##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.lowPi.4d.R.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	22208573
Total Bases	3.3 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	71-150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.41229506281201	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.880584718342774	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	35.01510065504884	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	35.015678359883815	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.92221278692692	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.88052289537018	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.827037558874224	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.97867913440454	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.95594741724288	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.97323761414117	35.2	34.0	37.0	32.0	39.0
15-19	34.968807415046435	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
20-24	34.968409685755134	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
25-29	34.95448995304651	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
30-34	34.942911370307314	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
35-39	34.92928275040454	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
40-44	34.879843103832016	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.793839577175895	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.776121941738445	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.75732739784767	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.751560399670886	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.72556822989033	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.72023803127818	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.698753402031116	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.68691819239643	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
85-89	34.67286199639015	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
90-94	34.65653533350094	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
95-99	34.640137943232595	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
100-104	34.60368503764671	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
105-109	34.58573564028008	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
110-114	34.54772747254494	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
115-119	34.52956338392573	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.50769198304626	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.48585021616983	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.45415571715178	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.43443646576465	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.40246017237817	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.434324044806516	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	35.158291480811826	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	4.0
22	139.0
23	1824.0
24	14153.0
25	61400.0
26	162216.0
27	303153.0
28	449866.0
29	584364.0
30	731436.0
31	926975.0
32	1214849.0
33	1672021.0
34	2477076.0
35	4199096.0
36	8410706.0
37	999287.0
38	8.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.03755058913511	10.855339512358583	15.824897889657297	38.282212008849015
2	23.012022575807734	12.301099144149514	35.847424901902656	28.839453378140096
3	21.557081383428546	17.200478031829434	28.310823172125094	32.93161741261692
4	26.412171785620675	24.553909236991302	22.334965633266947	26.698953344121072
5	26.150782329539478	30.412074740244115	24.434114185963747	19.003028744252664
6	19.511940221221106	36.31136206551081	25.482627186376416	18.69407052689167
7	16.078805720682222	25.064101467273396	40.252254312980504	18.604838499063874
8	18.517278921574874	24.347420876471222	31.494340486154577	25.640959715799326
9	19.637166766853305	22.96433580760563	32.7065386979339	24.69195872760716
10-14	20.206931090793514	29.151958581397892	27.19821496360687	23.44289536420172
15-19	20.413963298388982	27.74025125445948	27.98832081144752	23.857464635704016
20-24	20.55126558787111	27.906406064731964	27.760178486350267	23.782149861046655
25-29	20.57107151900976	28.094421200945558	27.59547898944908	23.739028290595606
30-34	20.508049638490274	27.893559700243454	27.62266582583453	23.97572483543175
35-39	20.582703694524014	27.82501475969945	27.6743360548744	23.917945490902138
40-44	20.61956023614165	27.924629653524384	27.599544224975332	23.85626588535864
45-49	20.722210221831638	27.707873626467343	27.54279926343998	24.027116888261038
50-54	20.837884482519648	27.723656391747852	27.60033150200094	23.83812762373156
55-59	20.820574460208103	27.740585054366207	27.55656333940399	23.882277146021703
60-64	20.77461566374757	27.689179436119094	27.506116201589315	24.030088698544024
65-69	20.869197703732908	27.61973816664781	27.594095688338037	23.91696844128124
70-74	21.008685545588452	27.55314618853037	27.567028256334385	23.871140009546792
75-79	21.037431642529363	27.47656250323638	27.54448973266617	23.94151612156809
80-84	21.08583227757416	27.473156298037054	27.49982535970205	23.941186064686732
85-89	21.033087151744272	27.492603786159414	27.59690369129375	23.877405370802567
90-94	21.02084703424436	27.412461276099005	27.534336007225235	24.0323556824314
95-99	21.112986070362982	27.321364817759402	27.644553786815113	23.92109532506251
100-104	21.187227500285434	27.393856222869577	27.49058811118515	23.928328165659835
105-109	21.141798108038195	27.239221877779368	27.593291873930585	24.025688140251848
110-114	21.192595774649156	27.213615359606912	27.66346779923865	23.930321066505282
115-119	21.226646796977626	27.227299311504144	27.651431952557637	23.894621938960594
120-124	21.186962620948773	27.149489862383504	27.650116701885345	24.01343081478238
125-129	21.239512609815094	27.064010952991573	27.705573345486993	23.99090309170634
130-134	21.296422225274938	27.17072803408734	27.622110196750143	23.910739543887576
135-139	21.283311659762603	27.035166755148754	27.725943090788835	23.955578494299807
140-144	21.32366902430897	26.944727857578073	27.85917273240145	23.872430385711514
145-149	20.96747244859573	27.16733974791493	27.89358093610713	23.97160686738221
150	21.10128387821312	25.754454498701396	28.419905889488167	24.724355733597317
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.5
7	1.0
8	1.0
9	1.5
10	1.5
11	4.5
12	8.5
13	17.0
14	32.0
15	71.0
16	152.0
17	313.5
18	626.5
19	1193.0
20	2208.5
21	3743.5
22	5997.0
23	9393.0
24	14402.5
25	21846.5
26	31921.0
27	44664.5
28	60309.0
29	82434.0
30	110209.0
31	139882.0
32	170132.5
33	203280.5
34	239344.0
35	283521.5
36	350127.5
37	439508.0
38	548647.0
39	684183.0
40	839853.5
41	997474.5
42	1156179.0
43	1318029.5
44	1453271.0
45	1532425.0
46	1550639.0
47	1511969.5
48	1430019.5
49	1310176.0
50	1156792.5
51	991429.0
52	822490.5
53	660130.5
54	515502.5
55	390216.0
56	293290.0
57	220836.0
58	166867.0
59	125635.5
60	88526.0
61	61745.0
62	45668.0
63	31536.0
64	21232.0
65	17023.0
66	15679.0
67	12712.0
68	7762.0
69	4529.5
70	3528.0
71	2775.5
72	2164.0
73	1356.5
74	645.5
75	210.0
76	52.5
77	24.5
78	12.0
79	3.0
80	2.0
81	1.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.5
87	0.5
88	0.5
89	0.5
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	9.455807899048714E-5
3	4.5027656662136736E-5
4	1.4408850131883755E-4
5	1.3058020432019652E-4
6	1.0356361032291449E-4
7	1.4859126698505123E-4
8	1.8011062664854695E-4
9	1.0356361032291449E-4
10-14	1.792100735153042E-4
15-19	1.9722113618015892E-4
20-24	1.8011062664854695E-4
25-29	3.1159138410198617E-4
30-34	4.385693758892118E-4
35-39	5.682490270761656E-4
40-44	3.250996811006272E-4
45-49	1.6480122338342047E-4
50-54	3.584201470306084E-4
55-59	4.817959262848631E-4
60-64	8.168016918511604E-4
65-69	5.007075420829604E-4
70-74	2.890775792005926E-4
75-79	4.1335405194722137E-4
80-84	2.2153625432246726E-4
85-89	2.872771195589556E-4
90-94	3.872397618219707E-4
95-99	5.916686302650572E-4
100-104	3.6022619395215886E-4
105-109	4.520865157064537E-4
110-114	3.161032989918169E-4
115-119	3.737440533718756E-4
120-124	3.1971166510788465E-4
125-129	3.7375137433558826E-4
130-134	3.764595993870049E-4
135-139	2.963154195321073E-4
140-144	3.612755495465091E-4
145-149	3.6776585644730277E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
70-71	1.0
72-73	3.0
74-75	4.0
76-77	3.0
78-79	2.0
80-81	5.0
82-83	9.0
84-85	15.0
86-87	18.0
88-89	25.0
90-91	20.0
92-93	34.0
94-95	36.0
96-97	33.0
98-99	48.0
100-101	50.0
102-103	40.0
104-105	56.0
106-107	66.0
108-109	71.0
110-111	103.0
112-113	113.0
114-115	72.0
116-117	74.0
118-119	81.0
120-121	80.0
122-123	85.0
124-125	89.0
126-127	111.0
128-129	137.0
130-131	185.0
132-133	216.0
134-135	291.0
136-137	522.0
138-139	1795.0
140-141	4504.0
142-143	6644.0
144-145	61789.0
146-147	686089.0
148-149	1045845.0
150-151	2.0399209E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	50.24241290757495
#Duplication Level	Percentage of total
1	37.99208957190391
2	11.427867248436762
3	6.857960823789648
4	4.8199843780792495
5	3.574478834711483
6	2.862018460839013
7	2.3432439188136733
8	1.9173329980309024
9	1.670652003382889
>10	18.09580269051044
>50	4.272777757932406
>100	3.658647810982907
>500	0.3046927356146749
>1k	0.20245076697218845
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	2.701659399728204E-5	0.0	0.0	1.8911615798097427E-4	3.151935966349572E-5
2	4.5027656662136735E-6	1.1707190732155551E-4	0.0	0.0	0.0016164928741707087	3.602212532970939E-5
3	1.8011062664854694E-5	1.3058020432019652E-4	0.0	0.0	0.0027646981190551953	8.104978199184612E-5
4	2.701659399728204E-5	1.4859126698505123E-4	0.0	0.0	0.004065997396590947	8.55525476580598E-5
5	2.701659399728204E-5	1.4859126698505123E-4	0.0	0.0	0.005272738595136212	9.455807899048714E-5
6	4.052489099592306E-5	1.4859126698505123E-4	0.0	0.0	0.006317380229697783	9.906084465670081E-5
7	4.5027656662136736E-5	1.6209956398369223E-4	0.0	0.0	0.0074250605835863475	9.906084465670081E-5
8	5.403318799456408E-5	1.666023296499059E-4	0.0	0.0	0.009392769179721722	9.906084465670081E-5
9	7.204425065941878E-5	1.666023296499059E-4	0.0	0.0	0.012499677489409158	1.0356361032291449E-4
10-11	1.1482052448844867E-4	1.7560786098233327E-4	0.0	9.005531332427347E-6	0.016869611568469528	1.2382605582087603E-4
12-13	1.5759679831747856E-4	1.7560786098233327E-4	0.0	9.005531332427347E-6	0.020325484217288522	1.5084264981815804E-4
14-15	1.598481811505854E-4	1.778592438154401E-4	0.0	9.005531332427347E-6	0.024341951191551116	1.8461339231476062E-4
16-17	1.891161579809743E-4	2.0712722064582896E-4	0.0	9.005531332427347E-6	0.028727644950443235	1.9812168931340163E-4
18-19	2.161327519782563E-4	2.3189243181000418E-4	0.0	9.005531332427347E-6	0.032235299404423684	2.0487583781272215E-4
20-21	2.6566317430660677E-4	2.6791455713971355E-4	0.0	9.005531332427347E-6	0.03577222183523453	2.1388136914514947E-4
22-23	3.03936682469423E-4	2.769200884721409E-4	0.0	9.005531332427347E-6	0.03956129914335334	2.2288690047757683E-4
24-25	3.534671047977734E-4	2.814228541383546E-4	0.0	1.8011062664854694E-5	0.043802904400926615	2.2964104897689735E-4
26-27	4.165058241247648E-4	2.836742369714614E-4	0.0	1.8011062664854694E-5	0.047868901797517564	2.4089796314243154E-4
28-29	4.592820979537947E-4	2.836742369714614E-4	0.0	2.026244549796153E-5	0.05216904300875162	2.499034944748589E-4
30-31	4.975556061166109E-4	2.836742369714614E-4	0.0	3.151935966349572E-5	0.05669432250329637	2.5440626014107257E-4
32-33	5.538401769442818E-4	2.9042838547078194E-4	0.0	3.602212532970939E-5	0.06091566531537168	2.701659399728204E-4
34-35	6.191302791043801E-4	2.9718253397010246E-4	0.0	3.602212532970939E-5	0.06432200754186232	2.7917147130524775E-4
36-37	6.483982559347689E-4	2.9718253397010246E-4	0.0	3.602212532970939E-5	0.06765630551769355	2.8592561980456826E-4
38-39	6.776662327651578E-4	2.9718253397010246E-4	0.0	3.827350816281622E-5	0.07141161208331576	2.9718253397010246E-4
40-41	7.069342095955467E-4	2.9718253397010246E-4	0.0	4.27762738290299E-5	0.07493277483429484	3.03936682469423E-4
42-43	7.136883580948672E-4	2.9718253397010246E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.07818827441096733	3.061880653025298E-4
44-45	7.407049520921493E-4	3.061880653025298E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.08220474138522993	3.061880653025298E-4
46-47	7.767270774218587E-4	3.061880653025298E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.08600957837318049	3.1069083096874344E-4
48-49	8.285088825833159E-4	3.1294221380185033E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.08953524388982578	3.30953276466705E-4
50-51	8.375144139157433E-4	3.151935966349571E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.0932590310957845	3.422101906322392E-4
52-53	8.915476019103073E-4	3.2419912796738447E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.09742408933703214	3.4671295629845286E-4
54-55	9.275697272400167E-4	3.2419912796738447E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.10087545922018493	3.4671295629845286E-4
56-57	9.568377040704056E-4	3.2870189363359815E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.1048198819437881	3.557184876308802E-4
58-59	9.680946182359398E-4	3.44461573465346E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.10847162489908739	3.6472401896330757E-4
60-61	0.001019876423397397	3.5121572196466653E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.11184419638308143	3.6922678462952125E-4
62-63	0.0010671554628926406	3.602212532970939E-4	0.0	5.403318799456408E-5	0.11524153307823964	3.6922678462952125E-4
64-65	0.0010919206740568157	3.6247263613020073E-4	0.0	6.0787336493884595E-5	0.11969927108779119	3.6922678462952125E-4
66-67	0.0011121831195547774	3.939919957936964E-4	0.0	6.529010216009827E-5	0.12359866615473222	3.6922678462952125E-4
68-69	0.001159462159050021	4.052489099592306E-4	0.0	7.204425065941878E-5	0.12646017373561103	3.7372955029573487E-4
70-71	0.0012472660895411875	4.1425444129165797E-4	0.0	7.204425065941878E-5	0.1291550789868399	3.7823231596194855E-4
72-73	0.0012855395977040037	4.165058241247648E-4	0.0	7.204425065941878E-5	0.13206836837288016	3.827350816281622E-4
74-75	0.001335070020032354	4.2776273829029895E-4	0.0	7.204425065941878E-5	0.13521129880789728	3.872378472943759E-4
76-77	0.0014093656535248797	4.367682696227263E-4	0.0	7.654701632563244E-5	0.13762478120498783	3.872378472943759E-4
78-79	0.0014633988415194438	4.367682696227263E-4	0.0	9.230669615738031E-5	0.14026115050255594	3.872378472943759E-4
80-81	0.00150167234968226	4.4127103528894E-4	0.0	9.455807899048714E-5	0.14284348661212948	3.872378472943759E-4
82-83	0.0015286889436795421	4.592820979537947E-4	0.0	9.680946182359398E-5	0.14523220379805582	3.872378472943759E-4
84-85	0.001598481811505854	4.660362464531152E-4	0.0	9.906084465670081E-5	0.14748133524832957	3.917406129605896E-4
86-87	0.0016795315934977004	4.817959262848631E-4	0.0	9.906084465670081E-5	0.149534596392123	3.9624337862680326E-4
88-89	0.0017335647814922643	4.8629869195107676E-4	0.0	9.906084465670081E-5	0.15161937689557992	3.984947614599101E-4
90-91	0.0017763410553212943	4.908014576172904E-4	0.0	9.906084465670081E-5	0.15431653352964192	4.0074614429301694E-4
92-93	0.0018146145634841105	4.975556061166109E-4	0.0	1.0581499315602132E-4	0.15700918739803768	4.0750029279233745E-4
94-95	0.0018844074313104223	5.065611374490383E-4	0.0	1.0806637598912816E-4	0.15986394083041716	4.097516756254443E-4
96-97	0.0019384406193049862	5.24572200113893E-4	2.2513828331068367E-6	1.0806637598912816E-4	0.16213558610902196	4.097516756254443E-4
98-99	0.002017239018463726	5.380804971125339E-4	4.5027656662136735E-6	1.0806637598912816E-4	0.16411004885365665	4.097516756254443E-4
100-101	0.0020802777377907167	5.51588794111175E-4	4.5027656662136735E-6	1.1256914165534183E-4	0.16631865541293445	4.097516756254443E-4
102-103	0.0021185512459535333	5.538401769442818E-4	4.5027656662136735E-6	1.1256914165534183E-4	0.1682143197584104	4.1425444129165797E-4
104-105	0.002177087199614311	5.538401769442818E-4	4.5027656662136735E-6	1.1256914165534183E-4	0.16999741496223103	4.1875720695787165E-4
106-107	0.0022423773017744095	5.583429426104955E-4	4.5027656662136735E-6	1.1707190732155551E-4	0.17171747144672467	4.1875720695787165E-4
108-109	0.002303164638268294	5.65097091109816E-4	4.5027656662136735E-6	1.2157467298776919E-4	0.17344878484538379	4.1875720695787165E-4
110-111	0.0023819630374270332	5.741026224422433E-4	4.5027656662136735E-6	1.2157467298776919E-4	0.17503600974272412	4.1875720695787165E-4
112-113	0.002431493459755384	5.853595366077776E-4	4.5027656662136735E-6	1.2157467298776919E-4	0.17663449155422997	4.1875720695787165E-4
114-115	0.002465264202251986	6.056219821057392E-4	4.5027656662136735E-6	1.2157467298776919E-4	0.17834554250739118	4.1875720695787165E-4
116-117	0.002510291858914123	6.146275134381665E-4	4.5027656662136735E-6	1.2157467298776919E-4	0.1799282646390653	4.232599726240853E-4
118-119	0.002580084726740435	6.371413417692348E-4	4.5027656662136735E-6	1.283288214870897E-4	0.1813106136985929	4.27762738290299E-4
120-121	0.0026813969542302425	6.438954902685553E-4	4.5027656662136735E-6	1.3733435281951703E-4	0.1827650070087799	4.27762738290299E-4
122-123	0.002800720244384905	6.438954902685553E-4	4.5027656662136735E-6	1.3958573565262387E-4	0.18420589202196827	4.322655039565126E-4
124-125	0.002879518643543644	6.438954902685553E-4	4.5027656662136735E-6	1.3958573565262387E-4	0.18585615563863558	4.322655039565126E-4
126-127	0.0029110380032071398	6.483982559347689E-4	4.5027656662136735E-6	1.3958573565262387E-4	0.18738709596514824	4.322655039565126E-4
128-129	0.0029560656598692767	6.574037872671963E-4	4.5027656662136735E-6	1.418371184857307E-4	0.1887626908761765	4.3451688678961946E-4
130-131	0.0030236071448624816	6.596551701003031E-4	4.5027656662136735E-6	1.4859126698505123E-4	0.19001671111421703	4.4127103528894E-4
132-133	0.003106908309687435	6.6190655293341E-4	4.5027656662136735E-6	1.5759679831747856E-4	0.1912954965634217	4.4127103528894E-4
134-135	0.003239739896840738	6.6190655293341E-4	4.5027656662136735E-6	1.6209956398369223E-4	0.19243919904263998	4.5027656662136734E-4
136-137	0.003408593609323751	6.641579357665169E-4	4.5027656662136735E-6	1.6435094681679907E-4	0.19355813631069407	4.5027656662136734E-4
138-139	0.0034401129689872463	6.75414849932051E-4	4.5027656662136735E-6	1.666023296499059E-4	0.19467031943024887	4.5027656662136734E-4
>>END_MODULE
