168784038963893	3.0660134235039596E-4
128-129	0.004342137929502905	5.676268094865439E-4	1.2429784149340376E-5	2.485956829868075E-4	0.169569186995993	3.0660134235039596E-4
130-131	0.004429146418548287	5.738417015612141E-4	1.2429784149340376E-5	2.548105750614777E-4	0.1703667648122423	3.107446037335094E-4
132-133	0.004501653492752773	5.821282243274409E-4	1.2429784149340376E-5	2.610254671361479E-4	0.17106283272460537	3.107446037335094E-4
134-135	0.004580375459031928	5.841998550189976E-4	1.2429784149340376E-5	2.610254671361479E-4	0.17185626727947162	3.107446037335094E-4
136-137	0.004657025794619528	5.904147470936678E-4	1.2429784149340376E-5	2.6516872851926134E-4	0.17260619758981513	3.107446037335094E-4
138-139	0.0046611690560026415	5.945580084767814E-4	1.2429784149340376E-5	2.6516872851926134E-4	0.17324218821212306	3.128162344250661E-4
>>END_MODULE
