##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.lowPi.4d.S.1.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24030269
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	69-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.41675525979339	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.8767947208581	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	35.01566486833751	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	35.00543327251143	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.91350729365535	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.844956334030215	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.81507918200999	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.950047750193725	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.919704602557715	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.940278745943296	35.2	34.0	37.4	31.6	39.0
15-19	34.936010246077565	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.93225330103463	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.92226544779836	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.89891458976177	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.88828420522467	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.8289432964733	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.73531002919693	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.715497633422245	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.69594649148539	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.68150347380631	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.65956603315593	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.650337227202634	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.628555726387326	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
80-84	34.61111088582696	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
85-89	34.59722236922458	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.58050814145452	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.55509750543846	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.51718563848195	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.487016117518365	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.45058374817635	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.42310158514667	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.397258735149556	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.36107823889988	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.33088265158995	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.29404201260598	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.26149467551734	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.283819165329	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	35.07349773401061	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	10.0
22	174.0
23	2435.0
24	18202.0
25	77766.0
26	201337.0
27	359156.0
28	519447.0
29	669884.0
30	834373.0
31	1055556.0
32	1373698.0
33	1866338.0
34	2702209.0
35	4413963.0
36	8499512.0
37	1436207.0
38	1.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.240647160462494	10.741169813787769	15.28010776741617	37.738075258333566
2	23.336641247454406	11.688189331704386	35.26595167615616	29.70921774468504
3	22.049618955306833	15.878680756240094	27.53220399020368	34.53949629824939
4	27.23761280629687	23.122647833619315	21.94078702747925	27.69895233260457
5	27.55656881567375	29.034880834548293	23.93887369854115	19.469676651236806
6	20.64429810385188	35.75149864277278	25.134568967945935	18.469634285429407
7	16.985116207570687	25.000714724655392	39.18455555549545	18.82961351227847
8	19.27628452127586	24.44039102934443	30.89335398011595	25.389970469263762
9	20.08527755738416	23.000234121692845	32.25160732906599	24.66288099185701
10-14	20.9848459444874	28.601715188096804	26.745850103773883	23.667588763641913
15-19	21.261294378708442	27.38836140234106	27.399973443448417	23.950370775502076
20-24	21.306247295802088	27.46473496209616	27.20273831077811	24.026279431323648
25-29	21.22755056449361	27.680562621550735	26.948356243276322	24.14353057067933
30-34	21.220288524425783	27.553855281094346	27.045990988757314	24.17986520572256
35-39	21.43259239125283	27.29240990523841	27.028167554297877	24.246830149210883
40-44	21.528435104527503	27.36693705168968	26.911021612810593	24.193606230972225
45-49	21.734068727508838	27.28988423357747	26.84451659583168	24.131530443082017
50-54	21.742142372109896	27.459618027638115	26.7615474714911	24.03669212876089
55-59	21.697114917573877	27.3780676713912	26.882224715978452	24.04259269505647
60-64	21.894498274395747	27.25133710775903	26.66726402920287	24.186900588642352
65-69	21.8019460725617	27.33176857631553	26.805000985845197	24.061284365277576
70-74	22.07648667685723	27.151569545675937	26.739381696420228	24.032562081046606
75-79	21.92280977793549	27.1239486604338	26.722211715977302	24.231029845653413
80-84	22.167604176106178	27.08682213862813	26.69699673164514	24.048576953620547
85-89	22.03438714021962	27.103554843154093	26.772772000636202	24.089286015990083
90-94	22.01366383456696	26.907788413335222	26.724428924292525	24.3541188278053
95-99	22.226630240672453	26.944422820962	26.839437149292277	23.989509789073267
100-104	22.215669268719104	26.78958115349488	26.878091802134485	24.116657775651536
105-109	22.32547290177228	26.737767356162696	26.831005247777505	24.105754494287517
110-114	22.233480226260024	26.77068261160928	26.849736205727947	24.14610095640275
115-119	22.321505553484794	26.943370935859157	26.75680917709366	23.978314333562388
120-124	22.224255134885887	26.827781330196014	26.846201560904596	24.1017619740135
125-129	22.535856997799648	26.778991461660006	26.77716614434403	23.907985396196317
130-134	22.283498231314077	26.953023001094834	26.69429964869328	24.0691791188978
135-139	22.427271651827013	26.752959032277325	26.76569374122892	24.054075574666747
140-144	22.349245149651857	26.611018206306277	27.037167784717536	24.002568859324327
145-149	21.9071783809952	26.878454519024693	27.218257866319284	23.996109233660825
150	21.886849869502022	25.452974255521767	27.73521431195548	24.92496156302073
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	2.0
9	1.5
10	1.5
11	5.0
12	8.0
13	15.5
14	27.5
15	59.5
16	113.0
17	257.0
18	568.0
19	1016.5
20	1664.5
21	2658.5
22	4416.0
23	7056.0
24	11176.5
25	16658.5
26	23184.5
27	32870.5
28	49090.5
29	71344.0
30	97680.5
31	125315.0
32	154749.0
33	189428.0
34	225151.0
35	271191.0
36	338381.5
37	415650.0
38	499834.5
39	611634.5
40	760139.5
41	926644.0
42	1093752.5
43	1252335.5
44	1390207.5
45	1488698.0
46	1546890.5
47	1557053.5
48	1505322.0
49	1437273.5
50	1341819.0
51	1197926.0
52	1026354.0
53	870190.5
54	725658.0
55	596560.0
56	505750.0
57	419018.0
58	344261.0
59	279852.5
60	217676.0
61	155585.5
62	94202.0
63	53463.5
64	33615.5
65	21542.5
66	15077.0
67	7865.0
68	3921.5
69	2632.0
70	1923.5
71	1804.5
72	1773.5
73	1315.5
74	696.0
75	197.0
76	42.0
77	18.0
78	9.0
79	3.5
80	4.0
81	2.5
82	0.5
83	1.0
84	0.5
85	0.5
86	0.5
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.5
95	0.5
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	8.322836502579309E-5
3	7.074411027192413E-5
4	1.1651971103611032E-4
5	9.98740380309517E-5
6	1.0819687453353103E-4
7	1.4981105704642755E-4
8	2.1639374906706207E-4
9	1.290039657899793E-4
10-14	1.7311499925364964E-4
15-19	1.6895358100235997E-4
20-24	1.5896617719926483E-4
25-29	3.195969216990455E-4
30-34	4.552591566910883E-4
35-39	5.476426418697186E-4
40-44	2.796473064866648E-4
45-49	2.255488692198993E-4
50-54	3.770244935668427E-4
55-59	5.002024738050165E-4
60-64	8.064828570999352E-4
65-69	5.285001179137862E-4
70-74	2.455236911302644E-4
75-79	4.627498135309677E-4
80-84	2.26381350704329E-4
85-89	3.1543612302404965E-4
90-94	4.469381614861651E-4
95-99	5.900935625386568E-4
100-104	3.637125654668053E-4
105-109	4.111559048176078E-4
110-114	2.9463671538523594E-4
115-119	3.6288967349076536E-4
120-124	2.838227302821108E-4
125-129	3.6373039933244736E-4
130-134	2.971488394065506E-4
135-139	2.963293648283281E-4
140-144	2.6478208654928735E-4
145-149	2.432761419943675E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
68-69	1.0
70-71	0.0
72-73	1.0
74-75	1.0
76-77	4.0
78-79	7.0
80-81	8.0
82-83	8.0
84-85	7.0
86-87	19.0
88-89	19.0
90-91	24.0
92-93	28.0
94-95	31.0
96-97	42.0
98-99	46.0
100-101	61.0
102-103	54.0
104-105	60.0
106-107	69.0
108-109	82.0
110-111	100.0
112-113	126.0
114-115	83.0
116-117	89.0
118-119	100.0
120-121	121.0
122-123	118.0
124-125	113.0
126-127	122.0
128-129	152.0
130-131	203.0
132-133	250.0
134-135	369.0
136-137	718.0
138-139	1880.0
140-141	5018.0
142-143	7011.0
144-145	63123.0
146-147	751160.0
148-149	1175128.0
150-151	2.2023713E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.294746687927464
#Duplication Level	Percentage of total
1	32.99388882145466
2	9.59724491308295
3	5.703805976134236
4	3.9350060111658904
5	2.888411401390422
6	2.3113848155088235
7	1.9005210569139432
8	1.5966066042560432
9	1.4700961796310081
>10	16.39889066046652
>50	5.306121337904983
>100	10.407075360151131
>500	3.1216705288486057
>1k	2.294351821624597
>5k	0.07492451146631646
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	8.32283650257931E-6	1.2484254753868965E-5	0.0	1.664567300515862E-5	2.4136225857479998E-4	8.32283650257931E-6
2	1.664567300515862E-5	9.571261977966206E-5	0.0	4.1614182512896545E-5	0.0019267366503471102	1.2484254753868965E-5
3	2.496850950773793E-5	1.1651971103611033E-4	0.0	4.1614182512896545E-5	0.00349559133108331	1.664567300515862E-5
4	5.825985551805517E-5	1.3316538404126895E-4	0.0	4.57756007641862E-5	0.005118544449086275	2.0807091256448273E-5
5	5.825985551805517E-5	1.3316538404126895E-4	4.161418251289655E-6	4.57756007641862E-5	0.00626709588644222	2.9129927759027584E-5
6	9.15512015283724E-5	1.3316538404126895E-4	4.161418251289655E-6	4.993701901547586E-5	0.007619556818111358	3.329134601031724E-5
7	1.290039657899793E-4	1.5397247529771722E-4	4.161418251289655E-6	4.993701901547586E-5	0.009217541426606584	3.329134601031724E-5
8	2.0807091256448273E-4	1.5397247529771722E-4	4.161418251289655E-6	4.993701901547586E-5	0.012242892495294165	3.7452764261606895E-5
9	2.8297644108769653E-4	1.5397247529771722E-4	4.161418251289655E-6	4.993701901547586E-5	0.015314019164745929	3.7452764261606895E-5
10-11	3.5996267873655515E-4	1.6229531180029654E-4	4.161418251289655E-6	4.993701901547586E-5	0.026630996099128147	4.993701901547586E-5
12-13	4.265453707571896E-4	1.6229531180029654E-4	4.161418251289655E-6	4.993701901547586E-5	0.035114047204382104	6.450198289498964E-5
14-15	4.639981350187965E-4	1.6229531180029654E-4	4.161418251289655E-6	5.201772814112068E-5	0.042146844049061626	7.698623764885862E-5
16-17	5.076930266573378E-4	1.68537439177231E-4	4.161418251289655E-6	5.409843726676551E-5	0.04648928399428238	7.906694677450345E-5
18-19	5.950828099344207E-4	1.7894098480545517E-4	4.161418251289655E-6	5.409843726676551E-5	0.04977056228542427	7.906694677450345E-5
20-21	8.281222320066413E-4	1.9142523955932412E-4	4.161418251289655E-6	5.617914639241034E-5	0.052608649532803815	7.906694677450345E-5
22-23	0.001098614418340469	1.955866578106138E-4	4.161418251289655E-6	6.242127376934482E-5	0.05530108714138822	7.906694677450345E-5
24-25	0.0012130534202509343	2.0390949431319308E-4	4.161418251289655E-6	6.242127376934482E-5	0.0579872826225957	7.906694677450345E-5
26-27	0.0012567483118894759	2.0390949431319308E-4	4.161418251289655E-6	6.450198289498964E-5	0.060396743790092404	7.906694677450345E-5
28-29	0.0013524609316691379	2.0390949431319308E-4	4.161418251289655E-6	6.658269202063447E-5	0.0633534314576337	7.906694677450345E-5
30-31	0.0015480475894797516	2.0390949431319308E-4	4.161418251289655E-6	8.738978327708275E-5	0.06649946365560869	8.738978327708275E-5
32-33	0.0016541637548876378	2.0390949431319308E-4	4.161418251289655E-6	1.0195474715659654E-4	0.06931050168435485	1.0819687453353102E-4
34-35	0.0017935712663058412	2.059902034388379E-4	4.161418251289655E-6	1.3524609316691377E-4	0.07219020311424729	1.1235829278482068E-4
36-37	0.0018372661579443826	2.0807091256448273E-4	4.161418251289655E-6	1.456496387951379E-4	0.07489304426845991	1.290039657899793E-4
38-39	0.001868476794829055	2.1015162169012755E-4	4.161418251289655E-6	1.7061814830287585E-4	0.07775818073447285	1.3108467491562413E-4
40-41	0.001916333104718886	2.184744581927069E-4	4.161418251289655E-6	1.7894098480545517E-4	0.0802945651586339	1.3316538404126895E-4
42-43	0.0019204945229701759	2.2679729469528618E-4	4.161418251289655E-6	1.8726382130803445E-4	0.0825833451968432	1.4148822054384826E-4
44-45	0.0019496244507292034	2.4136225857479998E-4	4.161418251289655E-6	1.914252395593241E-4	0.08506979260198877	1.4148822054384826E-4
46-47	0.0019808350876138756	2.4968509507737927E-4	4.161418251289655E-6	2.059902034388379E-4	0.08867982293498256	1.456496387951379E-4
48-49	0.0019954000514933895	2.5592722245431374E-4	4.161418251289655E-6	2.122323308157724E-4	0.09138058338006952	1.5397247529771722E-4
50-51	0.002007884306247258	2.7049218633382754E-4	4.161418251289655E-6	2.184744581927069E-4	0.09406469815215135	1.5605318442336207E-4
52-53	0.002049498488760155	2.746536045851172E-4	4.161418251289655E-6	2.205551673183517E-4	0.09644502939188904	1.6229531180029654E-4
54-55	0.0020869512530217616	2.788150228364069E-4	4.161418251289655E-6	2.2471658556964135E-4	0.09852157709928258	1.6645673005158618E-4
56-57	0.002176421745424489	2.788150228364069E-4	4.161418251289655E-6	2.3095871294657582E-4	0.10065430395306853	1.7686027567981034E-4
58-59	0.00222843947356561	2.8713785933898617E-4	4.161418251289655E-6	2.351201311978655E-4	0.10273917449696464	1.8934453043367927E-4
60-61	0.002347039893727365	2.975414049672103E-4	4.161418251289655E-6	2.372008403235103E-4	0.10481156078610689	1.9142523955932412E-4
62-63	0.0024261068405018685	2.9962211409285516E-4	4.161418251289655E-6	2.3928154944915516E-4	0.10703167742316992	1.9350594868496895E-4
64-65	0.0024573174773865414	2.9962211409285516E-4	4.161418251289655E-6	2.4968509507737927E-4	0.10985103828841866	1.9558665781061377E-4
66-67	0.002496850950773793	3.1418707797236896E-4	4.161418251289655E-6	2.5592722245431374E-4	0.11257052511563645	1.9558665781061377E-4
68-69	0.002519738751155886	3.245906236005931E-4	4.161418251289655E-6	2.6216934983124826E-4	0.11457840942188371	1.9974807606190344E-4
70-71	0.0025634336427944274	3.266713327262379E-4	4.161418251289655E-6	2.663307680825379E-4	0.11662790791064387	2.0390949431319308E-4
72-73	0.0026112899526842584	3.3083275097752754E-4	4.161418251289655E-6	2.7049218633382754E-4	0.11836321932143165	2.0807091256448273E-4
74-75	0.002638339171317641	3.3291346010317236E-4	4.161418251289655E-6	2.8297644108769653E-4	0.12029203668090441	2.2263587644399653E-4
76-77	0.0026549848443228	3.3707487835446206E-4	4.161418251289655E-6	2.9337998671592064E-4	0.12187545632552012	2.28878003820931E-4
78-79	0.002673711226453603	3.3707487835446206E-4	4.161418251289655E-6	3.3083275097752754E-4	0.12340269682374341	2.3095871294657582E-4
80-81	0.0027111639907152103	3.3707487835446206E-4	4.161418251289655E-6	3.412362966057517E-4	0.1250027621413643	2.3303942207222067E-4
82-83	0.0027444553367255275	3.412362966057517E-4	4.161418251289655E-6	3.412362966057517E-4	0.1266423609323724	2.3303942207222067E-4
84-85	0.0027756659736101995	3.412362966057517E-4	4.161418251289655E-6	3.4539771485704135E-4	0.12833397745152167	2.3303942207222067E-4
86-87	0.002848490793007769	3.433170057313965E-4	8.32283650257931E-6	3.516398422339758E-4	0.12992571993263996	2.351201311978655E-4
88-89	0.0028984278120232445	3.4539771485704135E-4	8.32283650257931E-6	3.558012604852655E-4	0.1314550411399889	2.3928154944915516E-4
90-91	0.002919234903279693	3.49559133108331E-4	8.32283650257931E-6	3.620433878622E-4	0.1336834806135545	2.434429677004448E-4
92-93	0.002940041994536141	3.5996267873655515E-4	8.32283650257931E-6	3.662048061134896E-4	0.1358037232125866	2.4760438595173445E-4
94-95	0.0029795754679233927	3.7036622436477926E-4	8.32283650257931E-6	3.662048061134896E-4	0.13749117831348454	2.538465133286689E-4
96-97	0.003037835323441448	3.807697699930034E-4	8.32283650257931E-6	3.662048061134896E-4	0.13899553101132578	2.538465133286689E-4
98-99	0.003096095178959503	3.8493118824429307E-4	8.32283650257931E-6	3.745276426160689E-4	0.14032926556086409	2.5592722245431374E-4
100-101	0.0032126148899956136	3.9117331562122753E-4	8.32283650257931E-6	3.8285047911864825E-4	0.1417691162758103	2.580079315799586E-4
102-103	0.0032667133272623787	3.9117331562122753E-4	8.32283650257931E-6	3.9117331562122753E-4	0.1429343133861714	2.580079315799586E-4
104-105	0.0032875204185188276	3.9325402474687236E-4	8.32283650257931E-6	3.994961521238069E-4	0.14412447900604025	2.642500589568931E-4
106-107	0.003324973182780434	4.036575703750965E-4	8.32283650257931E-6	4.1406111600332063E-4	0.14534585526279376	2.663307680825379E-4
108-109	0.003364506656167686	4.0781898862638616E-4	1.2484254753868965E-5	4.494331711392827E-4	0.14655890868304472	2.663307680825379E-4
110-111	0.003408201547806227	4.2030324338025515E-4	1.2484254753868965E-5	4.5359458939057235E-4	0.1475701333181081	2.663307680825379E-4
112-113	0.0034664614033242825	4.265453707571896E-4	1.2484254753868965E-5	4.5359458939057235E-4	0.14881023595699241	2.663307680825379E-4
114-115	0.0035247212588423375	4.327874981341241E-4	1.2484254753868965E-5	4.57756007641862E-4	0.15027505518144635	2.663307680825379E-4
116-117	0.003593384659988617	4.390296255110586E-4	1.2484254753868965E-5	4.7648238977266545E-4	0.15160046689448214	2.663307680825379E-4
118-119	0.0036329181333758682	4.4527175288799307E-4	1.2484254753868965E-5	4.8272451714959997E-4	0.15276774471396887	2.663307680825379E-4
120-121	0.0037327921714068206	4.494331711392827E-4	1.2484254753868965E-5	5.014508992804034E-4	0.1538705205505606	2.663307680825379E-4
122-123	0.003940863083971303	4.5359458939057235E-4	1.2484254753868965E-5	5.243386996624965E-4	0.1549087944042574	2.663307680825379E-4
124-125	0.004080270595389507	4.5359458939057235E-4	1.2484254753868965E-5	5.264194087881413E-4	0.1561343320792622	2.663307680825379E-4
126-127	0.004134369032656272	4.5359458939057235E-4	1.2484254753868965E-5	5.30580827039431E-4	0.15725167287973346	2.7049218633382754E-4
128-129	0.004205113142928196	4.5359458939057235E-4	1.2484254753868965E-5	5.368229544163654E-4	0.15818174985889671	2.746536045851172E-4
130-131	0.004302906471833503	4.5359458939057235E-4	1.2484254753868965E-5	5.389036635420103E-4	0.15898698429052127	2.746536045851172E-4
132-133	0.0043590856182259136	4.57756007641862E-4	1.2484254753868965E-5	5.493072091702345E-4	0.15970066752061743	2.746536045851172E-4
134-135	0.004394457673361876	4.57756007641862E-4	1.2484254753868965E-5	5.534686274215241E-4	0.16064739017278584	2.7673431371076206E-4
136-137	0.0044631210745081544	4.57756007641862E-4	1.2484254753868965E-5	5.534686274215241E-4	0.16154417580593874	2.788150228364069E-4
138-139	0.004469363201885089	4.57756007641862E-4	1.2484254753868965E-5	5.55549336547169E-4	0.1624326386025891	2.788150228364069E-4
>>END_MODULE
