##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	T3.10uM.1.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24077269
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	66-150
%GC	43
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	36.0743041081611	37.0	35.0	38.0	33.0	39.0
2	35.268832150357255	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
3	35.46844640062791	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
4	35.47156623120338	36.0	35.0	38.0	32.0	39.0
5	35.38185497699095	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
6	35.28366144848072	36.0	35.0	37.0	33.0	39.0
7	35.14661957716218	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
8	35.31823376646247	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
9	35.28712334442914	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
10-14	35.32451697906436	35.8	34.2	37.4	33.0	39.0
15-19	35.30307853436368	36.0	34.0	37.0	33.0	39.0
20-24	35.305768897627054	36.0	34.0	37.0	33.0	39.0
25-29	35.29349142546025	36.0	34.0	37.0	32.6	39.0
30-34	35.26946174003373	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
35-39	35.23922905874416	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
40-44	35.22109679465723	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
45-49	35.2050581151874	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
50-54	35.17990130857449	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
55-59	35.15569148643893	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
60-64	35.13730347075493	36.0	34.0	37.0	32.0	39.0
65-69	35.10249812521742	35.8	34.0	37.0	32.0	39.0
70-74	35.091413265898424	35.8	34.0	37.0	32.0	39.0
75-79	35.06124493333775	35.2	34.0	37.0	32.0	39.0
80-84	35.04042631593332	35.4	34.0	37.0	32.0	39.0
85-89	35.011152595374305	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
90-94	34.982330202754454	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
95-99	34.94545471698841	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
100-104	34.91955492581301	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
105-109	34.892927035782996	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
110-114	34.851589642138265	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
115-119	34.82522373859043	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
120-124	34.78760092660149	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
125-129	34.74426640668399	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
130-134	34.710102336139684	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
135-139	34.6692708653747	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
140-144	34.62090140415687	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
145-149	34.62822209656156	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
150	35.27034168046365	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	1.0
22	46.0
23	767.0
24	6506.0
25	31978.0
26	100365.0
27	219326.0
28	361932.0
29	497498.0
30	645617.0
31	847561.0
32	1144934.0
33	1623764.0
34	2483019.0
35	4453905.0
36	1.0477796E7
37	1182230.0
38	24.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.843325918732724	12.33102475201818	15.06548770128373	36.76016162796537
2	22.47283275483201	12.672688584980719	34.05659289660291	30.79788576358437
3	21.253802053883692	16.732712777334896	27.537942871734067	34.47554229704735
4	24.495769001697052	23.858839077528568	22.41163995936381	29.23375196141057
5	24.548288128538914	30.666858162366452	24.402269888573507	20.382583820521127
6	18.94347309252053	37.49889781403972	25.479677767550008	18.077951325889735
7	15.028655847815623	26.48565380147368	39.84036290069697	18.645327450013728
8	17.285689116572254	26.53396160385083	31.792675879347936	24.387673400228984
9	18.022108336096682	24.89148597470656	32.931354776029245	24.155050913167514
10-14	19.081949591018418	30.78675455685762	27.50469550403516	22.6266003480888
15-19	19.30378286601198	29.123262483898095	28.41454136012558	23.15841328996435
20-24	19.342271145572315	29.258714950058806	28.077443292739613	23.321570611629273
25-29	19.52477440842159	29.290339321491913	27.887744068267107	23.297142201819394
30-34	19.362594520196016	29.252088068245065	27.855143880955108	23.53017353060381
35-39	19.46290659885674	29.05232002474974	28.048683502955335	23.436089873438185
40-44	19.432209538755547	29.161599883282307	27.962415162727073	23.44377541523507
45-49	19.596274610921355	28.972058468825196	27.978532943539836	23.453133976713612
50-54	19.55454538718642	29.091661186244007	27.94670251443996	23.407090912129615
55-59	19.635160648119367	28.98418513412842	27.91478561970659	23.465868598045624
60-64	19.638208957157957	28.911787257104884	27.854306891748642	23.595696893988517
65-69	19.621993613269538	28.790969813001855	28.032859456352654	23.55417711737595
70-74	19.688503234581006	28.786634610507683	27.998372504841214	23.5264896500701
75-79	19.539995906004364	28.816587475465077	28.02119222126874	23.622224397261814
80-84	19.79384871787935	28.658379433425583	27.867512929674238	23.68025891902083
85-89	19.72465518372944	28.700066726400813	28.023620559440012	23.551657530429733
90-94	19.907893112343878	28.582188542192316	27.94466413110346	23.56525421436035
95-99	19.935008151704675	28.619875546244955	27.951513679868583	23.493602622181786
100-104	19.977662254551447	28.48079905847703	27.93521264676408	23.606326040207442
105-109	19.910847397051878	28.49239577661139	28.0019369248254	23.59481990151133
110-114	19.97795691820973	28.536774585377856	27.892938297330556	23.59233019908186
115-119	20.057111789346422	28.478745676536484	27.97325742906119	23.490885105055906
120-124	20.060437192770674	28.304724257166704	28.10512636045551	23.52971218960711
125-129	20.160365470177265	28.341900691680582	27.982295272483963	23.515438565658183
130-134	20.0659432514004	28.458087751379956	27.93185581015359	23.544113187066053
135-139	20.133539628013924	28.33187312797389	27.947170811892512	23.587416432119674
140-144	20.230318266519156	28.233322821861538	28.041243670528814	23.495115241090488
145-149	19.901068974477976	28.16225047556607	28.345892931025034	23.590787618930918
150	20.30210053506546	27.150727487541776	28.361655267765894	24.18551670962687
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.5
3	0.5
4	1.0
5	3.5
6	3.5
7	5.0
8	12.0
9	17.0
10	26.5
11	55.0
12	103.0
13	186.0
14	302.5
15	464.0
16	876.5
17	1654.0
18	3459.0
19	6585.5
20	8051.5
21	9733.0
22	13922.5
23	19935.5
24	29287.0
25	41340.0
26	54907.0
27	73452.0
28	100633.5
29	137098.0
30	180867.5
31	232642.0
32	287307.0
33	345210.5
34	414771.0
35	499152.5
36	594707.0
37	703270.5
38	825632.5
39	962106.5
40	1106867.0
41	1249254.5
42	1383361.5
43	1493799.5
44	1575607.5
45	1610427.5
46	1569498.0
47	1476830.5
48	1337064.5
49	1163958.0
50	983594.5
51	808177.0
52	653582.5
53	527025.0
54	433279.0
55	343260.5
56	256752.5
57	181275.5
58	118219.0
59	75477.5
60	52005.0
61	39454.0
62	29272.5
63	19420.0
64	12234.5
65	8221.5
66	5467.0
67	3684.5
68	2325.5
69	1503.5
70	1480.5
71	1907.5
72	2042.5
73	1432.0
74	826.0
75	497.5
76	250.5
77	110.0
78	36.5
79	15.0
80	4.5
81	1.5
82	4.0
83	5.5
84	5.5
85	4.0
86	2.0
87	1.0
88	0.5
89	0.0
90	0.0
91	0.5
92	1.0
93	0.5
94	0.5
95	0.5
96	0.5
97	0.5
98	0.5
99	0.5
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	4.6932233053507857E-4
3	6.271475390336005E-4
4	8.680386467418709E-4
5	5.814612944682389E-4
6	4.817822154165408E-4
7	6.603738987174998E-4
8	6.936002584013992E-4
9	8.181991072160218E-4
10-14	8.082311993108521E-4
15-19	6.396074239150628E-4
20-24	5.465736168001446E-4
25-29	7.201813461485188E-4
30-34	3.5967534357821064E-4
35-39	3.580140255940157E-4
40-44	1.1463094090945281E-4
45-49	1.727770703562767E-4
50-54	2.1015672500066348E-4
55-59	3.098358040523616E-4
60-64	2.3258451778729558E-4
65-69	1.4204269590790278E-4
70-74	8.057393695793832E-5
75-79	1.7194652419903113E-4
80-84	6.229953463410554E-5
85-89	2.0434290304097876E-4
90-94	6.811455336128584E-5
95-99	5.897759089948195E-5
100-104	7.89142889064577E-5
105-109	1.2127986273644817E-4
110-114	6.313256651078184E-5
115-119	1.354043137920375E-4
120-124	1.4620526842543794E-4
125-129	8.971830694576703E-5
130-134	1.0384282244060339E-4
135-139	2.533870390901182E-4
140-144	0.029367968934136672
145-149	8.006617545253319E-5
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
66-67	2.0
68-69	1.0
70-71	1.0
72-73	2.0
74-75	7.0
76-77	5.0
78-79	13.0
80-81	11.0
82-83	17.0
84-85	15.0
86-87	32.0
88-89	35.0
90-91	33.0
92-93	57.0
94-95	57.0
96-97	76.0
98-99	78.0
100-101	72.0
102-103	77.0
104-105	95.0
106-107	77.0
108-109	91.0
110-111	90.0
112-113	111.0
114-115	111.0
116-117	122.0
118-119	119.0
120-121	119.0
122-123	132.0
124-125	169.0
126-127	174.0
128-129	174.0
130-131	233.0
132-133	283.0
134-135	373.0
136-137	594.0
138-139	1413.0
140-141	3401.0
142-143	5321.0
144-145	46677.0
146-147	604886.0
148-149	938401.0
150-151	2.2473512E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	48.61018317430293
#Duplication Level	Percentage of total
1	37.149207223176376
2	11.043773888961363
3	6.3196160346031105
4	4.411208247021044
5	3.2380174504637753
6	2.5254657969543373
7	2.037468561321807
8	1.702956774227545
9	1.381296621499622
>10	16.415365794732892
>50	4.441139547233364
>100	6.771939345579256
>500	1.4556844204628212
>1k	1.0852271530599173
>5k	0.021633140702711943
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	0.0	0.0	2.0766474802437104E-5	1.1629225889364778E-4	1.3705873369608489E-4
2	0.0	4.153294960487421E-6	0.0	2.4919769762924524E-5	0.0015034927756964462	3.5718336660191816E-4
3	1.6613179841949684E-5	4.153294960487421E-6	0.0	2.9073064723411944E-5	0.002732868084000723	4.983953952584904E-4
4	1.6613179841949684E-5	4.153294960487421E-6	0.0	3.7379654644386784E-5	0.004340193233709355	6.229942440731132E-4
5	1.6613179841949684E-5	4.153294960487421E-6	0.0	3.7379654644386784E-5	0.006188409491126257	6.686804886384748E-4
6	1.6613179841949684E-5	4.153294960487421E-6	0.0	3.7379654644386784E-5	0.007210120051406163	6.936002584013993E-4
7	1.6613179841949684E-5	4.153294960487421E-6	0.0	3.7379654644386784E-5	0.008360582755461178	7.143667332038363E-4
8	1.6613179841949684E-5	4.153294960487421E-6	0.0	3.7379654644386784E-5	0.010084200164063457	7.683595676901728E-4
9	2.0766474802437104E-5	4.153294960487421E-6	0.0	3.7379654644386784E-5	0.013440062492137294	8.472721719394339E-4
10-11	2.0766474802437104E-5	4.153294960487421E-6	0.0	3.7379654644386784E-5	0.017828018617892252	9.594111358725942E-4
12-13	2.0766474802437104E-5	4.153294960487421E-6	0.0	4.153294960487421E-5	0.021283560025017786	0.001090239927127948
14-15	2.0766474802437104E-5	4.153294960487421E-6	0.0	4.153294960487421E-5	0.02511289797858719	0.0012003022435808646
16-17	2.2843122282680812E-5	4.153294960487421E-6	0.0	5.191618700609276E-5	0.028609972335317597	0.0013103645600337811
18-19	3.737965464438679E-5	4.153294960487421E-6	0.0	5.399283448633647E-5	0.031540121929941475	0.0014079669916052355
20-21	4.568624456536163E-5	4.153294960487421E-6	0.0	6.22994244073113E-5	0.0346197901431429	0.001499339480735959
22-23	5.191618700609276E-5	4.153294960487421E-6	0.0	6.22994244073113E-5	0.03745856724863605	0.0016010952072679006
24-25	5.814612944682389E-5	4.153294960487421E-6	0.0	6.22994244073113E-5	0.040041916714059225	0.001727770703562767
26-27	5.814612944682389E-5	4.153294960487421E-6	0.0	6.22994244073113E-5	0.04357637072543402	0.0018129132502527593
28-29	6.0222776927067596E-5	4.153294960487421E-6	0.0	6.437607188755501E-5	0.047108748089328564	0.0018669060847390957
30-31	6.22994244073113E-5	4.153294960487421E-6	0.0	6.852936684804244E-5	0.050738727884794575	0.0019333588041068944
32-33	6.437607188755501E-5	4.153294960487421E-6	0.0	8.306589920974841E-5	0.053901461997205746	0.002055881005441273
34-35	7.475930928877357E-5	4.153294960487421E-6	0.0	8.721919417023583E-5	0.057381923174094206	0.002180479854255896
36-37	7.475930928877357E-5	4.153294960487421E-6	2.0766474802437105E-6	8.721919417023583E-5	0.060330762596040276	0.00223862598370272
38-39	7.475930928877357E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	8.721919417023583E-5	0.06332321161507146	0.002300925408110031
40-41	7.475930928877357E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	8.721919417023583E-5	0.06643610618795678	0.0023694547749580734
42-43	7.475930928877357E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	9.760243157145439E-5	0.06930395635817335	0.002437984141806116
44-45	7.475930928877357E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	9.96790790516981E-5	0.07220710953555405	0.002523126688496108
46-47	7.683595676901729E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	1.0383237401218551E-4	0.07515179566253963	0.002616575825107075
48-49	7.8912604249261E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	1.0798566897267294E-4	0.07913065223468657	0.0026851051919551177
50-51	8.514254668999212E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	1.204455538541352E-4	0.08218332403064484	0.002724561494079748
52-53	9.137248913072326E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	1.204455538541352E-4	0.08489957893480361	0.002788937565967303
54-55	9.137248913072326E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	1.204455538541352E-4	0.08771343627053384	0.002845007047933883
56-57	9.137248913072326E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	1.3290543873559747E-4	0.09074118829672917	0.0028927699399794882
58-59	9.137248913072326E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	1.3290543873559747E-4	0.09313140954648969	0.0029799891341497245
60-61	9.137248913072326E-5	4.153294960487421E-6	4.153294960487421E-6	1.3290543873559747E-4	0.09565453623498579	0.003052671795958254
62-63	9.344913661096697E-5	6.229942440731132E-6	4.153294960487421E-6	1.3290543873559747E-4	0.09814858985875849	0.003154427522490196
64-65	9.760243157145439E-5	8.306589920974842E-6	4.153294960487421E-6	1.3290543873559747E-4	0.10080254533850994	0.0032354167742197006
66-67	9.96790790516981E-5	8.306589920974842E-6	4.153294960487421E-6	1.3290543873559747E-4	0.10336720497661092	0.0032873329612257934
68-69	1.017557265319418E-4	8.306589920974842E-6	4.153294960487421E-6	1.3498208621584118E-4	0.10577196275873314	0.0033683222129552983
70-71	1.1213896393316036E-4	8.306589920974842E-6	4.153294960487421E-6	1.43288676136816E-4	0.10805835163448146	0.00341400845752066
72-73	1.3290543873559744E-4	8.306589920974842E-6	4.153294960487421E-6	1.4536532361705972E-4	0.11012461587732396	0.0035178408315328456
74-75	1.4536532361705972E-4	8.306589920974842E-6	4.153294960487421E-6	1.4536532361705972E-4	0.11248991735732156	0.0035926001408216187
76-77	1.5367191353803458E-4	1.2459884881462262E-5	4.153294960487421E-6	1.4536532361705972E-4	0.11516879260683593	0.003663206155149905
78-79	1.5367191353803458E-4	1.6613179841949684E-5	4.153294960487421E-6	1.4536532361705972E-4	0.11779990496430472	0.0037026624572745357
80-81	1.57825208498522E-4	1.6613179841949684E-5	4.153294960487421E-6	1.4536532361705972E-4	0.12064075871727811	0.0037483487018398973
82-83	1.619785034590094E-4	1.6613179841949684E-5	4.153294960487421E-6	1.4536532361705972E-4	0.12320957165033958	0.003758731939241116
84-85	1.6405515093925312E-4	2.0766474802437104E-5	4.153294960487421E-6	1.4951861857754714E-4	0.12593828643937982	0.0037878050039645275
86-87	1.6613179841949683E-4	2.0766474802437104E-5	4.153294960487421E-6	1.4951861857754714E-4	0.1291300936165144	0.003854257723332326
88-89	1.7028509337998425E-4	2.0766474802437104E-5	4.153294960487421E-6	1.4951861857754714E-4	0.13176951256390415	0.003910327205298906
90-91	1.7651503582071537E-4	2.0766474802437104E-5	4.153294960487421E-6	1.4951861857754714E-4	0.1342282631805127	0.003949783507423537
92-93	1.8689827322193394E-4	2.0766474802437104E-5	8.306589920974842E-6	1.4951861857754714E-4	0.13648142569657712	0.0040224661692320664
94-95	1.9105156818242136E-4	2.0766474802437104E-5	8.306589920974842E-6	1.4951861857754714E-4	0.1384085545582433	0.004072305708757916
96-97	1.9520486314290877E-4	2.0766474802437104E-5	8.306589920974842E-6	1.4951861857754714E-4	0.14037513972203408	0.004101378773481328
98-99	1.993581581033962E-4	2.9073064723411944E-5	8.306589920974842E-6	1.4951861857754714E-4	0.1421444433752017	0.004149141665526933
100-101	1.993581581033962E-4	2.9073064723411944E-5	8.306589920974842E-6	1.5159526605779084E-4	0.14405080576206547	0.004180291377730589
102-103	1.993581581033962E-4	2.9073064723411944E-5	8.306589920974842E-6	1.5367191353803458E-4	0.14594055496908725	0.004240514154657657
104-105	1.993581581033962E-4	3.114971220365565E-5	8.306589920974842E-6	1.5367191353803458E-4	0.14754788011879585	0.0042986602841044805
106-107	1.993581581033962E-4	3.322635968389937E-5	8.306589920974842E-6	1.6820844589974054E-4	0.14933172030432523	0.004350576471110573
108-109	2.035114530638836E-4	3.322635968389937E-5	8.306589920974842E-6	1.9935815810339622E-4	0.15136060489252331	0.004390032773235204
110-111	2.035114530638836E-4	3.322635968389937E-5	8.306589920974842E-6	2.1597133794534588E-4	0.15350993503457555	0.004446102255201784
112-113	2.035114530638836E-4	3.322635968389937E-5	8.306589920974842E-6	2.2427792786632072E-4	0.15531454169490733	0.004487635204806658
114-115	2.035114530638836E-4	3.322635968389937E-5	1.2459884881462262E-5	2.2635457534656443E-4	0.15689902372233328	0.004514631622049826
116-117	2.0766474802437102E-4	3.322635968389937E-5	1.2459884881462262E-5	2.2843122282680813E-4	0.15847727580731852	0.0045312448018917754
118-119	2.0766474802437102E-4	3.322635968389937E-5	1.2459884881462262E-5	2.3881446022802668E-4	0.16016143691379617	0.00457277775149665
120-121	2.0974139550461473E-4	3.322635968389937E-5	1.2459884881462262E-5	2.554276400699764E-4	0.1618310614879121	0.004618463996062012
122-123	2.1597133794534588E-4	3.322635968389937E-5	1.2459884881462262E-5	2.595809350304638E-4	0.16417559649310726	0.004647537060785424
124-125	2.2427792786632072E-4	3.322635968389937E-5	1.2459884881462262E-5	2.616575825107075E-4	0.16588052407438736	0.004695299952831029
126-127	2.2427792786632072E-4	3.322635968389937E-5	1.2459884881462262E-5	2.6996417243168236E-4	0.167479542634175	0.0047160664276334665
128-129	2.2635457534656443E-4	3.322635968389937E-5	1.2459884881462262E-5	2.6996417243168236E-4	0.1692280798125402	0.004745139492356878
130-131	2.2843122282680813E-4	3.7379654644386784E-5	1.2459884881462262E-5	2.7411746739216977E-4	0.17088732114925492	0.0047679826146395585
132-133	2.2843122282680813E-4	3.7379654644386784E-5	1.6613179841949684E-5	2.7411746739216977E-4	0.1723015180833009	0.004792902384402484
134-135	2.2843122282680813E-4	3.7379654644386784E-5	1.6613179841949684E-5	2.7411746739216977E-4	0.1739545294775749	0.004817822154165408
136-137	2.3258451778729555E-4	3.7379654644386784E-5	1.6613179841949684E-5	2.7619411487241345E-4	0.17614746921671226	0.004851048513849307
138-139	2.3258451778729555E-4	3.7379654644386784E-5	1.6613179841949684E-5	2.782707623526572E-4	0.17768834164705308	0.0048780449310924755
>>END_MODULE
