##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	T3.1uM.3.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24141884
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	43
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.7634688328384	37.0	35.0	38.0	32.0	39.0
2	35.275448635243215	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
3	35.478896717422714	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
4	35.47677691600208	36.0	35.0	38.0	32.0	39.0
5	35.39217925162759	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
6	35.287627137964876	36.0	35.0	37.0	33.0	39.0
7	35.15157976071793	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
8	35.32419669483956	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
9	35.29226882210187	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
10-14	35.33159656470887	35.8	34.2	37.4	33.0	39.0
15-19	35.31261324923937	36.0	34.0	37.0	33.0	39.0
20-24	35.3166579211465	36.0	34.0	37.0	33.0	39.0
25-29	35.305823456031845	36.0	34.0	37.0	33.0	39.0
30-34	35.281927715334895	36.0	34.0	37.0	32.2	39.0
35-39	35.25393598113553	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
40-44	35.234382088821235	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
45-49	35.22047569278355	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
50-54	35.19411812267841	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
55-59	35.169335052724136	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
60-64	35.15031578314269	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
65-69	35.11427920869804	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
70-74	35.10243525318902	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
75-79	35.0706771849289	35.4	34.0	37.0	32.0	39.0
80-84	35.048877179593774	35.4	34.0	37.0	32.0	39.0
85-89	35.017662962840845	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
90-94	34.985975386179476	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
95-99	34.95023532546176	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
100-104	34.91942575815541	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
105-109	34.89230764260155	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
110-114	34.84572981959486	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
115-119	34.81812661348219	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
120-124	34.77730003176223	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
125-129	34.730275284232164	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
130-134	34.69091644214677	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
135-139	34.645684355040395	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
140-144	34.59221330033729	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.55241704417104	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	34.51917758365503	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	3.0
22	88.0
23	991.0
24	7137.0
25	32720.0
26	98859.0
27	215079.0
28	354169.0
29	489470.0
30	643176.0
31	851813.0
32	1161898.0
33	1651278.0
34	2534363.0
35	4505018.0
36	1.0470174E7
37	1125623.0
38	25.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.03351915967568	12.448934483704765	15.305786674054211	36.21175968256535
2	23.040366528767155	12.146273337283892	33.310262634821505	31.503097499127446
3	21.659057222580454	15.972331041490802	27.46991710736658	34.89869462856216
4	24.78980880849746	22.753209165663527	22.452720935976743	30.004261089862272
5	25.14409807719973	29.70318142657376	24.374314387000727	20.778406109225784
6	19.440613943817585	37.32274122761508	25.154780599403864	18.081864229163475
7	15.088728094572717	26.899771710142588	39.71346729558183	18.298032899702864
8	17.285841149567467	26.852541413645355	31.68226765418451	24.17934978260267
9	18.068331295639954	24.838801581132973	33.05440765587277	24.038459467354294
10-14	19.00151286857863	30.888334101189084	27.611124047701193	22.499028982531097
15-19	19.267808642954094	29.15231433813899	28.441141526940957	23.13873549196596
20-24	19.325896040758813	29.310490276049755	28.099174217840833	23.264439465350602
25-29	19.476282293914444	29.337280038590784	27.923718983541995	23.26271868395278
30-34	19.364802774250332	29.316308103590742	27.897893622356072	23.420995499802856
35-39	19.439489598213992	29.09998859902571	28.04171275340554	23.418809049354753
40-44	19.424954799863364	29.186077598239585	27.996494452840604	23.392473149056446
45-49	19.533071940422513	29.00599321264749	28.00394379166542	23.456991055264577
50-54	19.509529471462915	29.101720310947872	27.99204016982712	23.396710047762095
55-59	19.596671192618132	29.038157426745535	27.95678455180045	23.408386828835884
60-64	19.61923025881748	28.929386022608618	27.90043559177994	23.550948126793966
65-69	19.611389530920853	28.866883496861462	28.047488640944803	23.474238331272886
70-74	19.702707586672087	28.834975544511266	28.001237816773738	23.46107905204291
75-79	19.571414912864178	28.876952230142074	28.012842402152422	23.53879045484133
80-84	19.773427523428463	28.72233791700969	27.911708193380786	23.592526366181062
85-89	19.73636282140697	28.757687973466073	28.030257623135796	23.47569158199116
90-94	19.88088856076913	28.665751746926105	27.945993694786413	23.507365997518352
95-99	19.890623215625933	28.681119924890652	27.962653595709597	23.465603263773822
100-104	19.949963436545985	28.567982512768335	27.97065088482101	23.51140316586467
105-109	19.874476410314923	28.530270290855807	28.037023968906183	23.55822932992309
110-114	19.93154747503286	28.586708604096323	27.93395802560552	23.5477858952653
115-119	20.002273396348436	28.526308469580265	28.005134717746273	23.46628341632503
120-124	20.03578897463377	28.376482556323236	28.094891027482387	23.492837441560603
125-129	20.124380316968473	28.35820543127699	28.04644981266231	23.470964439092228
130-134	20.02971436458145	28.482459449373803	28.018467012005992	23.46935917403875
135-139	20.10226213419564	28.340645231370775	28.034915417711836	23.522177216721747
140-144	20.192703674418723	28.25472320093152	28.104875270556118	23.44769785409364
145-149	20.189686622579536	28.593560017490947	27.965697888256386	23.251055471673133
150	20.15046890536419	28.444513296715062	27.784104500625777	23.62091329729497
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.5
3	1.0
4	0.5
5	0.5
6	1.0
7	5.5
8	12.5
9	18.5
10	24.5
11	46.0
12	88.0
13	146.0
14	270.5
15	446.5
16	800.0
17	1427.0
18	2739.0
19	5065.0
20	6574.5
21	8465.0
22	12282.5
23	17830.5
24	26453.0
25	37386.0
26	50756.5
27	69332.5
28	95632.5
29	131146.0
30	175127.5
31	225878.5
32	280468.0
33	341482.0
34	413570.5
35	500011.5
36	600450.5
37	714659.5
38	841487.5
39	982821.0
40	1133910.0
41	1281624.0
42	1415070.0
43	1523029.0
44	1599823.0
45	1627974.5
46	1583633.5
47	1489520.0
48	1346596.0
49	1164610.5
50	980897.0
51	801035.0
52	638365.5
53	509012.0
54	409587.5
55	318321.5
56	236539.0
57	167542.0
58	112291.0
59	74642.0
60	52602.5
61	39542.5
62	28868.0
63	19694.5
64	12895.5
65	8496.0
66	5716.5
67	3886.5
68	2492.5
69	1698.5
70	1592.0
71	1931.5
72	2067.5
73	1509.0
74	929.5
75	570.5
76	273.5
77	108.0
78	35.0
79	10.0
80	4.5
81	5.0
82	4.0
83	3.5
84	3.5
85	2.5
86	1.0
87	1.0
88	0.5
89	0.0
90	0.5
91	0.5
92	0.0
93	0.5
94	1.5
95	1.0
96	0.5
97	1.5
98	1.0
99	0.5
100	0.5
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0014414782210037957
2	6.213268193981878E-4
3	7.165969317059099E-4
4	7.165969317059099E-4
5	6.917438589299825E-4
6	5.426254222744174E-4
7	8.574310107694992E-4
8	5.923315678262724E-4
9	8.61573189565487E-4
10-14	8.151807870504224E-4
15-19	6.494936352109056E-4
20-24	5.873609532710868E-4
25-29	6.652339146356597E-4
30-34	4.0261977897002575E-4
35-39	3.6285486252854166E-4
40-44	1.33378157230811E-4
45-49	1.6900089487630708E-4
50-54	2.584719568696461E-4
55-59	3.007221805887229E-4
60-64	2.4935916351847274E-4
65-69	1.7977055974587568E-4
70-74	9.69269838261173E-5
75-79	1.880549173378515E-4
80-84	4.4735530996669524E-5
85-89	2.2284921922415002E-4
90-94	8.864262623414146E-5
95-99	6.213268193981878E-5
100-104	7.538765408698012E-5
105-109	1.3006441419402065E-4
110-114	5.5505195866238116E-5
115-119	1.2923597843482305E-4
120-124	1.474615651371699E-4
125-129	1.0603977717729074E-4
130-134	1.0355446989969796E-4
135-139	1.8556961006025875E-4
140-144	0.029614921519795223
145-149	9.69269838261173E-5
150	7.870139712377045E-5
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4141884E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	50.737624900957734
#Duplication Level	Percentage of total
1	38.73721943937745
2	11.735318704839862
3	6.694520857049212
4	4.479579952757405
5	3.191811442949641
6	2.5970415000595923
7	2.1695964175456024
8	1.7665397109664491
9	1.5011900673811247
>10	16.552128516139483
>50	4.2694331728607855
>100	5.167931234106811
>500	0.7681837410401229
>1k	0.34819481954845133
>5k	0.021310423377959437
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	0.0	4.142178795987918E-6	1.2426536387963757E-5	6.213268193981878E-5	1.2012318508364965E-4
2	4.142178795987918E-6	0.0	4.142178795987918E-6	2.4853072775927514E-5	0.0011308148113047018	3.976491644148402E-4
3	8.284357591975837E-6	0.0	4.142178795987918E-6	2.4853072775927514E-5	0.002087658113177911	5.757628526423207E-4
4	1.6568715183951674E-5	0.0	4.142178795987918E-6	2.4853072775927514E-5	0.0033303117519742865	6.586064285620791E-4
5	2.0710893979939592E-5	0.0	4.142178795987918E-6	2.8995251571915432E-5	0.004838064833713889	6.876016801339945E-4
6	2.8995251571915432E-5	0.0	4.142178795987918E-6	2.8995251571915432E-5	0.0059316000358547	7.165969317059099E-4
7	3.313743036790335E-5	0.0	4.142178795987918E-6	3.7279609163891266E-5	0.007049988310771437	7.414500044818375E-4
8	3.313743036790335E-5	0.0	4.142178795987918E-6	3.7279609163891266E-5	0.008773134689902411	7.952983288296804E-4
9	3.313743036790335E-5	0.0	4.142178795987918E-6	3.7279609163891266E-5	0.011506972695254438	9.029949775253663E-4
10-11	4.1421787959879184E-5	0.0	4.142178795987918E-6	3.7279609163891266E-5	0.01575477705054005	0.0010003361792310823
12-13	4.3492877357873143E-5	0.0	4.142178795987918E-6	3.7279609163891266E-5	0.019051951372146433	0.0011390991688966776
14-15	5.177723494984899E-5	0.0	4.142178795987918E-6	3.9350698561885225E-5	0.022767485752147595	0.001267506711572303
16-17	5.7990503143830865E-5	0.0	4.142178795987918E-6	5.177723494984899E-5	0.026031522643386075	0.0013586346450840375
18-19	7.041703953179461E-5	0.0	6.213268193981878E-6	5.7990503143830865E-5	0.029028389002283335	0.0014539047573917596
20-21	8.284357591975837E-5	0.0	8.284357591975837E-6	7.041703953179461E-5	0.03189270563970898	0.0015367483333115178
22-23	8.69857547157463E-5	0.0	8.284357591975837E-6	7.870139712377045E-5	0.03451056263877335	0.0016175208198332823
24-25	8.905684411374026E-5	0.0	8.284357591975837E-6	8.284357591975837E-5	0.036985514469376125	0.0017127909321410044
26-27	9.112793351173422E-5	0.0	8.284357591975837E-6	8.491466531775234E-5	0.03995545666609947	0.0018101321338467205
28-29	9.319902290972818E-5	0.0	8.284357591975837E-6	8.69857547157463E-5	0.04310765472984627	0.001892975709766479
30-31	9.527011230772214E-5	0.0	8.284357591975837E-6	9.319902290972818E-5	0.04674241662332567	0.001975819285686237
32-33	9.527011230772214E-5	0.0	8.284357591975837E-6	1.0769664869568589E-4	0.04982626873693868	0.0020731604873919533
34-35	1.0148338050170401E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.0769664869568589E-4	0.05271336735774225	0.0022222789240475185
36-37	1.0355446989969797E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.0769664869568589E-4	0.0557143758954355	0.002303051410569283
38-39	1.0355446989969797E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.2633645327763153E-4	0.05853519965550327	0.0023651840925091013
40-41	1.0355446989969797E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.2840754267562547E-4	0.0615072129416246	0.002506018171572691
42-43	1.0562555929769193E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.325497214716134E-4	0.06436738740025427	0.002590932836890443
44-45	1.0769664869568589E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.325497214716134E-4	0.06727933909383377	0.0026820607704021774
46-47	1.1183882749167381E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.325497214716134E-4	0.07021200168139322	0.002754548899331966
48-49	1.1390991688966777E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.325497214716134E-4	0.07375149346256489	0.002808397223679809
50-51	1.1805209568565569E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.325497214716134E-4	0.07648533146791692	0.0028788142632116035
52-53	1.2426536387963755E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.325497214716134E-4	0.07912182827156322	0.00294508912394741
54-55	1.2426536387963755E-4	0.0	8.284357591975837E-6	1.3462081086960736E-4	0.08174796962821956	0.003005150716489235
56-57	1.2426536387963755E-4	0.0	1.2426536387963757E-5	1.4911843665556506E-4	0.08460193081865525	0.003063141219633066
58-59	1.2426536387963755E-4	2.071089397993959E-6	1.2426536387963757E-5	1.5326061545155298E-4	0.08711002007962593	0.0031418426167568363
60-61	1.2426536387963755E-4	4.142178795987918E-6	1.2426536387963757E-5	1.5533170484954693E-4	0.08967609984374045	0.0032557525336465044
62-63	1.2426536387963755E-4	4.142178795987918E-6	1.2426536387963757E-5	1.574027942475409E-4	0.09202885739986158	0.003357235914148208
64-65	1.366919002676013E-4	4.142178795987918E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.09460943478976205	0.003450434937057936
66-67	1.429051684615832E-4	4.142178795987918E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.09728735338136825	0.0035084254402017673
68-69	1.5326061545155298E-4	6.213268193981878E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.09977266065896101	0.0035829846585295495
70-71	1.5533170484954693E-4	8.284357591975837E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.10212127603628615	0.0036368329828773928
72-73	1.7604259882948655E-4	8.284357591975837E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.10418408107668814	0.0037093211118071814
74-75	1.8846913521745033E-4	8.284357591975837E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.1065575495267892	0.0037548850785630483
76-77	1.946824034114322E-4	8.284357591975837E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.10915469563187363	0.0037921646877269394
78-79	2.0710893979939595E-4	8.284357591975837E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.11169385123381423	0.0038460130120747827
80-81	2.0710893979939595E-4	8.284357591975837E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.11413980781284509	0.00391228787281059
82-83	2.091800291973899E-4	8.284357591975837E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.11646149902799632	0.003947496392576487
84-85	2.1746438678936573E-4	8.284357591975837E-6	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.11871277320361576	0.004026197789700257
86-87	2.2781983377933554E-4	1.2426536387963757E-5	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.12139069179522194	0.004104899186824027
88-89	2.2781983377933554E-4	1.4497625785957714E-5	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.12371859627856716	0.004135965527793937
90-91	2.3196201257532346E-4	1.6568715183951674E-5	1.2426536387963757E-5	1.6154497304352882E-4	0.1263468087246215	0.004175316226355822
92-93	2.3196201257532346E-4	1.6568715183951674E-5	1.4497625785957714E-5	1.6154497304352882E-4	0.12830813038452177	0.00425815980227558
94-95	2.3196201257532346E-4	1.6568715183951674E-5	1.6568715183951674E-5	1.6154497304352882E-4	0.13003127676365275	0.004349287735787315
96-97	2.3196201257532346E-4	1.6568715183951674E-5	1.6568715183951674E-5	1.677582412375107E-4	0.13184969325509144	0.004394851702543182
98-99	2.3196201257532346E-4	1.6568715183951674E-5	1.6568715183951674E-5	1.7811368822748052E-4	0.1335852661706104	0.004438344579901055
100-101	2.3196201257532346E-4	1.6568715183951674E-5	1.6568715183951674E-5	1.8225586702346844E-4	0.13551137931074475	0.004469410920870965
102-103	2.3817528076930535E-4	1.6568715183951674E-5	1.6568715183951674E-5	1.8432695642146238E-4	0.13728837401422356	0.004504619440636862
104-105	2.402463701672993E-4	1.6568715183951674E-5	1.6568715183951674E-5	1.8639804581945636E-4	0.13887068631429095	0.004537756871004765
106-107	2.402463701672993E-4	1.6568715183951674E-5	2.0710893979939592E-5	1.8846913521745033E-4	0.1405420554584721	0.004550183407392728
108-109	2.402463701672993E-4	1.8639804581945633E-5	2.0710893979939592E-5	2.05037850401402E-4	0.14268977516419185	0.004587463016556621
110-111	2.464596383612812E-4	2.0710893979939592E-5	2.0710893979939592E-5	2.1125111859538387E-4	0.1448312816017176	0.004653737877292426
112-113	2.5267290655526305E-4	2.0710893979939592E-5	2.0710893979939592E-5	2.1746438678936573E-4	0.14666212462954425	0.004728297095620209
114-115	2.5267290655526305E-4	2.0710893979939592E-5	2.0710893979939592E-5	2.195354761873597E-4	0.14820508623104972	0.004784216509366046
116-117	2.5267290655526305E-4	2.0710893979939592E-5	2.0710893979939592E-5	2.195354761873597E-4	0.1496921284188094	0.004815282850335955
118-119	2.56815085351251E-4	2.0710893979939592E-5	2.0710893979939592E-5	2.2367765498334762E-4	0.15131379141743867	0.004838064833713889
120-121	2.630283535452328E-4	2.0710893979939592E-5	2.0710893979939592E-5	2.2781983377933554E-4	0.15280911796279031	0.004867060085285805
122-123	2.650994429432268E-4	2.0710893979939592E-5	2.0710893979939592E-5	2.3196201257532346E-4	0.15463167663302502	0.004933334946021611
124-125	2.6717053234122075E-4	2.0710893979939592E-5	2.0710893979939592E-5	2.3196201257532346E-4	0.15604415960245688	0.0049747567339814905
126-127	2.713127111372087E-4	2.0710893979939592E-5	2.0710893979939592E-5	2.402463701672993E-4	0.15748770891285868	0.005007894164349394
128-129	2.858103369231664E-4	2.4853072775927514E-5	2.0710893979939592E-5	2.4231745956529324E-4	0.15922328182837758	0.005038960505319302
130-131	2.982368733111301E-4	2.4853072775927514E-5	2.0710893979939592E-5	2.443885489632872E-4	0.16070618183734128	0.00506381357809523
132-133	3.0237905210711807E-4	2.4853072775927514E-5	2.0710893979939592E-5	2.443885489632872E-4	0.16198611508530153	0.0050741690250852
134-135	3.06521230903106E-4	2.4853072775927514E-5	2.0710893979939592E-5	2.443885489632872E-4	0.16347937054125516	0.005086595561473164
136-137	3.106634096990939E-4	2.4853072775927514E-5	2.0710893979939592E-5	2.4645963836128113E-4	0.1654034125919916	0.005111448634249092
138-139	3.106634096990939E-4	2.4853072775927514E-5	2.0710893979939592E-5	2.5267290655526305E-4	0.16689252586914924	0.005157012601004958
>>END_MODULE
