##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.lowPi.4d.S.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24118417
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	69-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	36.583710614175054	37.0	35.0	39.0	33.0	39.0
2	35.77474114491013	36.0	35.0	39.0	33.0	39.0
3	35.982660553551256	37.0	35.0	39.0	33.0	39.0
4	36.04424121201653	37.0	35.0	39.0	33.0	39.0
5	35.86807152393128	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
6	35.71877739737231	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
7	35.54942026253215	35.0	35.0	37.0	33.0	39.0
8	35.80367028234067	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
9	35.79120221696142	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
10-14	35.8127216475277	36.2	35.0	38.4	33.0	39.0
15-19	35.8113636562466	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
20-24	35.805766506151706	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
25-29	35.79876110442903	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
30-34	35.78508558003621	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
35-39	35.778770124092304	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
40-44	35.76696278201011	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
45-49	35.75706223173768	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
50-54	35.74213508291196	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
55-59	35.732705434191644	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
60-64	35.72395100391539	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
65-69	35.705851449537505	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
70-74	35.702817661760136	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
75-79	35.692073234784075	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
80-84	35.671993848827654	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
85-89	35.65608996244771	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
90-94	35.649189856298364	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
95-99	35.62165705175015	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
100-104	35.60171494963471	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
105-109	35.57501836210573	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
110-114	35.558508347793875	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
115-119	35.524612730791176	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
120-124	35.50381498559462	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
125-129	35.47714213009393	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
130-134	35.442410444937174	36.0	34.0	38.0	32.8	39.0
135-139	35.40826767265061	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
140-144	35.370396006576776	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
145-149	35.35876651846167	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
150	35.80061464835531	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	9.0
22	102.0
23	1352.0
24	9997.0
25	41717.0
26	106523.0
27	191716.0
28	280990.0
29	361974.0
30	451856.0
31	569493.0
32	743427.0
33	1022415.0
34	1542898.0
35	2820679.0
36	1.0732924E7
37	5240272.0
38	73.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.50250346032246	10.674303375714915	15.224780299635752	37.598412864326875
2	23.595796272074743	11.666643586088332	34.931845816319004	29.80571432551792
3	22.16947705704866	16.231984818348373	27.59056791505752	34.007970209545455
4	27.215593898809722	23.429358793879175	21.732455296548046	27.622592010763057
5	27.53189181062593	29.44167092103648	23.729076036289232	19.29736123204836
6	20.50114988909096	36.31589275795219	24.685197985456174	18.49775936750067
7	16.770175441942555	25.42862078032852	39.22856261728076	18.572641160448168
8	19.100540516873508	24.682661317941708	30.76230276673457	25.45449539845021
9	19.996579375792056	23.104413413739426	32.12108760923452	24.777919601233993
10-14	20.798483601304603	29.074512982748313	26.56969906602121	23.55730434992587
15-19	21.135922613408034	27.749884148667743	27.208570700757534	23.90562253716669
20-24	21.16123743507308	27.837753185584308	27.017678389035115	23.983330990307504
25-29	21.0859307101183	28.05590256386472	26.761424998942505	24.096741727074473
30-34	21.067946010818364	27.940340946430442	26.860615692499596	24.131097350251597
35-39	21.282321813223497	27.683419386849117	26.835118889781405	24.199139910145977
40-44	21.371775979724543	27.736132638951737	26.73802585059067	24.15406553073305
45-49	21.577764919341377	27.642482344863563	26.680283566170303	24.09946916962476
50-54	21.596433635057252	27.786310925976736	26.604629506801743	24.012625932164262
55-59	21.525783152615805	27.714431701481768	26.729394486385804	24.03039065951663
60-64	21.74043090817865	27.613184600067047	26.493166543742063	24.15321794801224
65-69	21.647848030376768	27.6481235227435	26.662936880479577	24.04109156640016
70-74	21.92263736593247	27.476300308477402	26.58582823650466	24.015234089085467
75-79	21.753824095448756	27.46445599536937	26.572072661731706	24.20964724745017
80-84	22.01628052775168	27.392384445140216	26.551296514038835	24.040038513069266
85-89	21.871016233457233	27.401910391066643	26.633565949856152	24.093507425619972
90-94	21.870633498885212	27.20246875971359	26.59045747572522	24.336440265675986
95-99	22.06634928207676	27.240410907524744	26.710466830259822	23.982772980138673
100-104	22.06843239310789	27.07235123723152	26.745748967341143	24.113467402319447
105-109	22.13213643107501	27.016414273582363	26.728421284195313	24.123028011147316
110-114	22.061999235500792	27.043852226839242	26.720370130728206	24.17377840693176
115-119	22.173398026139488	27.2287381825373	26.627634841618363	23.97022894970485
120-124	22.080143219721204	27.112873807150194	26.69910776677818	24.107875206350414
125-129	22.40295457244032	27.057043224640214	26.63292649425635	23.90707570866312
130-134	22.153312849602145	27.225553247334833	26.561469852840563	24.05966405022246
135-139	22.304641595439893	27.050522451299003	26.568627743684132	24.076208209576972
140-144	22.237940465140554	26.919829829867282	26.808093744996597	24.034135959995567
145-149	21.836044167764886	27.182205760826804	27.00783180723136	23.973918264176948
150	22.40973178540188	25.519610975359864	27.1389018030067	24.931755436231555
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	1.0
10	2.5
11	4.5
12	11.0
13	19.0
14	28.0
15	64.0
16	125.5
17	272.0
18	604.0
19	1069.0
20	1786.0
21	2812.0
22	4594.5
23	7304.0
24	11724.5
25	17921.0
26	25021.5
27	35195.0
28	52528.0
29	76254.0
30	103203.0
31	131105.0
32	161975.0
33	197949.0
34	234879.0
35	281892.5
36	351431.0
37	431323.0
38	515889.5
39	629508.0
40	781142.0
41	951437.0
42	1118484.0
43	1275239.0
44	1414709.0
45	1510364.0
46	1564047.5
47	1569316.0
48	1510244.0
49	1439583.0
50	1339797.5
51	1189428.0
52	1012899.0
53	854067.5
54	708807.5
55	576815.0
56	483982.5
57	396803.5
58	322128.5
59	258254.5
60	200792.0
61	144590.5
62	86876.0
63	49184.5
64	31199.5
65	19544.5
66	13044.0
67	6666.5
68	3325.5
69	2235.0
70	1626.5
71	1537.5
72	1557.5
73	1177.0
74	640.0
75	204.5
76	62.5
77	46.5
78	26.0
79	15.0
80	14.5
81	9.5
82	6.0
83	5.0
84	3.5
85	2.5
86	1.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.5
92	0.5
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	6.219313647326024E-5
3	0.0014760504389653764
4	0.0015299511572422022
5	3.234043096609533E-4
6	1.65848363928694E-5
7	4.560830008039085E-5
8	8.707039106256435E-5
9	4.9754509178608204E-5
10-14	4.394981644110391E-5
15-19	2.653573822859104E-5
20-24	1.3102020750366828E-4
25-29	1.5921442937154624E-4
30-34	2.454555786144671E-4
35-39	2.20578324025163E-4
40-44	1.4843428571618112E-4
45-49	2.214075658448065E-4
50-54	2.288707422215977E-4
55-59	2.454555786144671E-4
60-64	4.535952753449781E-4
65-69	5.987125937825853E-4
70-74	3.524277908833465E-4
75-79	2.355047060722981E-4
80-84	1.8906723835513526E-4
85-89	1.144355590024062E-4
90-94	1.592150749874809E-4
95-99	8.790032752988835E-5
100-104	6.551097348610027E-5
105-109	7.463315874453792E-5
110-114	1.0697504315364948E-4
115-119	8.20978232881671E-5
120-124	1.0365971021554835E-4
125-129	1.78296506908546E-4
130-134	1.326879612046939E-4
135-139	1.4679071095443592E-4
140-144	1.202826552809262E-4
145-149	1.087659651363093E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
68-69	1.0
70-71	0.0
72-73	1.0
74-75	0.0
76-77	2.0
78-79	3.0
80-81	6.0
82-83	7.0
84-85	13.0
86-87	14.0
88-89	21.0
90-91	29.0
92-93	34.0
94-95	32.0
96-97	47.0
98-99	60.0
100-101	53.0
102-103	46.0
104-105	46.0
106-107	70.0
108-109	68.0
110-111	95.0
112-113	86.0
114-115	76.0
116-117	69.0
118-119	86.0
120-121	75.0
122-123	80.0
124-125	109.0
126-127	120.0
128-129	152.0
130-131	171.0
132-133	212.0
134-135	257.0
136-137	493.0
138-139	1497.0
140-141	4459.0
142-143	4727.0
144-145	53918.0
146-147	732790.0
148-149	625742.0
150-151	2.269265E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	42.08920162341438
#Duplication Level	Percentage of total
1	31.769208175566305
2	9.660302159231279
3	5.634173888039479
4	3.8607846712025675
5	2.9162440326149865
6	2.3027302307746855
7	1.951004439173577
8	1.5866850599417097
9	1.370010851599677
>10	16.925221468288353
>50	5.375219752425179
>100	10.723839345677408
>500	3.1690935396932858
>1k	2.6740083574876397
>5k	0.0814740282839939
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	8.292418196434699E-6	3.731588188395615E-5	0.0	1.243862729465205E-5	1.9487182761621544E-4	4.1462090982173495E-6
2	8.292418196434699E-6	1.2024006384830315E-4	0.0	3.3169672785738796E-5	0.0017621388667423737	8.292418196434699E-6
3	2.902346368752145E-5	1.2853248204473783E-4	0.0	3.731588188395615E-5	0.003445499760618618	2.48772545893041E-5
4	7.877797286612965E-5	1.409711093393899E-4	0.0	4.14620909821735E-5	0.00499203575425369	3.3169672785738796E-5
5	8.2924181964347E-5	1.492635275358246E-4	0.0	4.560830008039085E-5	0.006219313647326025	3.731588188395615E-5
6	1.1194764565186844E-4	1.492635275358246E-4	0.0	4.560830008039085E-5	0.007674633040800315	3.731588188395615E-5
7	1.409711093393899E-4	1.824332003215634E-4	0.0	4.560830008039085E-5	0.00902629720681917	3.731588188395615E-5
8	2.0316424581265014E-4	1.8657940941978074E-4	0.0	4.560830008039085E-5	0.011883035275490925	4.14620909821735E-5
9	2.6950359138412774E-4	1.9487182761621544E-4	0.0	4.560830008039085E-5	0.01448685458917142	4.14620909821735E-5
10-11	3.130387869154099E-4	2.052373503617588E-4	0.0	4.768140462949952E-5	0.023996185155932912	5.3900718276825546E-5
12-13	3.565739824466921E-4	2.0731045491086749E-4	0.0	4.97545091786082E-5	0.031739230646853814	6.841245012058627E-5
14-15	4.0218228252708295E-4	2.1560287310730218E-4	0.0	4.97545091786082E-5	0.03843121213137662	7.46317637679123E-5
16-17	4.394981644110391E-4	2.2389529130373688E-4	0.0	5.3900718276825546E-5	0.04302728491675055	7.46317637679123E-5
18-19	4.7059473264766916E-4	2.2804150040195423E-4	0.0	5.3900718276825546E-5	0.04643961500458343	8.499728651345567E-5
20-21	7.048555466969495E-4	2.5706496408947567E-4	0.0	6.012003192415157E-5	0.04922586751858549	8.914349561167302E-5
22-23	9.764322426301859E-4	2.7157669593323643E-4	0.0	6.219313647326024E-5	0.051920903432426765	9.536280925899905E-5
24-25	0.0010510640063980982	2.7779600958056244E-4	0.0	6.633934557147759E-5	0.05459520830077695	9.743591380810772E-5
26-27	0.0010987454110275977	2.7779600958056244E-4	0.0	6.633934557147759E-5	0.0572342703917923	9.95090183572164E-5
28-29	0.0011837426975410533	2.7779600958056244E-4	0.0	7.048555466969495E-5	0.06051392178848222	9.95090183572164E-5
30-31	0.0013226407023313345	2.7779600958056244E-4	0.0	9.12166001607817E-5	0.06379150008062304	1.0572833200454242E-4
32-33	0.001397272466099247	2.819422186787798E-4	0.0	1.0365522745543374E-4	0.06684932929055834	1.160938547500858E-4
34-35	0.001473977334416268	2.8608842777699714E-4	0.0	1.513366320849333E-4	0.07013312689634647	1.2645937749562915E-4
36-37	0.001492635275358246	2.881615323261058E-4	0.0	1.7621388667423738E-4	0.07302096153325485	1.2853248204473783E-4
38-39	0.0015071470072020067	2.9438084597343183E-4	0.0	1.907256185179981E-4	0.07575953264262741	1.3060558659384652E-4
40-41	0.0015340973663404193	2.9438084597343183E-4	0.0	1.969449321653241E-4	0.07849603064745087	1.3267869114295518E-4
42-43	0.0015444628890859628	3.0060015962075784E-4	0.0	2.0316424581265014E-4	0.08114338515666264	1.409711093393899E-4
44-45	0.0015755594573225928	3.068194732680839E-4	0.0	2.0938355945997617E-4	0.08386122522054412	1.4511731843760726E-4
46-47	0.0016253139665012013	3.068194732680839E-4	0.0	2.1560287310730218E-4	0.08764671412721656	1.4511731843760726E-4
48-49	0.0016315332801485273	3.130387869154099E-4	0.0	2.1560287310730218E-4	0.09039357765478556	1.513366320849333E-4
50-51	0.0016460450119922879	3.1718499601362724E-4	0.0	2.1560287310730218E-4	0.09335811716001095	1.575559457322593E-4
52-53	0.0016626298483851574	3.192581005627359E-4	0.0	2.1560287310730218E-4	0.09598266751918254	1.59629050281368E-4
54-55	0.0016812877893271354	3.192581005627359E-4	0.0	2.1767597765641087E-4	0.09820503559582704	1.6170215483047665E-4
56-57	0.001722749880309309	3.213312051118446E-4	0.0	2.1974908220551953E-4	0.10039630710423492	1.65848363928694E-4
58-59	0.0017683581803896997	3.275505187591706E-4	0.0	2.2596839585284557E-4	0.10241965714416498	1.679214684778027E-4
60-61	0.0018450630487067206	3.31696727857388E-4	0.0	2.321877095001716E-4	0.10436630231577802	1.6999457302691135E-4
62-63	0.0018865251396888941	3.358429369556053E-4	0.0	2.404801276966063E-4	0.1067752498018423	1.6999457302691135E-4
64-65	0.0018989637669835462	3.358429369556053E-4	0.0	2.4669944134393234E-4	0.10972320447067484	1.741407821251287E-4
66-67	0.0019093292897290897	3.462084597011487E-4	0.0	2.5291875499125835E-4	0.11254055355291354	1.741407821251287E-4
68-69	0.0019362796488675022	3.5657398244669204E-4	0.0	2.6121117318769304E-4	0.11464268156570973	1.7828699122334605E-4
70-71	0.00197152242620235	3.607201915449094E-4	0.0	2.6950359138412774E-4	0.11691687725608194	1.824332003215634E-4
72-73	0.0019984727853407627	3.607201915449094E-4	0.0	2.7157669593323643E-4	0.11890913072777537	1.886525139688894E-4
74-75	0.0020129845171845233	3.607201915449094E-4	0.0	2.8608842777699714E-4	0.12097601596323673	2.0316424581265014E-4
76-77	0.0020337155626756103	3.607201915449094E-4	0.0	2.923077414243232E-4	0.12250804022502804	2.0316424581265014E-4
78-79	0.0020503003990684793	3.627932960940181E-4	0.0	3.130387869154099E-4	0.12413335419152924	2.0938355945997617E-4
80-81	0.0020710314445595663	3.814512370359962E-4	0.0	3.151118914645186E-4	0.1257213522761465	2.1145666400908483E-4
82-83	0.0020917624900506533	3.8559744613421356E-4	0.0	3.151118914645186E-4	0.127543611174813	2.1145666400908483E-4
84-85	0.0021187128491890654	3.876705506833222E-4	0.0	3.151118914645186E-4	0.12927258036876965	2.1145666400908483E-4
86-87	0.0021788328811132174	3.9388986433064826E-4	0.0	3.1718499601362724E-4	0.13089167502162352	2.1560287310730218E-4
88-89	0.002193344612956978	3.9388986433064826E-4	0.0	3.25477414210062E-4	0.13247760000169165	2.1560287310730218E-4
90-91	0.0022161487629971735	4.042553870761916E-4	0.0	3.31696727857388E-4	0.13460875147817536	2.1560287310730218E-4
92-93	0.0022555377494302385	4.0840159617440896E-4	0.0	3.358429369556053E-4	0.13667978292273494	2.1767597765641087E-4
94-95	0.0023094384677070636	4.1047470072351765E-4	0.0	3.358429369556053E-4	0.1384833838804595	2.1974908220551953E-4
96-97	0.0023571198723365636	4.1462090982173497E-4	0.0	3.358429369556053E-4	0.14026832689724206	2.1974908220551953E-4
98-99	0.0024234592179080408	4.1669401437084366E-4	0.0	3.482815642502574E-4	0.14173815802256012	2.2389529130373688E-4
100-101	0.002578942059091192	4.2291332801816967E-4	0.0	3.482815642502574E-4	0.1432909133298425	2.2389529130373688E-4
102-103	0.002622477254622474	4.2291332801816967E-4	0.0	3.482815642502574E-4	0.1445078257001693	2.2389529130373688E-4
104-105	0.0026369889864662345	4.2291332801816967E-4	0.0	3.5242777334847477E-4	0.1456355945748844	2.2389529130373688E-4
106-107	0.002666012450153756	4.2705953711638704E-4	0.0	3.731588188395615E-4	0.1469001883498407	2.2389529130373688E-4
108-109	0.002709547645685038	4.2705953711638704E-4	0.0	4.063284916253003E-4	0.14816892833389522	2.2596839585284557E-4
110-111	0.0027510097366672116	4.3535195531282174E-4	0.0	4.063284916253003E-4	0.14937132897237826	2.2804150040195423E-4
112-113	0.0028256415004351237	4.4157126896014775E-4	0.0	4.1047470072351765E-4	0.15054677925172286	2.2804150040195423E-4
114-115	0.002856738068671754	4.4364437350925644E-4	0.0	4.1254780527262634E-4	0.15197929449515696	2.2804150040195423E-4
116-117	0.0029044194733012538	4.4364437350925644E-4	0.0	4.2291332801816967E-4	0.15317754892454177	2.2804150040195423E-4
118-119	0.0029583201915780793	4.4779058260747376E-4	0.0	4.2498643256727836E-4	0.1543364143674935	2.321877095001716E-4
120-121	0.0030619754190335125	4.5193679170569114E-4	0.0	4.3535195531282174E-4	0.15544759840581576	2.321877095001716E-4
122-123	0.0032672127693952717	4.6022920990212583E-4	0.0	4.4779058260747376E-4	0.15647793136672278	2.321877095001716E-4
124-125	0.003389525937792684	4.6022920990212583E-4	0.0	4.4779058260747376E-4	0.15777776791901393	2.321877095001716E-4
126-127	0.003439280446971292	4.643754190003432E-4	0.0	4.4779058260747376E-4	0.15915430933962207	2.3426081404928027E-4
128-129	0.003491108060699009	4.643754190003432E-4	0.0	4.4779058260747376E-4	0.16019915403237286	2.3840702314749764E-4
130-131	0.003559520510819595	4.6852162809856053E-4	0.0	4.5193679170569114E-4	0.16108436967484227	2.404801276966063E-4
132-133	0.0036196405427437466	4.726678371967779E-4	0.0	4.5193679170569114E-4	0.1618286142079723	2.404801276966063E-4
134-135	0.003683906783766115	4.8096025539321255E-4	0.0	4.5193679170569114E-4	0.16275529194142385	2.4255323224571496E-4
136-137	0.0037979275339670923	4.892526735896473E-4	0.0	4.5193679170569114E-4	0.163750382124996	2.4462633679482365E-4
138-139	0.0038062199521635273	4.933988826878647E-4	0.0	4.5193679170569114E-4	0.16462523224471987	2.4462633679482365E-4
>>END_MODULE
