##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.lowPi.2d.S.3.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24083958
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	72-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.50736158068371	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.84488774644101	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.9875618866301	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.95856009215761	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.81931163474044	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.79310742860455	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.77097738669034	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.94038853580462	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.92207779967064	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.905410223684996	35.2	34.0	37.4	31.6	39.0
15-19	34.898266165386936	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.90560519163835	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.89695747683997	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.87555007362162	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.870384726630064	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.80313861201718	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.70140654621637	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.66472099810172	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.654124567066596	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.62118169280979	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
65-69	34.60401800235659	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
70-74	34.574915187377506	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.55475017081052	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.522317928408576	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.504748106248215	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.476058432607516	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.43983751840767	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.401957085144616	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.342562908625155	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.31259818289163	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.25977423673494	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
120-124	34.2234966244081	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.16543832798619	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.119603794353814	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.06718833530292	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.04559794448602	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.05186940570601	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	34.98211242435828	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	18.0
22	317.0
23	3646.0
24	24075.0
25	92238.0
26	224797.0
27	395622.0
28	572312.0
29	741047.0
30	919502.0
31	1143914.0
32	1451251.0
33	1895903.0
34	2606790.0
35	4045775.0
36	8435231.0
37	1531515.0
38	5.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.29725471203695	10.271542576182869	15.648677846058359	38.782524865721825
2	23.11554218933538	11.901861531735062	36.076362952391904	28.906233326537656
3	21.92759573392061	16.81896317629092	28.009312429776855	33.244128660011604
4	27.27142765202552	24.44704045640354	21.830497073777348	26.451034817793595
5	27.15195768933955	30.22059832866314	23.83765556104284	18.789788420954466
6	20.039519279672707	35.92056217045209	25.194402361307894	18.84551618856731
7	16.75977860078901	24.372693377605202	39.85469389612553	19.012834125480257
8	19.364782295515536	23.530140344192965	31.091546845423746	26.013530514867757
9	20.09794412341903	22.438429499231354	32.38634249816973	25.07728387917988
10-14	21.096367332348976	28.43565653977736	26.619230536582734	23.848745591290932
15-19	21.40070326785471	27.306959255254498	27.263000446970604	24.029337029920192
20-24	21.33093732189876	27.334924049305275	27.172299319786642	24.161839309009324
25-29	21.256865555878495	27.604729599301585	26.7983297610828	24.340075083737116
30-34	21.280933370048512	27.414660940620237	27.008261155895486	24.29614453343576
35-39	21.549811798279457	27.133036914270566	26.929476728206463	24.387674559243514
40-44	21.731651734701348	27.187137817824997	26.74352993359185	24.3376805138818
45-49	21.990050635389032	27.161455635499276	26.65497302766276	24.193520701448932
50-54	21.964642383656813	27.409755692755404	26.5249753014776	24.100626622110184
55-59	21.881356767842203	27.319472537118667	26.66968185099555	24.129488844043586
60-64	22.13429672984793	27.165648502447365	26.387046244924424	24.313008522780283
65-69	21.952613036080024	27.273387540820355	26.60734704676543	24.1666523763342
70-74	22.313665543145596	27.018388184004426	26.526366723764085	24.14157954908589
75-79	22.145771842183372	26.97308671011885	26.479486130099488	24.40165531759829
80-84	22.439375820762184	26.920184178749857	26.50956734758536	24.130872652902603
85-89	22.272776075808437	26.940078616664138	26.5391294275748	24.248015879952632
90-94	22.271065310517624	26.683625048633424	26.527914210282965	24.517395430565983
95-99	22.50941494695456	26.726628894631293	26.708039537126076	24.055916621288066
100-104	22.47274273046123	26.540996625332948	26.731516261476564	24.25474438272926
105-109	22.579184723732602	26.528799748540177	26.612047234253346	24.27996829347388
110-114	22.50370379573062	26.58123995801277	26.610178055083168	24.304878191173444
115-119	22.613521177870542	26.822717994750516	26.46936095169652	24.09439987568242
120-124	22.549297631060995	26.648778922979787	26.539673906918694	24.262249539040525
125-129	22.95009765801805	26.620311705059663	26.41477309438968	24.014817542532604
130-134	22.617628992697863	26.859528282674233	26.33593517835711	24.186907546270792
135-139	22.750750583436425	26.64159893408647	26.402916092399902	24.204734390077203
140-144	22.701105095488845	26.477786257358773	26.688009441322762	24.13309920582962
145-149	22.148216000037195	26.553272009805607	27.049108739548235	24.249403250608967
150	21.95952693018833	25.16205328810961	27.721984148308287	25.15643563339378
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	1.0
11	2.0
12	8.5
13	16.0
14	25.5
15	50.0
16	90.5
17	206.0
18	468.5
19	853.5
20	1441.5
21	2297.0
22	3856.5
23	6343.0
24	10022.0
25	15371.5
26	21895.0
27	31085.5
28	48067.0
29	71310.5
30	97359.0
31	123546.0
32	149776.0
33	182888.0
34	219281.5
35	265806.0
36	335159.5
37	409045.0
38	482030.5
39	588495.0
40	732903.5
41	890754.5
42	1052350.0
43	1205929.5
44	1339398.0
45	1442079.5
46	1518022.0
47	1545350.0
48	1498733.0
49	1445419.0
50	1367495.0
51	1226470.0
52	1057073.0
53	908783.5
54	767783.5
55	639855.0
56	553255.5
57	461794.5
58	380713.0
59	313308.0
60	244327.0
61	171616.0
62	101283.5
63	57764.0
64	36771.0
65	23366.5
66	15724.5
67	7788.0
68	3432.0
69	1993.0
70	1454.0
71	1278.5
72	1234.0
73	936.5
74	505.5
75	165.5
76	35.5
77	20.5
78	12.5
79	2.5
80	2.0
81	1.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.5
95	0.5
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.1625996026068474E-4
3	7.473854588186875E-5
4	3.321713150305278E-5
5	1.660856575152639E-5
6	7.058640444398715E-5
7	1.743899403910271E-4
8	1.0795567738492153E-4
9	9.134711163339513E-5
10-14	1.5445966148919542E-4
15-19	1.9764193244316405E-4
20-24	1.8269422326679027E-4
25-29	3.080888946908145E-4
30-34	7.698070225832482E-4
35-39	7.133378990280585E-4
40-44	0.0010637786363852653
45-49	8.677975605172539E-4
50-54	5.339653889115734E-4
55-59	3.296800301677988E-4
60-64	2.350112053840984E-4
65-69	3.1971489071688303E-4
70-74	3.7120145071173853E-4
75-79	2.740414054474233E-4
80-84	2.7238079725676664E-4
85-89	3.8448934442175133E-4
90-94	3.720337913974477E-4
95-99	2.8733076684952667E-4
100-104	4.334898982030357E-4
105-109	3.1806078786082053E-4
110-114	2.549495824743837E-4
115-119	2.49139463986741E-4
120-124	2.358554947599262E-4
125-129	1.469975659943704E-4
130-134	1.6278271131664663E-4
135-139	1.4950515289443472E-4
140-144	1.5953544607564822E-4
145-149	1.5751765855522145E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
72-73	1.0
74-75	3.0
76-77	4.0
78-79	8.0
80-81	13.0
82-83	9.0
84-85	22.0
86-87	13.0
88-89	16.0
90-91	34.0
92-93	36.0
94-95	37.0
96-97	39.0
98-99	60.0
100-101	51.0
102-103	69.0
104-105	57.0
106-107	77.0
108-109	87.0
110-111	133.0
112-113	121.0
114-115	110.0
116-117	122.0
118-119	123.0
120-121	167.0
122-123	180.0
124-125	201.0
126-127	242.0
128-129	342.0
130-131	351.0
132-133	514.0
134-135	659.0
136-137	1061.0
138-139	2419.0
140-141	5919.0
142-143	9470.0
144-145	72420.0
146-147	768137.0
148-149	1414378.0
150-151	2.1806253E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	42.61337394814148
#Duplication Level	Percentage of total
1	33.44865341268443
2	8.57461720463384
3	4.9316702183638395
4	3.477706702521817
5	2.593451472800094
6	2.0425302670493286
7	1.6476305402847904
8	1.418688876573426
9	1.2221086464981639
>10	15.364975393267684
>50	4.990461669383636
>100	11.143268094369464
>500	4.11300817640662
>1k	4.6399632239260455
>5k	0.33272956696247324
>10k+	0.05853653427453762
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	3.321713150305278E-5	0.0	0.0	3.072584664032382E-4	2.9064990065171182E-5
2	1.660856575152639E-5	1.0380353594703993E-4	0.0	1.660856575152639E-5	0.0021881785377636017	4.567355581669757E-5
3	2.0760707189407987E-5	1.1625996026068473E-4	0.0	1.660856575152639E-5	0.0043597485097756775	4.9825697254579166E-5
4	5.8129980130342364E-5	1.287163845743295E-4	0.0	2.4912848627289583E-5	0.006298798561266384	5.3977838692460765E-5
5	8.719497019551355E-5	1.3286852601221113E-4	0.0	2.9064990065171182E-5	0.007482158871062639	6.643426300610556E-5
6	1.2456424313644793E-4	1.370206674500927E-4	0.0	2.9064990065171182E-5	0.009059972617457645	6.643426300610556E-5
7	1.411728088879743E-4	1.577813746395007E-4	0.0	2.9064990065171182E-5	0.010563047817970784	6.643426300610556E-5
8	2.0760707189407986E-4	1.577813746395007E-4	0.0	2.9064990065171182E-5	0.01377680529089114	7.058640444398715E-5
9	2.57432769148659E-4	1.577813746395007E-4	0.0	2.9064990065171182E-5	0.01655874005427181	7.058640444398715E-5
10-11	2.927259713706526E-4	1.577813746395007E-4	0.0	3.114106078411198E-5	0.029150108964647755	9.342318235233594E-5
12-13	3.1763881999794224E-4	1.598574453584415E-4	0.0	3.321713150305278E-5	0.037844693135571816	1.0795567738492153E-4
14-15	3.342473857494686E-4	1.660856575152639E-4	0.0	3.321713150305278E-5	0.04422030631343901	1.1210781882280313E-4
16-17	3.6123630509569894E-4	1.681617282342047E-4	0.0	4.1521414378815974E-5	0.0480361242948522	1.1210781882280313E-4
18-19	4.0068164875557417E-4	1.723138696720863E-4	0.0	4.1521414378815974E-5	0.05110040467600882	1.1210781882280313E-4
20-21	7.224726101913979E-4	2.2421563764560626E-4	0.0	4.1521414378815974E-5	0.05356054847795366	1.1210781882280313E-4
22-23	0.0010401114301893401	2.3251992052136946E-4	0.0	4.1521414378815974E-5	0.05617224544238119	1.1625996026068473E-4
24-25	0.0010940892688818009	2.4290027411607348E-4	0.0	4.359748509775677E-5	0.05872166028524049	1.2248817241750713E-4
26-27	0.0011418388954174395	2.4497634483501427E-4	0.0	4.567355581669757E-5	0.06099703379319961	1.2664031385538872E-4
28-29	0.0012082731584235448	2.4497634483501427E-4	0.0	5.6053909411401565E-5	0.06374159928363934	1.3286852601221113E-4
30-31	0.0013577502501872824	2.4497634483501427E-4	0.0	6.851033372504636E-5	0.06651522976414426	1.453249503258559E-4
32-33	0.0014262605839123286	2.4497634483501427E-4	0.0	8.096675803869114E-5	0.06911031816282025	1.681617282342047E-4
34-35	0.0014968469883563159	2.4497634483501427E-4	0.0	1.1625996026068473E-4	0.0717946776024107	1.7646601110996789E-4
36-37	0.001515531624826783	2.4497634483501427E-4	0.0	1.2871638457432954E-4	0.07415932215128426	1.8061815254784947E-4
38-39	0.0015196837662646645	2.5328062771077744E-4	0.0	1.494770917637375E-4	0.07665268308473216	1.826942232667903E-4
40-41	0.0015300641198593688	2.5328062771077744E-4	0.0	1.494770917637375E-4	0.07896750193635116	1.826942232667903E-4
42-43	0.001536292332016191	2.5328062771077744E-4	0.0	1.557053039205599E-4	0.08115983261555265	1.826942232667903E-4
44-45	0.001557053039205599	2.5328062771077744E-4	0.0	1.6193351607738228E-4	0.08371339959984983	1.8684636470467188E-4
46-47	0.001577813746395007	2.5328062771077744E-4	0.0	1.660856575152639E-4	0.08761226041002065	1.9307457686149428E-4
48-49	0.0015923462414275925	2.5535669842971823E-4	0.0	1.660856575152639E-4	0.0900018178075215	1.9515064758043508E-4
50-51	0.0016089548071791188	2.57432769148659E-4	0.0	1.660856575152639E-4	0.09260521048907328	1.9930278901831666E-4
52-53	0.0016525522922768757	2.57432769148659E-4	0.0	1.660856575152639E-4	0.09473525904670653	2.0137885973725746E-4
54-55	0.0016961497773746326	2.57432769148659E-4	0.0	1.660856575152639E-4	0.09640234383401598	2.0345493045619828E-4
56-57	0.0017459754746292117	2.595088398675998E-4	0.0	1.660856575152639E-4	0.09835385030982033	2.0968314261302068E-4
58-59	0.0017874968890080277	2.615849105865406E-4	0.0	1.681617282342047E-4	0.10032611749281409	2.1175921333196147E-4
60-61	0.0018539311520141331	2.615849105865406E-4	0.0	1.7023779895314548E-4	0.102188352927704	2.1175921333196147E-4
62-63	0.00189752863711189	2.6988919346230384E-4	0.0	1.7023779895314548E-4	0.1043308579096509	2.2421563764560626E-4
64-65	0.0019162132735823572	2.761174056191262E-4	0.0	1.723138696720863E-4	0.1069155659547322	2.2421563764560626E-4
66-67	0.0019369739807717653	2.8442168849488944E-4	0.0	1.743899403910271E-4	0.10928436264504365	2.2421563764560626E-4
68-69	0.001970191112274818	2.927259713706526E-4	0.0	1.743899403910271E-4	0.11104071847326756	2.3251992052136946E-4
70-71	0.0020117125266536336	3.072584664032382E-4	0.0	1.743899403910271E-4	0.11283444357443241	2.3874813267819184E-4
72-73	0.0020303971631241012	3.072584664032382E-4	0.0	1.8061815254784947E-4	0.11431260592631826	2.4705241555395506E-4
74-75	0.002055310011751391	3.114106078411198E-4	0.0	1.868463647046719E-4	0.11603366855232017	2.5328062771077744E-4
76-77	0.00207814678965974	3.155627492790014E-4	0.0	1.909985061425535E-4	0.11732083239806347	2.5328062771077744E-4
78-79	0.002096831426130207	3.155627492790014E-4	0.0	1.9930278901831666E-4	0.11845851915204303	2.57432769148659E-4
80-81	0.0021217442747574963	3.176388199979422E-4	0.0	1.9930278901831666E-4	0.11989931223098794	2.595088398675998E-4
82-83	0.0021591135476984307	3.19714890716883E-4	0.0	1.9930278901831666E-4	0.12137955065359274	2.615849105865406E-4
84-85	0.0022359281642992403	3.19714890716883E-4	0.0	1.9930278901831666E-4	0.12299265760220973	2.615849105865406E-4
86-87	0.002277449578678056	3.19714890716883E-4	0.0	2.0553100117513907E-4	0.12433795142808338	2.615849105865406E-4
88-89	0.002289906002991701	3.259431028737054E-4	0.0	2.0760707189407986E-4	0.12572476666833582	2.615849105865406E-4
90-91	0.0023065145687432274	3.30095244311587E-4	0.0	2.0968314261302068E-4	0.12758492603250676	2.615849105865406E-4
92-93	0.002348035983122043	3.321713150305278E-4	0.0	2.1591135476984306E-4	0.1292291740419079	2.615849105865406E-4
94-95	0.0024165463168470897	3.321713150305278E-4	0.0	2.2421563764560626E-4	0.13067204319157175	2.615849105865406E-4
96-97	0.002476752367696373	3.321713150305278E-4	0.0	2.2421563764560626E-4	0.13187408813783846	2.615849105865406E-4
98-99	0.0025411105599835375	3.3839952718735017E-4	0.0	2.3667206195925104E-4	0.13299724239678545	2.615849105865406E-4
100-101	0.0026262294594601105	3.446277393441726E-4	0.0	2.4497634483501427E-4	0.1342823301718098	2.615849105865406E-4
102-103	0.0026532183788063406	3.446277393441726E-4	2.076070718940799E-6	2.4497634483501427E-4	0.1352186380660521	2.615849105865406E-4
104-105	0.0026760551567146895	3.446277393441726E-4	4.152141437881598E-6	2.4705241555395506E-4	0.13633971625428012	2.6573705202442225E-4
106-107	0.002740413349001854	3.487798807820542E-4	4.152141437881598E-6	2.595088398675998E-4	0.13732377377505806	2.6573705202442225E-4
108-109	0.0027487176318776174	3.5293202221993577E-4	4.152141437881598E-6	2.864977592138302E-4	0.1383638852052474	2.6573705202442225E-4
110-111	0.002798543329132197	3.5708416365781736E-4	4.152141437881598E-6	2.927259713706526E-4	0.13941852913046932	2.6573705202442225E-4
112-113	0.0028670536628572427	3.633123758146398E-4	4.152141437881598E-6	2.948020420895934E-4	0.1405562158844489	2.6573705202442225E-4
114-115	0.0028898904407655916	3.653884465335806E-4	4.152141437881598E-6	2.968781128085342E-4	0.14184337973019218	2.6988919346230384E-4
116-117	0.0029480204208959344	3.674645172525214E-4	4.152141437881598E-6	3.072584664032382E-4	0.14278799190731023	2.6988919346230384E-4
118-119	0.0030019982595883947	3.7161665869040296E-4	4.152141437881598E-6	3.1763881999794224E-4	0.14367447410429796	2.6988919346230384E-4
120-121	0.0031099539369733166	3.7369272940934376E-4	4.152141437881598E-6	3.238670321547646E-4	0.14463361877644862	2.78193476338067E-4
122-123	0.0033528542110893896	3.7576880012828455E-4	8.304282875763195E-6	3.321713150305278E-4	0.14550349240768481	2.823456177759486E-4
124-125	0.0034587338177553707	3.840730830040478E-4	8.304282875763195E-6	3.321713150305278E-4	0.14632976855382324	2.8442168849488944E-4
126-127	0.0035044073735720684	3.9030129516087015E-4	8.304282875763195E-6	3.321713150305278E-4	0.1471664250535564	2.8649775921383024E-4
128-129	0.003570841636578174	3.9030129516087015E-4	8.304282875763195E-6	3.3839952718735017E-4	0.14790758230021828	2.8649775921383024E-4
130-131	0.003670493031087332	3.9445343659875174E-4	8.304282875763195E-6	3.467038100631134E-4	0.1485968377789066	2.8857382993277103E-4
132-133	0.003763916213439668	3.9445343659875174E-4	8.304282875763195E-6	3.5500809293887657E-4	0.149284017186876	2.906499006517118E-4
134-135	0.0038926325980139977	3.9652950731769253E-4	8.304282875763195E-6	3.5708416365781736E-4	0.1501538908181122	2.906499006517118E-4
136-137	0.00397567542677163	4.0483379019345576E-4	8.304282875763195E-6	3.5916023437675815E-4	0.15101130802503476	2.906499006517118E-4
138-139	0.003986055780366334	4.2559449738286374E-4	8.304282875763195E-6	3.653884465335806E-4	0.15174831313025872	2.906499006517118E-4
>>END_MODULE
