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##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total read depth at the locus">
##INFO=<ID=DPB,Number=1,Type=Float,Description="Total read depth per bp at the locus; bases in reads overlapping / bases in haplotype">
##INFO=<ID=AC,Number=A,Type=Integer,Description="Total number of alternate alleles in called genotypes">
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##INFO=<ID=RO,Number=1,Type=Integer,Description="Count of full observations of the reference haplotype.">
##INFO=<ID=AO,Number=A,Type=Integer,Description="Count of full observations of this alternate haplotype.">
##INFO=<ID=PRO,Number=1,Type=Float,Description="Reference allele observation count, with partial observations recorded fractionally">
##INFO=<ID=PAO,Number=A,Type=Float,Description="Alternate allele observations, with partial observations recorded fractionally">
##INFO=<ID=QR,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele quality sum in phred">
##INFO=<ID=QA,Number=A,Type=Integer,Description="Alternate allele quality sum in phred">
##INFO=<ID=PQR,Number=1,Type=Float,Description="Reference allele quality sum in phred for partial observations">
##INFO=<ID=PQA,Number=A,Type=Float,Description="Alternate allele quality sum in phred for partial observations">
##INFO=<ID=SRF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the forward strand">
##INFO=<ID=SRR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the reverse strand">
##INFO=<ID=SAF,Number=A,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the forward strand">
##INFO=<ID=SAR,Number=A,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the reverse strand">
##INFO=<ID=SRP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the reference allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SRF and SRR given E(SRF/SRR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
##INFO=<ID=SAP,Number=A,Type=Float,Description="Strand balance probability for the alternate allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SAF and SAR given E(SAF/SAR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
##INFO=<ID=AB,Number=A,Type=Float,Description="Allele balance at heterozygous sites: a number between 0 and 1 representing the ratio of reads showing the reference allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
##INFO=<ID=ABP,Number=A,Type=Float,Description="Allele balance probability at heterozygous sites: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between ABR and ABA given E(ABR/ABA) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
##INFO=<ID=RUN,Number=A,Type=Integer,Description="Run length: the number of consecutive repeats of the alternate allele in the reference genome">
##INFO=<ID=RPP,Number=A,Type=Float,Description="Read Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between RPL and RPR given E(RPL/RPR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
##INFO=<ID=RPPR,Number=1,Type=Float,Description="Read Placement Probability for reference observations: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between RPL and RPR given E(RPL/RPR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
##INFO=<ID=RPL,Number=A,Type=Float,Description="Reads Placed Left: number of reads supporting the alternate balanced to the left (5') of the alternate allele">
##INFO=<ID=RPR,Number=A,Type=Float,Description="Reads Placed Right: number of reads supporting the alternate balanced to the right (3') of the alternate allele">
##INFO=<ID=EPP,Number=A,Type=Float,Description="End Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between EL and ER given E(EL/ER) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
##INFO=<ID=EPPR,Number=1,Type=Float,Description="End Placement Probability for reference observations: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between EL and ER given E(EL/ER) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
##INFO=<ID=DPRA,Number=A,Type=Float,Description="Alternate allele depth ratio.  Ratio between depth in samples with each called alternate allele and those without.">
##INFO=<ID=ODDS,Number=1,Type=Float,Description="The log odds ratio of the best genotype combination to the second-best.">
##INFO=<ID=GTI,Number=1,Type=Integer,Description="Number of genotyping iterations required to reach convergence or bailout.">
##INFO=<ID=TYPE,Number=A,Type=String,Description="The type of allele, either snp, mnp, ins, del, or complex.">
##INFO=<ID=CIGAR,Number=A,Type=String,Description="The extended CIGAR representation of each alternate allele, with the exception that '=' is replaced by 'M' to ease VCF parsing.  Note that INDEL alleles do not have the first matched base (which is provided by default, per the spec) referred to by the CIGAR.">
##INFO=<ID=NUMALT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of unique non-reference alleles in called genotypes at this position.">
##INFO=<ID=MEANALT,Number=A,Type=Float,Description="Mean number of unique non-reference allele observations per sample with the corresponding alternate alleles.">
##INFO=<ID=LEN,Number=A,Type=Integer,Description="allele length">
##INFO=<ID=MQM,Number=A,Type=Float,Description="Mean mapping quality of observed alternate alleles">
##INFO=<ID=MQMR,Number=1,Type=Float,Description="Mean mapping quality of observed reference alleles">
##INFO=<ID=PAIRED,Number=A,Type=Float,Description="Proportion of observed alternate alleles which are supported by properly paired read fragments">
##INFO=<ID=PAIREDR,Number=1,Type=Float,Description="Proportion of observed reference alleles which are supported by properly paired read fragments">
##INFO=<ID=MIN_DP,Number=1,Type=Integer,Description="Minimum depth in gVCF output block.">
##INFO=<ID=END,Number=1,Type=Integer,Description="Last position (inclusive) in gVCF output record.">
##INFO=<ID=technology.illumina,Number=A,Type=Float,Description="Fraction of observations supporting the alternate observed in reads from illumina">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Float,Description="Genotype Quality, the Phred-scaled marginal (or unconditional) probability of the called genotype">
##FORMAT=<ID=GL,Number=G,Type=Float,Description="Genotype Likelihood, log10-scaled likelihoods of the data given the called genotype for each possible genotype generated from the reference and alternate alleles given the sample ploidy">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth">
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Number of observation for each allele">
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SL2.50ch00	331030	.	G	A	5154.74	.	AB=0.5;ABP=3.0103;AC=2;AF=0.0596817;AN=2;AO=191;CIGAR=1X;DP=3731;DPB=3731;DPRA=0.846313;EPP=15.3911;EPPR=31.6296;GTI=18;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9997;NS=377;NUMALT=1;ODDS=1.16025;PAIRED=0.958115;PAIREDR=0.979379;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=6903;QR=129956;RO=3540;RPL=93;RPP=3.29452;RPPR=4.93395;RPR=98;RUN=1;SAF=90;SAP=4.38594;SAR=101;SRF=1534;SRP=139.668;SRR=2006;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0014757:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	343803	.	T	C,A	25460	.	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SL2.50ch00	453090	.	T	A	15960.3	.	AB=0.51773;ABP=3.39531;AC=2;AF=0.160542;AN=8;AO=593;CIGAR=1X;DP=4074;DPB=4074;DPRA=1.00025;EPP=6.99805;EPPR=4.96825;GTI=55;LEN=1;MEANALT=1.01075;MQM=59.9983;MQMR=59.998;NS=517;NUMALT=1;ODDS=0.0281528;PAIRED=0.996627;PAIREDR=0.960322;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=21158;QR=125087;RO=3478;RPL=305;RPP=4.06857;RPPR=21.0539;RPR=288;RUN=1;SAF=257;SAP=25.8639;SAR=336;SRF=1537;SRP=104.913;SRR=1941;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:23.7199:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00250732:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:23.7199:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:23.7199:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	587522	.	A	G	29593.4	.	AB=0.5625;ABP=7.89611;AC=10;AF=0.121719;AN=52;AO=1128;CIGAR=1X;DP=5180;DPB=5180;DPRA=2.06263;EPP=22.2609;EPPR=435.163;GTI=117;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9787;MQMR=59.9975;NS=1105;NUMALT=1;ODDS=0.00365067;PAIRED=0.974291;PAIREDR=0.955824;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=40478;QR=147819;RO=4052;RPL=561;RPP=3.0796;RPPR=734.1;RPR=567;RUN=1;SAF=541;SAP=7.08374;SAR=587;SRF=1721;SRP=202.419;SRR=2331;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:27.7958:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	0/0:27.7958:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	1/1:0.000260329:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.7958:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:27.7958:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8061:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40278	0/0:30.8061:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.8473:6:6,0:6:244:0:0:0,-1.80618,-22.3388	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8061:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	1/1:0.000260329:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00707741:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	0/0:30.8061:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.3082	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8061:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.7958:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:27.7958:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.7958:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.7958:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.7958:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00707741:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	1/1:0.000260329:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.7958:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:27.7958:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	1/1:0.000260329:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.7958:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000260329:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8061:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	621221	.	CGTAGCTAC	TGTAGCTAC,CAA	444.93	.	AB=0.25,0.3;ABP=33.4109,6.48466;AC=1,2;AF=0.00267953,0.00107181;AN=68;AO=34,3;CIGAR=1X8M,1M6D1M1X;DP=20702;DPB=21108;DPRA=0.975748,0.450184;EPP=76.8404,3.73412;EPPR=27483.6;GTI=8;LEN=1,7;MEANALT=1.08333,1;MQM=60,60;MQMR=59.9992;NS=1866;NUMALT=2;ODDS=3.19743;PAIRED=1,1;PAIREDR=0.990301;PAO=215.5,47;PQA=2557,120.5;PQR=6610.5;PRO=573.5;QA=1344,161;QR=768902;RO=20620;RPL=34,2;RPP=76.8404,3.73412;RPPR=29288.3;RPR=0,1;RUN=1,1;SAF=0,2;SAP=76.8404,3.73412;SAR=34,1;SRF=2115;SRP=28292.4;SRR=18505;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:33.6787:14:14,0,0:14:536:0,0:0,0:0,-4.21442,-48.5786,-4.21442,-48.5786,-48.5786	0/0:33.6787:18:18,0,0:18:664:0,0:0,0:0,-5.41854,-60.0781,-5.41854,-60.0781,-60.0781	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:6:6,0,0:6:207:0,0:0,0:0,-1.80618,-18.9627,-1.80618,-18.9627,-18.9627	0/0:33.6787:16:16,0,0:16:612:0,0:0,0:0,-4.81648,-55.412,-4.81648,-55.412,-55.412	0/0:33.6787:13:13,0,0:13:500:0,0:0,0:0,-3.91339,-45.344,-3.91339,-45.344,-45.344	0/0:33.6787:12:12,0,0:12:469:0,0:0,0:0,-3.61236,-42.5618,-3.61236,-42.5618,-42.5618	0/0:33.6787:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	0/0:33.6787:14:14,0,0:14:533:0,0:0,0:0,-4.21442,-48.3101,-4.21442,-48.3101,-48.3101	0/0:33.6787:5:5,0,0:5:199:0,0:0,0:0,-1.50515,-18.2889,-1.50515,-18.2889,-18.2889	0/0:33.6787:15:15,0,0:15:587:0,0:0,0:0,-4.51545,-53.1722,-4.51545,-53.1722,-53.1722	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:30:30,0,0:30:1108:0,0:0,0:0,-9.0309,-100.011,-9.0309,-100.011,-100.011	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:20:20,0,0:20:753:0,0:0,0:0,-6.0206,-68.0878,-6.0206,-68.0878,-68.0878	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:13:13,0,0:13:491:0,0:0,0:0,-3.91339,-44.5324,-3.91339,-44.5324,-44.5324	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:10:10,0,0:10:381:0,0:0,0:0,-3.0103,-34.6422,-3.0103,-34.6422,-34.6422	0/0:33.6787:8:8,0,0:8:310:0,0:0,0:0,-2.40824,-28.262,-2.40824,-28.262,-28.262	0/0:33.6787:8:8,0,0:8:302:0,0:0,0:0,-2.40824,-27.5348,-2.40824,-27.5348,-27.5348	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:2:2,0,0:2:61:0,0:0,0:0,-0.60206,-5.79392,-0.60206,-5.79392,-5.79392	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:17:17,0,0:17:668:0,0:0,0:0,-5.11751,-60.4557,-5.11751,-60.4557,-60.4557	0/0:33.6787:6:6,0,0:6:237:0,0:0,0:0,-1.80618,-21.7037,-1.80618,-21.7037,-21.7037	0/0:33.6787:12:12,0,0:12:470:0,0:0,0:0,-3.61236,-42.65,-3.61236,-42.65,-42.65	0/0:33.6787:12:12,0,0:12:435:0,0:0,0:0,-3.61236,-39.4806,-3.61236,-39.4806,-39.4806	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:14:14,0,0:14:533:0,0:0,0:0,-4.21442,-48.3089,-4.21442,-48.3089,-48.3089	0/0:33.6787:19:19,0,0:19:733:0,0:0,0:0,-5.71957,-66.2936,-5.71957,-66.2936,-66.2936	0/0:33.6787:14:14,0,0:14:548:0,0:0,0:0,-4.21442,-49.6637,-4.21442,-49.6637,-49.6637	0/1:-0:8:7,1,0:7:272:1,0:38,0:-1.38903,0,-22.4378,-3.49624,-22.7388,-25.8543	0/0:33.6787:10:10,0,0:10:388:0,0:0,0:0,-3.0103,-35.2741,-3.0103,-35.2741,-35.2741	0/0:33.6787:13:13,0,0:13:498:0,0:0,0:0,-3.91339,-45.1643,-3.91339,-45.1643,-45.1643	0/0:33.6787:4:4,0,0:4:155:0,0:0,0:0,-1.20412,-14.3247,-1.20412,-14.3247,-14.3247	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:10:10,0,0:10:391:0,0:0,0:0,-3.0103,-35.5458,-3.0103,-35.5458,-35.5458	0/0:33.6787:9:9,0,0:9:346:0,0:0,0:0,-2.70927,-31.4946,-2.70927,-31.4946,-31.4946	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:21:21,0,0:21:809:0,0:0,0:0,-6.32163,-73.1282,-6.32163,-73.1282,-73.1282	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	2/2:0.000930964:1:0,0,0:0:0:0,0:0,0:0,0,0,0,0,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6787:1:1,0,0:1:35:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863
SL2.50ch00	624537	.	A	G	16033.4	.	AB=0.464516;ABP=4.70545;AC=2;AF=0.0885358;AN=60;AO=596;CIGAR=1X;DP=4446;DPB=4446;DPRA=1.74503;EPP=6.74115;EPPR=911.52;GTI=53;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9866;MQMR=60;NS=881;NUMALT=1;ODDS=0.279037;PAIRED=0.969799;PAIREDR=0.935308;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=22403;QR=139176;RO=3849;RPL=306;RPP=3.94301;RPPR=21.0867;RPR=290;RUN=1;SAF=256;SAP=28.7182;SAR=340;SRF=1755;SRP=67.8447;SRR=2094;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6498:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83664	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6498:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9313	0/0:28.6498:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83664	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6498:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45771	0/0:28.6498:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83664	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.6601:3:3,0:3:99:0:0:0,-0.90309,-9.23658	0/0:28.6498:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9313	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6498:2:2,0:2:63:0:0:0,-0.60206,-5.98315	0/0:40.691:6:6,0:6:209:0:0:0,-1.80618,-19.1501	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.6704:4:4,0:4:146:0:0:0,-1.20412,-13.4978	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6498:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9313	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6498:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9313	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6498:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9313	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6498:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:25.6392:1:1,0:1:27:0:0:0,-0.30103,-2.69978	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6498:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	1/1:0.000324045:1:0,1:0:0:1:36:-3.59656,-0.30103,0	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.6394:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.6601:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6498:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	746107	.	A	C	15785.3	.	AB=0.484848;ABP=3.27351;AC=2;AF=0.215584;AN=2;AO=561;CIGAR=1X;DP=3407;DPB=3407;DPRA=0.753044;EPP=11.5607;EPPR=3.44978;GTI=53;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=385;NUMALT=1;ODDS=0.0733074;PAIRED=0.975045;PAIREDR=0.978918;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=20666;QR=103670;RO=2846;RPL=259;RPP=10.1673;RPPR=28.8421;RPR=302;RUN=1;SAF=332;SAP=44.0747;SAR=229;SRF=1788;SRP=409.608;SRR=1058;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00471754:1:0,1:0:0:1:34:-3.39891,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	775640	.	T	C	852.583	.	AB=0.5;ABP=3.0103;AC=4;AF=0.520833;AN=6;AO=98;CIGAR=1X;DP=185;DPB=185;DPRA=1.07177;EPP=215.815;EPPR=181.172;GTI=1;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9898;MQMR=59.907;NS=168;NUMALT=1;ODDS=0.315571;PAIRED=1;PAIREDR=1;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=3865;QR=3404;RO=86;RPL=0;RPP=215.815;RPPR=189.757;RPR=98;RUN=1;SAF=98;SAP=215.815;SAR=0;SRF=85;SRP=181.172;SRR=1;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:36.6984:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	1/1:36.6984:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.2286:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	775653	.	T	C	5389.72	.	AB=0;ABP=0;AC=6;AF=0.954802;AN=6;AO=186;CIGAR=1X;DP=194;DPB=194;DPRA=1.10059;EPP=406.904;EPPR=7.35324;GTI=7;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9516;MQMR=59.625;NS=177;NUMALT=1;ODDS=4.47203;PAIRED=1;PAIREDR=1;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=7389;QR=287;RO=8;RPL=0;RPP=406.904;RPPR=20.3821;RPR=186;RUN=1;SAF=186;SAP=406.904;SAR=0;SRF=6;SRP=7.35324;SRR=2;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:45.8546:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	1/1:45.8546:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:45.8546:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	775666	.	A	G	778.06	.	AB=0.5;ABP=3.0103;AC=6;AF=0.436198;AN=6;AO=185;CIGAR=1X;DP=676;DPB=676;DPRA=0.488047;EPP=404.733;EPPR=4.00537;GTI=1;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9514;MQMR=59.9226;NS=384;NUMALT=1;ODDS=2.00655;PAIRED=1;PAIREDR=1;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=7323;QR=17766;RO=491;RPL=0;RPP=404.733;RPPR=1069.2;RPR=185;RUN=1;SAF=185;SAP=404.733;SAR=0;SRF=238;SRP=4.00537;SRR=253;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.8448:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	1/1:27.8448:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.8448:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	775686	.	T	A	1211.38	.	AB=0.446154;ABP=7.92117;AC=5;AF=0.162935;AN=14;AO=185;CIGAR=1X;DP=1805;DPB=1805;DPRA=0.733607;EPP=404.733;EPPR=368.252;GTI=88;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9514;MQMR=59.9704;NS=804;NUMALT=1;ODDS=0.0522186;PAIRED=1;PAIREDR=1;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=7211;QR=58893;RO=1620;RPL=185;RPP=404.733;RPPR=3503.45;RPR=0;RUN=1;SAF=185;SAP=404.733;SAR=0;SRF=549;SRP=368.252;SRR=1071;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0333865:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	0/1:29.5038:2:1,1:1:35:1:40:-3.39362,0,-2.89657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.6606:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.6606:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0333865:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.6606:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.6606:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	777635	.	G	A	6255.88	.	AB=0.5;ABP=3.0103;AC=2;AF=0.356771;AN=6;AO=299;CIGAR=1X;DP=831;DPB=831;DPRA=1.03169;EPP=284.859;EPPR=3.34154;GTI=96;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.99;MQMR=59.9755;NS=384;NUMALT=1;ODDS=0.358926;PAIRED=1;PAIREDR=1;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=11605;QR=19248;RO=531;RPL=3;RPP=626.484;RPPR=578.082;RPR=296;RUN=1;SAF=48;SAP=302.289;SAR=251;SRF=234;SRP=19.2411;SRR=297;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.2484:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0138858:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.2485:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	781813	.	A	C	91787.8	.	AB=0.475836;ABP=4.37453;AC=15;AF=0.449159;AN=42;AO=3186;CIGAR=1X;DP=5863;DPB=5863;DPRA=1.45565;EPP=283.928;EPPR=1761.27;GTI=353;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9677;MQMR=59.9993;NS=1367;NUMALT=1;ODDS=0.00157677;PAIRED=0.986503;PAIREDR=0.9858;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=116934;QR=101363;RO=2676;RPL=1760;RPP=79.0432;RPPR=1539.41;RPR=1426;RUN=1;SAF=950;SAP=1130.18;SAR=2236;SRF=528;SRP=2132.61;SRR=2148;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:28.1099:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.1044:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	0/0:31.1202:3:3,0:3:119:0:0:0,-0.90309,-11.095	0/0:31.1202:3:3,0:3:112:0:0:0,-0.90309,-10.4437	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1254:3:0,3:0:0:3:120:-11.1873,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00676776:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:54.098:6:5,1:5:197:1:41:-2.28839,0,-16.2998	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1099:2:2,0:2:71:0:0:0,-0.60206,-6.73943	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00676776:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00338383:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:31.1202:3:3,0:3:106:0:0:0,-0.90309,-9.8865	0/0:28.1099:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1254:3:0,3:0:0:3:122:-11.3725,-0.90309,0	0/0:28.1099:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00338383:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.1305:4:4,0:4:156:0:0:0,-1.20412,-14.4141	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1099:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	0/0:31.1202:3:3,0:3:122:0:0:0,-0.90309,-11.3725	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00338383:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1254:3:0,3:0:0:3:115:-10.7241,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.1042:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	881381	.	A	G	3643.86	.	AB=0.506494;ABP=3.0385;AC=7;AF=0.0242277;AN=54;AO=187;CIGAR=1X;DP=9625;DPB=9625;DPRA=0.835164;EPP=55.1372;EPPR=7016.85;GTI=35;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9981;NS=1651;NUMALT=1;ODDS=0.169646;PAIRED=0.994652;PAIREDR=0.993006;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=6890;QR=365427;RO=9437;RPL=0;RPP=409.076;RPPR=9069.2;RPR=187;RUN=1;SAF=127;SAP=55.1372;SAR=60;SRF=8279;SRP=11671.2;SRR=1158;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:60.2088:11:11,0:11:436:0:0:0,-3.31133,-39.5942	0/0:39.1367:4:4,0:4:157:0:0:0,-1.20412,-14.5079	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.1367:4:4,0:4:161:0:0:0,-1.20412,-14.8755	0/0:48.1676:7:7,0:7:279:0:0:0,-2.10721,-25.4793	0/0:45.1573:6:6,0:6:238:0:0:0,-1.80618,-21.7936	0/0:30.1058:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:72.25:15:15,0:15:603:0:0:0,-4.51545,-54.6081	0/0:30.1058:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:90.3095:21:21,0:21:843:0:0:0,-6.32163,-76.1799	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.1573:6:6,0:6:237:0:0:0,-1.80618,-21.7024	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1161:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49724	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.1264:3:3,0:3:120:0:0:0,-0.90309,-11.1877	0/0:39.1367:4:4,0:4:158:0:0:0,-1.20412,-14.5998	0/0:33.1161:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.1573:6:6,0:6:237:0:0:0,-1.80618,-21.6995	0/0:33.1161:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49724	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.1367:4:4,0:4:163:0:0:0,-1.20412,-15.0584	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:66.2294:13:13,0:13:485:0:0:0,-3.91339,-43.9781	0/0:36.1264:3:3,0:3:123:0:0:0,-0.90309,-11.4648	0/0:54.1882:9:9,0:9:354:0:0:0,-2.70927,-32.2166	0/0:39.1367:4:4,0:4:153:0:0:0,-1.20412,-14.1403	1/1:0.000192792:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	1/1:0.000385592:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	0/0:33.1161:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.3082	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.1367:4:4,0:4:164:0:0:0,-1.20412,-15.1499	1/1:0.00308569:5:0,5:0:0:5:201:-18.4705,-1.50515,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:62.5755:9:1,8:1:37:8:306:-25.1823,0,-0.988559	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	1143875	.	G	C	57.4126	.	AB=0.25;ABP=7.35324;AC=1;AF=0.00174825;AN=126;AO=8;CIGAR=1X;DP=5094;DPB=5094;DPRA=1.17953;EPP=4.09604;EPPR=786.054;GTI=4;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9744;NS=1716;NUMALT=1;ODDS=2.62361;PAIRED=0.625;PAIREDR=0.65893;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=299;QR=187973;RO=5084;RPL=0;RPP=20.3821;RPPR=1886.6;RPR=8;RUN=1;SAF=5;SAP=4.09604;SAR=3;SRF=945;SRP=4360.32;SRR=4139;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:36.0003:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.21529:4:3,1:3:99:1:32:-1.99519,0,-8.03246	0/0:42.0209:3:3,0:3:111:0:0:0,-0.90309,-10.3539	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.0209:3:3,0:3:118:0:0:0,-0.90309,-11.0025	0/0:36.0003:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:36.0003:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:48.0415:5:5,0:5:176:0:0:0,-1.50515,-16.1809	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.0518:6:6,0:6:237:0:0:0,-1.80618,-21.7016	0/0:39.0106:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45771	0/0:63.093:10:10,0:10:382:0:0:0,-3.0103,-34.7296	0/0:39.0106:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45771	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.0003:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:36.0003:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:48.0415:5:5,0:5:167:0:0:0,-1.50515,-15.3584	0/0:54.0621:7:7,0:7:264:0:0:0,-2.10721,-24.1174	0/0:45.0312:4:4,0:4:150:0:0:0,-1.20412,-13.8637	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.0312:4:4,0:4:140:0:0:0,-1.20412,-12.9446	0/0:48.0415:5:5,0:5:156:0:0:0,-1.50515,-14.347	0/0:54.0621:7:7,0:7:252:0:0:0,-2.10721,-23.029	0/0:39.0106:2:2,0:2:64:0:0:0,-0.60206,-6.07869	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.0003:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.0003:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:39.0106:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40073	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.0209:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.7242	0/0:48.0415:5:5,0:5:192:0:0:0,-1.50515,-17.6484	0/0:39.0106:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.30883	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.0003:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	0/0:42.0209:3:3,0:3:99:0:0:0,-0.90309,-9.23658	0/0:39.0106:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21467	0/0:36.0003:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	0/0:51.0518:6:6,0:6:216:0:0:0,-1.80618,-19.7905	0/0:45.0312:4:4,0:4:126:0:0:0,-1.20412,-11.6514	0/0:42.0209:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0732	0/0:36.0003:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:39.0106:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:48.0415:5:5,0:5:168:0:0:0,-1.50515,-15.4509	0/0:36.0003:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	0/0:48.0415:5:5,0:5:180:0:0:0,-1.50515,-16.5521	0/0:42.0209:3:3,0:3:99:0:0:0,-0.90309,-9.23658	0/0:39.0106:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:42.0209:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	0/0:36.0003:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:48.0415:5:5,0:5:154:0:0:0,-1.50515,-14.1647	0/0:48.0415:5:5,0:5:180:0:0:0,-1.50515,-16.5521	0/0:51.0518:6:6,0:6:216:0:0:0,-1.80618,-19.7905	0/0:42.0209:3:3,0:3:89:0:0:0,-0.90309,-8.30436	0/0:48.0415:5:5,0:5:176:0:0:0,-1.50515,-16.185	0/0:36.0003:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:42.0209:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	0/0:51.0518:6:6,0:6:212:0:0:0,-1.80618,-19.4248	0/0:39.0106:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45771	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:63.093:10:10,0:10:341:0:0:0,-3.0103,-31.0178	0/0:45.0312:4:4,0:4:144:0:0:0,-1.20412,-13.3136	0/0:54.0621:7:7,0:7:221:0:0:0,-2.10721,-20.2	0/0:45.0312:4:4,0:4:135:0:0:0,-1.20412,-12.4825	0/0:36.0003:1:1,0:1:27:0:0:0,-0.30103,-2.69978	0/0:42.0209:3:3,0:3:104:0:0:0,-0.90309,-9.7028	0/0:42.0209:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	0/0:42.0209:3:3,0:3:104:0:0:0,-0.90309,-9.7028	0/0:36.0003:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:36.0003:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:39.0106:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:42.0209:3:3,0:3:99:0:0:0,-0.90309,-9.23658
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SL2.50ch00	1152564	.	CCATC	TCATT	130.964	.	AB=0.337349;ABP=22.0826;AC=1;AF=0.0160758;AN=30;AO=40;CIGAR=1X3M1X;DP=4797;DPB=4871.6;DPRA=0.824887;EPP=45.5712;EPPR=86.0074;GTI=27;LEN=5;MEANALT=1;MQM=59.85;MQMR=59.9952;NS=1213;NUMALT=1;ODDS=0.211034;PAIRED=1;PAIREDR=0.993471;PAO=0;PQA=0;PQR=453.5;PRO=70.5;QA=1395;QR=174820;RO=4748;RPL=0;RPP=89.8692;RPPR=1032.04;RPR=40;RUN=1;SAF=6;SAP=45.5712;SAR=34;SRF=2995;SRP=708.494;SRR=1753;TYPE=complex;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:50.8876:5:5,0:5:188:0:0:0,-1.50515,-17.283	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.8567:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9307	0/0:38.8464:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.8567:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21354	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.8464:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.8567:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49724	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.8464:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.867:3:3,0:3:117:0:0:0,-0.90309,-10.9086	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.8567:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.1188	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.8464:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.8567:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.11959	0/0:41.8567:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21354	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.0535516:2:1,1:1:35:1:29:-2.2976,0,-2.89657	0/0:41.8567:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.11959	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.8567:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	1152585	.	G	A	177.669	.	AB=0.341463;ABP=20.9117;AC=1;AF=0.0163317;AN=30;AO=41;CIGAR=1X;DP=4138;DPB=4138;DPRA=0.911699;EPP=75.5163;EPPR=3274.14;GTI=22;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8537;MQMR=59.9949;NS=1194;NUMALT=1;ODDS=0.0046256;PAIRED=1;PAIREDR=0.99707;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=1488;QR=156385;RO=4096;RPL=4;RPP=60.6867;RPPR=2508.62;RPR=37;RUN=1;SAF=6;SAP=47.552;SAR=35;SRF=2551;SRP=539.536;SRR=1545;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:50.6712:5:5,0:5:198:0:0:0,-1.50515,-18.1972	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.6403:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	0/0:38.63:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.6403:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.63:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.6403:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.63:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.6506:3:3,0:3:121:0:0:0,-0.90309,-11.28	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.6403:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.63:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.6403:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	0/0:41.6403:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.202203:2:1,1:1:40:1:35:-2.89657,0,-3.39362	0/0:41.6403:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49763	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.6403:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	1615390	.	C	T	11775	.	AB=0.435374;ABP=8.34296;AC=1;AF=0.0459246;AN=54;AO=491;CIGAR=1X;DP=7676;DPB=7676;DPRA=1.47224;EPP=24.0661;EPPR=5536.67;GTI=52;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9919;MQMR=59.9985;NS=1644;NUMALT=1;ODDS=0.267013;PAIRED=0.99389;PAIREDR=0.990118;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=17443;QR=265656;RO=7185;RPL=237;RPP=4.28842;RPPR=6082.29;RPR=254;RUN=1;SAF=247;SAP=3.0501;SAR=244;SRF=5706;SRP=5402.99;SRR=1479;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:57.993:11:11,0:11:402:0:0:0,-3.31133,-36.5168	0/0:33.9106:3:3,0:3:120:0:0:0,-0.90309,-11.1877	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.9003:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02588	0/0:33.9106:3:3,0:3:119:0:0:0,-0.90309,-11.0952	0/0:45.9518:7:7,0:7:279:0:0:0,-2.10721,-25.4804	0/0:27.89:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.9209:4:4,0:4:153:0:0:0,-1.20412,-14.1401	0/0:33.9106:3:3,0:3:116:0:0:0,-0.90309,-10.8174	0/0:36.9209:4:4,0:4:145:0:0:0,-1.20412,-13.4039	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:54.9827:10:10,0:10:380:0:0:0,-3.0103,-34.5537	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:54.9827:10:10,0:10:377:0:0:0,-3.0103,-34.2786	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9106:3:3,0:3:121:0:0:0,-0.90309,-11.28	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.9209:4:4,0:4:158:0:0:0,-1.20412,-14.6004	0/0:27.89:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	0/0:33.9106:3:3,0:3:121:0:0:0,-0.90309,-11.28	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.9415:6:6,0:6:239:0:0:0,-1.80618,-21.8846	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9106:3:3,0:3:113:0:0:0,-0.90309,-10.539	0/0:27.89:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.9415:6:6,0:6:233:0:0:0,-1.80618,-21.3401	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.9209:4:4,0:4:154:0:0:0,-1.20412,-14.2324	0/0:30.9003:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	0/0:27.89:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	0/0:30.9003:2:2,0:2:69:0:0:0,-0.60206,-6.55189	0/0:27.89:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9106:3:3,0:3:118:0:0:0,-0.90309,-11.0025	0/0:27.89:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:27.1243:7:6,1:6:232:1:39:-1.78935,0,-19.1402	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	1615506	.	G	A	15033.6	.	AB=0.470085;ABP=3.91972;AC=1;AF=0.0695574;AN=30;AO=591;CIGAR=1X;DP=5127;DPB=5127;DPRA=1.83543;EPP=3.45488;EPPR=629.804;GTI=52;LEN=1;MEANALT=1.01176;MQM=59.9865;MQMR=59.9974;NS=1107;NUMALT=1;ODDS=0.305668;PAIRED=0.981387;PAIREDR=0.986105;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=21359;QR=163170;RO=4534;RPL=289;RPP=3.63125;RPPR=1009.96;RPR=302;RUN=1;SAF=256;SAP=25.9412;SAR=335;SRF=1399;SRP=1446.36;SRR=3135;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:45.6444:7:7,0:7:235:0:0:0,-2.10721,-21.4774	0/0:30.5929:2:2,0:2:71:0:0:0,-0.60206,-6.7419	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6032:3:3,0:3:106:0:0:0,-0.90309,-9.88901	0/0:33.6032:3:3,0:3:103:0:0:0,-0.90309,-9.60929	0/0:27.5826:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.5929:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83664	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6032:3:3,0:3:100:0:0:0,-0.90309,-9.32912	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.6238:5:5,0:5:172:0:0:0,-1.50515,-15.8183	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.5826:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.5826:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.5929:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83664	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.5929:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83664	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.5929:2:2,0:2:69:0:0:0,-0.60206,-6.55266	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6032:3:3,0:3:101:0:0:0,-0.90309,-9.42377	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:47.5729:4:3,1:3:109:1:36:-2.39415,0,-8.96388	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	1624014	.	A	G	20025.9	.	AB=0.406015;ABP=13.2146;AC=8;AF=0.0857858;AN=54;AO=812;CIGAR=1X;DP=6993;DPB=6993;DPRA=1.42084;EPP=41.5192;EPPR=5133.87;GTI=99;LEN=1;MEANALT=1.00671;MQM=59.9852;MQMR=59.9969;NS=1597;NUMALT=1;ODDS=0.0540767;PAIRED=0.993842;PAIREDR=0.98948;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=29281;QR=214520;RO=6179;RPL=216;RPP=389.169;RPPR=5861.62;RPR=596;RUN=1;SAF=304;SAP=114.301;SAR=508;SRF=903;SRP=6723.41;SRR=5276;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:40.1529:5:5,0:5:171:0:0:0,-1.50515,-15.7266	0/0:34.1323:3:3,0:3:104:0:0:0,-0.90309,-9.70309	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.1323:3:3,0:3:96:0:0:0,-0.90309,-8.95728	0/0:31.122:2:2,0:2:69:0:0:0,-0.60206,-6.55266	0/0:40.1529:5:5,0:5:172:0:0:0,-1.50515,-15.8185	0/0:28.1117:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:70.2559:15:15,0:15:510:0:0:0,-4.51545,-46.224	0/0:31.122:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	0/0:28.1117:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.1426:4:4,0:4:138:0:0:0,-1.20412,-12.7604	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:43.1632:6:6,0:6:204:0:0:0,-1.80618,-18.6934	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.1529:5:5,0:5:174:0:0:0,-1.50515,-16.002	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.1323:3:3,0:3:104:0:0:0,-0.90309,-9.70309	0/0:31.122:2:2,0:2:69:0:0:0,-0.60206,-6.55266	0/0:28.1117:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:49.1838:8:8,0:8:273:0:0:0,-2.40824,-24.9024	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.1323:3:3,0:3:103:0:0:0,-0.90309,-9.61002	0/0:34.1323:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1117:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:28.1117:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.122:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	1/1:0.00159343:3:0,3:0:0:3:103:-9.61002,-0.90309,0	1/1:0.000796642:2:0,2:0:0:2:70:-6.6474,-0.60206,0	0/0:28.1116:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1117:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	1/1:0.00318745:4:0,4:0:0:4:140:-12.9449,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00159343:3:0,3:0:0:3:105:-9.79616,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	1634363	.	G	A	19546.4	.	AB=0.567376;ABP=8.56989;AC=2;AF=0.185422;AN=4;AO=662;CIGAR=1X;DP=3968;DPB=3968;DPRA=0.906874;EPP=3.22023;EPPR=8.45114;GTI=43;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=391;NUMALT=1;ODDS=0.00647734;PAIRED=0.969789;PAIREDR=0.976097;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=24889;QR=121585;RO=3305;RPL=301;RPP=14.8189;RPPR=18.3906;RPR=361;RUN=1;SAF=338;SAP=3.65321;SAR=324;SRF=1700;SRP=8.93996;SRR=1605;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:20.603:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00206731:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	1637637	.	A	C	15351.9	.	AB=0.529412;ABP=3.64897;AC=1;AF=0.0768293;AN=50;AO=621;CIGAR=1X;DP=4571;DPB=4571;DPRA=1.89306;EPP=12.1053;EPPR=2091.78;GTI=68;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=1230;NUMALT=1;ODDS=0.00152651;PAIRED=0.982287;PAIREDR=0.986832;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=22362;QR=143931;RO=3949;RPL=353;RPP=28.2742;RPPR=1380.95;RPR=268;RUN=1;SAF=345;SAP=19.6583;SAR=276;SRF=3048;SRP=2537.74;SRR=901;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:37.2208:4:4,0:4:145:0:0:0,-1.20412,-13.4041	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.2002:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	0/0:34.2105:3:3,0:3:116:0:0:0,-0.90309,-10.8163	0/0:28.1899:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.2105:3:3,0:3:118:0:0:0,-0.90309,-11.0029	0/0:28.1899:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:28.1899:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.2311:5:5,0:5:188:0:0:0,-1.50515,-17.2834	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.2002:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.4033	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1895:1:1,0:1:26:0:0:0,-0.30103,-2.59983	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.2002:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.11959	0/0:28.1899:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	0/0:28.1899:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:43.2414:6:6,0:6:225:0:0:0,-1.80618,-20.6071	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1899:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	0/0:31.2002:2:2,0:2:66:0:0:0,-0.60206,-6.26573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:36.1473:3:2,1:2:66:1:23:-1.39682,0,-5.36452	0/0:37.2208:4:4,0:4:160:0:0:0,-1.20412,-14.7838	0/0:34.2105:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0697	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.2105:3:3,0:3:116:0:0:0,-0.90309,-10.8168	0/0:31.2002:2:2,0:2:69:0:0:0,-0.60206,-6.55189	0/0:28.1899:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1899:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:28.1897:1:1,0:1:28:0:0:0,-0.30103,-2.79973	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.2105:3:3,0:3:120:0:0:0,-0.90309,-11.1879	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	1809756	.	ATTTTTTTTTTTG	ATTTTTTTTTTG,ATTTTTTTTTG	16433.6	.	AB=0.282597,0.225434;ABP=755.514,116.291;AC=9,1;AF=0.195019,0.0168176;AN=45;AO=1087,91;CIGAR=1M1D11M,1M2D10M;DP=6718;DPB=7048.38;DPRA=1.50454,1.48018;EPP=524.645,23.0785;EPPR=4682.33;GTI=399;LEN=1,2;MEANALT=1.19386,1.55769;MQM=59.9899,59.9451;MQMR=59.9994;NS=1546;NUMALT=2;ODDS=0.000700877;PAIRED=0.99356,1;PAIREDR=0.989932;PAO=189,143;PQA=3203.33,2101;PQR=3952.83;PRO=210.5;QA=38014,3336;QR=195065;RO=5264;RPL=865,67;RPP=828.947,47.1318;RPPR=5828.76;RPR=222,24;RUN=1,1;SAF=188,19;SAP=1012.88,70.0396;SAR=899,72;SRF=551;SRP=7148.67;SRR=4713;TYPE=del,del;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:-0:10:8,1,0:8:297:1,0:37,0:-0.638711,0,-24.0379,-3.04695,-24.339,-27.3663	0/0:2.21849:2:2,0,0:2:79:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.49763,-0.60206,-7.49763,-7.49763	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:2.21849:4:4,0,0:4:153:0,0:0,0:0,-1.20412,-14.1417,-1.20412,-14.1417,-14.1417	0/0:2.21849:4:4,0,0:4:145:0,0:0,0:0,-1.20412,-13.4039,-1.20412,-13.4039,-13.4039	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:2.21849:4:4,0,0:4:151:0,0:0,0:0,-1.20412,-13.9578,-1.20412,-13.9578,-13.9578	0/0:2.21849:1:1,0,0:1:39:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.89656,-0.30103,-3.89656,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	./0:-0:8:7,0,0:7:251:0,0:0,0:0,-2.10721,-22.5977,-2.10721,-22.5977,-22.5977	.:.:.:.:.:.:.:.:.	./0:-0:4:1,0,0:1:39:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.53433,-0.30103,-3.53433,-3.53433	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:-0:4:3,1,0:3:117:1,0:26,0:-1.39571,0,-9.70626,-2.2988,-10.0073,-12.0137	.:.:.:.:.:.:.:.:.	./0:-0:4:3,0,0:3:114:0,0:0,0:0,-0.90309,-10.3046,-0.90309,-10.3046,-10.3046	0/0:2.21849:3:3,0,0:3:111:0,0:0,0:0,-0.90309,-10.3521,-0.90309,-10.3521,-10.3521	0/0:2.21849:3:3,0,0:3:116:0,0:0,0:0,-0.90309,-10.8177,-0.90309,-10.8177,-10.8177	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:2.21849:4:4,0,0:4:156:0,0:0,0:0,-1.20412,-14.4171,-1.20412,-14.4171,-14.4171	./0:-0:2:1,0,0:1:39:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.53678,-0.30103,-3.53678,-3.53678	./0:-0:2:1,0,0:1:39:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.5268,-0.30103,-3.5268,-3.5268	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:-0:6:5,1,0:5:175:1,0:35,0:-1.69245,0,-14.2829,-3.1976,-14.5839,-17.4316	0/0:2.21849:2:2,0,0:2:80:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.59179,-0.60206,-7.59179,-7.59179	0/0:2.21849:8:8,0,0:8:283:0,0:0,0:0,-2.40824,-25.807,-2.40824,-25.807,-25.807	0/0:2.21849:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	1/1:0.9691:3:0,3,0:0:0:3,0:107,0:-9.98137,-0.90309,0,-9.98137,-0.90309,-9.98137	1/2:-0:5:0,4,1:0:0:4,1:136,33:-14.0355,-2.9981,-1.79398,-11.3693,0,-11.0683	0/0:2.21849:3:3,0,0:3:113:0,0:0,0:0,-0.90309,-10.539,-0.90309,-10.539,-10.539	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:2.21849:1:1,0,0:1:28:0,0:0,0:0,-0.30103,-2.79973,-0.30103,-2.79973,-2.79973	1/1:2.21849:5:0,5,0:0:0:5,0:162,0:-14.899,-1.50515,0,-14.899,-1.50515,-14.899	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.9691:8:1,7,0:1:40:7,0:238,0:-19.3435,0,-1.58744,-19.6445,-3.69465,-22.947	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	1922977	.	A	G	36845.3	.	AB=0.452555;ABP=5.68898;AC=2;AF=0.103436;AN=46;AO=1336;CIGAR=1X;DP=6706;DPB=6706;DPRA=2.29006;EPP=8.10741;EPPR=6.50836;GTI=135;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=1426;NUMALT=1;ODDS=0.00950096;PAIRED=0.97979;PAIREDR=0.982492;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=50147;QR=198990;RO=5369;RPL=647;RPP=5.87742;RPPR=32.7132;RPR=689;RUN=1;SAF=567;SAP=69.3312;SAR=769;SRF=1364;SRP=2823.98;SRR=4005;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:46.4187:7:7,0:7:257:0:0:0,-2.10721,-23.4795	0/0:34.3775:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.7232	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.3569:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:34.3775:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.7224	0/0:34.3775:3:3,0:3:123:0:0:0,-0.90309,-11.4648	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.3775:3:3,0:3:118:0:0:0,-0.90309,-11.0027	0/0:34.3775:3:3,0:3:122:0:0:0,-0.90309,-11.3725	0/0:31.3672:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21426	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.3981:5:5,0:5:186:0:0:0,-1.50515,-17.1001	0/0:28.3568:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:28.3569:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.3775:3:3,0:3:112:0:0:0,-0.90309,-10.4449	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.3569:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.3672:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02577	0/0:31.3672:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	0/0:34.3775:3:3,0:3:120:0:0:0,-0.90309,-11.1873	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.3569:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:37.3878:4:4,0:4:161:0:0:0,-1.20412,-14.8755	0/0:31.3672:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	0/0:37.3878:4:4,0:4:141:0:0:0,-1.20412,-13.0313	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.3775:3:3,0:3:99:0:0:0,-0.90309,-9.23399	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.3672:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000407469:2:0,2:0:0:2:69:-6.55266,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	2076850	.	C	T	95969	.	AB=0.797408;ABP=1129.31;AC=30;AF=0.934177;AN=32;AO=3281;CIGAR=1X;DP=3597;DPB=3597;DPRA=2.67581;EPP=2130.7;EPPR=18.8428;GTI=33;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8909;MQMR=59.9968;NS=1185;NUMALT=1;ODDS=0.0124709;PAIRED=1;PAIREDR=1;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=117347;QR=11524;RO=316;RPL=2548;RPP=2183.24;RPPR=654.892;RPR=733;RUN=1;SAF=2354;SAP=1350.72;SAR=927;SRF=134;SRP=18.8428;SRR=182;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.8031:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.8031:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.8031:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:46.8461:5:0,5:0:0:5:192:-17.6484,-1.50515,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.8042:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:37.8152:2:0,2:0:0:2:71:-6.74206,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.0491729:1:1,0:1:27:0:0:0,-0.30103,-2.69978	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.8031:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:40.8255:3:0,3:0:0:3:101:-9.42193,-0.90309,0	1/1:34.8031:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	1/1:40.8255:3:0,3:0:0:3:104:-9.7028,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.802:1:0,1:0:0:1:34:-3.39891,-0.30103,0	1/1:34.8042:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.8031:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	1/1:34.8031:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:37.8152:2:0,2:0:0:2:72:-6.83672,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	2076862	.	C	T	2774.49	.	AB=0.72;ABP=34.5401;AC=6;AF=0.0232657;AN=34;AO=136;CIGAR=1X;DP=3533;DPB=3533;DPRA=1.66243;EPP=33.9218;EPPR=1843.88;GTI=23;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9265;MQMR=59.8964;NS=1182;NUMALT=1;ODDS=0.432778;PAIRED=1;PAIREDR=1;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=4873;QR=121549;RO=3397;RPL=101;RPP=72.5613;RPPR=3755.9;RPR=35;RUN=1;SAF=75;SAP=6.13977;SAR=61;SRF=2382;SRP=1197.54;SRR=1015;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7587:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7587:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7587:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7587:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.7999:5:5,0:5:179:0:0:0,-1.50515,-16.4602	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7587:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.769:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7587:1:1,0:1:25:0:0:0,-0.30103,-2.49986	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7587:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.7793:3:3,0:3:104:0:0:0,-0.90309,-9.70182	0/0:28.7587:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:34.7793:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:4.15401e-13:1:0,1:0:0:1:34:-3.39891,-0.30103,0	0/0:28.7587:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7587:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	1/1:4.15401e-13:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:8.30802e-13:2:0,2:0:0:2:69:-6.55266,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	2082724	.	T	C	133912	.	AB=0.438356;ABP=5.41974;AC=8;AF=0.822294;AN=10;AO=3982;CIGAR=1X;DP=4438;DPB=4438;DPRA=1.96283;EPP=14.6344;EPPR=13.0867;GTI=88;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9862;MQMR=60;NS=619;NUMALT=1;ODDS=0.0920795;PAIRED=0.992215;PAIREDR=0.980263;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=150956;QR=17232;RO=456;RPL=2410;RPP=385.959;RPPR=56.5161;RPR=1572;RUN=1;SAF=1924;SAP=12.8021;SAR=2058;SRF=242;SRP=6.74371;SRR=214;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:29.2866:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:29.2866:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00626482:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:29.2866:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:29.2866:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	2235581	.	C	T	3257.95	.	AB=0.272727;ABP=7.94546;AC=2;AF=0.0210793;AN=12;AO=131;CIGAR=1X;DP=3942;DPB=3942;DPRA=1.6307;EPP=5.01601;EPPR=43.337;GTI=2;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9542;MQMR=59.9866;NS=593;NUMALT=1;ODDS=2.9157;PAIRED=1;PAIREDR=0.993701;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=4992;QR=140266;RO=3810;RPL=72;RPP=5.81167;RPPR=118.423;RPR=59;RUN=1;SAF=51;SAP=16.9508;SAR=80;SRF=1576;SRP=249.774;SRR=2234;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:120.456:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21426	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:88.5654:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:88.5654:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:118.392:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02486	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:88.5654:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.229088:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	2240211	.	G	A	3264.36	.	AB=0.466667;ABP=3.44459;AC=20;AF=0.0989583;AN=36;AO=194;CIGAR=1X;DP=2558;DPB=2558;DPRA=0.801197;EPP=169.609;EPPR=1395.55;GTI=89;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9987;NS=960;NUMALT=1;ODDS=0.0523196;PAIRED=0.943299;PAIREDR=0.969107;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=7402;QR=89956;RO=2363;RPL=39;RPP=153.625;RPPR=1506.26;RPR=155;RUN=1;SAF=7;SAP=365.669;SAR=187;SRF=104;SRP=4270.62;SRR=2259;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:0.0437974:2:0,2:0:0:2:76:-7.21467,-0.60206,0	0/0:35.668:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.6787:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21426	1/1:0.0437974:2:0,2:0:0:2:69:-6.55057,-0.60206,0	0/0:38.6787:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.1188	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.6787:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.6786:2:2,0:2:66:0:0:0,-0.60206,-6.26715	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.6646:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0218435:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.7096:5:5,0:5:196:0:0:0,-1.50515,-18.0148	1/1:0.0218435:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0437974:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0218435:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	0/0:38.6787:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40278	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0437974:2:0,2:0:0:2:81:-7.68573,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0218435:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0166831:1:0,1:0:0:1:26:-2.59983,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0218435:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	2669282	.	A	C,G	18832.4	.	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SL2.50ch00	3037692	.	G	T	264.485	.	AB=0;ABP=0;AC=2;AF=0.0123762;AN=6;AO=16;CIGAR=1X;DP=4274;DPB=4274;DPRA=0.299859;EPP=3.55317;EPPR=118.1;GTI=7;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=404;NUMALT=1;ODDS=1.78896;PAIRED=0.75;PAIREDR=0.979093;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=571;QR=155029;RO=4257;RPL=4;RPP=11.6962;RPPR=5.30011;RPR=12;RUN=1;SAF=3;SAP=16.582;SAR=13;SRF=1458;SRP=920.304;SRR=2799;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.331:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.331:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:5.60585e-10:1:0,1:0:0:1:32:-3.19931,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	3981718	.	G	A	49.7281	.	AB=0.411765;ABP=4.1599;AC=1;AF=0.00168237;AN=46;AO=8;CIGAR=1X;DP=7614;DPB=7614;DPRA=0.877962;EPP=12.7819;EPPR=2484.81;GTI=3;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.8159;NS=1486;NUMALT=1;ODDS=0.330991;PAIRED=1;PAIREDR=0.866255;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=308;QR=275353;RO=7604;RPL=3;RPP=4.09604;RPPR=275.037;RPR=5;RUN=1;SAF=6;SAP=7.35324;SAR=2;SRF=3046;SRP=655.864;SRR=4558;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:51.8164:4:4,0:4:142:0:0:0,-1.20412,-13.1258	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.7958:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40278	0/0:45.7958:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59179	0/0:42.7855:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.28165:4:3,1:3:102:1:40:-2.79156,0,-8.30975	0/0:42.7855:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:45.7958:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.64622	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:57.837:6:6,0:6:199:0:0:0,-1.80618,-18.2304	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:54.8267:5:5,0:5:187:0:0:0,-1.50515,-17.1908	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.7855:1:1,0:1:26:0:0:0,-0.30103,-2.59983	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:60.8473:7:7,0:7:275:0:0:0,-2.10721,-25.1189	0/0:48.8061:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.7249	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.7958:2:2,0:2:51:0:0:0,-0.60206,-4.84469	0/0:42.7855:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.7855:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.8061:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.7241	0/0:42.7855:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:42.7855:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	0/0:45.7958:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.12034	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.8061:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.725	0/0:42.7855:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.8164:4:4,0:4:128:0:0:0,-1.20412,-11.8343	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.7855:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	4102888	.	G	A	4192.11	.	AB=0.198925;ABP=1321.02;AC=4;AF=0.0634744;AN=22;AO=362;CIGAR=1X;DP=6541;DPB=6541;DPRA=3.03605;EPP=8.40899;EPPR=394.158;GTI=26;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.7597;MQMR=59.9697;NS=898;NUMALT=1;ODDS=0.0118149;PAIRED=0.994475;PAIREDR=0.989966;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=13793;QR=238166;RO=6179;RPL=18;RPP=640.511;RPPR=525.218;RPR=344;RUN=1;SAF=174;SAP=4.18601;SAR=188;SRF=2740;SRP=174.718;SRR=3439;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:34.9004:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0355273:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:43.9315:4:4,0:4:150:0:0:0,-1.20412,-13.8655	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:14.5626:2:0,2:0:0:2:65:-6.17303,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.9001:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8993:1:1,0:1:30:0:0:0,-0.30103,-2.99957	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9109:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.9003:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:34.9004:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.9003:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9109:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02588	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	4193972	.	G	T	34884.1	.	AB=0.315789;ABP=53.4113;AC=2;AF=0.200883;AN=8;AO=1211;CIGAR=1X;DP=5904;DPB=5904;DPRA=1.10961;EPP=17.2136;EPPR=18.519;GTI=58;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9926;MQMR=59.9953;NS=453;NUMALT=1;ODDS=0.0328419;PAIRED=0.983485;PAIREDR=0.979953;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=42866;QR=157955;RO=4689;RPL=642;RPP=12.5659;RPPR=41.1553;RPR=569;RUN=1;SAF=632;SAP=8.04718;SAR=579;SRF=2586;SRP=111.046;SRR=2103;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:24.2577:2:2,0:2:44:0:0:0,-0.60206,-4.17986	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:21.2472:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00126912:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:21.2468:1:1,0:1:24:0:0:0,-0.30103,-2.39989	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	4194177	.	CGTTG	CGTGG,CGTCG,TGTCG	64829.5	.	AB=0.433333,0.40796,0.425532;ABP=5.32654,17.8001,5.27418;AC=50,0,0;AF=0.760397,0.0204734,0.00383877;AN=50;AO=3569,320,30;CIGAR=3M1X1M,3M1X1M,1X2M1X1M;DP=8836;DPB=9056;DPRA=0.209194,1.94488,1.4136;EPP=7274.22,3.68889,4.16842;EPPR=71.3579;GTI=544;LEN=1,1,5;MEANALT=1.00167,1.12195,1.3;MQM=59.9849,59.9625,60;MQMR=59.9953;NS=1563;NUMALT=3;ODDS=0.00689443;PAIRED=1,0.990625,0.966667;PAIREDR=0.984716;PAO=81.3333,91.3333,21;PQA=134,158,17;PQR=1285;PRO=264.333;QA=119846,11265,1006;QR=168624;RO=4907;RPL=0,149,12;RPP=7753,6.29465,5.61607;RPPR=141.291;RPR=3569,171,18;RUN=1,1,1;SAF=56,122,9;SAP=7274.22,42.2054,13.4334;SAR=3513,198,21;SRF=2614;SRP=48.6086;SRR=2293;TYPE=snp,snp,complex;technology.illumina=1,1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:1.76091:4:0,4,0,0:0:0:4,0,0:129,0,0:-11.9286,-1.20412,0,-11.9286,-1.20412,-11.9286,-11.9286,-1.20412,-11.9286,-11.9286	1/1:0.791812:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:70,0,0:-6.6474,-0.60206,0,-6.6474,-0.60206,-6.6474,-6.6474,-0.60206,-6.6474,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.791812:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:49,0,0:-4.65463,-0.60206,0,-4.65463,-0.60206,-4.65463,-4.65463,-0.60206,-4.65463,-4.65463	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.791812:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:70,0,0:-6.6474,-0.60206,0,-6.6474,-0.60206,-6.6474,-6.6474,-0.60206,-6.6474,-6.6474	1/1:0.791812:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:33,0,0:-3.29913,-0.30103,0,-3.29913,-0.30103,-3.29913,-3.29913,-0.30103,-3.29913,-3.29913	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:110,0,0:-10.2601,-0.90309,0,-10.2601,-0.90309,-10.2601,-10.2601,-0.90309,-10.2601,-10.2601	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:4:0,4,0,0:0:0:4,0,0:136,0,0:-12.5759,-1.20412,0,-12.5759,-1.20412,-12.5759,-12.5759,-1.20412,-12.5759,-12.5759	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:105,0,0:-9.79616,-0.90309,0,-9.79616,-0.90309,-9.79616,-9.79616,-0.90309,-9.79616,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.791812:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:70,0,0:-6.64706,-0.60206,0,-6.64706,-0.60206,-6.64706,-6.64706,-0.60206,-6.64706,-6.64706	1/1:0.791812:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:35,0,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	1/1:0.791812:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:35,0,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:105,0,0:-9.79616,-0.90309,0,-9.79616,-0.90309,-9.79616,-9.79616,-0.90309,-9.79616,-9.79616	1/1:0.791812:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:70,0,0:-6.6474,-0.60206,0,-6.6474,-0.60206,-6.6474,-6.6474,-0.60206,-6.6474,-6.6474	1/1:1.76091:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:105,0,0:-9.79616,-0.90309,0,-9.79616,-0.90309,-9.79616,-9.79616,-0.90309,-9.79616,-9.79616	1/1:1.76091:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:103,0,0:-9.60997,-0.90309,0,-9.60997,-0.90309,-9.60997,-9.60997,-0.90309,-9.60997,-9.60997	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:4:0,4,0,0:0:0:4,0,0:134,0,0:-12.3912,-1.20412,0,-12.3912,-1.20412,-12.3912,-12.3912,-1.20412,-12.3912,-12.3912	1/1:1.76091:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:99,0,0:-9.23712,-0.90309,0,-9.23712,-0.90309,-9.23712,-9.23712,-0.90309,-9.23712,-9.23712	1/1:0.791812:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:62,0,0:-5.88885,-0.60206,0,-5.88885,-0.60206,-5.88885,-5.88885,-0.60206,-5.88885,-5.88885	1/1:0.791812:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:20,0,0:-1.99996,-0.30103,0,-1.99996,-0.30103,-1.99996,-1.99996,-0.30103,-1.99996,-1.99996	1/1:0.791812:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:59,0,0:-5.60359,-0.60206,0,-5.60359,-0.60206,-5.60359,-5.60359,-0.60206,-5.60359,-5.60359	1/1:1.76091:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:105,0,0:-9.79616,-0.90309,0,-9.79616,-0.90309,-9.79616,-9.79616,-0.90309,-9.79616,-9.79616	1/1:1.76091:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:64,0,0:-6.07837,-0.60206,0,-6.07837,-0.60206,-6.07837,-6.07837,-0.60206,-6.07837,-6.07837	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.791812:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:69,0,0:-6.55266,-0.60206,0,-6.55266,-0.60206,-6.55266,-6.55266,-0.60206,-6.55266,-6.55266	1/1:0.791812:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:35,0,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.791812:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:35,0,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	4194235	.	GGC	GGG,GAC,GGT	106213	.	AB=0.594595,0.357143,0.511628;ABP=11.6375,12.937,3.0608;AC=52,0,0;AF=0.764192,0.0040549,0.00218341;AN=52;AO=4525,26,74;CIGAR=2M1X,1M1X1M,2M1X;DP=9550;DPB=9709;DPRA=0.27552,0.945416,4.06692;EPP=9137.96,4.34659,3.47981;EPPR=52.6727;GTI=571;LEN=1,1,1;MEANALT=1.0121,1.36364,1;MQM=59.7752,60,60;MQMR=59.9927;NS=1603;NUMALT=3;ODDS=0.00579971;PAIRED=1,1,1;PAIREDR=0.984716;PAO=56,60,58;PQA=103.917,37.25,104.917;PQR=202.917;PRO=143;QA=178820,937,2497;QR=172577;RO=4907;RPL=4525,26,27;RPP=9828.92,59.4686,14.748;RPPR=130.621;RPR=0,0,47;RUN=1,1,1;SAF=81,11,20;SAP=9137.96,4.34659,36.9322;SAR=4444,15,54;SRF=2254;SRP=73.4608;SRR=2653;TYPE=snp,snp,snp;technology.illumina=1,1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:13.0103:4:0,4,0,0:0:0:4,0,0:163,0,0:-15.0584,-1.20412,0,-15.0584,-1.20412,-15.0584,-15.0584,-1.20412,-15.0584,-15.0584	1/1:0.054629:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:82,0,0:-7.77968,-0.60206,0,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:13.0103:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:78,0,0:-7.27939,-0.90309,0,-7.27939,-0.90309,-7.27939,-7.27939,-0.90309,-7.27939,-7.27939	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:13.0103:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:123,0,0:-11.4635,-0.90309,0,-11.4635,-0.90309,-11.4635,-11.4635,-0.90309,-11.4635,-11.4635	1/1:0.054629:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:38,0,0:-3.79727,-0.30103,0,-3.79727,-0.30103,-3.79727,-3.79727,-0.30103,-3.79727,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:13.0103:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:116,0,0:-10.8163,-0.90309,0,-10.8163,-0.90309,-10.8163,-10.8163,-0.90309,-10.8163,-10.8163	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:13.0103:7:0,7,0,0:0:0:7,0,0:280,0,0:-25.5669,-2.10721,0,-25.5669,-2.10721,-25.5669,-25.5669,-2.10721,-25.5669,-25.5669	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.054629:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:33,0,0:-3.29913,-0.30103,0,-3.29913,-0.30103,-3.29913,-3.29913,-0.30103,-3.29913,-3.29913	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:13.0103:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:123,0,0:-11.4648,-0.90309,0,-11.4648,-0.90309,-11.4648,-11.4648,-0.90309,-11.4648,-11.4648	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.054629:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:80,0,0:-7.59073,-0.60206,0,-7.59073,-0.60206,-7.59073,-7.59073,-0.60206,-7.59073,-7.59073	1/1:0.054629:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:41,0,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	1/1:0.054629:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:41,0,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:13.0103:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:123,0,0:-11.4648,-0.90309,0,-11.4648,-0.90309,-11.4648,-11.4648,-0.90309,-11.4648,-11.4648	1/1:0.054629:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:82,0,0:-7.77968,-0.60206,0,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968	1/1:13.0103:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:123,0,0:-11.4648,-0.90309,0,-11.4648,-0.90309,-11.4648,-11.4648,-0.90309,-11.4648,-11.4648	1/1:13.0103:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:116,0,0:-10.8155,-0.90309,0,-10.8155,-0.90309,-10.8155,-10.8155,-0.90309,-10.8155,-10.8155	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:13.0103:5:0,5,0,0:0:0:5,0,0:197,0,0:-18.1027,-1.50515,0,-18.1027,-1.50515,-18.1027,-18.1027,-1.50515,-18.1027,-18.1027	1/1:13.0103:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:119,0,0:-11.095,-0.90309,0,-11.095,-0.90309,-11.095,-11.095,-0.90309,-11.095,-11.095	1/1:0.054629:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:79,0,0:-7.49724,-0.60206,0,-7.49724,-0.60206,-7.49724,-7.49724,-0.60206,-7.49724,-7.49724	1/1:0.054629:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:38,0,0:-3.79727,-0.30103,0,-3.79727,-0.30103,-3.79727,-3.79727,-0.30103,-3.79727,-3.79727	1/1:13.0103:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:111,0,0:-10.3505,-0.90309,0,-10.3505,-0.90309,-10.3505,-10.3505,-0.90309,-10.3505,-10.3505	1/1:13.0103:4:0,4,0,0:0:0:4,0,0:159,0,0:-14.6908,-1.20412,0,-14.6908,-1.20412,-14.6908,-14.6908,-1.20412,-14.6908,-14.6908	1/1:0.054629:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:78,0,0:-7.4033,-0.60206,0,-7.4033,-0.60206,-7.4033,-7.4033,-0.60206,-7.4033,-7.4033	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.054629:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:79,0,0:-7.49724,-0.60206,0,-7.49724,-0.60206,-7.49724,-7.49724,-0.60206,-7.49724,-7.49724	1/1:13.0103:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:79,0,0:-7.49724,-0.60206,0,-7.49724,-0.60206,-7.49724,-7.49724,-0.60206,-7.49724,-7.49724	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:13.0103:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:123,0,0:-11.4622,-0.90309,0,-11.4622,-0.90309,-11.4622,-11.4622,-0.90309,-11.4622,-11.4622	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	4194245	.	GCC	GC	80684.4	.	AB=0.462963;ABP=3.6537;AC=52;AF=0.759769;AN=52;AO=3602;CIGAR=1M1D1M;DP=8951;DPB=7872.67;DPRA=0.213309;EPP=7312.18;EPPR=57.4621;GTI=585;LEN=1;MEANALT=1.00084;MQM=59.9853;MQMR=59.9936;NS=1561;NUMALT=1;ODDS=0.139886;PAIRED=1;PAIREDR=0.983901;PAO=94;PQA=135;PQR=344;PRO=165;QA=138548;QR=188851;RO=5342;RPL=3602;RPP=7824.65;RPPR=168.47;RPR=0;RUN=1;SAF=60;SAP=7312.18;SAR=3542;SRF=2394;SRP=127.769;SRR=2948;TYPE=del;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:4.77121:4:0,4:0:0:4:155:-14.3244,-1.20412,0	1/1:1.76091:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	1/1:1.76091:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:4.77121:3:0,3:0:0:3:117:-10.9086,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:4.77121:4:0,4:0:0:4:155:-14.3233,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:1:0,1:0:0:1:31:-3.09945,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:4.77121:3:0,3:0:0:3:123:-11.4648,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:2:0,2:0:0:2:80:-7.59073,-0.60206,0	1/1:1.76091:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	1/1:1.76091:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:4.77121:3:0,3:0:0:3:123:-11.4648,-0.90309,0	1/1:1.76091:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	1/1:4.77121:3:0,3:0:0:3:123:-11.4648,-0.90309,0	1/1:4.77121:3:0,3:0:0:3:109:-10.166,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:4.77121:4:0,4:0:0:4:147:-13.5874,-1.20412,0	1/1:1.76091:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	1/1:1.76091:2:0,2:0:0:2:77:-7.30914,-0.60206,0	1/1:1.76091:1:0,1:0:0:1:38:-3.79727,-0.30103,0	1/1:4.77121:3:0,3:0:0:3:107:-9.9784,-0.90309,0	1/1:4.77121:4:0,4:0:0:4:151:-13.9531,-1.20412,0	1/1:1.76091:2:0,2:0:0:2:72:-6.83432,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:2:0,2:0:0:2:70:-6.64733,-0.60206,0	1/1:1.76091:2:0,2:0:0:2:79:-7.49724,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.76091:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	4194878	.	T	G	1794.48	.	AB=0.408163;ABP=6.59988;AC=2;AF=0.108911;AN=2;AO=126;CIGAR=1X;DP=5256;DPB=5256;DPRA=0.731431;EPP=4.73369;EPPR=168.454;GTI=42;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.5079;MQMR=59.9953;NS=404;NUMALT=1;ODDS=413.194;PAIRED=0.912698;PAIREDR=0.976009;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=4521;QR=175386;RO=5127;RPL=27;RPP=92.3509;RPPR=12.6674;RPR=99;RUN=1;SAF=41;SAP=36.3751;SAR=85;SRF=2367;SRP=68.4251;SRR=2760;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1:0:0:1:41:-4.09317,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	4196107	.	T	C	7149.48	.	AB=0.559524;ABP=8.18047;AC=2;AF=0.0357386;AN=76;AO=313;CIGAR=1X;DP=6104;DPB=6104;DPRA=1.61239;EPP=13.5624;EPPR=1054.33;GTI=35;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9981;NS=1469;NUMALT=1;ODDS=0.813079;PAIRED=0.977636;PAIREDR=0.955943;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=11401;QR=211248;RO=5788;RPL=201;RPP=57.9631;RPPR=1892.18;RPR=112;RUN=1;SAF=216;SAP=101.254;SAR=97;SRF=2777;SRP=23.553;SRR=3011;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:32.13:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	0/0:29.1197:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:32.13:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45771	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:32.13:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.13:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:56.2124:10:10,0:10:386:0:0:0,-3.0103,-35.0904	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.13:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:41.1609:5:5,0:5:190:0:0:0,-1.50515,-17.4647	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.1403:3:3,0:3:117:0:0:0,-0.90309,-10.9104	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:32.13:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:29.1197:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.13:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.30914	0/0:29.1197:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	0/0:32.13:2:2,0:2:58:0:0:0,-0.60206,-5.50862	0/0:32.13:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.1506:4:4,0:4:158:0:0:0,-1.20412,-14.5998	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:29.1197:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	0/0:35.1403:3:3,0:3:118:0:0:0,-0.90309,-11.0022	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.13:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000121557:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.1403:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.1197:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:32.13:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	4253248	.	T	C	10027.1	.	AB=0.455782;ABP=5.50675;AC=2;AF=0.180247;AN=2;AO=390;CIGAR=1X;DP=3903;DPB=3903;DPRA=0.540583;EPP=72.8538;EPPR=73.6877;GTI=51;LEN=1;MEANALT=1.0122;MQM=59.9872;MQMR=59.9989;NS=405;NUMALT=1;ODDS=0.022616;PAIRED=0.994872;PAIREDR=0.985185;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=14044;QR=128253;RO=3510;RPL=233;RPP=35.1704;RPPR=9.44677;RPR=157;RUN=1;SAF=228;SAP=27.264;SAR=162;SRF=1420;SRP=280.724;SRR=2090;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00394394:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	4684635	.	G	T	1956.57	.	AB=0.48913;ABP=3.10471;AC=1;AF=0.013245;AN=10;AO=82;CIGAR=1X;DP=4453;DPB=4453;DPRA=1.19876;EPP=3.434;EPPR=133.75;GTI=2;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=453;NUMALT=1;ODDS=1.53544;PAIRED=0.963415;PAIREDR=0.961107;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=2920;QR=158959;RO=4371;RPL=42;RPP=3.11623;RPPR=23.0811;RPR=40;RUN=1;SAF=37;SAP=4.70511;SAR=45;SRF=2076;SRP=26.8369;SRR=2295;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.1853:7:7,0:7:239:0:0:0,-2.10721,-21.8427	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:21.1235:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:24.1338:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45771	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.2059:9:9,0:9:312:0:0:0,-2.70927,-28.4154	0/1:77.3239:4:1,3:1:36:3:108:-8.87105,0,-2.39415	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5068633	.	A	G	86770.7	.	AB=0.395095;ABP=38.0911;AC=28;AF=0.603462;AN=38;AO=2902;CIGAR=1X;DP=5378;DPB=5378;DPRA=0.813128;EPP=491.527;EPPR=229.518;GTI=311;LEN=1;MEANALT=1.00131;MQM=59.98;MQMR=59.9992;NS=1213;NUMALT=1;ODDS=0.00407889;PAIRED=0.993453;PAIREDR=0.987874;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=109004;QR=92811;RO=2474;RPL=1849;RPP=477.125;RPPR=450.467;RPR=1053;RUN=1;SAF=1038;SAP=513.535;SAR=1864;SRF=969;SRP=255.175;SRR=1505;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:42.6913:6:0,6:0:0:6:224:-20.5173,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00593306:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:0.00593306:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.6765:2:2,0:2:58:0:0:0,-0.60206,-5.50918	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.6501:2:0,2:0:0:2:69:-6.55228,-0.60206,0	1/1:30.6501:2:0,2:0:0:2:78:-7.40278,-0.60206,0	1/1:39.681:5:0,5:0:0:5:188:-17.2827,-1.50515,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00593306:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00593306:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.6501:2:0,2:0:0:2:78:-7.40347,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:36.6707:4:0,4:0:0:4:155:-14.3251,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0074676:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	1/1:33.6604:3:0,3:0:0:3:117:-10.9097,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.6388:1:0,1:0:0:1:38:-3.79727,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.6501:2:0,2:0:0:2:78:-7.40347,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0074676:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.6501:2:0,2:0:0:2:78:-7.40347,-0.60206,0	1/1:33.6604:3:0,3:0:0:3:115:-10.7238,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:39.681:5:0,5:0:0:5:199:-18.2885,-1.50515,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5611624	.	G	A	16737.6	.	AB=0.489691;ABP=3.36848;AC=1;AF=0.079918;AN=62;AO=847;CIGAR=1X;DP=11051;DPB=11051;DPRA=0.994801;EPP=904.541;EPPR=5441.38;GTI=93;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9894;MQMR=59.9904;NS=1708;NUMALT=1;ODDS=0.158916;PAIRED=0.835891;PAIREDR=0.695286;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=28432;QR=346150;RO=10203;RPL=152;RPP=758.921;RPPR=3737.64;RPR=695;RUN=1;SAF=129;SAP=892.419;SAR=718;SRF=2961;SRP=3903.48;SRR=7242;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:35.713:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	0/0:41.7336:5:5,0:5:167:0:0:0,-1.50515,-15.3592	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.6923:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29913	0/0:35.713:3:3,0:3:103:0:0:0,-0.90309,-9.60997	0/0:41.7336:5:5,0:5:166:0:0:0,-1.50515,-15.2675	0/0:29.6924:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:56.7851:10:10,0:10:345:0:0:0,-3.0103,-31.3834	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.6924:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:62.8057:12:12,0:12:405:0:0:0,-3.61236,-36.7757	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.713:3:3,0:3:94:0:0:0,-0.90309,-8.77133	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.7027:2:2,0:2:58:0:0:0,-0.60206,-5.50862	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.7336:5:5,0:5:163:0:0:0,-1.50515,-14.9915	0/0:35.713:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.6924:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.7542:7:7,0:7:225:0:0:0,-2.10721,-20.5655	0/0:35.713:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	0/0:29.6923:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29913	0/0:32.7027:2:2,0:2:65:0:0:0,-0.60206,-6.17329	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.7439:6:6,0:6:201:0:0:0,-1.80618,-18.4192	0/0:41.7336:5:5,0:5:154:0:0:0,-1.50515,-14.1647	0/0:56.7851:10:10,0:10:332:0:0:0,-3.0103,-30.2031	0/0:41.7336:5:5,0:5:169:0:0:0,-1.50515,-15.5431	0/0:32.7027:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45788	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:49.4394:5:1,4:1:30:4:118:-9.4077,0,-1.49442	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.7027:2:2,0:2:65:0:0:0,-0.60206,-6.17329	0/0:38.7233:4:4,0:4:135:0:0:0,-1.20412,-12.4833	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:68.8263:14:14,0:14:482:0:0:0,-4.21442,-43.7087	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.6924:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.7027:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83347	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.7026:2:2,0:2:42:0:0:0,-0.60206,-3.98979	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.7027:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83347	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5617453	.	C	A	154994	.	AB=0.504469;ABP=5.39729;AC=31;AF=0.499707;AN=58;AO=7385;CIGAR=1X;DP=15117;DPB=15117;DPRA=2.07709;EPP=3702.37;EPPR=2828.73;GTI=194;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9866;MQMR=59.984;NS=1708;NUMALT=1;ODDS=0.0685755;PAIRED=0.998646;PAIREDR=0.997801;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=247928;QR=255721;RO=7732;RPL=1811;RPP=4166.64;RPPR=2954.82;RPR=5574;RUN=1;SAF=2154;SAP=2786.94;SAR=5231;SRF=2629;SRP=1721.95;SRR=5103;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:29.3184:8:3,5:3:97:5:154:-11.7563,0,-6.64269	0/1:29.3184:10:4,6:4:128:6:200:-15.3174,0,-8.82681	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:32.3274:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	0/1:29.3184:8:5,3:5:156:3:96:-6.54904,0,-11.94	0/1:-0:6:1,5:1:31:5:167:-13.5532,0,-1.29327	0/1:29.3184:5:2,3:2:66:3:103:-8.10482,0,-4.76303	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.3184:14:5,9:5:167:9:296:-22.7454,0,-11.145	0/1:29.3184:4:3,1:3:103:1:33:-2.09501,0,-8.40585	0/1:29.3184:7:2,5:2:57:5:143:-11.0454,0,-3.30711	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.3184:17:10,7:10:303:7:218:-14.8088,0,-22.4487	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.3184:4:2,2:2:55:2:68:-5.25376,0,-4.01999	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.3184:4:1,3:1:33:3:99:-8.03346,0,-2.09501	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.3184:7:3,4:3:97:4:125:-9.45232,0,-6.944	0/1:29.3184:6:4,2:4:132:2:60:-3.89279,0,-10.4006	0/1:29.3184:9:4,5:4:119:5:173:-13.2009,0,-8.29645	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.3184:10:4,6:4:128:6:208:-16.0493,0,-8.82698	0/1:29.3184:3:1,2:1:33:2:68:-5.55479,0,-2.39604	0/1:29.3184:5:2,3:2:70:3:99:-7.73225,0,-5.14225	0/1:29.3184:2:1,1:1:33:1:33:-2.69707,0,-2.69707	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.3184:9:5,4:5:167:4:138:-10.0511,0,-12.6501	0/1:29.3184:6:2,4:2:62:4:138:-10.9542,0,-4.08267	0/1:29.3184:11:8,3:8:246:3:101:-6.11244,0,-19.1304	0/1:29.3184:2:1,1:1:33:1:31:-2.49739,0,-2.69707	0/1:-0:4:3,1:3:88:1:29:-1.69554,0,-7.00709	0/1:-0:5:4,1:4:128:1:29:-1.39451,0,-10.3321	1/1:32.3274:3:0,3:0:0:3:83:-7.74518,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.3184:7:2,5:2:59:5:148:-11.5061,0,-3.49638	0/1:29.3184:11:8,3:8:251:3:99:-5.92607,0,-19.5872	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.3184:14:5,9:5:150:9:286:-21.836,0,-9.58341	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5619076	.	T	A	21399.2	.	AB=0.431515;ABP=109.787;AC=2;AF=0.101284;AN=44;AO=1179;CIGAR=1X;DP=12225;DPB=12225;DPRA=1.24876;EPP=578.535;EPPR=6476.66;GTI=31;LEN=1;MEANALT=1.00362;MQM=59.9059;MQMR=59.9782;NS=1402;NUMALT=1;ODDS=0.0511463;PAIRED=1;PAIREDR=1;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=40708;QR=385418;RO=11044;RPL=939;RPP=902.912;RPPR=9137.56;RPR=240;RUN=1;SAF=959;SAP=1008.85;SAR=220;SRF=8979;SRP=9402.12;SRR=2065;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:72.2261:14:14,0:14:475:0:0:0,-4.21442,-43.0741	0/0:57.1746:9:9,0:9:313:0:0:0,-2.70927,-28.5071	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.1334:5:5,0:5:171:0:0:0,-1.50515,-15.7265	0/0:51.154:7:7,0:7:235:0:0:0,-2.10721,-21.4781	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:66.2054:12:12,0:12:408:0:0:0,-3.61236,-37.0467	0/0:45.1334:5:5,0:5:175:0:0:0,-1.50515,-16.0937	0/0:57.1746:9:9,0:9:311:0:0:0,-2.70927,-28.3252	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:69.2158:13:13,0:13:446:0:0:0,-3.91339,-40.4688	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:63.1952:11:11,0:11:378:0:0:0,-3.31133,-34.3514	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.1334:5:5,0:5:164:0:0:0,-1.50515,-15.0831	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.1231:4:4,0:4:139:0:0:0,-1.20412,-12.8527	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.154:7:7,0:7:245:0:0:0,-2.10721,-22.3912	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:60.1849:10:10,0:10:340:0:0:0,-3.0103,-30.9298	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.1128:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:49.2563:6:2,4:2:64:4:138:-10.9539,0,-4.27219	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:60.1849:10:10,0:10:337:0:0:0,-3.0103,-30.6562	0/0:39.1128:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:57.1746:9:9,0:9:307:0:0:0,-2.70927,-27.9613	0/1:39.0361:5:3,2:3:104:2:70:-5.14225,0,-8.19794	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.1437:6:6,0:6:204:0:0:0,-1.80618,-18.6934	0/0:42.1231:4:4,0:4:126:0:0:0,-1.20412,-11.652	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:60.1849:10:10,0:10:344:0:0:0,-3.0103,-31.2928	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5632407	.	G	A	1249.26	.	AB=0.310345;ABP=12.0706;AC=2;AF=0.0171158;AN=42;AO=77;CIGAR=1X;DP=5086;DPB=5086;DPRA=0.979998;EPP=50.4161;EPPR=2500.79;GTI=31;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9111;NS=1373;NUMALT=1;ODDS=0.0910849;PAIRED=0.987013;PAIREDR=0.997598;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=2701;QR=183420;RO=4995;RPL=65;RPP=82.2267;RPPR=2748.4;RPR=12;RUN=1;SAF=20;SAP=41.6174;SAR=57;SRF=956;SRP=4135.06;SRR=4039;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:37.9796:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.7245	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.0001:5:5,0:5:199:0:0:0,-1.50515,-18.2887	0/0:37.9796:3:3,0:3:112:0:0:0,-0.90309,-10.4437	0/0:31.959:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.0001:5:5,0:5:190:0:0:0,-1.50515,-17.4657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.29931e-11:2:0,2:0:0:2:73:-6.9307,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9796:3:3,0:3:117:0:0:0,-0.90309,-10.9099	0/0:34.9693:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59179	0/0:31.959:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.9899:4:4,0:4:160:0:0:0,-1.20412,-14.7838	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.959:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:31.959:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.9693:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.3082	0/0:37.9796:3:3,0:3:106:0:0:0,-0.90309,-9.88783	0/0:37.9796:3:3,0:3:110:0:0:0,-0.90309,-10.2589	0/0:31.959:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:31.959:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:34.9693:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	0/0:31.959:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9796:3:3,0:3:117:0:0:0,-0.90309,-10.9102	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.9693:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5633731	.	CGTCC	TGTCC	36467	.	AB=0.342213;ABP=1115.19;AC=11;AF=0.430645;AN=14;AO=1934;CIGAR=1X4M;DP=7815;DPB=8158.6;DPRA=1.44491;EPP=26.2924;EPPR=3.51716;GTI=119;LEN=1;MEANALT=1.02015;MQM=59.7539;MQMR=59.9497;NS=620;NUMALT=1;ODDS=0.00653949;PAIRED=0.380041;PAIREDR=0.933333;PAO=148;PQA=799.5;PQR=1781.5;PRO=493.5;QA=68652;QR=200955;RO=5865;RPL=1430;RPP=965.774;RPPR=886.788;RPR=504;RUN=1;SAF=1133;SAP=126.769;SAR=801;SRF=3552;SRP=571.377;SRR=2313;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.2377:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	1/1:21.7272:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	1/1:0.0267433:1:0,1:0:0:1:38:-3.79727,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.6401:3:2,1:2:79:1:38:-2.89148,0,-6.59454	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:21.811:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:21.811:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0267433:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5633783	.	T	C	3517.52	.	AB=0.202323;ABP=798.078;AC=11;AF=0.3371;AN=12;AO=565;CIGAR=1X;DP=5009;DPB=5009;DPRA=2.53647;EPP=105.123;EPPR=122.254;GTI=198;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8124;MQMR=59.9761;NS=531;NUMALT=1;ODDS=0.00279002;PAIRED=0.649558;PAIREDR=0.986274;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=18482;QR=156909;RO=4444;RPL=565;RPP=1229.89;RPPR=685.687;RPR=0;RUN=1;SAF=364;SAP=105.123;SAR=201;SRF=2378;SRP=50.5755;SRR=2066;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00775657:1:0,1:0:0:1:31:-3.09945,-0.30103,0	1/1:0.00160961:1:0,1:0:0:1:24:-2.39989,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.00430362:3:2,1:2:61:1:27:-1.79648,0,-4.89098	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00775657:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00775657:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00775657:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5637509	.	C	T	14506	.	AB=0.396761;ABP=25.8767;AC=10;AF=0.132126;AN=46;AO=741;CIGAR=1X;DP=9262;DPB=9262;DPRA=0.661145;EPP=715.256;EPPR=1801.35;GTI=166;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9836;NS=1491;NUMALT=1;ODDS=0.00895762;PAIRED=0.982456;PAIREDR=0.977459;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=25791;QR=297576;RO=8518;RPL=623;RPP=750.351;RPPR=1914.11;RPR=118;RUN=1;SAF=633;SAP=810.719;SAR=108;SRF=5519;SRP=1621.9;SRR=2999;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:18.2891:5:0,5:0:0:5:174:-16.002,-1.50515,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.4841:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	1/1:0.0554521:5:0,5:0:0:5:171:-15.7265,-1.50515,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.4945:2:2,0:2:67:0:0:0,-0.60206,-6.36304	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.5048:3:3,0:3:90:0:0:0,-0.90309,-8.3974	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.5151:4:4,0:4:140:0:0:0,-1.20412,-12.9449	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.5151:4:4,0:4:140:0:0:0,-1.20412,-12.9449	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0276375:4:0,4:0:0:4:140:-12.9449,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.4945:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	0/0:36.4841:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:42.5048:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.4945:2:2,0:2:69:0:0:0,-0.60206,-6.55266	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.4841:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:36.4841:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.4945:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	1/1:0.0276375:4:0,4:0:0:4:139:-12.8527,-1.20412,0	0/0:45.5151:4:4,0:4:140:0:0:0,-1.20412,-12.9449	0/0:39.4945:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	1/1:0.00689291:2:0,2:0:0:2:69:-6.55266,-0.60206,0	0/0:36.4841:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.484:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	0/0:36.484:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:54.546:7:7,0:7:242:0:0:0,-2.10721,-22.1176	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5642722	.	C	T	39256.2	.	AB=0.306508;ABP=2156.77;AC=2;AF=0.219589;AN=6;AO=2068;CIGAR=1X;DP=8763;DPB=8763;DPRA=5.11464;EPP=103.919;EPPR=28.2725;GTI=11;LEN=1;MEANALT=1.01481;MQM=59.8148;MQMR=59.9483;NS=633;NUMALT=1;ODDS=0.190416;PAIRED=0.974855;PAIREDR=0.978329;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=71600;QR=236024;RO=6691;RPL=1376;RPP=494.275;RPPR=45.7741;RPR=692;RUN=1;SAF=1417;SAP=619.125;SAR=651;SRF=3569;SRP=67.8556;SRR=3122;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:27.0841:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29913	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:29.8326:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.0302:1:1,0:1:30:0:0:0,-0.30103,-2.99957	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5642734	.	CAGTC	TAGTT,TAGTC	22506.6	.	AB=0.243445,0.291457;ABP=3295.48,378.871;AC=2,0;AF=0.180599,0.0283912;AN=8;AO=1447,342;CIGAR=1X3M1X,1X4M;DP=8013;DPB=8378;DPRA=8.27943,7.90971;EPP=19.5552,5.06748;EPPR=108.154;GTI=47;LEN=5,1;MEANALT=1.07627,1.21053;MQM=59.7153,59.9123;MQMR=59.951;NS=634;NUMALT=2;ODDS=0.0133483;PAIRED=1,0.997076;PAIREDR=0.991293;PAO=99.5,189;PQA=970,889;PQR=1508.5;PRO=309.5;QA=46947,11840;QR=213465;RO=6202;RPL=971,207;RPP=370.712,35.9253;RPPR=52.5095;RPR=476,135;RUN=1,1;SAF=990,185;SAP=429.335,7.98818;SAR=457,157;SRF=3312;SRP=65.3619;SRR=2890;TYPE=complex,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:27.8633:1:1,0,0:1:37:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.69783,-0.30103,-3.69783,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:31.842:1:0,1,0:0:0:1,0:36,0:-3.59827,-0.30103,0,-3.59827,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.8633:1:1,0,0:1:37:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.69783,-0.30103,-3.69783,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.7989:1:1,0,0:1:22:0,0:0,0:0,-0.30103,-2.19993,-0.30103,-2.19993,-2.19993	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5642783	.	T	C	22447.9	.	AB=0.218168;ABP=4635.77;AC=2;AF=0.204791;AN=8;AO=1492;CIGAR=1X;DP=8143;DPB=8143;DPRA=7.99435;EPP=430.557;EPPR=206.317;GTI=22;LEN=1;MEANALT=1.00755;MQM=59.8405;MQMR=59.968;NS=647;NUMALT=1;ODDS=0.106447;PAIRED=1;PAIREDR=0.992931;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=54127;QR=234207;RO=6649;RPL=544;RPP=240.557;RPPR=47.962;RPR=948;RUN=1;SAF=1223;SAP=1327.6;SAR=269;SRF=3526;SRP=56.0509;SRR=3123;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:33.3414:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.7978:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.3414:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.3106:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5650840	.	C	T	51888.2	.	AB=0.372401;ABP=900.744;AC=2;AF=0.495086;AN=2;AO=2462;CIGAR=1X;DP=7322;DPB=7322;DPRA=1.76694;EPP=3.0985;EPPR=190.626;GTI=48;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.7344;MQMR=59.9893;NS=407;NUMALT=1;ODDS=0.0310368;PAIRED=0.583672;PAIREDR=0.971811;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=84105;QR=178421;RO=4860;RPL=1492;RPP=243.34;RPPR=303.442;RPR=970;RUN=1;SAF=1186;SAP=10.1545;SAR=1276;SRF=3062;SRP=716.869;SRR=1798;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:18.9923:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5650894	.	CCA	CCG,TCG	52151.3	.	AB=0.311815,0.361963;ABP=1856.59,29.9872;AC=2,0;AF=0.54875,0.0125;AN=2;AO=2457,60;CIGAR=2M1X,1X1M1X;DP=6838;DPB=7078.67;DPRA=5.84091,2.91196;EPP=235.596,3.0103;EPPR=213.068;GTI=63;LEN=1,3;MEANALT=1.04261,2;MQM=59.9304,59.9833;MQMR=59.9942;NS=400;NUMALT=2;ODDS=0.00254137;PAIRED=0.885633,0.95;PAIREDR=0.98076;PAO=172,84.5;PQA=394.5,186;PQR=338.5;PRO=203.5;QA=86455,1981;QR=149525;RO=4314;RPL=1163,34;RPP=18.177,5.32654;RPPR=59.1625;RPR=1294,26;RUN=1,1;SAF=871,28;SAP=454.826,3.58936;SAR=1586,32;SRF=2638;SRP=468.837;SRR=1676;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:18.5942:1:0,1,0:0:0:1,0:35,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5650999	.	TCC	CCC,CCT	157504	.	AB=0.500106,0.398126;ABP=3.01122,41.5018;AC=26,0;AF=0.547064,0.00362027;AN=46;AO=6062,196;CIGAR=1X2M,1X1M1X;DP=11234;DPB=11451.7;DPRA=7.08475,17.0855;EPP=126.859,32.9678;EPPR=60.2655;GTI=12;LEN=1,3;MEANALT=1.01553,1.9;MQM=59.987,59.9847;MQMR=59.9994;NS=1243;NUMALT=2;ODDS=0.0944224;PAIRED=0.598317,0.933673;PAIREDR=0.972837;PAO=174.5,48;PQA=272.5,131;PQR=327.5;PRO=208.5;QA=216630,7075;QR=172415;RO=4970;RPL=2386,93;RPP=599.108,4.11819;RPPR=560.908;RPR=3676,103;RUN=1,1;SAF=2563,99;SAP=316.837,3.05462;SAR=3499,97;SRF=2124;SRP=230.768;SRR=2846;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:1.24939:5:2,3,0:2:61:3,0:99,0:-7.73197,0,-4.28877,-8.33403,-5.19186,-13.211	1/1:3.0103:4:0,4,0:0:0:4,0:125,0:-11.5587,-1.20412,0,-11.5587,-1.20412,-11.5587	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:20,0:-1.99996,-0.30103,0,-1.99996,-0.30103,-1.99996	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:35,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863	0/1:1.24939:2:1,1,0:1:35:1,0:35,0:-2.89657,0,-2.89657,-3.1976,-3.1976,-6.04534	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:35,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.0103:1:1,0,0:1:35:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.24939:2:1,1,0:1:25:1,0:33,0:-2.69707,0,-1.8978,-2.9981,-2.19883,-4.90699	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.24939:2:1,1,0:1:35:1,0:35,0:-2.89657,0,-2.89657,-3.1976,-3.1976,-6.04534	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.24939:2:1,1,0:1:35:1,0:35,0:-2.89657,0,-2.89657,-3.1976,-3.1976,-6.04534	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:35,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.24939:3:1,2,0:1:34:2,0:70,0:-5.74431,0,-2.49582,-6.04534,-3.09788,-8.8	0/0:3.0103:2:2,0,0:2:68:0,0:0,0:0,-0.60206,-6.45788,-0.60206,-6.45788,-6.45788	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:35,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.24939:5:2,3,0:2:67:3,0:105,0:-8.29101,0,-4.85799,-8.89307,-5.76108,-14.3133	0/1:1.24939:4:1,3,0:1:34:3,0:93,0:-7.47424,0,-2.19479,-7.77527,-3.09788,-10.5407	0/1:1.24939:3:1,2,0:1:34:2,0:70,0:-5.74431,0,-2.49582,-6.04534,-3.09788,-8.8	0/1:1.24939:6:1,5,0:1:35:5,0:165,0:-13.3694,0,-1.69245,-13.6704,-3.1976,-16.5215	0/1:1.24939:2:1,1,0:1:35:1,0:33,0:-2.69707,0,-2.89657,-2.9981,-3.1976,-5.85582	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:27,0:-2.69978,-0.30103,0,-2.69978,-0.30103,-2.69978	0/0:3.0103:2:2,0,0:2:56:0,0:0,0:0,-0.60206,-5.31948,-0.60206,-5.31948,-5.31948	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.0103:2:2,0,0:2:62:0,0:0,0:0,-0.60206,-5.88871,-0.60206,-5.88871,-5.88871	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.24939:7:3,4,0:3:104:4,0:115,0:-8.52828,0,-7.59588,-9.43137,-8.8,-17.9102	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5651047	.	CCAT	TCAC,CCAC	121080	.	AB=0.471812,0.0488798;ABP=70.7089,870.931;AC=27,0;AF=0.517606,0.0125196;AN=54;AO=5201,361;CIGAR=1X2M1X,3M1X;DP=11193;DPB=11575.8;DPRA=4.43931,23.6088;EPP=499.965,4.74868;EPPR=121.962;GTI=17;LEN=4,1;MEANALT=1.01471,1.30435;MQM=59.9831,59.9806;MQMR=59.9988;NS=1278;NUMALT=2;ODDS=0.119012;PAIRED=0.536051,0.501385;PAIREDR=0.97937;PAO=342,182;PQA=787,430;PQR=463;PRO=241;QA=176347,12871;QR=200267;RO=5623;RPL=3271,218;RPP=753.812,36.8456;RPPR=421.503;RPR=1930,143;RUN=1,1;SAF=2241,188;SAP=218.847,4.36371;SAR=2960,173;SRF=2485;SRP=167.68;SRR=3138;TYPE=complex,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:1.24939:6:3,3,0:3:103:3,0:109,0:-8.36076,0,-7.80061,-9.26385,-8.7037,-17.6144	1/1:3.0103:3:0,3,0:0:0:3,0:116,0:-10.8175,-0.90309,0,-10.8175,-0.90309,-10.8175	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.0103:1:1,0,0:1:29:0,0:0,0:0,-0.30103,-2.89966,-0.30103,-2.89966,-2.89966	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:39,0:-3.89656,-0.30103,0,-3.89656,-0.30103,-3.89656	0/1:1.24939:2:1,1,0:1:41:1,0:30,0:-2.39751,0,-3.49251,-2.69854,-3.79354,-6.13737	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:40,0:-3.99568,-0.30103,0,-3.99568,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.0103:1:1,0,0:1:39:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.89656,-0.30103,-3.89656,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:40,0:-3.99568,-0.30103,0,-3.99568,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.24939:2:1,1,0:1:40:1,0:39,0:-3.2945,0,-3.39362,-3.59553,-3.69465,-6.89557	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.24939:2:1,1,0:1:41:1,0:39,0:-3.2945,0,-3.49251,-3.59553,-3.79354,-6.98951	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:39,0:-3.89656,-0.30103,0,-3.89656,-0.30103,-3.89656	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:36,0:-3.59827,-0.30103,0,-3.59827,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.0103:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	0/1:1.24939:3:1,2,0:1:38:2,0:80,0:-6.68848,0,-2.89418,-6.98951,-3.49624,-10.0994	0/0:3.0103:2:2,0,0:2:81:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.68573,-0.60206,-7.68573,-7.68573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:39,0:-3.89656,-0.30103,0,-3.89656,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.24939:5:2,3,0:2:78:3,0:116,0:-9.31255,0,-5.89763,-9.91461,-6.80072,-16.327	0/1:1.24939:4:1,3,0:1:40:3,0:110,0:-9.05549,0,-2.79156,-9.35652,-3.69465,-12.6599	0/1:1.24939:3:1,2,0:1:40:2,0:76,0:-6.31158,0,-3.09259,-6.61261,-3.69465,-9.91431	0/1:1.24939:6:1,5,0:1:40:5,0:187,0:-15.3853,0,-2.1895,-15.6863,-3.69465,-18.9857	0/1:1.24939:2:1,1,0:1:41:1,0:38,0:-3.19521,0,-3.49251,-3.49624,-3.79354,-6.89518	1/1:3.0103:1:0,1,0:0:0:1,0:38,0:-3.79727,-0.30103,0,-3.79727,-0.30103,-3.79727	0/0:3.0103:2:2,0,0:2:68:0,0:0,0:0,-0.60206,-6.45788,-0.60206,-6.45788,-6.45788	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.0103:2:2,0,0:2:77:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.30914,-0.60206,-7.30914,-7.30914	0/0:3.0103:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.24939:7:3,4,0:3:120:4,0:126,0:-9.54469,0,-9.08048,-10.4478,-10.2846,-20.3691	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.0103:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5651055	.	A	G	146155	.	AB=0.488726;ABP=14.3204;AC=26;AF=0.529938;AN=54;AO=5742;CIGAR=1X;DP=11431;DPB=11431;DPRA=7.60188;EPP=249.906;EPPR=138.619;GTI=0;LEN=1;MEANALT=1.00102;MQM=59.9815;MQMR=59.9988;NS=1286;NUMALT=1;ODDS=0.663851;PAIRED=0.556078;PAIREDR=0.971167;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=207400;QR=207882;RO=5688;RPL=3665;RPP=956.667;RPPR=412.756;RPR=2077;RUN=1;SAF=2350;SAP=413.618;SAR=3392;SRF=2458;SRP=230.535;SRR=3230;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:90.8829:6:3,3:3:105:3:114:-8.82391,0,-7.98834	1/1:35.5855:4:0,4:0:0:4:151:-13.9557,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.5618:1:1,0:1:30:0:0:0,-0.30103,-2.99957	1/1:26.5504:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	0/1:45.201:2:1,1:1:40:1:40:-3.39362,0,-3.39362	1/1:26.5504:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.5846:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:40.2305:2:1,1:1:35:1:35:-2.89657,0,-2.89657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:47.9478:3:1,2:1:41:2:65:-5.26665,0,-3.19148	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:46.1899:2:1,1:1:41:1:41:-3.49251,0,-3.49251	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.5493:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	1/1:26.5493:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.5808:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/1:46.0872:3:1,2:1:39:2:80:-6.68848,0,-2.99347	0/0:32.5975:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.5504:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:76.9345:5:2,3:2:82:3:121:-9.77505,0,-6.27453	0/1:45.0599:4:1,3:1:41:3:111:-9.14798,0,-2.89045	0/1:48.0644:3:1,2:1:41:2:79:-6.59454,0,-3.19148	0/1:38.0505:6:1,5:1:40:5:196:-16.2061,0,-2.1895	0/1:45.4977:2:1,1:1:41:1:40:-3.39362,0,-3.49251	1/1:26.5493:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	0/0:32.5975:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9311	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.5975:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49724	0/0:29.5808:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:91.3053:6:3,3:3:123:3:108:-8.26683,0,-9.65861	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.5808:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5653139	.	CC	CG	35411	.	AB=0.537037;ABP=4.2971;AC=6;AF=0.451261;AN=8;AO=1268;CIGAR=1M1X;DP=3810;DPB=3842.5;DPRA=0.609807;EPP=20.1355;EPPR=478.068;GTI=157;LEN=1;MEANALT=1.00355;MQM=59.9779;MQMR=59.9689;NS=595;NUMALT=1;ODDS=0.162086;PAIRED=0.786278;PAIREDR=0.624754;PAO=31.5;PQA=95.5;PQR=95.5;PRO=31.5;QA=46542;QR=92969;RO=2537;RPL=997;RPP=905.637;RPPR=370.222;RPR=271;RUN=1;SAF=939;SAP=640.238;SAR=329;SRF=1485;SRP=163.486;SRR=1052;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.3743:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.7238	1/1:22.5851:3:0,3:0:0:3:117:-10.9086,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00953375:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00953375:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5659906	.	G	A	2788.54	.	AB=0.354839;ABP=8.68415;AC=2;AF=0.0913598;AN=16;AO=157;CIGAR=1X;DP=2949;DPB=2949;DPRA=0.608984;EPP=76.7159;EPPR=250.409;GTI=59;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8025;MQMR=59.918;NS=706;NUMALT=1;ODDS=0.620009;PAIRED=1;PAIREDR=0.998567;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=5487;QR=96631;RO=2792;RPL=121;RPP=102.94;RPPR=238.279;RPR=36;RUN=1;SAF=40;SAP=85.0145;SAR=117;SRF=1083;SRP=307.791;SRR=1709;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.3571:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02588	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.3468:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.3571:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.3468:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00579611:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.3571:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49724	0/0:31.3468:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.3468:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5659935	.	C	A	2664.83	.	AB=0.313725;ABP=18.3809;AC=2;AF=0.0855856;AN=16;AO=148;CIGAR=1X;DP=3987;DPB=3987;DPRA=0.485883;EPP=45.7942;EPPR=40.3699;GTI=62;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.6959;MQMR=59.9276;NS=777;NUMALT=1;ODDS=0.264772;PAIRED=1;PAIREDR=0.995572;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=5292;QR=139371;RO=3839;RPL=97;RPP=34.0565;RPPR=118.061;RPR=51;RUN=1;SAF=44;SAP=55.8299;SAR=104;SRF=1461;SRP=478.646;SRR=2378;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.7082:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6978:1:1,0:1:30:0:0:0,-0.30103,-2.99957	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.7082:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.7082:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49763	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00642055:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.7082:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	0/0:33.6978:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6978:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5659941	.	A	G	11311.8	.	AB=0.347826;ABP=40.0197;AC=2;AF=0.183504;AN=16;AO=503;CIGAR=1X;DP=4171;DPB=4171;DPRA=0.752812;EPP=5.29402;EPPR=182.989;GTI=112;LEN=1;MEANALT=1.00649;MQM=59.6143;MQMR=59.9569;NS=782;NUMALT=1;ODDS=0.196871;PAIRED=0.998012;PAIREDR=0.995632;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=17584;QR=129709;RO=3663;RPL=113;RPP=334.253;RPPR=396.771;RPR=390;RUN=1;SAF=181;SAP=88.8374;SAR=322;SRF=1400;SRP=444.519;SRR=2263;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.4039:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.3933:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.4039:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02588	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.4039:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02588	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0056986:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.4039:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83664	0/0:30.3935:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.3935:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5663460	.	TGTC	CGTC	12399.2	.	AB=0.247743;ABP=2084.53;AC=9;AF=0.322623;AN=32;AO=1425;CIGAR=1X3M;DP=7546;DPB=7894.75;DPRA=4.92774;EPP=506.83;EPPR=379.69;GTI=212;LEN=1;MEANALT=1.04778;MQM=59.8814;MQMR=59.9973;NS=1136;NUMALT=1;ODDS=0.000547189;PAIRED=0.957193;PAIREDR=0.974142;PAO=232.5;PQA=302.5;PQR=453.5;PRO=323.5;QA=48352;QR=205963;RO=6033;RPL=39;RPP=2767.88;RPPR=423.613;RPR=1386;RUN=1;SAF=426;SAP=503.331;SAR=999;SRF=2725;SRP=125.347;SRR=3308;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:44.6079:1:1,0:1:24:0:0:0,-0.30103,-2.39989	0/1:31.0955:2:1,1:1:34:1:35:-2.89657,0,-2.79685	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.6182:1:1,0:1:26:0:0:0,-0.30103,-2.59983	0/0:44.6331:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:36.8083:6:4,2:4:125:2:60:-3.89297,0,-9.75326	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.1483:2:0,2:0:0:2:70:-6.6474,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.6331:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.5801:1:1,0:1:21:0:0:0,-0.30103,-2.09995	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.111:2:1,1:1:34:1:33:-2.69707,0,-2.79685	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.6462:2:2,0:2:65:0:0:0,-0.60206,-6.17345	1/1:0.0137772:1:0,1:0:0:1:24:-2.39989,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:53.6668:4:4,0:4:139:0:0:0,-1.20412,-12.8527	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.0027902:2:1,1:1:35:1:20:-1.3979,0,-2.89657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.6337:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.6331:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:46.9098:4:1,3:1:34:3:103:-8.40585,0,-2.19479	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5663525	.	G	A	33083.9	.	AB=0.507716;ABP=4.35072;AC=2;AF=0.107581;AN=42;AO=1421;CIGAR=1X;DP=13411;DPB=13411;DPRA=1.50909;EPP=3.96538;EPPR=4.82137;GTI=49;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9958;MQMR=59.9815;NS=1385;NUMALT=1;ODDS=0.0123704;PAIRED=0.976073;PAIREDR=0.962886;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=50945;QR=435070;RO=11990;RPL=724;RPP=4.12431;RPPR=4.61056;RPR=697;RUN=1;SAF=547;SAP=166.412;SAR=874;SRF=4493;SRP=1637.32;SRR=7497;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:41.6184:4:4,0:4:142:0:0:0,-1.20412,-13.128	0/0:38.6081:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.7224	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.5873:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:32.5873:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:53.6596:8:8,0:8:305:0:0:0,-2.40824,-27.8056	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.5867:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.6081:3:3,0:3:117:0:0:0,-0.90309,-10.9086	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.6081:3:3,0:3:110:0:0:0,-0.90309,-10.2593	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.5865:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.5978:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49763	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:34.67:3:2,1:2:75:1:39:-2.99347,0,-6.2165	0/0:32.5871:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	0/0:32.5834:1:1,0:1:28:0:0:0,-0.30103,-2.79973	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.1434:6:1,5:1:24:5:193:-15.9352,0,-0.593711	0/0:32.5859:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	0/0:41.6184:4:4,0:4:150:0:0:0,-1.20412,-13.8647	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.5872:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:35.5978:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02543	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.5867:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:32.5873:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.6287:5:5,0:5:193:0:0:0,-1.50515,-17.7385	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5663885	.	CATC	CATT	120219	.	AB=0.486648;ABP=17.7972;AC=7;AF=0.471257;AN=14;AO=4849;CIGAR=3M1X;DP=10625;DPB=10992;DPRA=4.55935;EPP=22.1989;EPPR=65.709;GTI=4;LEN=1;MEANALT=1.03202;MQM=59.9876;MQMR=59.9997;NS=748;NUMALT=1;ODDS=0.129232;PAIRED=0.941019;PAIREDR=0.968625;PAO=261;PQA=514;PQR=598;PRO=374.5;QA=175510;QR=198603;RO=5737;RPL=2391;RPP=5.02056;RPPR=6.72001;RPR=2458;RUN=1;SAF=2339;SAP=16.105;SAR=2510;SRF=2769;SRP=17.9994;SRR=2968;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.0533:1:0,1:0:0:1:30:-2.99957,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:39.2531:2:1,1:1:35:1:35:-2.89657,0,-2.89657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:39.2531:2:1,1:1:35:1:35:-2.89657,0,-2.89657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.0816:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.493:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:28.4734:1:1,0:1:28:0:0:0,-0.30103,-2.79973	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:39.2531:2:1,1:1:35:1:35:-2.89657,0,-2.89657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5664004	.	G	T	91719.7	.	AB=0.28375;ABP=7861.91;AC=28;AF=0.415006;AN=58;AO=5546;CIGAR=1X;DP=21740;DPB=21740;DPRA=2.08822;EPP=5066.08;EPPR=3711.09;GTI=389;LEN=1;MEANALT=1.002;MQM=59.9776;MQMR=59.9922;NS=1806;NUMALT=1;ODDS=0.0106354;PAIRED=0.93581;PAIREDR=0.959605;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=206690;QR=577921;RO=16190;RPL=4429;RPP=4297.93;RPPR=12138.3;RPR=1117;RUN=1;SAF=4638;SAP=5450.45;SAR=908;SRF=10649;SRP=3502.54;SRR=5541;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:29.5605:12:7,5:7:238:5:171:-12.1099,0,-18.1393	0/1:29.5605:14:10,4:10:361:4:157:-10.2933,0,-28.6202	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:-0:4:3,1:3:94:1:38:-2.59315,0,-7.56593	0/1:29.5605:6:3,3:3:104:3:119:-9.28921,0,-7.89654	0/1:29.5605:10:8,2:8:292:2:80:-4.58149,0,-23.6188	0/1:29.5605:10:6,4:6:195:4:154:-11.2217,0,-14.8585	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.5605:22:18,4:18:642:4:159:-8.06929,0,-51.4861	0/0:32.5696:5:5,0:5:188:0:0:0,-1.50515,-17.2834	0/1:29.5605:9:7,2:7:244:2:73:-4.22143,0,-19.5898	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:-0:22:19,3:19:689:3:106:-3.26555,0,-55.7164	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.5605:11:8,3:8:271:3:112:-7.1344,0,-21.4059	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:-0:7:6,1:6:223:1:40:-1.88847,0,-18.3214	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.5605:12:7,5:7:253:5:169:-11.9261,0,-19.5076	0/1:29.5605:7:5,2:5:171:2:77:-5.20193,0,-13.6188	0/1:29.5605:8:5,3:5:182:3:120:-8.77945,0,-14.3266	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:-0:13:12,1:12:433:1:40:-0.0822893,0,-35.3959	0/1:-0:4:3,1:3:109:1:40:-2.79156,0,-8.96388	0/1:29.5605:7:4,3:4:148:3:119:-8.98818,0,-11.5743	0/1:29.5605:12:9,3:9:334:3:118:-7.39015,0,-26.7992	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.5605:15:12,3:12:433:3:99:-4.72199,0,-34.7941	0/1:29.5605:13:10,3:10:340:3:120:-7.27392,0,-27.0132	0/1:29.5605:22:18,4:18:636:4:162:-8.3443,0,-50.9427	0/1:29.5605:3:1,2:1:35:2:64:-5.17501,0,-2.59554	0/1:-0:3:2,1:2:73:1:34:-2.49582,0,-6.02821	0/1:29.5605:12:9,3:9:320:3:117:-7.29693,0,-25.529	0/1:29.5605:5:3,2:3:110:2:78:-5.89832,0,-8.75403	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:-0:7:6,1:6:216:1:40:-1.88847,0,-17.6829	0/1:29.5605:13:9,4:9:328:4:152:-10.1358,0,-25.9548	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.5605:14:10,4:10:359:4:153:-9.92646,0,-28.4371	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5664101	.	CGAT	TGAT,CGAC,TGAC	333695	.	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SL2.50ch00	5664210	.	C	T	134056	.	AB=0.487639;ABP=16.6991;AC=27;AF=0.493647;AN=52;AO=5531;CIGAR=1X;DP=11912;DPB=11912;DPRA=3.72983;EPP=501.663;EPPR=117.13;GTI=1;LEN=1;MEANALT=1.00204;MQM=59.9951;MQMR=59.9898;NS=1338;NUMALT=1;ODDS=0.262702;PAIRED=0.978304;PAIREDR=0.965512;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=194958;QR=225831;RO=6379;RPL=2312;RPP=325.983;RPPR=66.2451;RPR=3219;RUN=1;SAF=3377;SAP=590.234;SAR=2154;SRF=3847;SRP=591.655;SRR=2532;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.1124:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:45.0968:3:1,2:1:37:2:71:-5.83881,0,-2.79474	0/1:42.1227:3:1,2:1:34:2:74:-6.12279,0,-2.49582	0/0:30.8866:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:40.1496:2:1,1:1:34:1:35:-2.89657,0,-2.79685	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9017:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02588	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:35.1649:4:0,4:0:0:4:128:-11.8366,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.1168:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8861:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:30.8866:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	1/1:29.1442:2:0,2:0:0:2:73:-6.9313,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:41.2909:2:1,1:1:35:1:37:-3.09577,0,-2.89657	0/0:30.8853:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	1/1:29.1442:2:0,2:0:0:2:72:-6.83664,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:39.0087:3:2,1:2:73:1:36:-2.69518,0,-6.02821	0/1:69.6256:5:2,3:2:70:3:103:-8.10487,0,-5.14225	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.13:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.1168:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	0/0:30.8809:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29913	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:29.1442:2:0,2:0:0:2:72:-6.83664,-0.60206,0	1/1:26.1069:1:0,1:0:0:1:34:-3.39891,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:65.2265:4:2,2:2:72:2:72:-5.6326,0,-5.63252	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8876:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.1258:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	0/0:30.8876:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8876:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5666676	.	GCCAC	GCCAT,TCCAT,GCTAC	12853.7	.	AB=0.619403,0.222973,0.846154;ABP=102.574,101.666,16.5402;AC=2,0,0;AF=0.0310458,0.00367647,0.00122549;AN=38;AO=563,33,24;CIGAR=4M1X,1X3M1X,2M1X2M;DP=7963;DPB=8255.8;DPRA=2.46664,2.22201,4.76215;EPP=5.82203,4.65535,16.0391;EPPR=855.365;GTI=22;LEN=1,5,1;MEANALT=1.18033,1.81818,1;MQM=59.9467,60,59.9583;MQMR=59.981;NS=1224;NUMALT=3;ODDS=0.0755774;PAIRED=0.984014,0.878788,0.958333;PAIREDR=0.978166;PAO=150.667,4,126.667;PQA=733.5,36,215.5;PQR=1499;PRO=326.667;QA=20241,1182,851;QR=250114;RO=7328;RPL=320,19,12;RPP=25.8783,4.65535,3.0103;RPPR=1324.78;RPR=243,14,12;RUN=1,1,1;SAF=312,18,12;SAP=17.3621,3.60252,3.0103;SAR=251,15,12;SRF=4576;SRP=988.878;SRR=2752;TYPE=snp,complex,snp;technology.illumina=1,1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:30.8948:2:2,0,0,0:2:69:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-6.55266,-0.60206,-6.55266,-6.55266,-0.60206,-6.55266,-6.55266,-6.55266	0/0:30.8948:2:2,0,0,0:2:60:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-5.69897,-0.60206,-5.69897,-5.69897,-0.60206,-5.69897,-5.69897,-5.69897	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8948:2:2,0,0,0:2:68:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-6.45793,-0.60206,-6.45793,-6.45793,-0.60206,-6.45793,-6.45793,-6.45793	0/0:33.9051:3:3,0,0,0:3:101:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-9.4236,-0.90309,-9.4236,-9.4236,-0.90309,-9.4236,-9.4236,-9.4236	0/0:30.8948:2:2,0,0,0:2:70:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-6.6474,-0.60206,-6.6474,-6.6474,-0.60206,-6.6474,-6.6474,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9051:3:3,0,0,0:3:105:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-9.79616,-0.90309,-9.79616,-9.79616,-0.90309,-9.79616,-9.79616,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9051:3:3,0,0,0:3:104:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-9.70309,-0.90309,-9.70309,-9.70309,-0.90309,-9.70309,-9.70309,-9.70309	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.936:6:6,0,0,0:6:197:0,0,0:0,0,0:0,-1.80618,-18.053,-1.80618,-18.053,-18.053,-1.80618,-18.053,-18.053,-18.053	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8948:2:2,0,0,0:2:67:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-6.36314,-0.60206,-6.36314,-6.36314,-0.60206,-6.36314,-6.36314,-6.36314	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.8843:1:1,0,0,0:1:35:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-3.49863	0/0:33.9051:3:3,0,0,0:3:102:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-9.5169,-0.90309,-9.5169,-9.5169,-0.90309,-9.5169,-9.5169,-9.5169	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9051:3:3,0,0,0:3:102:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-9.51695,-0.90309,-9.51695,-9.51695,-0.90309,-9.51695,-9.51695,-9.51695	0/0:30.8948:2:2,0,0,0:2:68:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-6.45793,-0.60206,-6.45793,-6.45793,-0.60206,-6.45793,-6.45793,-6.45793	0/1:45.0223:2:1,1,0,0:1:35:1,0,0:32,0,0:-2.59725,0,-2.89657,-2.89828,-3.1976,-5.76098,-2.89828,-3.1976,-5.76098,-5.76098	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8948:2:2,0,0,0:2:68:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-6.45788,-0.60206,-6.45788,-6.45788,-0.60206,-6.45788,-6.45788,-6.45788	0/0:27.8843:1:1,0,0,0:1:35:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9051:3:3,0,0,0:3:89:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-8.30488,-0.90309,-8.30488,-8.30488,-0.90309,-8.30488,-8.30488,-8.30488	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:46.9845:2:1,1,0,0:1:34:1,0,0:34,0,0:-2.79685,0,-2.79685,-3.09788,-3.09788,-5.85587,-3.09788,-3.09788,-5.85587,-5.85587	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9051:3:3,0,0,0:3:103:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-9.60997,-0.90309,-9.60997,-9.60997,-0.90309,-9.60997,-9.60997,-9.60997	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5676127	.	C	A	5086.27	.	AB=0.523077;ABP=3.31097;AC=2;AF=0.0769231;AN=2;AO=194;CIGAR=1X;DP=4389;DPB=4389;DPRA=0.58256;EPP=3.72666;EPPR=12.0317;GTI=22;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9948;MQMR=59.9857;NS=377;NUMALT=1;ODDS=0.768578;PAIRED=0.984536;PAIREDR=0.980448;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=7073;QR=152042;RO=4194;RPL=89;RPP=5.87575;RPPR=50.8593;RPR=105;RUN=1;SAF=86;SAP=8.42779;SAR=108;SRF=2204;SRP=26.7215;SRR=1990;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000792722:1:0,1:0:0:1:30:-2.99957,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5678214	.	C	A	1494.05	.	AB=0.524823;ABP=3.76493;AC=1;AF=0.00139795;AN=34;AO=74;CIGAR=1X;DP=7225;DPB=7225;DPRA=7.0991;EPP=5.94472;EPPR=201.342;GTI=4;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.986;NS=1073;NUMALT=1;ODDS=0.575773;PAIRED=1;PAIREDR=0.983072;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=2604;QR=257517;RO=7148;RPL=45;RPP=10.5224;RPPR=3.49636;RPR=29;RUN=1;SAF=39;SAP=3.47981;SAR=35;SRF=3392;SRP=43.2609;SRR=3756;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:53.8358:3:2,1:2:64:1:36:-2.69518,0,-5.17528	0/0:30.8108:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21354	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.8211:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	0/0:30.8108:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8108:2:2,0:2:65:0:0:0,-0.60206,-6.17345	0/0:27.8005:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8108:2:2,0:2:65:0:0:0,-0.60206,-6.17345	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.8211:3:3,0:3:100:0:0:0,-0.90309,-9.33053	0/0:33.8211:3:3,0:3:94:0:0:0,-0.90309,-8.77091	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.8005:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:27.8005:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:27.8005:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:30.8108:2:2,0:2:69:0:0:0,-0.60206,-6.55266	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.8005:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.8314:4:4,0:4:122:0:0:0,-1.20412,-11.2825	0/0:27.8005:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.8314:4:4,0:4:138:0:0:0,-1.20412,-12.7604	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5678427	.	CC	CT,TC	1049.88	.	AB=0.233728,0.2;ABP=211.163,18.6449;AC=1,0;AF=0.00593556,0.00197852;AN=58;AO=95,9;CIGAR=1M1X,1X1M;DP=16443;DPB=16526.5;DPRA=2.52452,0.5426;EPP=67.2173,3.25157;EPPR=15607.1;GTI=16;LEN=1,1;MEANALT=1.07692,1;MQM=59.9158,59.7778;MQMR=59.9855;NS=1769;NUMALT=2;ODDS=0.141379;PAIRED=1,1;PAIREDR=0.995039;PAO=33,49.5;PQA=56.5,0;PQR=52.5;PRO=81.5;QA=3489,330;QR=616080;RO=16328;RPL=75,6;RPP=72.1546,5.18177;RPPR=15400.4;RPR=20,3;RUN=1,1;SAF=21,6;SAP=67.2173,5.18177;SAR=74,3;SRF=2570;SRP=16649.6;SRR=13758;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:1.76091:9:9,0,0:9:341:0,0:0,0:0,-2.70927,-31.0425,-2.70927,-31.0425,-31.0425	0/0:1.76091:8:8,0,0:8:319:0,0:0,0:0,-2.40824,-29.0766,-2.40824,-29.0766,-29.0766	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:1.76091:4:4,0,0:4:149:0,0:0,0:0,-1.20412,-13.7719,-1.20412,-13.7719,-13.7719	0/0:1.76091:11:11,0,0:11:445:0,0:0,0:0,-3.31133,-40.4052,-3.31133,-40.4052,-40.4052	0/0:1.76091:12:12,0,0:12:479:0,0:0,0:0,-3.61236,-43.4601,-3.61236,-43.4601,-43.4601	0/0:1.76091:7:7,0,0:7:285:0,0:0,0:0,-2.10721,-26.0244,-2.10721,-26.0244,-26.0244	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:1.76091:18:18,0,0:18:712:0,0:0,0:0,-5.41854,-64.4071,-5.41854,-64.4071,-64.4071	0/0:1.76091:5:5,0,0:5:205:0,0:0,0:0,-1.50515,-18.835,-1.50515,-18.835,-18.835	0/0:1.76091:5:5,0,0:5:203:0,0:0,0:0,-1.50515,-18.6531,-1.50515,-18.6531,-18.6531	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:1.76091:24:24,0,0:24:962:0,0:0,0:0,-7.22472,-86.878,-7.22472,-86.878,-86.878	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:1.76091:16:16,0,0:16:624:0,0:0,0:0,-4.81648,-56.491,-4.81648,-56.491,-56.491	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:1.76091:6:6,0,0:6:245:0,0:0,0:0,-1.80618,-22.4295,-1.80618,-22.4295,-22.4295	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:1.76091:6:6,0,0:6:243:0,0:0,0:0,-1.80618,-22.2482,-1.80618,-22.2482,-22.2482	0/1:-0:4:3,1,0:3:120:1,0:40,0:-2.79156,0,-9.98357,-3.69465,-10.2846,-13.5797	0/0:1.76091:4:4,0,0:4:163:0,0:0,0:0,-1.20412,-15.0584,-1.20412,-15.0584,-15.0584	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:1.76091:8:8,0,0:8:318:0,0:0,0:0,-2.40824,-28.9865,-2.40824,-28.9865,-28.9865	0/0:1.76091:3:3,0,0:3:119:0,0:0,0:0,-0.90309,-11.095,-0.90309,-11.095,-11.095	0/0:1.76091:3:3,0,0:3:122:0,0:0,0:0,-0.90309,-11.3725,-0.90309,-11.3725,-11.3725	0/0:1.76091:6:6,0,0:6:229:0,0:0,0:0,-1.80618,-20.9711,-1.80618,-20.9711,-20.9711	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:1.76091:17:17,0,0:17:672:0,0:0,0:0,-5.11751,-60.8102,-5.11751,-60.8102,-60.8102	0/0:1.76091:11:11,0,0:11:427:0,0:0,0:0,-3.31133,-38.7779,-3.31133,-38.7779,-38.7779	0/0:1.76091:8:8,0,0:8:318:0,0:0,0:0,-2.40824,-28.9843,-2.40824,-28.9843,-28.9843	0/0:1.76091:10:10,0,0:10:399:0,0:0,0:0,-3.0103,-36.2681,-3.0103,-36.2681,-36.2681	0/0:1.76091:4:4,0,0:4:147:0,0:0,0:0,-1.20412,-13.5896,-1.20412,-13.5896,-13.5896	0/0:1.76091:11:11,0,0:11:447:0,0:0,0:0,-3.31133,-40.585,-3.31133,-40.585,-40.585	0/0:1.76091:4:4,0,0:4:152:0,0:0,0:0,-1.20412,-14.0485,-1.20412,-14.0485,-14.0485	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:1.76091:1:1,0,0:1:39:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.89656,-0.30103,-3.89656,-3.89656	0/0:1.76091:9:9,0,0:9:352:0,0:0,0:0,-2.70927,-32.0359,-2.70927,-32.0359,-32.0359	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:1.76091:15:15,0,0:15:600:0,0:0,0:0,-4.51545,-54.3365,-4.51545,-54.3365,-54.3365	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5678566	.	G	A	7578.75	.	AB=0.434483;ABP=8.41652;AC=16;AF=0.0621222;AN=44;AO=373;CIGAR=1X;DP=9355;DPB=9355;DPRA=0.846737;EPP=146.508;EPPR=1849.97;GTI=82;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9744;NS=1489;NUMALT=1;ODDS=0.082322;PAIRED=0.981233;PAIREDR=0.984636;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=12834;QR=311944;RO=8982;RPL=104;RPP=161.504;RPPR=1188.06;RPR=269;RUN=1;SAF=134;SAP=67.1939;SAR=239;SRF=3861;SRP=386.826;SRR=5121;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:34.125:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:37.1354:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.1457:3:3,0:3:109:0:0:0,-0.90309,-10.167	0/0:37.1354:2:2,0:2:67:0:0:0,-0.60206,-6.36304	0/0:37.1354:2:2,0:2:62:0:0:0,-0.60206,-5.88849	0/0:34.125:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0042641:3:0,3:0:0:3:102:-9.51695,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00106563:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.1457:3:3,0:3:104:0:0:0,-0.90309,-9.70309	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:49.1766:6:6,0:6:208:0:0:0,-1.80618,-19.0596	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.1354:2:2,0:2:69:0:0:0,-0.60206,-6.55266	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.1249:1:1,0:1:24:0:0:0,-0.30103,-2.39989	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00106563:1:0,1:0:0:1:34:-3.39891,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00213153:2:0,2:0:0:2:61:-5.79402,-0.60206,0	0/0:34.125:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.125:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:49.1766:6:6,0:6:202:0:0:0,-1.80618,-18.5102	0/0:40.1457:3:3,0:3:102:0:0:0,-0.90309,-9.5168	1/1:0.00106563:1:0,1:0:0:1:29:-2.89966,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00213153:2:0,2:0:0:2:63:-5.98364,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00853239:4:0,4:0:0:4:128:-11.8366,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0687332:7:0,7:0:0:7:247:-22.5714,-2.10721,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5683152	.	G	A	244.702	.	AB=0.187739;ABP=224.06;AC=1;AF=0.00832702;AN=40;AO=67;CIGAR=1X;DP=8725;DPB=8725;DPRA=3.8657;EPP=3.04271;EPPR=1326.46;GTI=12;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.2537;MQMR=59.9504;NS=1321;NUMALT=1;ODDS=0.170685;PAIRED=0.985075;PAIREDR=0.794502;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=2480;QR=306877;RO=8657;RPL=37;RPP=4.59839;RPPR=82.517;RPR=30;RUN=1;SAF=3;SAP=123.608;SAR=64;SRF=4308;SRP=3.43195;SRR=4349;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:38.0422:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	0/0:38.0422:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.0422:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.0422:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:53.0937:6:6,0:6:208:0:0:0,-1.80618,-19.0596	0/0:38.0422:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.0731:4:4,0:4:138:0:0:0,-1.20412,-12.7604	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.0628:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.0422:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.0525:2:2,0:2:62:0:0:0,-0.60206,-5.88849	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.0628:3:3,0:3:103:0:0:0,-0.90309,-9.60997	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.0731:4:4,0:4:138:0:0:0,-1.20412,-12.7604	0/0:38.0422:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.0731:4:4,0:4:138:0:0:0,-1.20412,-12.7604	0/0:41.0525:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	0/0:50.0834:5:5,0:5:175:0:0:0,-1.50515,-16.0937	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.0628:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.0525:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21354	0/1:0.367494:6:5,1:5:173:1:35:-1.69245,0,-14.104	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.0834:5:5,0:5:173:0:0:0,-1.50515,-15.9102	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5683183	.	AC	AT	103511	.	AB=0.412654;ABP=752.967;AC=9;AF=0.407743;AN=48;AO=5073;CIGAR=1M1X;DP=12816;DPB=12877.5;DPRA=4.32524;EPP=1288.55;EPPR=571.475;GTI=53;LEN=1;MEANALT=1.00508;MQM=59.9572;MQMR=59.9591;NS=1653;NUMALT=1;ODDS=0.0138869;PAIRED=0.90479;PAIREDR=0.699677;PAO=32;PQA=76.5;PQR=46;PRO=75.5;QA=181143;QR=264774;RO=7735;RPL=1238;RPP=2889.92;RPPR=3534.98;RPR=3835;RUN=1;SAF=506;SAP=7062.21;SAR=4567;SRF=2268;SRP=2875.92;SRR=5467;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:33.1524:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:33.1524:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.392:4:3,1:3:97:1:34:-2.19479,0,-7.84666	0/0:33.1524:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	0/0:33.1524:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/1:31.392:2:1,1:1:35:1:35:-2.89657,0,-2.89657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1524:4:4,0:4:97:0:0:0,-1.20412,-8.97109	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1524:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.392:10:4,6:4:117:6:208:-16.0493,0,-7.80942	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.392:5:3,2:3:102:2:70:-5.14225,0,-8.01175	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.392:9:2,7:2:69:7:235:-18.7688,0,-3.84339	0/0:33.1524:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:33.1524:3:3,0:3:103:0:0:0,-0.90309,-9.60997	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1524:3:3,0:3:90:0:0:0,-0.90309,-8.3974	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.1524:3:0,3:0:0:3:104:-9.70309,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.392:7:3,4:3:95:4:139:-10.7455,0,-6.75677	0/0:33.1524:3:3,0:3:103:0:0:0,-0.90309,-9.60997	0/0:33.1524:5:5,0:5:137:0:0:0,-1.50515,-12.6012	0/0:33.1524:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	0/0:33.1524:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1524:3:3,0:3:96:0:0:0,-0.90309,-8.9575	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1524:1:1,0:1:25:0:0:0,-0.30103,-2.49986	0/0:33.1524:5:5,0:5:141:0:0:0,-1.50515,-12.9689	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.392:5:4,1:4:139:1:34:-1.89376,0,-11.3475	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5683224	.	CA	CC	126754	.	AB=0.383395;ABP=1603.27;AC=10;AF=0.420216;AN=58;AO=6163;CIGAR=1M1X;DP=15920;DPB=16021;DPRA=3.62969;EPP=4511.18;EPPR=4850.11;GTI=68;LEN=1;MEANALT=1.00607;MQM=59.9557;MQMR=59.9902;NS=1761;NUMALT=1;ODDS=0.00817392;PAIRED=0.896641;PAIREDR=0.67683;PAO=54;PQA=163;PQR=114.5;PRO=122.5;QA=221280;QR=348629;RO=9741;RPL=1849;RPP=2143.91;RPPR=4933.62;RPR=4314;RUN=1;SAF=640;SAP=8404.1;SAR=5523;SRF=2964;SRP=3244.05;SRR=6777;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:33.4272:4:4,0:4:147:0:0:0,-1.20412,-13.5893	0/0:33.4272:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.64712	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.6668:5:3,2:3:112:2:68:-4.95256,0,-8.94134	0/1:31.6668:6:3,3:3:110:3:113:-8.73323,0,-8.45343	0/0:33.4272:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/1:31.6668:3:2,1:2:74:1:39:-2.99347,0,-6.12234	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.4272:6:6,0:6:207:0:0:0,-1.80618,-18.9676	0/0:33.4272:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:33.4272:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.6668:10:4,6:4:146:6:230:-18.056,0,-10.4874	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.6668:11:7,4:7:264:4:152:-10.7383,0,-20.8091	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.4272:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.6668:10:3,7:3:103:7:243:-19.192,0,-6.59899	0/0:33.4272:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	0/0:33.4272:5:5,0:5:181:0:0:0,-1.50515,-16.6434	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.4272:4:4,0:4:151:0:0:0,-1.20412,-13.9578	0/0:33.4272:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4272:3:0,3:0:0:3:117:-10.9104,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.6668:8:4,4:4:149:4:148:-11.2734,0,-11.3654	0/0:33.4272:5:5,0:5:187:0:0:0,-1.50515,-17.1925	0/0:33.4272:7:7,0:7:253:0:0:0,-2.10721,-23.1183	0/0:33.4272:5:5,0:5:171:0:0:0,-1.50515,-15.7233	0/0:33.4272:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:33.4272:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	0/1:31.6668:4:3,1:3:107:1:35:-2.29451,0,-8.77796	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.4272:2:2,0:2:71:0:0:0,-0.60206,-6.74206	0/0:33.4272:7:7,0:7:258:0:0:0,-2.10721,-23.5745	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.4272:6:6,0:6:215:0:0:0,-1.80618,-19.6969	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.4272:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5685021	.	A	T	6360.85	.	AB=0.502778;ABP=3.03443;AC=12;AF=0.469067;AN=22;AO=800;CIGAR=1X;DP=5593;DPB=5593;DPRA=0.363212;EPP=1697.03;EPPR=28.479;GTI=384;LEN=1;MEANALT=1.00188;MQM=57.1688;MQMR=59.8826;NS=986;NUMALT=1;ODDS=0.00272238;PAIRED=1;PAIREDR=0.552099;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=26444;QR=166392;RO=4789;RPL=0;RPP=1740.19;RPPR=12.2825;RPR=800;RUN=1;SAF=5;SAP=1697.03;SAR=795;SRF=2456;SRP=9.87023;SRR=2333;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00587351:1:0,1:0:0:1:34:-3.39783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.941:2:2,0:2:64:0:0:0,-0.60206,-6.07836	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:25.8373:2:0,2:0:0:2:65:-6.17158,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:53.9513:3:3,0:3:92:0:0:0,-0.90309,-8.58469	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00587351:1:0,1:0:0:1:34:-3.39783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00587351:1:0,1:0:0:1:35:-3.49727,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.941:2:2,0:2:65:0:0:0,-0.60206,-6.17284	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.9257:1:1,0:1:27:0:0:0,-0.30103,-2.69973	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.8622:3:0,3:0:0:3:103:-9.60673,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:37.8007:4:2,2:2:68:2:58:-4.30457,0,-5.25321	0/1:0.00228818:2:1,1:1:33:1:24:-1.79772,0,-2.69685	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5685033	.	T	C	4986.69	.	AB=0.491071;ABP=3.32051;AC=13;AF=0.43787;AN=24;AO=787;CIGAR=1X;DP=5460;DPB=5460;DPRA=0.412088;EPP=1550.91;EPPR=74.4309;GTI=430;LEN=1;MEANALT=1.00188;MQM=57.2046;MQMR=59.8572;NS=1014;NUMALT=1;ODDS=0.00945169;PAIRED=0.993647;PAIREDR=0.602098;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=24165;QR=166747;RO=4672;RPL=9;RPP=1634.68;RPPR=4.57383;RPR=778;RUN=1;SAF=12;SAP=1609.32;SAR=775;SRF=2495;SRP=50.0112;SRR=2177;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00625081:1:0,1:0:0:1:33:-3.29828,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:49.2952:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45733	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:25.0509:2:0,2:0:0:2:53:-5.03328,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:52.3055:3:3,0:3:98:0:0:0,-0.90309,-9.14322	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00625081:1:0,1:0:0:1:33:-3.29828,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00625081:1:0,1:0:0:1:33:-3.29828,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:49.2952:2:2,0:2:55:0:0:0,-0.60206,-5.22331	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.2809:1:1,0:1:27:0:0:0,-0.30103,-2.69973	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:31.2514:4:0,4:0:0:4:114:-10.5414,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:49.1027:4:2,2:2:65:2:70:-5.44069,0,-4.96872	0/1:29.8624:2:1,1:1:35:1:35:-2.89521,0,-2.89622	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.00193792:2:1,1:1:23:1:22:-1.5978,0,-1.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5685080	.	CGTT	CGTC,GGTC	20557.6	.	AB=0.364751,0.100271;ABP=210.355,515.131;AC=15,0;AF=0.479206,0.00614367;AN=26;AO=1154,45;CIGAR=3M1X,1X2M1X;DP=6198;DPB=6408.5;DPRA=0.463517,3.13246;EPP=1243.69,20.4303;EPPR=39.3193;GTI=281;LEN=1,4;MEANALT=1.03716,1.85185;MQM=57.8267,59.4889;MQMR=59.8863;NS=1058;NUMALT=2;ODDS=0.0363986;PAIRED=0.981802,0.8;PAIREDR=0.804004;PAO=100.5,1.5;PQA=225.5,4;PQR=644.5;PRO=320;QA=44269,1563;QR=174884;RO=4995;RPL=992,6;RPP=1299.31,55.5599;RPPR=73.6142;RPR=162,39;RUN=1,1;SAF=219,38;SAP=967.671,49.3833;SAR=935,7;SRF=2629;SRP=33.0801;SRR=2366;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00776011:1:0,1,0:0:0:1,0:41,0:-4.08923,-0.30103,0,-4.08923,-0.30103,-4.08923	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00776011:1:0,1,0:0:0:1,0:41,0:-4.08923,-0.30103,0,-4.08923,-0.30103,-4.08923	0/0:49.8445:2:2,0,0:2:80:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.58968,-0.60206,-7.58968,-7.58968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.6572:2:0,2,0:0:0:2,0:81,0:-7.67662,-0.60206,0,-7.67662,-0.60206,-7.67662	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:52.8548:3:3,0,0:3:109:0,0:0,0:0,-0.90309,-10.1616,-0.90309,-10.1616,-10.1616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00776011:1:0,1,0:0:0:1,0:41,0:-4.08923,-0.30103,0,-4.08923,-0.30103,-4.08923	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00776011:1:0,1,0:0:0:1,0:41,0:-4.08923,-0.30103,0,-4.08923,-0.30103,-4.08923	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:49.8445:2:2,0,0:2:82:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.77703,-0.60206,-7.77703,-7.77703	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.834:1:1,0,0:1:40:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.99457,-0.30103,-3.99457,-3.99457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.678:4:0,4,0:0:0:4,0:159,0:-14.6756,-1.20412,0,-14.6756,-1.20412,-14.6756	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:62.8365:4:2,2,0:2:80:2,0:82,0:-6.56541,0,-6.38529,-7.16747,-6.98735,-13.7506	0/1:35.0899:2:1,1,0:1:41:1,0:40,0:-3.38936,0,-3.49111,-3.69039,-3.79214,-7.0783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:36.0669:2:1,1,0:1:41:1,0:41,0:-3.48717,0,-3.49111,-3.7882,-3.79214,-7.17122	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5685092	.	A	G	22153.7	.	AB=0.535079;ABP=13.2174;AC=15;AF=0.462264;AN=26;AO=1115;CIGAR=1X;DP=6139;DPB=6139;DPRA=0.313173;EPP=1130.85;EPPR=36.1807;GTI=291;LEN=1;MEANALT=1.00172;MQM=57.7883;MQMR=59.8726;NS=1060;NUMALT=1;ODDS=0.0033707;PAIRED=0.994619;PAIREDR=0.845909;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=42102;QR=178147;RO=5023;RPL=951;RPP=1209.24;RPPR=24.1246;RPR=164;RUN=1;SAF=173;SAP=1154.69;SAR=942;SRF=2598;SRP=15.9488;SRR=2425;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00805129:1:0,1:0:0:1:39:-3.89317,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00805129:1:0,1:0:0:1:41:-4.08923,-0.30103,0	0/0:47.5378:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40179	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.408:2:0,2:0:0:2:78:-7.39703,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.5481:3:3,0:3:113:0:0:0,-0.90309,-10.5363	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00805129:1:0,1:0:0:1:39:-3.89317,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00805129:1:0,1:0:0:1:39:-3.89317,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.5378:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40179	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.5272:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.4288:4:0,4:0:0:4:155:-14.3135,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:60.4129:4:2,2:2:78:2:78:-6.19291,0,-6.19767	0/1:35.7008:2:1,1:1:38:1:39:-3.29111,0,-3.1945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:35.7028:2:1,1:1:39:1:39:-3.29111,0,-3.29362	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5687767	.	T	A	100616	.	AB=0.290378;ABP=2867.05;AC=34;AF=0.760931;AN=42;AO=4161;CIGAR=1X;DP=9833;DPB=9833;DPRA=2.8178;EPP=11.4274;EPPR=10.631;GTI=374;LEN=1;MEANALT=1.00156;MQM=59.6811;MQMR=59.9944;NS=1418;NUMALT=1;ODDS=0.00234385;PAIRED=0.58063;PAIREDR=0.543336;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=156576;QR=200462;RO=5665;RPL=2893;RPP=1381.06;RPPR=3.24987;RPR=1268;RUN=1;SAF=902;SAP=2902.19;SAR=3259;SRF=2662;SRP=47.5824;SRR=3003;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:0.00766884:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.3361:1:1,0:1:28:0:0:0,-0.30103,-2.79973	0/0:51.3453:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/1:79.442:5:2,3:2:72:3:119:-9.58935,0,-5.33149	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:42.5621:6:0,6:0:0:6:206:-18.8737,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.5312:3:0,3:0:0:3:121:-11.28,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:68.7117:7:2,5:2:67:5:200:-16.2725,0,-4.25563	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00766884:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:49.4089:5:1,4:1:36:4:158:-13.0953,0,-2.09312	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.5208:2:0,2:0:0:2:77:-7.30883,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.424:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00766884:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	1/1:0.00766884:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.5208:2:0,2:0:0:2:79:-7.49763,-0.60206,0	0/1:45.1802:3:1,2:1:26:2:74:-6.12279,0,-1.69674	1/1:42.5621:6:0,6:0:0:6:224:-20.5169,-1.80618,0	1/1:0.00766884:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00766884:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	1/1:0.00766884:1:0,1:0:0:1:38:-3.79727,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.5208:2:0,2:0:0:2:80:-7.59157,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.5208:2:0,2:0:0:2:80:-7.59157,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5687786	.	CAC	AAC,AAT,CGC	67793.5	.	AB=0.276572,0.175532,0.156463;ABP=2760.7,174.926,605.764;AC=34,0,0;AF=0.725761,0.0109696,0.00707714;AN=42;AO=3622,48,124;CIGAR=1X2M,1X1M1X,1M1X1M;DP=9181;DPB=9320.33;DPRA=1.73588,3.63525,9.20711;EPP=3280.15,55.3066,11.486;EPPR=487.844;GTI=265;LEN=1,3,1;MEANALT=1.02209,1.21739,1.69231;MQM=59.7446,60,59.0323;MQMR=59.9797;NS=1413;NUMALT=3;ODDS=0.00468552;PAIRED=0.643015,0.604167,0.0483871;PAIREDR=0.549628;PAO=45.8333,6.5,74.3333;PQA=51.5,14.5,165;PQR=445;PRO=160.333;QA=137562,1824,4252;QR=187540;RO=5380;RPL=3621,48,124;RPP=7859.4,107.241,272.273;RPPR=500.31;RPR=1,0,0;RUN=1,1,1;SAF=643,7,73;SAP=3274.55,55.3066,11.486;SAR=2979,41,51;SRF=2731;SRP=5.72424;SRR=2649;TYPE=snp,complex,snp;technology.illumina=1,1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:28.5309:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:41,0,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.5309:1:1,0,0,0:1:35:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-3.49863	0/0:28.5309:1:1,0,0,0:1:38:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-3.79727,-0.30103,-3.79727,-3.79727,-0.30103,-3.79727,-3.79727,-3.79727	0/1:25.5186:5:2,3,0,0:2:80:3,0,0:122,0,0:-9.86734,0,-6.08664,-10.4694,-6.98973,-17.0569,-10.4694,-6.98973,-17.0569,-17.0569	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.3104:6:0,6,0,0:0:0:6,0,0:227,0,0:-20.7868,-1.80618,0,-20.7868,-1.80618,-20.7868,-20.7868,-1.80618,-20.7868,-20.7868	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.3104:3:0,3,0,0:0:0:3,0,0:123,0,0:-11.4648,-0.90309,0,-11.4648,-0.90309,-11.4648,-11.4648,-0.90309,-11.4648,-11.4648	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:25.5186:7:2,5,0,0:2:80:5,0,0:204,0,0:-16.6368,0,-5.48436,-17.2389,-6.98951,-23.8266,-17.2389,-6.98951,-23.8266,-23.8266	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00203084:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:40,0,0:-3.99568,-0.30103,0,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:25.5186:5:1,4,0,0:1:40:4,0,0:161,0,0:-13.3697,0,-2.49053,-13.6708,-3.69465,-16.9654,-13.6708,-3.69465,-16.9654,-16.9654	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.5309:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:79,0,0:-7.49763,-0.60206,0,-7.49763,-0.60206,-7.49763,-7.49763,-0.60206,-7.49763,-7.49763	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.5309:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:41,0,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00203084:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:41,0,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	1/1:0.00203084:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:41,0,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.5309:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:82,0,0:-7.77968,-0.60206,0,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968	0/1:27.2815:3:1,2,0,0:1:29:2,0,0:81,0,0:-6.78264,0,-1.99657,-7.08367,-2.59863,-9.35415,-7.08367,-2.59863,-9.35415,-9.35415	1/1:26.3104:6:0,6,0,0:0:0:6,0,0:235,0,0:-21.5164,-1.80618,0,-21.5164,-1.80618,-21.5164,-21.5164,-1.80618,-21.5164,-21.5164	1/1:0.00203084:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:41,0,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00203084:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:41,0,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	1/1:28.5309:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:35,0,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.5309:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:79,0,0:-7.49724,-0.60206,0,-7.49724,-0.60206,-7.49724,-7.49724,-0.60206,-7.49724,-7.49724	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.5309:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:82,0,0:-7.77968,-0.60206,0,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5687798	.	CGT	TGT	60846.5	.	AB=0.279453;ABP=1796.05;AC=34;AF=0.704674;AN=42;AO=3193;CIGAR=1X2M;DP=8483;DPB=8737.33;DPRA=1.70078;EPP=3679.23;EPPR=464.774;GTI=378;LEN=1;MEANALT=1.00745;MQM=59.8807;MQMR=59.9855;NS=1412;NUMALT=1;ODDS=0.0290276;PAIRED=0.728469;PAIREDR=0.542334;PAO=134.333;PQA=273;PQR=546.5;PRO=241.5;QA=122890;QR=183660;RO=5244;RPL=3193;RPP=6936.52;RPPR=323.679;RPR=0;RUN=1;SAF=434;SAP=3679.23;SAR=2759;SRF=2636;SRP=3.33494;SRR=2608;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:0.9691:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:2.21849:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29913	0/0:2.21849:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/1:0.9691:5:2,3:2:82:3:122:-9.86734,0,-6.27453	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:2.21849:6:0,6:0:0:6:225:-20.6057,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:2.21849:3:0,3:0:0:3:123:-11.4648,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.9691:7:2,5:2:76:5:205:-16.7278,0,-5.10705	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.9691:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.9691:5:1,4:1:41:4:163:-13.5533,0,-2.58942	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:2.21849:2:0,2:0:0:2:77:-7.3082,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.9691:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.9691:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	1/1:0.9691:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:2.21849:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	0/1:0.9691:3:1,2:1:32:2:82:-6.87659,0,-2.29622	1/1:2.21849:5:0,5:0:0:5:205:-18.835,-1.50515,0	1/1:0.9691:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.9691:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	1/1:0.9691:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:2.21849:2:0,2:0:0:2:80:-7.59179,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:2.21849:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5687811	.	G	A	42932	.	AB=0.694891;ABP=228.999;AC=34;AF=0.656674;AN=42;AO=2375;CIGAR=1X;DP=7584;DPB=7584;DPRA=0.360754;EPP=4962.42;EPPR=112.311;GTI=444;LEN=1;MEANALT=1.00097;MQM=59.9642;MQMR=59.9846;NS=1401;NUMALT=1;ODDS=0.128716;PAIRED=0.981053;PAIREDR=0.53533;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=88396;QR=186753;RO=5208;RPL=2374;RPP=5151.58;RPPR=235.049;RPR=1;RUN=1;SAF=24;SAP=4953.9;SAR=2351;SRF=2667;SRP=9.62979;SRR=2541;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:0.00496269:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.0967:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:40.0966:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/1:84.8104:5:2,3:2:78:3:115:-9.21906,0,-5.89763	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:40.3924:6:0,6:0:0:6:228:-20.8842,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:31.3615:3:0,3:0:0:3:113:-10.5394,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:77.0493:7:2,5:2:74:5:189:-15.2685,0,-4.91822	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00496269:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:54.0633:5:1,4:1:39:4:154:-12.7283,0,-2.39141	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.3505:2:0,2:0:0:2:76:-7.21467,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00496269:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00496269:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	1/1:0.00496269:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.3502:2:0,2:0:0:2:74:-7.02588,-0.60206,0	0/1:57.9449:3:1,2:1:37:2:82:-6.87659,0,-2.79474	1/1:37.3821:5:0,5:0:0:5:191:-17.5585,-1.50515,0	1/1:0.00496269:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00496269:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	1/1:0.00496269:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.3505:2:0,2:0:0:2:76:-7.21467,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00993107:2:0,2:0:0:2:76:-7.21467,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5688535	.	G	T	208907	.	AB=0.585538;ABP=39.0445;AC=46;AF=0.937999;AN=46;AO=6469;CIGAR=1X;DP=7172;DPB=7172;DPRA=0.700377;EPP=743.246;EPPR=258.163;GTI=44;LEN=1;MEANALT=1.00152;MQM=59.9852;MQMR=59.9116;NS=1379;NUMALT=1;ODDS=0.247307;PAIRED=0.981141;PAIREDR=0.981455;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=237932;QR=26209;RO=701;RPL=2582;RPP=574.671;RPPR=1340.12;RPR=3887;RUN=1;SAF=4617;SAP=2569.31;SAR=1852;SRF=506;SRP=302.621;SRR=195;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:31.5004:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	1/1:31.5004:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:31.5004:2:0,2:0:0:2:79:-7.49724,-0.60206,0	1/1:31.5004:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.4901:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	1/1:31.5004:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:40.5313:5:0,5:0:0:5:190:-17.4632,-1.50515,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:37.521:4:0,4:0:0:4:146:-13.4898,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.4901:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:31.5004:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.4901:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.4901:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	1/1:28.4901:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:31.5004:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:40.5313:5:0,5:0:0:5:183:-16.8245,-1.50515,0	1/1:31.5004:2:0,2:0:0:2:76:-7.21354,-0.60206,0	1/1:43.5416:6:0,6:0:0:6:235:-21.5184,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.4901:1:0,1:0:0:1:38:-3.79727,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.4901:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.4901:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	1/1:34.5107:3:0,3:0:0:3:111:-10.3524,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.5107:3:0,3:0:0:3:115:-10.7241,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:28.4901:1:0,1:0:0:1:36:-3.59656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5688554	.	CGTCG	TGTCG,CGTCA,TGTCT	6929.1	.	AB=0.489185,0.258333,0.535714;ABP=3.62091,63.8839,3.63072;AC=2,0,0;AF=0.0225592,0.00184911,0.00184911;AN=44;AO=312,31,30;CIGAR=1X4M,4M1X,1X3M1X;DP=7152;DPB=7420.2;DPRA=2.61036,4.07593,3.8042;EPP=24.8364,3.08035,3.29983;EPPR=1051.42;GTI=14;LEN=1,1,5;MEANALT=1.03636,1.16667,1;MQM=59.9455,59.8065,60;MQMR=59.9741;NS=1352;NUMALT=3;ODDS=0.471444;PAIRED=0.961538,1,1;PAIREDR=0.983735;PAO=91.8333,135.667,1.5;PQA=469.5,557.167,1;PQR=1026.67;PRO=227;QA=11284,1058,1056;QR=234589;RO=6763;RPL=101,7,12;RPP=87.2245,23.254,5.61607;RPPR=1220.17;RPR=211,24,18;RUN=1,1,1;SAF=193,16,18;SAP=41.1224,3.08035,5.61607;SAR=119,15,12;SRF=4849;SRP=2768.88;SRR=1914;TYPE=snp,snp,complex;technology.illumina=1,1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:31.7931:2:2,0,0,0:2:80:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-7.59179,-0.60206,-7.59179,-7.59179,-0.60206,-7.59179,-7.59179,-7.59179	0/0:31.7931:2:2,0,0,0:2:78:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-7.40278,-0.60206,-7.40278,-7.40278,-0.60206,-7.40278,-7.40278,-7.40278	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.7931:2:2,0,0,0:2:73:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-6.9307,-0.60206,-6.9307,-6.9307,-0.60206,-6.9307,-6.9307,-6.9307	0/0:31.7931:2:2,0,0,0:2:75:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-7.12034,-0.60206,-7.12034,-7.12034,-0.60206,-7.12034,-7.12034,-7.12034	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:35,0,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	0/0:31.7931:2:2,0,0,0:2:80:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-7.59179,-0.60206,-7.59179,-7.59179,-0.60206,-7.59179,-7.59179,-7.59179	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.824:5:5,0,0,0:5:183:0,0,0:0,0,0:0,-1.50515,-16.8235,-1.50515,-16.8235,-16.8235,-1.50515,-16.8235,-16.8235,-16.8235	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8034:3:3,0,0,0:3:108:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-10.0741,-0.90309,-10.0741,-10.0741,-0.90309,-10.0741,-10.0741,-10.0741	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7828:1:1,0,0,0:1:41:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.7931:2:2,0,0,0:2:79:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-7.49763,-0.60206,-7.49763,-7.49763,-0.60206,-7.49763,-7.49763,-7.49763	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7828:1:1,0,0,0:1:40:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7828:1:1,0,0,0:1:41:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457,-4.09457	0/0:28.7828:1:1,0,0,0:1:40:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.7931:2:2,0,0,0:2:82:0,0,0:0,0,0:0,-0.60206,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.824:5:5,0,0,0:5:164:0,0,0:0,0,0:0,-1.50515,-15.0818,-1.50515,-15.0818,-15.0818,-1.50515,-15.0818,-15.0818,-15.0818	0/0:34.8034:1:1,0,0,0:1:40:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-3.75702,-0.90309,-4.59774,-3.99568,-0.90309,-3.75702,-4.59774,-3.75702	0/0:43.8343:6:6,0,0,0:6:216:0,0,0:0,0,0:0,-1.80618,-19.7825,-1.80618,-19.7825,-19.7825,-1.80618,-19.7825,-19.7825,-19.7825	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7828:1:1,0,0,0:1:37:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-3.69783,-0.30103,-3.69783,-3.69783,-0.30103,-3.69783,-3.69783,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7828:1:1,0,0,0:1:29:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-2.89966,-0.30103,-2.89966,-2.89966,-0.30103,-2.89966,-2.89966,-2.89966	0/0:34.8034:3:3,0,0,0:3:108:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-10.0745,-0.90309,-10.0745,-10.0745,-0.90309,-10.0745,-10.0745,-10.0745	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8034:3:3,0,0,0:3:107:0,0,0:0,0,0:0,-0.90309,-9.97917,-0.90309,-9.97917,-9.97917,-0.90309,-9.97917,-9.97917,-9.97917	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.7828:1:1,0,0,0:1:36:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-3.59656,-0.30103,-3.59656,-3.59656,-0.30103,-3.59656,-3.59656,-3.59656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5695243	.	G	A	13023.3	.	AB=0.631579;ABP=11.5819;AC=4;AF=0.106512;AN=34;AO=499;CIGAR=1X;DP=3203;DPB=3203;DPRA=1.54475;EPP=99.6212;EPPR=973.305;GTI=70;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.988;MQMR=59.9637;NS=906;NUMALT=1;ODDS=0.0166768;PAIRED=0.993988;PAIREDR=0.99852;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=18890;QR=103198;RO=2703;RPL=198;RPP=49.1769;RPPR=807.974;RPR=301;RUN=1;SAF=324;SAP=99.6212;SAR=175;SRF=2026;SRP=1464.96;SRR=677;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:27.4626:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.4626:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.4626:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.4626:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.4626:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.4729:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.4935:4:4,0:4:161:0:0:0,-1.20412,-14.8749	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.4729:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	0/0:27.4626:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.4729:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	1/1:0.000309828:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000309828:1:0,1:0:0:1:38:-3.79727,-0.30103,0	0/0:27.4626:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.4626:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.4626:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.4626:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.4626:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5697324	.	TGC	CGC	59571.7	.	AB=0.453645;ABP=29.383;AC=5;AF=0.195528;AN=58;AO=2722;CIGAR=1X2M;DP=27013;DPB=27175.7;DPRA=0.589063;EPP=1793.16;EPPR=35279.9;GTI=233;LEN=1;MEANALT=1.03425;MQM=59.9695;MQMR=59.9979;NS=1744;NUMALT=1;ODDS=0.0706663;PAIRED=1;PAIREDR=0.993852;PAO=101.75;PQA=214.333;PQR=240;PRO=128.25;QA=94141;QR=823133;RO=24237;RPL=229;RPP=4092.03;RPPR=233.805;RPR=2493;RUN=1;SAF=625;SAP=1731.56;SAR=2097;SRF=12808;SRP=173.385;SRR=11429;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:34.8451:14:14,0:14:480:0:0:0,-4.21442,-43.5278	0/0:34.8451:28:28,0:28:937:0:0:0,-8.42884,-84.6364	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8451:5:5,0:5:166:0:0:0,-1.50515,-15.2675	0/0:34.8451:16:16,0:16:522:0:0:0,-4.81648,-47.2921	0/0:34.8451:19:19,0:19:636:0:0:0,-5.71957,-57.5557	0/0:34.8451:10:10,0:10:346:0:0:0,-3.0103,-31.4745	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8451:27:27,0:27:893:0:0:0,-8.12781,-80.6744	0/0:34.8451:16:16,0:16:523:0:0:0,-4.81648,-47.3829	0/0:34.8451:15:15,0:15:512:0:0:0,-4.51545,-46.4055	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8451:42:42,0:42:1437:0:0:0,-12.6433,-129.626	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8451:44:44,0:44:1475:0:0:0,-13.2453,-133.042	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8451:29:29,0:29:995:0:0:0,-8.72987,-89.8618	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8451:21:21,0:21:717:0:0:0,-6.32163,-64.8484	0/0:34.8451:6:6,0:6:207:0:0:0,-1.80618,-18.9682	0/0:34.8451:4:4,0:4:138:0:0:0,-1.20412,-12.7604	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8451:12:12,0:12:399:0:0:0,-3.61236,-36.2309	0/0:34.8451:8:8,0:8:278:0:0:0,-2.40824,-25.358	0/0:34.8451:23:23,0:23:769:0:0:0,-6.92369,-69.521	0/1:33.8762:21:13,8:13:414:8:274:-18.6721,0,-31.2456	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.8451:12:0,12:0:0:12:397:-36.0493,-3.61236,0	0/0:34.8451:14:14,0:14:475:0:0:0,-4.21442,-43.0742	0/0:34.8451:27:27,0:27:935:0:0:0,-8.12781,-84.4651	0/0:34.8451:12:12,0:12:397:0:0:0,-3.61236,-36.0489	0/0:34.8451:10:10,0:10:328:0:0:0,-3.0103,-29.8383	0/0:34.8451:19:19,0:19:654:0:0:0,-5.71957,-59.1828	1/1:0.000355804:4:0,4:0:0:4:134:-12.3909,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8451:16:16,0:16:530:0:0:0,-4.81648,-48.0162	0/0:34.8451:13:13,0:13:437:0:0:0,-3.91339,-39.6534	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.8451:31:31,0:31:1040:0:0:0,-9.33193,-93.9045	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5697556	.	A	T,G	2527.63	.	AB=0.378571,0.154639;ABP=20.9405,103.502;AC=2,0;AF=0.128827,0.00382653;AN=2;AO=169,24;CIGAR=1X,1X;DP=5792;DPB=5792;DPRA=0.285958,2.74034;EPP=17.0028,8.80089;EPPR=10.0785;GTI=52;LEN=1,1;MEANALT=1,1;MQM=59.6746,59.4583;MQMR=59.9914;NS=392;NUMALT=2;ODDS=582.008;PAIRED=1,1;PAIREDR=0.980354;PAO=0,0;PQA=0,0;PQR=0;PRO=0;QA=5801,849;QR=196321;RO=5599;RPL=18,7;RPP=230.295,12.0581;RPPR=20.6059;RPR=151,17;RUN=1,1;SAF=62,15;SAP=29.0294,6.26751;SAR=107,9;SRF=2680;SRP=25.1637;SRR=2919;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1,0:0:0:1,0:35,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5698610	.	G	A	405.034	.	AB=0.242424;ABP=22.0271;AC=2;AF=0.00552486;AN=42;AO=29;CIGAR=1X;DP=6259;DPB=6259;DPRA=1.77186;EPP=4.88226;EPPR=1145.26;GTI=8;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9655;MQMR=59.9794;NS=1267;NUMALT=1;ODDS=0.254655;PAIRED=0.965517;PAIREDR=0.984425;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=1017;QR=214170;RO=6228;RPL=18;RPP=6.67934;RPPR=2385.42;RPR=11;RUN=1;SAF=26;SAP=42.621;SAR=3;SRF=4318;SRP=2024.72;SRR=1910;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:33.1492:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:36.1595:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1492:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:36.1595:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	0/0:36.1595:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.1904:5:5,0:5:154:0:0:0,-1.50515,-14.1639	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1492:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.211:7:7,0:7:204:0:0:0,-2.10721,-18.6462	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.1595:2:2,0:2:66:0:0:0,-0.60206,-6.26818	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.1698:3:3,0:3:103:0:0:0,-0.90309,-9.60997	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.20415e-09:2:0,2:0:0:2:70:-6.6474,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1492:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1492:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.211:7:7,0:7:228:0:0:0,-2.10721,-20.8386	0/0:33.1492:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:48.2007:6:6,0:6:198:0:0:0,-1.80618,-18.1443	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1492:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1492:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.1492:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:39.1698:3:3,0:3:99:0:0:0,-0.90309,-9.23712	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.1595:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5698892	.	C	A	892.587	.	AB=0.142857;ABP=18.5208;AC=1;AF=0.00421719;AN=128;AO=44;CIGAR=1X;DP=10694;DPB=10694;DPRA=1.1043;EPP=6.16881;EPPR=5310.46;GTI=9;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9966;NS=1897;NUMALT=1;ODDS=0.183485;PAIRED=0.931818;PAIREDR=0.926573;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=1559;QR=398802;RO=10650;RPL=26;RPP=6.16881;RPPR=5031.28;RPR=18;RUN=1;SAF=26;SAP=6.16881;SAR=18;SRF=3034;SRP=4283.71;SRR=7616;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:29.8711:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	0/0:44.9226:6:6,0:6:238:0:0:0,-1.80618,-21.7941	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:29.8711:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:38.902:4:4,0:4:155:0:0:0,-1.20412,-14.324	0/0:44.9226:6:6,0:6:238:0:0:0,-1.80618,-21.7941	0/0:32.8814:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	0/0:29.8711:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:41.9123:5:5,0:5:199:0:0:0,-1.50515,-18.2885	0/0:32.8814:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.1201	0/0:29.8711:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	0/0:35.8917:3:3,0:3:93:0:0:0,-0.90309,-8.67673	0/0:44.9226:6:6,0:6:240:0:0:0,-1.80618,-21.9756	0/0:29.8711:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:44.9226:6:6,0:6:238:0:0:0,-1.80618,-21.7939	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:29.8711:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:32.8814:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	0/0:29.8711:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:38.902:4:4,0:4:158:0:0:0,-1.20412,-14.6004	0/0:35.8917:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	0/1:0.524241:5:4,1:4:144:1:36:-2.09312,0,-11.8085	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.8917:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	0/0:29.8711:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:32.8814:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	0/0:29.8711:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:38.902:4:4,0:4:162:0:0:0,-1.20412,-14.9667	0/0:35.8917:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	0/0:53.9535:9:9,0:9:340:0:0:0,-2.70927,-30.9525	0/0:35.8917:3:3,0:3:121:0:0:0,-0.90309,-11.28	0/0:50.9432:8:8,0:8:316:0:0:0,-2.40824,-28.8065	0/0:35.8917:3:3,0:3:112:0:0:0,-0.90309,-10.4465	0/0:29.8711:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:35.8917:3:3,0:3:116:0:0:0,-0.90309,-10.8177	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.8711:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:29.8711:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:32.8814:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40278	0/0:29.8711:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:44.9226:6:6,0:6:236:0:0:0,-1.80618,-21.6115	0/0:35.8917:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.9123:5:5,0:5:180:0:0:0,-1.50515,-16.5521	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:38.902:4:4,0:4:144:0:0:0,-1.20412,-13.3136	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.9226:6:6,0:6:212:0:0:0,-1.80618,-19.4248	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:41.9123:5:5,0:5:180:0:0:0,-1.50515,-16.5521	0/0:35.8917:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	0/0:29.8711:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:29.8711:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:29.8711:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:38.902:4:4,0:4:129:0:0:0,-1.20412,-11.9277	0/0:35.8917:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	0/0:32.8814:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	0/0:32.8814:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45771	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.8711:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:29.8711:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827
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SL2.50ch00	5704844	.	TGCCT	TGCCC	115237	.	AB=0.473684;ABP=10.7819;AC=21;AF=0.222439;AN=139;AO=4357;CIGAR=4M1X;DP=15342;DPB=15563;DPRA=1.46264;EPP=3676.73;EPPR=11904.1;GTI=254;LEN=1;MEANALT=1.04348;MQM=59.9853;MQMR=59.9996;NS=2050;NUMALT=1;ODDS=0.00118451;PAIRED=0.896947;PAIREDR=0.87845;PAO=106.75;PQA=738.833;PQR=1051.17;PRO=221.667;QA=162349;QR=308882;RO=10942;RPL=912;RPP=3200.71;RPPR=10256.5;RPR=3445;RUN=1;SAF=3472;SAP=3338.5;SAR=885;SRF=9046;SRP=10148.4;SRR=1896;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:35.5473:5:5,0:5:122:0:0:0,-1.50515,-11.2234	0/0:35.5473:4:4,0:4:100:0:0:0,-1.20412,-9.24944	0/0:35.5473:2:2,0:2:48:0:0:0,-0.60206,-4.55979	0/0:35.5473:4:4,0:4:109:0:0:0,-1.20412,-10.0815	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.5473:8:8,0:8:195:0:0:0,-2.40824,-17.7928	0/0:35.5473:3:3,0:3:83:0:0:0,-0.90309,-7.7459	0/0:35.5473:7:7,0:7:167:0:0:0,-2.10721,-15.2679	0/0:35.5473:9:9,0:9:222:0:0:0,-2.70927,-20.2256	0/0:35.5473:2:2,0:2:54:0:0:0,-0.60206,-5.12959	0/0:35.5473:7:7,0:7:172:0:0:0,-2.10721,-15.7249	0/0:35.5473:3:3,0:3:72:0:0:0,-0.90309,-6.7197	0/0:35.5473:13:13,0:13:312:0:0:0,-3.91339,-28.3185	0/0:35.5473:3:3,0:3:72:0:0:0,-0.90309,-6.7197	0/0:35.5473:10:10,0:10:243:0:0:0,-3.0103,-22.1119	0/0:35.5473:4:3,0:3:72:0:0:0,-0.90309,-6.38983	0/0:35.5473:2:2,0:2:46:0:0:0,-0.60206,-4.36984	0/0:35.5473:8:8,0:8:191:0:0:0,-2.40824,-17.428	0/0:35.5473:10:10,0:10:246:0:0:0,-3.0103,-22.3848	0/0:35.5473:3:3,0:3:69:0:0:0,-0.90309,-6.43976	0/0:35.5473:4:4,0:4:94:0:0:0,-1.20412,-8.69462	0/0:35.5473:3:3,0:3:71:0:0:0,-0.90309,-6.62638	0/0:35.5473:2:2,0:2:48:0:0:0,-0.60206,-4.55979	0/0:35.5473:6:6,0:6:142:0:0:0,-1.80618,-13.0161	0/0:35.5473:8:8,0:8:189:0:0:0,-2.40824,-17.2455	0/1:34.5784:6:5,1:5:124:1:37:-1.89165,0,-9.60119	0/0:35.5473:7:7,0:7:172:0:0:0,-2.10721,-15.7246	0/0:35.5473:2:2,0:2:46:0:0:0,-0.60206,-4.36984	1/1:35.5473:7:0,7:0:0:7:276:-25.2062,-2.10721,0	0/0:0.000302686:1:1,0:1:24:0:0:0,-0.30103,-2.39989	1/1:35.5473:17:1,16:1:26:16:608:-52.4581,-2.51768,0	0/0:35.5473:7:7,0:7:187:0:0:0,-3.0103,-17.0957	0/0:35.5473:7:7,0:7:173:0:0:0,-2.10721,-15.8163	0/1:34.5784:11:9,2:9:229:2:78:-4.09214,0,-17.5517	0/0:35.5473:2:2,0:2:58:0:0:0,-0.60206,-5.50935	0/0:35.5473:6:6,0:6:150:0:0:0,-2.70927,-13.7492	1/1:0.000302686:4:0,4:0:0:4:156:-14.4159,-1.20412,0	0/0:35.5473:7:7,0:7:166:0:0:0,-2.10721,-15.1765	0/0:35.5473:2:2,0:2:50:0:0:0,-0.60206,-4.74971	0/0:35.5473:9:9,0:9:219:0:0:0,-3.61236,-19.9523	0/0:35.5473:9:9,0:9:214:0:0:0,-2.70927,-19.4969	0/0:35.5473:6:6,0:6:137:0:0:0,-1.80618,-12.5579	0/0:35.5473:11:11,0:11:257:0:0:0,-4.51545,-23.3626	0/0:35.5473:2:2,0:2:48:0:0:0,-0.60206,-4.55979	0/0:35.5473:2:2,0:2:48:0:0:0,-0.60206,-4.55979	0/0:35.5473:9:9,0:9:212:0:0:0,-2.70927,-19.3147	0/0:35.5473:7:7,0:7:163:0:0:0,-2.10721,-14.9022	0/0:35.5473:2:2,0:2:48:0:0:0,-0.60206,-4.55979	0/0:35.5473:4:4,0:4:92:0:0:0,-1.20412,-8.50967	0/0:35.5473:5:5,0:5:118:0:0:0,-1.50515,-10.8555	.:.:.:.:.:.:.:.:.	./1:-0:10:0,8:0:0:8:288:-25.9076,-2.40824,0	0/1:34.5784:3:2,1:2:48:1:36:-2.69518,0,-3.6567	0/0:35.5473:15:15,0:15:359:0:0:0,-4.51545,-32.5479	1/1:35.5473:5:0,5:0:0:5:176:-16.185,-1.50515,0	1/1:35.5473:5:0,5:0:0:5:172:-15.818,-1.50515,0	0/0:0.000302686:1:1,0:1:24:0:0:0,-0.30103,-2.39989	1/1:0.000302686:8:1,7:1:23:7:248:-20.3643,-0.108326,0	0/0:35.5473:5:5,0:5:120:0:0:0,-1.50515,-11.0395	0/0:35.5473:6:6,0:6:142:0:0:0,-1.80618,-13.0161	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.5473:8:8,0:8:189:0:0:0,-2.40824,-17.2455	0/1:34.5784:7:6,1:6:143:1:36:-1.49107,0,-11.0005	0/0:35.5473:7:7,0:7:165:0:0:0,-2.10721,-15.0851	0/1:34.5784:9:8,1:8:191:1:36:-0.889005,0,-14.7187	0/0:35.5473:4:4,0:4:96:0:0:0,-1.20412,-8.8796	0/1:34.5784:6:2,3:2:48:3:100:-7.59199,0,-2.84132	0/0:35.5473:6:6,0:6:142:0:0:0,-1.80618,-13.0161	0/0:35.5473:6:6,0:6:141:0:0:0,-1.80618,-12.9245	0/0:0.000302686:1:1,0:1:22:0:0:0,-0.30103,-2.19993	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000302686:3:0,3:0:0:3:104:-9.70239,-0.90309,0	0/0:35.5473:3:3,0:3:72:0:0:0,-0.90309,-6.7197	0/0:35.5473:4:4,0:4:94:0:0:0,-1.20412,-8.69464
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SL2.50ch00	5705862	.	A	G	18767.4	.	AB=0.5;ABP=3.0103;AC=21;AF=0.215896;AN=30;AO=756;CIGAR=1X;DP=6212;DPB=6212;DPRA=0.571678;EPP=94.0168;EPPR=23.1626;GTI=158;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9974;MQMR=59.9991;NS=887;NUMALT=1;ODDS=0.0361898;PAIRED=0.97619;PAIREDR=0.976352;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=26625;QR=193686;RO=5455;RPL=294;RPP=84.0786;RPPR=32.245;RPR=462;RUN=1;SAF=231;SAP=251.282;SAR=525;SRF=2029;SRP=779.887;SRR=3426;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:0.00958657:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	0/0:33.6644:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00958657:1:0,1:0:0:1:30:-2.99957,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.6749:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6644:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00958657:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0384739:3:0,3:0:0:3:100:-9.33037,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00958657:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.5572:2:1,1:1:31:1:35:-2.89657,0,-2.49739	0/0:33.6644:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0772917:4:0,4:0:0:4:132:-12.206,-1.20412,0	1/1:0.00958657:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00958657:1:0,1:0:0:1:31:-3.09945,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00958657:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0191943:2:0,2:0:0:2:64:-6.07866,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5706242	.	G	A	86.3487	.	AB=0.5;ABP=3.0103;AC=1;AF=0.0202276;AN=16;AO=22;CIGAR=1X;DP=5490;DPB=5490;DPRA=0.538588;EPP=4.58955;EPPR=81.0168;GTI=16;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8182;MQMR=59.9967;NS=791;NUMALT=1;ODDS=19.8825;PAIRED=0.863636;PAIREDR=0.968882;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=797;QR=193536;RO=5463;RPL=16;RPP=12.8806;RPPR=171.466;RPR=6;RUN=1;SAF=15;SAP=9.32731;SAR=7;SRF=2980;SRP=101.193;SRR=2483;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:86.3486:2:1,1:1:25:1:37:-3.09577,0,-1.8978	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:136.191:3:3,0:3:99:0:0:0,-0.90309,-9.23746	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:136.191:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:136.191:2:2,0:2:69:0:0:0,-0.60206,-6.55266	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:136.191:1:1,0:1:25:0:0:0,-0.30103,-2.49986	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:136.191:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:136.191:2:2,0:2:67:0:0:0,-0.60206,-6.36304	0/0:136.191:1:1,0:1:25:0:0:0,-0.30103,-2.49986	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5708765	.	CGC	CAC	2215.17	.	AB=0.349862;ABP=74.0827;AC=2;AF=0.0264766;AN=32;AO=142;CIGAR=1M1X1M;DP=5920;DPB=5989;DPRA=1.88717;EPP=3.07147;EPPR=362.972;GTI=11;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.5563;MQMR=59.9549;NS=982;NUMALT=1;ODDS=0.153058;PAIRED=1;PAIREDR=0.993588;PAO=34;PQA=67.5;PQR=216.5;PRO=97;QA=5022;QR=205293;RO=5770;RPL=87;RPP=18.6694;RPPR=3.06449;RPR=55;RUN=1;SAF=109;SAP=91.3372;SAR=33;SRF=3259;SRP=213.573;SRR=2511;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0143:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0143:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0143:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49828	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0143:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0143:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.0349:3:3,0:3:118:0:0:0,-0.90309,-11.0025	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0143:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.73301e-15:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	0/0:31.0143:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:31.0143:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	0/0:31.0143:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:31.0143:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:31.0143:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.0246:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	0/0:34.0246:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0143:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5709677	.	C	G	16024.9	.	AB=0.491525;ABP=3.08391;AC=4;AF=0.206564;AN=8;AO=588;CIGAR=1X;DP=4587;DPB=4587;DPRA=0.688289;EPP=29.068;EPPR=7.21848;GTI=89;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9881;MQMR=59.9677;NS=518;NUMALT=1;ODDS=0.0681957;PAIRED=0.993197;PAIREDR=0.990991;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=21138;QR=145463;RO=3996;RPL=232;RPP=59.7936;RPPR=89.0889;RPR=356;RUN=1;SAF=256;SAP=24.341;SAR=332;SRF=1897;SRP=25.1837;SRR=2099;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.0658:1:1,0:1:26:0:0:0,-0.30103,-2.59983	1/1:0.0196304:2:0,2:0:0:2:70:-6.6474,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.0974:4:4,0:4:140:0:0:0,-1.20412,-12.9449	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00980413:1:0,1:0:0:1:28:-2.79973,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5710680	.	C	T	36.7619	.	AB=0.571429;ABP=3.32051;AC=2;AF=0.00205761;AN=16;AO=5;CIGAR=1X;DP=5265;DPB=5265;DPRA=0.553167;EPP=3.44459;EPPR=218.211;GTI=1;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9694;NS=729;NUMALT=1;ODDS=0.822343;PAIRED=1;PAIREDR=0.981939;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=177;QR=181476;RO=5260;RPL=2;RPP=3.44459;RPPR=165.823;RPR=3;RUN=1;SAF=3;SAP=3.44459;SAR=2;SRF=2735;SRP=21.216;SRR=2525;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.9855:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45788	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:52.0061:4:4,0:4:120:0:0:0,-1.20412,-11.0984	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.9752:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.9752:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29913	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.9855:2:2,0:2:57:0:0:0,-0.60206,-5.41363	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:6.38234e-12:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.9752:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29913	0/0:42.9752:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29913	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5717654	.	T	C	25155.5	.	AB=0.519737;ABP=4.03889;AC=4;AF=0.230924;AN=12;AO=908;CIGAR=1X;DP=5433;DPB=5433;DPRA=0.7591;EPP=12.8058;EPPR=22.4066;GTI=80;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9868;MQMR=59.9881;NS=498;NUMALT=1;ODDS=0.113944;PAIRED=0.985683;PAIREDR=0.981428;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=31974;QR=160584;RO=4523;RPL=434;RPP=6.83668;RPPR=48.2588;RPR=474;RUN=1;SAF=438;SAP=5.45919;SAR=470;SRF=2264;SRP=3.0223;SRR=2259;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.4802:2:2,0:2:67:0:0:0,-0.60206,-6.36314	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.4693:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.4802:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0139447:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.4697:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0139447:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5717877	.	CCACGCT	TCACGCT,GCTCGCC	2860.36	.	AB=0.336364,0.307692;ABP=54.1781,11.3621;AC=0,2;AF=0.0688705,0.023416;AN=2;AO=154,21;CIGAR=1X6M,1X1M1X3M1X;DP=5436;DPB=5862.29;DPRA=0.601231,0.40563;EPP=3.51792,20.4855;EPPR=117.034;GTI=32;LEN=1,7;MEANALT=1.06061,1;MQM=59.9026,59.8095;MQMR=59.9813;NS=363;NUMALT=2;ODDS=0.140514;PAIRED=0.584416,1;PAIREDR=0.991046;PAO=220.5,0;PQA=1525,0;PQR=5103;PRO=622.5;QA=5243,757;QR=177777;RO=5249;RPL=144,21;RPP=256.198,48.6112;RPPR=34.2958;RPR=10,0;RUN=1,1;SAF=76,4;SAP=3.0667,20.4855;SAR=78,17;SRF=2516;SRP=22.4907;SRR=2733;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	2/2:-0:1:0,0,0:0:0:0,0:0,0:0,0,0,0,0,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5721384	.	C	A,T	915.541	.	AB=0.4,0.521053;ABP=3.87889,3.74174;AC=4,0;AF=0.282862,0.0232945;AN=6;AO=183,110;CIGAR=1X,1X;DP=5589;DPB=5589;DPRA=0.0875273,1.17489;EPP=295.495,4.2737;EPPR=32.9008;GTI=132;LEN=1,1;MEANALT=1,1;MQM=59.8306,59.9545;MQMR=59.9645;NS=601;NUMALT=2;ODDS=210.811;PAIRED=1,1;PAIREDR=0.97602;PAO=0,0;PQA=0,0;PQR=0;PRO=0;QA=6940,3908;QR=189165;RO=5296;RPL=0,58;RPP=400.39,3.72096;RPPR=11.278;RPR=183,52;RUN=1,1;SAF=170,49;SAP=295.495,5.85295;SAR=13,61;SRF=3024;SRP=234.879;SRR=2272;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:-0:1:0,1,0:0:0:1,0:36,0:-3.59827,-0.30103,0,-3.59827,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:160.002:1:1,0,0:1:35:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	1/1:160.002:1:0,1,0:0:0:1,0:41,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5722203	.	AG	TG	10901.9	.	AB=0.182791;ABP=4411.39;AC=2;AF=0.29955;AN=2;AO=1045;CIGAR=1X1M;DP=7413;DPB=7456.5;DPRA=4.09808;EPP=3.47784;EPPR=3.40736;GTI=125;LEN=1;MEANALT=1.01527;MQM=59.9005;MQMR=59.9764;NS=444;NUMALT=1;ODDS=0.0659937;PAIRED=0.57512;PAIREDR=0.971844;PAO=16.5;PQA=1;PQR=168;PRO=69;QA=36371;QR=221996;RO=6322;RPL=496;RPP=8.8473;RPPR=4.99423;RPR=549;RUN=1;SAF=334;SAP=298.349;SAR=711;SRF=2853;SRP=133.345;SRR=3469;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0201365:1:0,1:0:0:1:27:-2.69978,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5722211	.	G	A	11672	.	AB=0.178359;ABP=4678.34;AC=2;AF=0.299327;AN=2;AO=1032;CIGAR=1X;DP=7394;DPB=7394;DPRA=3.87323;EPP=25.7687;EPPR=6.63877;GTI=107;LEN=1;MEANALT=1.00391;MQM=59.8944;MQMR=59.9726;NS=446;NUMALT=1;ODDS=0.0943776;PAIRED=0.606589;PAIREDR=0.957946;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=37265;QR=224316;RO=6349;RPL=678;RPP=223.894;RPPR=3.42927;RPR=354;RUN=1;SAF=298;SAP=402.999;SAR=734;SRF=2904;SRP=103.112;SRR=3445;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0584946:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5722244	.	TTG	CTG,CTT	268529	.	AB=0.385993,0.406504;ABP=72.3277,12.3494;AC=2,0;AF=0.968326,0.00339367;AN=2;AO=8482,51;CIGAR=1X2M,1X1M1X;DP=8882;DPB=9139;DPRA=20.1818,2.46606;EPP=5.57039,4.07475;EPPR=8.42932;GTI=4;LEN=1,3;MEANALT=1.02273,2;MQM=59.9573,59.9412;MQMR=59.9792;NS=442;NUMALT=2;ODDS=0.299484;PAIRED=0.827753,0.803922;PAIREDR=0.946588;PAO=203.333,58.3333;PQA=345,152;PQR=219;PRO=155;QA=301842,1772;QR=11718;RO=337;RPL=3707,17;RPP=295.021,15.3153;RPPR=4.4601;RPR=4775,34;RUN=1,1;SAF=3538,14;SAP=509.099,25.534;SAR=4944,37;SRF=128;SRP=45.2864;SRR=209;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:20.4904:1:0,1,0:0:0:1,0:26,0:-2.59983,-0.30103,0,-2.59983,-0.30103,-2.59983	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5722298	.	T	A	84918.5	.	AB=0.383124;ABP=1184.16;AC=2;AF=0.244244;AN=18;AO=3882;CIGAR=1X;DP=11221;DPB=11221;DPRA=11.5897;EPP=97.9599;EPPR=38.8574;GTI=0;LEN=1;MEANALT=1.0069;MQM=59.9325;MQMR=59.9547;NS=999;NUMALT=1;ODDS=0.206302;PAIRED=0.679804;PAIREDR=0.940022;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=136568;QR=258499;RO=7336;RPL=2255;RPP=223.617;RPPR=52.284;RPR=1627;RUN=1;SAF=1452;SAP=538.038;SAR=2430;SRF=3450;SRP=59.2791;SRR=3886;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.4759:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5788:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:37.1974:3:1,2:1:35:2:73:-6.02821,0,-2.59554	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5971:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5664:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5788:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5971:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5788:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:41.1485:2:1,1:1:36:1:36:-2.99621,0,-2.99621	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5723867	.	G	A	34086.3	.	AB=0.421569;ABP=8.46027;AC=2;AF=0.20342;AN=18;AO=1225;CIGAR=1X;DP=5843;DPB=5843;DPRA=1.138;EPP=59.8072;EPPR=268.921;GTI=115;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9922;NS=848;NUMALT=1;ODDS=0.0369271;PAIRED=0.977143;PAIREDR=0.972932;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=43806;QR=167055;RO=4618;RPL=590;RPP=6.59988;RPPR=45.33;RPR=635;RUN=1;SAF=587;SAP=7.62091;SAR=638;SRF=2026;SRP=153.648;SRR=2592;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.4733:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.4839:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.4733:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:26.4732:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29913	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.4735:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.4733:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.4733:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.4733:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00194588:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5723965	.	G	A	37905.1	.	AB=0.469274;ABP=4.47817;AC=4;AF=0.182377;AN=36;AO=1391;CIGAR=1X;DP=6848;DPB=6848;DPRA=1.29104;EPP=150.141;EPPR=711.269;GTI=152;LEN=1;MEANALT=1.00413;MQM=59.9942;MQMR=59.9859;NS=1220;NUMALT=1;ODDS=0.0127156;PAIRED=0.988497;PAIREDR=0.981672;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=50246;QR=200217;RO=5456;RPL=549;RPP=137.028;RPPR=1219.09;RPR=842;RUN=1;SAF=734;SAP=12.266;SAR=657;SRF=3253;SRP=441.802;SRR=2203;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:31.1134:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.92919	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.1134:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49724	0/0:40.1443:5:5,0:5:196:0:0:0,-1.50515,-18.0147	0/0:28.103:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.1237:3:3,0:3:114:0:0:0,-0.90309,-10.6307	0/0:28.1031:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:49.1752:8:8,0:8:327:0:0:0,-2.40824,-29.8001	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.134:4:4,0:4:164:0:0:0,-1.20412,-15.1499	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.1134:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.3082	0/0:28.1031:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00174388:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00348845:2:0,2:0:0:2:81:-7.68573,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.1443:5:5,0:5:180:0:0:0,-1.50515,-16.5461	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.1134:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9307	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.134:4:4,0:4:154:0:0:0,-1.20412,-14.2294	0/0:28.103:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.1237:3:3,0:3:119:0:0:0,-0.90309,-11.095	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1031:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5724382	.	A	G	3459.49	.	AB=0.287202;ABP=267.322;AC=2;AF=0.0589812;AN=2;AO=194;CIGAR=1X;DP=5631;DPB=5631;DPRA=1.04173;EPP=10.5769;EPPR=11.8771;GTI=8;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.7526;MQMR=59.996;NS=373;NUMALT=1;ODDS=0.0669815;PAIRED=1;PAIREDR=0.967261;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=7072;QR=193062;RO=5437;RPL=133;RPP=61.0356;RPPR=16.9765;RPR=61;RUN=1;SAF=91;SAP=4.62211;SAR=103;SRF=2987;SRP=118.181;SRR=2450;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:1.90571e-13:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5724531	.	A	C	7905.18	.	AB=0.428571;ABP=3.32051;AC=2;AF=0.0756458;AN=28;AO=315;CIGAR=1X;DP=5846;DPB=5846;DPRA=0.802275;EPP=19.5617;EPPR=28.7444;GTI=53;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.985;NS=813;NUMALT=1;ODDS=0.123115;PAIRED=0.980952;PAIREDR=0.973237;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=11101;QR=197338;RO=5530;RPL=181;RPP=18.2382;RPPR=246.837;RPR=134;RUN=1;SAF=123;SAP=35.8306;SAR=192;SRF=2572;SRP=61.5168;SRR=2958;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6334:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.654:3:3,0:3:111:0:0:0,-0.90309,-10.3536	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.654:3:3,0:3:109:0:0:0,-0.90309,-10.1673	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6334:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6334:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6333:1:1,0:1:24:0:0:0,-0.30103,-2.39989	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.654:3:3,0:3:113:0:0:0,-0.90309,-10.539	0/0:30.6437:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.1201	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6334:1:1,0:1:30:0:0:0,-0.30103,-2.99957	0/0:27.6334:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:30.6437:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	1/1:0.00112781:1:0,1:0:0:1:34:-3.39891,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6334:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6334:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5735720	.	A	G	1859.36	.	AB=0.435185;ABP=18.7736;AC=7;AF=0.164491;AN=32;AO=340;CIGAR=1X;DP=6347;DPB=6347;DPRA=0.375464;EPP=706.976;EPPR=23.4968;GTI=183;LEN=1;MEANALT=1;MQM=58.9824;MQMR=59.948;NS=1149;NUMALT=1;ODDS=0.0533191;PAIRED=0.991176;PAIREDR=0.982512;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=12237;QR=214372;RO=6004;RPL=337;RPP=715.483;RPPR=5.68522;RPR=3;RUN=1;SAF=5;SAP=698.52;SAR=335;SRF=3398;SRP=229.873;SRR=2606;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.7124:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69568	0/0:53.7334:3:3,0:3:109:0:0:0,-0.90309,-10.167	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.7231:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9311	0/0:47.7126:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	1/1:25.9378:3:0,3:0:0:3:105:-9.79343,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.7231:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.64548	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:53.7334:3:3,0:3:112:0:0:0,-0.90309,-10.4445	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.7231:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83664	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0126907:1:0,1:0:0:1:38:-3.79656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.7231:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49724	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:58.4468:3:1,2:1:40:2:75:-6.21521,0,-3.09259	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.7126:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:56.2777:4:1,3:1:41:3:110:-9.05469,0,-2.89045	0/1:41.4501:5:3,2:3:96:2:74:-5.51952,0,-7.45005	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.7126:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.7231:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5735727	.	G	T	30129.6	.	AB=0.410596;ABP=23.9772;AC=2;AF=0.154991;AN=32;AO=1171;CIGAR=1X;DP=6138;DPB=6138;DPRA=1.40401;EPP=16.4082;EPPR=68.4249;GTI=126;LEN=1;MEANALT=1.00474;MQM=59.988;MQMR=59.869;NS=1142;NUMALT=1;ODDS=0.0282452;PAIRED=0.99573;PAIREDR=0.982208;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=40866;QR=174509;RO=4946;RPL=602;RPP=5.02971;RPPR=25.8332;RPR=569;RUN=1;SAF=698;SAP=96.888;SAR=473;SRF=2523;SRP=7.40066;SRR=2423;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.0192:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89317	0/0:34.0399:3:3,0:3:111:0:0:0,-0.90309,-10.3524	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0296:2:2,0:2:63:0:0:0,-0.60206,-5.98228	0/0:28.0193:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:34.0399:3:3,0:3:104:0:0:0,-0.90309,-9.69819	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.0193:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.0399:3:3,0:3:113:0:0:0,-0.90309,-10.5375	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0296:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.0192:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0296:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.0399:3:3,0:3:119:0:0:0,-0.90309,-11.091	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0021672:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.0502:4:4,0:4:150:0:0:0,-1.20412,-13.8605	0/0:37.0502:4:4,0:4:147:0:0:0,-1.20412,-13.5856	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.0192:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.0296:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5735742	.	ATTCG	GTTCG	13964.1	.	AB=0.392405;ABP=34.7853;AC=2;AF=0.0829576;AN=30;AO=602;CIGAR=1X4M;DP=6042;DPB=6415.4;DPRA=1.59708;EPP=39.0813;EPPR=67.0655;GTI=51;LEN=1;MEANALT=1.02586;MQM=59.8821;MQMR=59.8877;NS=1109;NUMALT=1;ODDS=0.403593;PAIRED=0.963455;PAIREDR=0.98986;PAO=161;PQA=703.5;PQR=2292;PRO=460;QA=21116;QR=191218;RO=5424;RPL=250;RPP=40.5385;RPPR=19.346;RPR=352;RUN=1;SAF=289;SAP=5.08799;SAR=313;SRF=2659;SRP=7.50858;SRR=2765;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.9099:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99142	0/0:33.9305:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.90309,-7.36828	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.9202:2:2,0:2:67:0:0:0,-0.60206,-6.36069	0/0:27.9099:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:33.9305:3:3,0:3:111:0:0:0,-0.90309,-10.3513	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9305:3:3,0:3:96:0:0:0,-0.90309,-8.9554	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9305:3:3,0:3:113:0:0:0,-0.90309,-10.5363	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000467892:2:0,2:0:0:2:76:-7.21354,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.9099:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09317	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.9202:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.11959	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.9305:3:3,0:3:110:0:0:0,-0.90309,-10.2564	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.9099:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.9408:4:4,0:4:146:0:0:0,-1.20412,-13.4938	0/0:39.9511:4:4,0:4:144:0:0:0,-1.50515,-13.2357	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.9099:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5741232	.	A	G	501.872	.	AB=0.428571;ABP=3.63072;AC=2;AF=0.0295508;AN=42;AO=57;CIGAR=1X;DP=3985;DPB=3985;DPRA=0.509471;EPP=118.251;EPPR=3252.71;GTI=39;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9649;MQMR=59.9916;NS=1269;NUMALT=1;ODDS=0.046555;PAIRED=0.22807;PAIREDR=0.65868;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=2033;QR=139101;RO=3923;RPL=12;RPP=44.4969;RPPR=19.1959;RPR=45;RUN=1;SAF=44;SAP=39.6206;SAR=13;SRF=1329;SRP=888.772;SRR=2594;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:41.349:3:3,0:3:116:0:0:0,-0.90309,-10.8175	0/0:35.3284:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.3284:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:38.3387:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.4033	0/0:35.3284:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.3284:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.3799:6:6,0:6:237:0:0:0,-1.80618,-21.702	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.3799:6:6,0:6:216:0:0:0,-1.80618,-19.7866	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.3284:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:3.06711e-14:2:0,2:0:0:2:73:-6.92919,-0.60206,0	0/0:35.3284:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.3284:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.3284:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:35.3284:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.3387:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	0/0:38.3387:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02486	0/0:35.3284:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.349:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79159	0/0:44.3593:4:4,0:4:152:0:0:0,-1.20412,-14.0468	0/0:35.3284:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.3593:4:4,0:4:159:0:0:0,-1.20412,-14.692	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5741250	.	CTGCA	CTGCG	12403.4	.	AB=0.47619;ABP=3.32051;AC=3;AF=0.129979;AN=24;AO=577;CIGAR=4M1X;DP=3802;DPB=4614.8;DPRA=1.19237;EPP=9.33655;EPPR=758.815;GTI=92;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9775;MQMR=59.9922;NS=954;NUMALT=1;ODDS=0.00581116;PAIRED=0.594454;PAIREDR=0.50342;PAO=351;PQA=1841.5;PQR=2165;PRO=487.5;QA=19581;QR=109605;RO=3216;RPL=93;RPP=578.36;RPPR=1908.72;RPR=484;RUN=1;SAF=228;SAP=58.11;SAR=349;SRF=1581;SRP=4.97921;SRR=1635;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:31.9472:3:3,0:3:98:0:0:0,-0.90309,-9.14437	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.9266:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:31.947:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.90309,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:19.4803:3:2,1:2:66:1:35:-0.789359,0,-3.55904	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00081369:2:1,1:1:20:1:28:-0.799769,-1.6124,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.9575:2:2,0:2:66:0:0:0,-1.20412,-6.26818	0/0:25.9266:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.9265:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.9369:2:2,0:2:66:0:0:0,-0.60206,-6.26836	0/0:25.9266:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9678:3:3,0:3:100:0:0:0,-1.50515,-9.33037	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9678:3:3,0:3:97:0:0:0,-1.50515,-9.05092	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5778878	.	G	A	175806	.	AB=0.772727;ABP=17.2236;AC=4;AF=0.904568;AN=6;AO=5186;CIGAR=1X;DP=5536;DPB=5536;DPRA=1.52215;EPP=187.621;EPPR=19.8829;GTI=50;LEN=1;MEANALT=1.00359;MQM=60;MQMR=60;NS=613;NUMALT=1;ODDS=0.306671;PAIRED=0.989202;PAIREDR=0.985632;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=196355;QR=12939;RO=348;RPL=2324;RPP=124.206;RPPR=12.0207;RPR=2862;RUN=1;SAF=2207;SAP=252.56;SAR=2979;SRF=143;SRP=26.9963;SRR=205;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.2905:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:26.2905:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00276332:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5879273	.	TAA	CAA,CAG	24904.7	.	AB=0.53913,0;ABP=4.53977,0;AC=3,0;AF=0.169872,0.00769231;AN=18;AO=846,121;CIGAR=1X2M,1X1M1X;DP=4074;DPB=4151.67;DPRA=1.34574,3.97764;EPP=3.17457,3.88966;EPPR=108.327;GTI=88;LEN=1,3;MEANALT=1.00704,1;MQM=59.9846,59.9835;MQMR=59.9987;NS=780;NUMALT=2;ODDS=0.0654373;PAIRED=0.946809,1;PAIREDR=0.826997;PAO=44.5,8;PQA=61,18.5;PQR=200.5;PRO=94.5;QA=30960,4282;QR=106510;RO=3104;RPL=441,64;RPP=6.33681,3.88966;RPPR=117.192;RPR=405,57;RUN=1,1;SAF=304,59;SAP=148.401,3.17181;SAR=542,62;SRF=1110;SRP=549.695;SRR=1994;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.5323:3:3,0,0:3:92:0,0:0,0:0,-0.90309,-8.58499,-0.90309,-8.58499,-8.58499	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000494532:1:0,1,0:0:0:1,0:31,0:-3.09914,-0.30103,0,-3.09914,-0.30103,-3.09914	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5108:1:1,0,0:1:23:0,0:0,0:0,-0.30103,-2.29991,-0.30103,-2.29991,-2.29991	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5099:1:1,0,0:1:20:0,0:0,0:0,-0.30103,-1.99996,-0.30103,-1.99996,-1.99996	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5117:1:1,0,0:1:34:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.39891,-0.30103,-3.39891,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5115:1:1,0,0:1:29:0,0:0,0:0,-0.30103,-2.89966,-0.30103,-2.89966,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5114:1:1,0,0:1:27:0,0:0,0:0,-0.30103,-2.69978,-0.30103,-2.69978,-2.69978	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.5117:1:1,0,0:1:35:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:48.1158:2:1,1,0:1:29:1,0:33,0:-2.69707,0,-2.2976,-2.9981,-2.59863,-5.28679	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5884210	.	GCG	GCA	33061.1	.	AB=0.534392;ABP=4.95199;AC=2;AF=0.170543;AN=18;AO=1147;CIGAR=2M1X;DP=4544;DPB=4662;DPRA=1.65055;EPP=4.01179;EPPR=214.057;GTI=103;LEN=1;MEANALT=1.00699;MQM=60;MQMR=60;NS=774;NUMALT=1;ODDS=0.00305063;PAIRED=0.979948;PAIREDR=0.981121;PAO=72;PQA=209;PQR=243;PRO=153;QA=43731;QR=122818;RO=3390;RPL=590;RPP=5.07197;RPPR=320.478;RPR=557;RUN=1;SAF=668;SAP=70.6364;SAR=479;SRF=2117;SRP=459.299;SRR=1273;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:26.0724:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.0827:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9307	0/0:0.0104901:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00246833:3:0,3:0:0:3:106:-9.8849,-0.90309,0	0/0:26.0724:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.0724:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.0827:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.0104901:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.0721:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5884424	.	TACACCC	TGTCCT,TGGCCT	18960.3	.	AB=0.446154,0.385965;ABP=4.64726,15.8868;AC=2,0;AF=0.126807,0.0453351;AN=18;AO=638,214;CIGAR=1M1D2X2M1X,1M1D2X2M1X;DP=4429;DPB=4654.71;DPRA=1.16156,1.22526;EPP=4.97075,4.47148;EPPR=95.7858;GTI=88;LEN=6,6;MEANALT=1.08738,1.18605;MQM=60,60;MQMR=60;NS=761;NUMALT=2;ODDS=0.0682816;PAIRED=0.981191,0.962617;PAIREDR=0.983146;PAO=119.667,119.667;PQA=580.833,580.833;PQR=4657.33;PRO=661.667;QA=22828,7670;QR=120499;RO=3560;RPL=313,122;RPP=3.50041,12.1427;RPPR=71.8728;RPR=325,92;RUN=1,1;SAF=324,103;SAP=3.35066,3.65971;SAR=314,111;SRF=1621;SRP=64.6923;SRR=1939;TYPE=complex,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:25.9538:1:1,0,0:1:37:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.69783,-0.30103,-3.69783,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.9641:2:2,0,0:2:69:0,0:0,0:0,-0.60206,-6.55254,-0.60206,-6.55254,-6.55254	0/0:25.9538:1:1,0,0:1:38:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.79727,-0.30103,-3.79727,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:2.43784e-05:3:0,3,0:0:0:3,0:101,0:-9.4209,-0.90309,0,-9.4209,-0.90309,-9.4209	0/0:25.9538:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.9538:1:1,0,0:1:35:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.9641:2:2,0,0:2:70:0,0:0,0:0,-0.60206,-6.64733,-0.60206,-6.64733,-6.64733	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.9538:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.9538:1:1,0,0:1:37:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.69783,-0.30103,-3.69783,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5898210	.	T	C	38571.2	.	AB=0.531073;ABP=4.49475;AC=2;AF=0.271868;AN=4;AO=1235;CIGAR=1X;DP=4427;DPB=4427;DPRA=1.04523;EPP=11.3815;EPPR=38.6963;GTI=63;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=423;NUMALT=1;ODDS=0.0140343;PAIRED=0.975709;PAIREDR=0.960201;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=47497;QR=116456;RO=3191;RPL=603;RPP=4.48901;RPPR=3.04364;RPR=632;RUN=1;SAF=639;SAP=6.26135;SAR=596;SRF=1681;SRP=22.9088;SRR=1510;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:23.9298:2:2,0:2:52:0:0:0,-0.60206,-4.93967	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00206318:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5899091	.	A	G	18437.3	.	AB=0.516854;ABP=3.44947;AC=2;AF=0.159184;AN=8;AO=609;CIGAR=1X;DP=4119;DPB=4119;DPRA=0.972914;EPP=3.09944;EPPR=36.3087;GTI=43;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=490;NUMALT=1;ODDS=0.271283;PAIRED=0.975369;PAIREDR=0.962393;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=24116;QR=130126;RO=3510;RPL=288;RPP=6.89328;RPPR=5.09145;RPR=321;RUN=1;SAF=283;SAP=9.60316;SAR=326;SRF=1551;SRP=105.994;SRR=1959;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:26.8104:2:2,0:2:58:0:0:0,-0.60206,-5.5083	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00193559:1:0,1:0:0:1:31:-3.09945,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:23.8:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:23.8:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5899159	.	A	C	22170.5	.	AB=0.495652;ABP=3.02918;AC=4;AF=0.168687;AN=10;AO=729;CIGAR=1X;DP=4081;DPB=4081;DPRA=1.19696;EPP=23.5306;EPPR=83.277;GTI=46;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=495;NUMALT=1;ODDS=0.113481;PAIRED=0.973937;PAIREDR=0.960621;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=28531;QR=126868;RO=3352;RPL=368;RPP=3.15626;RPPR=13.295;RPR=361;RUN=1;SAF=384;SAP=7.5409;SAR=345;SRF=1633;SRP=7.80153;SRR=1719;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:25.9893:2:2,0:2:71:0:0:0,-0.60206,-6.74038	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000602355:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000602355:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:22.979:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:22.979:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	5907316	.	G	A	20465.9	.	AB=0.535948;ABP=4.72761;AC=2;AF=0.169661;AN=8;AO=714;CIGAR=1X;DP=4371;DPB=4371;DPRA=0.936992;EPP=3.02247;EPPR=3.3526;GTI=48;LEN=1;MEANALT=1.01053;MQM=60;MQMR=60;NS=501;NUMALT=1;ODDS=0.0512231;PAIRED=0.985994;PAIREDR=0.979201;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=26489;QR=131093;RO=3654;RPL=339;RPP=6.9518;RPPR=41.9566;RPR=375;RUN=1;SAF=263;SAP=110.501;SAR=451;SRF=1338;SRP=571.423;SRR=2316;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:23.2917:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:23.2916:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00286292:2:0,2:0:0:2:70:-6.64733,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:23.2916:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	5926470	.	ATCA	ATCC,GTCC	27502.6	.	AB=0.574074,0.504673;ABP=8.15749,3.03059;AC=2,0;AF=0.264103,0.0397436;AN=4;AO=767,182;CIGAR=3M1X,1X2M1X;DP=3610;DPB=3734.5;DPRA=0.740921,1.34565;EPP=14.9718,3.2012;EPPR=10.3917;GTI=72;LEN=1,4;MEANALT=1.06306,1.31579;MQM=60,60;MQMR=60;NS=390;NUMALT=2;ODDS=0.110098;PAIRED=0.985658,0.983516;PAIREDR=0.972128;PAO=79,22.5;PQA=332.5,91.5;PQR=440;PRO=157.5;QA=30424,6616;QR=98973;RO=2655;RPL=354,83;RPP=12.8654,6.06468;RPPR=3.01112;RPR=413,99;RUN=1,1;SAF=488,108;SAP=126.677,16.8027;SAR=279,74;SRF=1610;SRP=264.098;SRR=1045;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000942632:1:0,1,0:0:0:1,0:41,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:19.5102:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	6037366	.	CT	CC	183004	.	AB=0.58125;ABP=12.1848;AC=25;AF=0.885821;AN=48;AO=5736;CIGAR=1M1X;DP=6261;DPB=6310;DPRA=1.4318;EPP=1659.8;EPPR=478.178;GTI=142;LEN=1;MEANALT=1.00303;MQM=59.901;MQMR=60;NS=1467;NUMALT=1;ODDS=0.0732885;PAIRED=0.98954;PAIREDR=0.986513;PAO=45.5;PQA=114.5;PQR=76;PRO=31;QA=213459;QR=19492;RO=519;RPL=4499;RPP=4031.23;RPPR=542.243;RPR=1237;RUN=1;SAF=1687;SAP=2115.06;SAR=4049;SRF=101;SRP=423.452;SRR=418;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:42.538:4:0,4:0:0:4:152:-14.0474,-1.20412,0	1/1:42.538:4:0,4:0:0:4:147:-13.5857,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00552217:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	1/1:33.507:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:39.5277:3:0,3:0:0:3:114:-10.6324,-0.90309,0	1/1:33.507:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	1/1:45.5483:5:0,5:0:0:5:204:-18.744,-1.50515,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:69.5191:5:3,2:3:112:2:80:-6.08642,0,-8.94022	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:39.5277:3:0,3:0:0:3:115:-10.7224,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:42.538:4:0,4:0:0:4:146:-13.4942,-1.20412,0	0/0:0.0110514:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.92919	0/0:0.0110514:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49724	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00552217:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:0.00552217:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:0.00552217:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:0.00552217:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.0221309:3:3,0:3:123:0:0:0,-0.90309,-11.4648	1/1:42.538:4:0,4:0:0:4:160:-14.7829,-1.20412,0	0/0:0.00552217:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:36.5174:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	1/1:39.5277:3:0,3:0:0:3:123:-11.4648,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.0110514:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	1/1:51.5689:7:0,7:0:0:7:279:-25.4795,-2.10721,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.0110514:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	6071067	.	CAGT	CAGC,AAGC,CAAC	16865.9	.	AB=0.507463,0.461538,0.3;ABP=3.04271,3.17734,6.48466;AC=2,0,0;AF=0.210674,0.0505618,0.0196629;AN=4;AO=479,136,72;CIGAR=3M1X,1X2M1X,2M2X;DP=3151;DPB=3267.25;DPRA=0.714424,0.827461,1.09978;EPP=3.12363,4.60697,3.13094;EPPR=6.62589;GTI=75;LEN=1,4,2;MEANALT=1.03571,1.10526,1.125;MQM=60,60,60;MQMR=60;NS=356;NUMALT=3;ODDS=0.152415;PAIRED=0.970772,0.977941,1;PAIREDR=0.972764;PAO=55.5,15.8333,29;PQA=216.167,63.3333,103.667;PQR=295.833;PRO=126.667;QA=17991,4995,2684;QR=88006;RO=2460;RPL=246,80,44;RPP=3.77644,12.2071,10.7311;RPPR=10.4816;RPR=233,56,28;RUN=1,1,1;SAF=285,79,41;SAP=40.5509,10.7382,6.02623;SAR=194,57,31;SRF=1382;SRP=84.587;SRR=1078;TYPE=snp,complex,mnp;technology.illumina=1,1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00527156:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:36,0,0:-3.59827,-0.30103,0,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.8837:1:1,0,0,0:1:36:0,0,0:0,0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6080734	.	T	C	30442.5	.	AB=0.471264;ABP=3.63429;AC=2;AF=0.289082;AN=6;AO=964;CIGAR=1X;DP=3523;DPB=3523;DPRA=0.92957;EPP=5.31693;EPPR=20.6268;GTI=66;LEN=1;MEANALT=1.01639;MQM=60;MQMR=60;NS=403;NUMALT=1;ODDS=0.0237571;PAIRED=0.98029;PAIREDR=0.97457;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=37839;QR=98490;RO=2556;RPL=465;RPP=5.61426;RPPR=3.42149;RPR=499;RUN=1;SAF=519;SAP=15.3453;SAR=445;SRF=1461;SRP=116.814;SRR=1095;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:21.0005:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.0343309:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00213856:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	6252489	.	C	T	81370	.	AB=0.484472;ABP=3.34749;AC=20;AF=0.702752;AN=38;AO=2836;CIGAR=1X;DP=4510;DPB=4510;DPRA=0.762018;EPP=380.341;EPPR=42.2836;GTI=214;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9915;MQMR=59.991;NS=1090;NUMALT=1;ODDS=0.000112449;PAIRED=0.994711;PAIREDR=0.994624;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=100063;QR=60139;RO=1674;RPL=1885;RPP=670.957;RPPR=196.284;RPR=951;RUN=1;SAF=1704;SAP=253.529;SAR=1132;SRF=908;SRP=29.1666;SRR=766;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:27.7767:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	1/1:27.7763:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.7767:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	0/0:0.00222619:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00222619:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00222619:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:31.7084:4:4,0:4:136:0:0:0,-1.20412,-12.5757	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.00445352:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.7877:2:0,2:0:0:2:65:-6.17329,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00734865:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6981:3:3,0:3:103:0:0:0,-0.90309,-9.60997	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.7763:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.7767:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	0/0:0.00445352:2:2,0:2:62:0:0:0,-0.60206,-5.88849	0/0:0.00222619:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	1/1:27.7767:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.7877:2:0,2:0:0:2:70:-6.6474,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.7757:1:0,1:0:0:1:31:-3.09945,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.6981:3:3,0:3:100:0:0:0,-0.90309,-9.33037	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6252499	.	G	T	6679.86	.	AB=0.3125;ABP=7.89611;AC=5;AF=0.0669975;AN=24;AO=261;CIGAR=1X;DP=3961;DPB=3961;DPRA=0.987492;EPP=7.41148;EPPR=10.6375;GTI=46;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9962;MQMR=59.9889;NS=806;NUMALT=1;ODDS=0.033558;PAIRED=1;PAIREDR=0.993243;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=9629;QR=135749;RO=3700;RPL=144;RPP=9.07545;RPPR=350.974;RPR=117;RUN=1;SAF=129;SAP=3.08518;SAR=132;SRF=1980;SRP=42.6837;SRR=1720;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:27.6207:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6207:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:27.6207:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000860798:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:26.8922:3:2,1:2:70:1:34:-2.49582,0,-5.74431	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00172177:2:0,2:0:0:2:70:-6.6474,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6207:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.631:2:2,0:2:59:0:0:0,-0.60206,-5.60359	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6207:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6207:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6207:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6206:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	6277770	.	CTTG	CTTA	8442.68	.	AB=0.55814;ABP=4.27278;AC=2;AF=0.14135;AN=8;AO=319;CIGAR=3M1X;DP=2317;DPB=2381.75;DPRA=1.01655;EPP=10.4233;EPPR=3.02012;GTI=50;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9561;MQMR=59.9709;NS=474;NUMALT=1;ODDS=0.0130649;PAIRED=0.902821;PAIREDR=0.881467;PAO=38.5;PQA=85.5;PQR=164.5;PRO=76;QA=12458;QR=73856;RO=1991;RPL=173;RPP=7.97269;RPPR=178.387;RPR=146;RUN=1;SAF=30;SAP=459.639;SAR=289;SRF=210;SRP=2694.76;SRR=1781;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:24.8028:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	1/1:0.00293056:1:0,1:0:0:1:38:-3.79656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.8131:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21467	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:24.8028:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6279442	.	G	C	26451.2	.	AB=0.596154;ABP=11.3621;AC=2;AF=0.312857;AN=2;AO=843;CIGAR=1X;DP=3016;DPB=3016;DPRA=0.888864;EPP=3.21895;EPPR=19.128;GTI=53;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=350;NUMALT=1;ODDS=0.0183985;PAIRED=0.979834;PAIREDR=0.974229;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=32947;QR=82711;RO=2173;RPL=417;RPP=3.21895;RPPR=10.574;RPR=426;RUN=1;SAF=447;SAP=9.71018;SAR=396;SRF=1062;SRP=5.40961;SRR=1111;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00295801:1:0,1:0:0:1:32:-3.19931,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	6300022	.	T	G	41628.3	.	AB=0.479675;ABP=3.45166;AC=3;AF=0.255556;AN=20;AO=1332;CIGAR=1X;DP=4331;DPB=4331;DPRA=1.29815;EPP=7.41845;EPPR=55.0329;GTI=124;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=675;NUMALT=1;ODDS=0.00663934;PAIRED=0.974474;PAIREDR=0.977652;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=52601;QR=115363;RO=2998;RPL=675;RPP=3.5385;RPPR=14.1472;RPR=657;RUN=1;SAF=625;SAP=13.972;SAR=707;SRF=1222;SRP=225.312;SRR=1776;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:28.1285:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:68.3751:3:1,2:1:41:2:75:-6.2165,0,-3.19148	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00158485:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.1182:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1285:2:2,0:2:64:0:0:0,-0.60206,-6.07579	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1285:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	0/0:25.1182:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:25.1182:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:25.1182:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.1182:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6300034	.	T	G	29903.9	.	AB=0.483871;ABP=3.29049;AC=3;AF=0.197466;AN=20;AO=968;CIGAR=1X;DP=4307;DPB=4307;DPRA=1.18447;EPP=3.04619;EPPR=105.509;GTI=78;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=671;NUMALT=1;ODDS=0.000973033;PAIRED=0.978306;PAIREDR=0.978437;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=38641;QR=129564;RO=3339;RPL=532;RPP=23.6842;RPPR=63.5078;RPR=436;RUN=1;SAF=448;SAP=14.6393;SAR=520;SRF=1430;SRP=152.224;SRR=1909;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:28.1005:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:73.9889:3:1,2:1:41:2:75:-6.21571,0,-3.19148	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000391866:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.0901:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1005:2:2,0:2:71:0:0:0,-0.60206,-6.73943	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.1005:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	0/0:25.0901:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:25.0901:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:25.0901:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.0901:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6301461	.	C	A	19625.3	.	AB=0.57971;ABP=6.81824;AC=2;AF=0.219316;AN=6;AO=672;CIGAR=1X;DP=2411;DPB=2411;DPRA=1.42557;EPP=16.2459;EPPR=230.683;GTI=74;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9821;MQMR=60;NS=497;NUMALT=1;ODDS=0.0128421;PAIRED=0.970238;PAIREDR=0.890742;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=26119;QR=65251;RO=1739;RPL=305;RPP=15.4316;RPPR=205.809;RPR=367;RUN=1;SAF=383;SAP=31.5626;SAR=289;SRF=1219;SRP=613.122;SRR=520;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00213011:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:24.0565:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:24.0566:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6315680	.	ACT	ACC,CCC	48739.3	.	AB=0.686212,0.212341;ABP=193.057,399.034;AC=2,0;AF=0.496652,0.0613839;AN=10;AO=1613,216;CIGAR=2M1X,1X1M1X;DP=3783;DPB=3969.67;DPRA=0.822048,2.31261;EPP=4.47635,142.99;EPPR=3.05047;GTI=167;LEN=1,3;MEANALT=1.37008,1.98913;MQM=60,60;MQMR=60;NS=448;NUMALT=2;ODDS=0.0207006;PAIRED=0.978301,0.986111;PAIREDR=0.983556;PAO=149.5,117;PQA=769,647;PQR=163;PRO=57.5;QA=61312,5446;QR=72451;RO=1946;RPL=869,49;RPP=24.0452,142.99;RPPR=4.62161;RPR=744,167;RUN=1,1;SAF=1140,0;SAP=601.934,472.048;SAR=473,216;SRF=1042;SRP=24.2608;SRR=904;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0189184:2:0,2,0:0:0:2,0:70,0:-6.6474,-0.60206,0,-6.6474,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.0258891:1:1,0,0:1:35:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.0258891:1:1,0,0:1:35:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:22.0029:2:2,0,0:2:67:0,0:0,0:0,-0.60206,-6.36314,-0.60206,-6.36314,-6.36314	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.0258891:1:1,0,0:1:35:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6400459	.	G	A	23581.8	.	AB=0.552941;ABP=5.07959;AC=4;AF=0.261111;AN=4;AO=759;CIGAR=1X;DP=4052;DPB=4052;DPRA=0.637615;EPP=5.09594;EPPR=3.17927;GTI=56;LEN=1;MEANALT=1.01;MQM=59.9895;MQMR=59.9903;NS=360;NUMALT=1;ODDS=0.188292;PAIRED=0.993412;PAIREDR=0.995137;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=29345;QR=124658;RO=3290;RPL=386;RPP=3.4938;RPPR=7.44829;RPR=373;RUN=1;SAF=340;SAP=20.8656;SAR=419;SRF=1497;SRP=60.8388;SRR=1793;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00462553:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00462553:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	6426695	.	T	G	28883.7	.	AB=0.532468;ABP=4.42035;AC=16;AF=0.16416;AN=76;AO=1136;CIGAR=1X;DP=5849;DPB=5849;DPRA=1.25258;EPP=3.01795;EPPR=11.6579;GTI=127;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=1197;NUMALT=1;ODDS=0.350724;PAIRED=0.877641;PAIREDR=0.937832;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=39952;QR=172373;RO=4713;RPL=717;RPP=172.76;RPPR=1636.65;RPR=419;RUN=1;SAF=608;SAP=15.2439;SAR=528;SRF=2477;SRP=29.7706;SRR=2236;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:29.8098:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	0/0:29.8098:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49763	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000792041:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	1/1:0.00634038:4:0,4:0:0:4:159:-14.6921,-1.20412,0	0/0:29.8098:2:2,0:2:65:0:0:0,-0.60206,-6.17353	1/1:31.0874:8:0,8:0:0:8:313:-28.5329,-2.40824,0	1/1:0.00634038:4:0,4:0:0:4:144:-13.3136,-1.20412,0	1/1:0.00634038:4:0,4:0:0:4:155:-14.3245,-1.20412,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00316903:3:0,3:0:0:3:98:-9.14192,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.8098:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49724	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:47.8716:8:8,0:8:311:0:0:0,-2.40824,-28.3513	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.8098:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59157	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.7994:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	0/0:29.8098:2:2,0:2:66:0:0:0,-0.60206,-6.26818	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.851:6:6,0:6:239:0:0:0,-1.80618,-21.8848	0/0:29.8098:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49763	0/0:29.8098:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.8098:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45771	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:41.851:6:6,0:6:239:0:0:0,-1.80618,-21.8846	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:29.8098:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.8304:4:4,0:4:144:0:0:0,-1.20412,-13.3136	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:26.7994:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	0/0:29.8098:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45771	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:26.7995:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:26.7994:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.000792041:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	0/0:29.8098:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83672	1/1:0.000792041:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	6435067	.	T	C	35005.2	.	AB=0.591912;ABP=22.9687;AC=7;AF=0.103271;AN=54;AO=1225;CIGAR=1X;DP=8273;DPB=8273;DPRA=1.44771;EPP=157.273;EPPR=5021.7;GTI=101;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=1651;NUMALT=1;ODDS=0.308347;PAIRED=0.981224;PAIREDR=0.986805;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=48148;QR=276060;RO=7048;RPL=447;RPP=197.221;RPPR=5463.76;RPR=778;RUN=1;SAF=703;SAP=61.0834;SAR=522;SRF=5447;SRP=4560.3;SRR=1601;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:51.7494:9:9,0:9:349:0:0:0,-2.70927,-31.7646	0/0:39.7082:5:5,0:5:205:0:0:0,-1.50515,-18.835	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.6773:2:2,0:2:79:0:0:0,-0.60206,-7.49724	0/0:36.6979:4:4,0:4:163:0:0:0,-1.20412,-15.0584	0/0:30.6773:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	0/1:105.509:6:3,3:3:123:3:123:-9.65861,0,-9.65861	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00397259:5:0,5:0:0:5:201:-18.4705,-1.50515,0	0/0:27.667:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	1/1:26.6612:7:0,7:0:0:7:283:-25.8434,-2.10721,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:89.4126:6:2,4:2:77:4:162:-13.1606,0,-5.50202	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:71.5454:3:1,2:1:41:2:82:-6.87659,0,-3.19148	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.6979:4:4,0:4:158:0:0:0,-1.20412,-14.5999	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.6979:4:4,0:4:163:0:0:0,-1.20412,-15.0584	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.667:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.667:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:30.6773:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	0/0:27.667:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:36.6979:4:4,0:4:164:0:0:0,-1.20412,-15.1499	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.6979:4:4,0:4:162:0:0:0,-1.20412,-14.9667	0/0:30.6773:2:2,0:2:81:0:0:0,-0.60206,-7.68573	0/0:42.7185:6:6,0:6:238:0:0:0,-1.80618,-21.7927	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.667:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.667:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6876:3:3,0:3:116:0:0:0,-0.90309,-10.8168	0/0:36.6979:4:4,0:4:157:0:0:0,-1.20412,-14.5064	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.6876:3:3,0:3:122:0:0:0,-0.90309,-11.3725	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.6669:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6438409	.	G	A	9435.66	.	AB=0.50495;ABP=3.0748;AC=8;AF=0.0601549;AN=56;AO=504;CIGAR=1X;DP=8998;DPB=8998;DPRA=0.970841;EPP=524.784;EPPR=7338.44;GTI=77;LEN=1;MEANALT=1.00794;MQM=59.9901;MQMR=59.9928;NS=1679;NUMALT=1;ODDS=0.133288;PAIRED=0.998016;PAIREDR=0.999764;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=17761;QR=297325;RO=8492;RPL=454;RPP=706.223;RPPR=7851.1;RPR=50;RUN=1;SAF=434;SAP=573.866;SAR=70;SRF=6680;SRP=6062.63;SRR=1812;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:69.0517:14:14,0:14:464:0:0:0,-4.21442,-42.0775	0/0:38.9487:4:4,0:4:137:0:0:0,-1.20412,-12.6681	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:32.9281:2:2,0:2:65:0:0:0,-0.60206,-6.17329	0/0:44.9693:6:6,0:6:198:0:0:0,-1.80618,-18.1446	0/0:32.9281:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	1/1:0.00119856:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:36.3827:15:0,15:0:0:15:504:-45.6799,-4.51545,0	0/0:29.9178:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	1/1:0.00239744:2:0,2:0:0:2:71:-6.74206,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:103.629:10:4,6:4:135:6:204:-15.6822,0,-9.47323	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:77.2827:7:3,4:3:105:4:143:-11.1142,0,-7.68895	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.9487:4:4,0:4:140:0:0:0,-1.20412,-12.9449	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.9487:4:4,0:4:140:0:0:0,-1.20412,-12.9449	0/0:47.9796:7:7,0:7:233:0:0:0,-2.10721,-21.2965	0/0:35.9384:3:3,0:3:103:0:0:0,-0.90309,-9.60997	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.9178:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:32.9281:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	0/0:29.9177:1:1,0:1:30:0:0:0,-0.30103,-2.99957	0/0:29.9178:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:60.0208:11:11,0:11:345:0:0:0,-3.31133,-31.3553	0/0:35.9384:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	0/0:54.0002:9:9,0:9:310:0:0:0,-2.70927,-28.2341	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:29.9178:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:38.9487:4:4,0:4:140:0:0:0,-1.20412,-12.9449	0/0:35.9384:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.959:5:5,0:5:170:0:0:0,-1.50515,-15.6348	0/0:35.9384:3:3,0:3:101:0:0:0,-0.90309,-9.4236	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.9487:4:4,0:4:140:0:0:0,-1.20412,-12.9449	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6440640	.	G	T	19122.9	.	AB=0.58042;ABP=11.0432;AC=2;AF=0.152355;AN=8;AO=689;CIGAR=1X;DP=4039;DPB=4039;DPRA=1.18355;EPP=3.54293;EPPR=71.9396;GTI=70;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=60;NS=722;NUMALT=1;ODDS=0.0169412;PAIRED=0.985486;PAIREDR=0.98178;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=25757;QR=120555;RO=3348;RPL=338;RPP=3.54293;RPPR=107.825;RPR=351;RUN=1;SAF=384;SAP=22.6796;SAR=305;SRF=2036;SRP=342.985;SRR=1312;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00294435:3:0,3:0:0:3:106:-9.88916,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.9621:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.9621:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.9725:2:2,0:2:67:0:0:0,-0.60206,-6.36314	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6440831	.	A	G	22718.5	.	AB=0.637255;ABP=19.7008;AC=2;AF=0.261905;AN=2;AO=785;CIGAR=1X;DP=3203;DPB=3203;DPRA=0.939364;EPP=32.357;EPPR=131.327;GTI=56;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=59.9975;NS=399;NUMALT=1;ODDS=0.0292192;PAIRED=0.992357;PAIREDR=0.98263;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=28959;QR=84442;RO=2418;RPL=277;RPP=150.618;RPPR=361.711;RPR=508;RUN=1;SAF=403;SAP=4.2302;SAR=382;SRF=1047;SRP=97.2835;SRR=1371;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00255537:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6441014	.	CGA	CGG,TGG,CAG	18186.6	.	AB=0.541096,0.4,0.515152;ABP=5.15203,3.87889,3.0761;AC=2,0,0;AF=0.25142,0.00426136,0.00426136;AN=2;AO=646,15,32;CIGAR=2M1X,1X1M1X,1M2X;DP=3795;DPB=3930;DPRA=0.694556,1.01627,2.21904;EPP=3.66914,3.15506,3.28173;EPPR=7.38055;GTI=56;LEN=1,3,2;MEANALT=1.0303,1.66667,1.5;MQM=59.9427,59.9333,59.9688;MQMR=59.9942;NS=352;NUMALT=3;ODDS=0.0753912;PAIRED=1,1,1;PAIREDR=0.988391;PAO=59.3333,13.3333,22.3333;PQA=133.667,29.1667,47.6667;PQR=274.5;PRO=142;QA=23536,528,1108;QR=109445;RO=3101;RPL=256,7,15;RPP=63.3678,3.15506,3.28173;RPPR=5.12855;RPR=390,8,17;RUN=1,1,1;SAF=422,8,18;SAP=134.791,3.15506,4.09604;SAR=224,7,14;SRF=1751;SRP=115.611;SRR=1350;TYPE=snp,complex,mnp;technology.illumina=1,1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00433555:2:0,2,0,0:0:0:2,0,0:68,0,0:-6.45793,-0.60206,0,-6.45793,-0.60206,-6.45793,-6.45793,-0.60206,-6.45793,-6.45793	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6441022	.	G	C	14711.5	.	AB=0.511905;ABP=3.1137;AC=2;AF=0.229396;AN=2;AO=531;CIGAR=1X;DP=3914;DPB=3914;DPRA=0.626087;EPP=11.2913;EPPR=3.93745;GTI=57;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9379;MQMR=59.9926;NS=364;NUMALT=1;ODDS=0.0295956;PAIRED=1;PAIREDR=0.987877;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=19213;QR=122007;RO=3382;RPL=217;RPP=41.4875;RPPR=9.43098;RPR=314;RUN=1;SAF=330;SAP=71.062;SAR=201;SRF=1953;SRP=179.307;SRR=1429;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0105117:2:0,2:0:0:2:70:-6.6474,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	6441089	.	G	A	12541.4	.	AB=0.4;ABP=7.35324;AC=2;AF=0.234925;AN=2;AO=488;CIGAR=1X;DP=3092;DPB=3092;DPRA=0.631916;EPP=6.01832;EPPR=16.6729;GTI=64;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9344;MQMR=59.9796;NS=398;NUMALT=1;ODDS=0.0210889;PAIRED=1;PAIREDR=0.993856;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=16784;QR=92610;RO=2604;RPL=309;RPP=78.2109;RPPR=291.326;RPR=179;RUN=1;SAF=206;SAP=28.712;SAR=282;SRF=1376;SRP=21.276;SRR=1228;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0124148:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	6750713	.	T	C	59539.8	.	AB=0.434698;ABP=212.026;AC=4;AF=0.520168;AN=12;AO=2666;CIGAR=1X;DP=6053;DPB=6053;DPRA=8.10918;EPP=30.5862;EPPR=4.25187;GTI=9;LEN=1;MEANALT=1.00214;MQM=59.9107;MQMR=59.9799;NS=595;NUMALT=1;ODDS=0.194892;PAIRED=0.762941;PAIREDR=0.972829;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=95280;QR=119654;RO=3386;RPL=210;RPP=4111.8;RPPR=139.894;RPR=2456;RUN=1;SAF=1421;SAP=28.2404;SAR=1245;SRF=1671;SRP=4.25187;SRR=1715;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:22.4351:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.9592:1:1,0:1:37:0:0:0,-0.30103,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.9598:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:22.4351:1:0,1:0:0:1:37:-3.69783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.9593:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:34.9586:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	6888716	.	A	G	62222.4	.	AB=0.512077;ABP=3.27256;AC=6;AF=0.33383;AN=14;AO=2073;CIGAR=1X;DP=4404;DPB=4404;DPRA=1.84096;EPP=18.858;EPPR=60.8177;GTI=203;LEN=1;MEANALT=1.00858;MQM=59.9884;MQMR=59.9987;NS=671;NUMALT=1;ODDS=0.00817147;PAIRED=1;PAIREDR=0.97939;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=76419;QR=87560;RO=2329;RPL=991;RPP=11.6847;RPPR=39.9328;RPR=1082;RUN=1;SAF=1091;SAP=15.4557;SAR=982;SRF=1103;SRP=17.116;SRR=1226;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:0.0123591:1:1,0:1:27:0:0:0,-0.30103,-2.69978	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.012327:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	0/0:0.0123591:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:25.4358:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:0.0123591:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:25.4462:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	1/1:0.012327:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7004413	.	G	A,T	72199.4	.	AB=0.448923,0.278746;ABP=150.302,125.044;AC=2,0;AF=0.438424,0.0147783;AN=2;AO=3017,80;CIGAR=1X,1X;DP=7598;DPB=7598;DPRA=1.68022,2.18607;EPP=4.10503,3.11887;EPPR=6.74716;GTI=26;LEN=1,1;MEANALT=1.0152,1.28571;MQM=59.999,59.9875;MQMR=59.998;NS=406;NUMALT=2;ODDS=0.0580579;PAIRED=0.987405,1;PAIREDR=0.982889;PAO=0,0;PQA=0,0;PQR=0;PRO=0;QA=106696,2961;QR=166914;RO=4500;RPL=1636,50;RPP=49.8118,13.8677;RPPR=11.9355;RPR=1381,30;RUN=1,1;SAF=1876,49;SAP=391.835,11.8048;SAR=1141,31;SRF=2620;SRP=267.254;SRR=1880;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:39.7342:1:0,1,0:0:0:1,0:41,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7056113	.	T	A	73546.6	.	AB=0.46446;ABP=68.3001;AC=2;AF=0.359008;AN=2;AO=2790;CIGAR=1X;DP=7914;DPB=7914;DPRA=1.47732;EPP=7.2723;EPPR=3.012;GTI=4;LEN=1;MEANALT=1.00772;MQM=59.9505;MQMR=59.9895;NS=383;NUMALT=1;ODDS=0.111879;PAIRED=0.999283;PAIREDR=0.98731;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=105253;QR=188644;RO=5122;RPL=1429;RPP=6.60918;RPPR=10.8517;RPR=1361;RUN=1;SAF=1403;SAP=3.20955;SAR=1387;SRF=2579;SRP=3.55974;SRR=2543;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:31.2297:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7056315	.	G	A	89991.6	.	AB=0.448335;ABP=177.8;AC=2;AF=0.467192;AN=2;AO=3423;CIGAR=1X;DP=7715;DPB=7715;DPRA=6.22688;EPP=4.92929;EPPR=6.75394;GTI=16;LEN=1;MEANALT=1.00581;MQM=59.3611;MQMR=59.8772;NS=381;NUMALT=1;ODDS=0.0539685;PAIRED=0.999416;PAIREDR=0.987413;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=131034;QR=164366;RO=4290;RPL=1813;RPP=29.1523;RPPR=6.08984;RPR=1610;RUN=1;SAF=1987;SAP=195.608;SAR=1436;SRF=2390;SRP=124.542;SRR=1900;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:42.3296:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7056331	.	ATT	AT	233138	.	AB=0.655172;ABP=15.1406;AC=2;AF=0.978723;AN=2;AO=6960;CIGAR=1M1D1M;DP=7035;DPB=4890;DPRA=18.7573;EPP=4.36934;EPPR=9.87495;GTI=12;LEN=1;MEANALT=1.03467;MQM=59.6158;MQMR=59.9677;NS=376;NUMALT=1;ODDS=0.230424;PAIRED=0.994971;PAIREDR=0.983871;PAO=209;PQA=546.5;PQR=401.5;PRO=159;QA=259954;QR=1795;RO=62;RPL=3367;RPP=18.9457;RPPR=120.83;RPR=3593;RUN=1;SAF=3950;SAP=278.687;SAR=3010;SRF=26;SRP=6.51267;SRR=36;TYPE=del;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:160.002:1:0,1:0:0:1:38:-3.79727,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7056335	.	T	C	94675.1	.	AB=0.416382;ABP=393.759;AC=2;AF=0.535904;AN=2;AO=3389;CIGAR=1X;DP=7225;DPB=7225;DPRA=8.59275;EPP=4.4257;EPPR=3.04657;GTI=16;LEN=1;MEANALT=1.01166;MQM=59.2039;MQMR=59.9979;NS=376;NUMALT=1;ODDS=0.013192;PAIRED=0.999705;PAIREDR=0.990084;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=131191;QR=147822;RO=3832;RPL=1774;RPP=19.2089;RPPR=6.45791;RPR=1615;RUN=1;SAF=1948;SAP=167.712;SAR=1441;SRF=2149;SRP=126.066;SRR=1683;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.965:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7090395	.	C	A	2593.98	.	AB=0.342857;ABP=10.5174;AC=14;AF=0.160265;AN=26;AO=199;CIGAR=1X;DP=3085;DPB=3085;DPRA=0.38709;EPP=162.772;EPPR=16.927;GTI=111;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.804;MQMR=59.9775;NS=755;NUMALT=1;ODDS=0.094062;PAIRED=1;PAIREDR=1;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=7143;QR=108213;RO=2886;RPL=199;RPP=435.133;RPPR=2386.96;RPR=0;RUN=1;SAF=160;SAP=162.772;SAR=39;SRF=1730;SRP=250.913;SRR=1156;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:0.0179053:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:39.1651:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/0:42.176:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.3082	1/1:0.0179053:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0179053:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0358847:2:0,2:0:0:2:72:-6.83672,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.176:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02486	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0179053:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.176:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21426	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0358847:2:0,2:0:0:2:62:-5.8882,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0358847:2:0,2:0:0:2:72:-6.8351,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.176:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21354	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.1863:3:3,0:3:108:0:0:0,-0.90309,-10.0752	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7097771	.	G	C	2366.97	.	AB=0.254054;ABP=100.21;AC=4;AF=0.148649;AN=4;AO=247;CIGAR=1X;DP=4192;DPB=4192;DPRA=1.81711;EPP=208.808;EPPR=103.867;GTI=54;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8057;MQMR=59.9977;NS=333;NUMALT=1;ODDS=0.0412283;PAIRED=0.813765;PAIREDR=0.958418;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=7883;QR=138726;RO=3944;RPL=247;RPP=539.364;RPPR=49.9546;RPR=0;RUN=1;SAF=200;SAP=208.808;SAR=47;SRF=1792;SRP=74.365;SRR=2152;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:9.23977e-05:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:9.23977e-05:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7097881	.	A	G	11211.4	.	AB=0.225735;ABP=2359.04;AC=2;AF=0.211429;AN=4;AO=885;CIGAR=1X;DP=6306;DPB=6306;DPRA=3.20283;EPP=76.4453;EPPR=27.0632;GTI=43;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8407;MQMR=59.8911;NS=525;NUMALT=1;ODDS=0.0225772;PAIRED=0.945763;PAIREDR=0.866581;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=31320;QR=193211;RO=5419;RPL=414;RPP=10.9822;RPPR=305.614;RPR=471;RUN=1;SAF=66;SAP=1394.25;SAR=819;SRF=2379;SRP=178.091;SRR=3040;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0949634:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.829:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7097885	.	CTTG	CTTT,TTTT	55380.3	.	AB=0.285115,0.0656759;ABP=1627.77,3420.89;AC=2,0;AF=0.37428,0.084453;AN=6;AO=2360,216;CIGAR=3M1X,1X2M1X;DP=6203;DPB=6359;DPRA=8.83796,5.45675;EPP=160.714,22.4731;EPPR=18.1543;GTI=72;LEN=1,4;MEANALT=1.29114,1.68148;MQM=59.8356,59.5185;MQMR=59.9434;NS=521;NUMALT=2;ODDS=0.00519702;PAIRED=0.922034,0.666667;PAIREDR=0.861241;PAO=108,19.5;PQA=188.5,25.5;PQR=257;PRO=147.5;QA=83549,7634;QR=125698;RO=3625;RPL=1340,184;RPP=97.2301,235.277;RPPR=275.942;RPR=1020,32;RUN=1,1;SAF=709,128;SAP=819.488,19.0953;SAR=1651,88;SRF=1489;SRP=253.768;SRR=2136;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:20.9322:1:0,1,0:0:0:1,0:41,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.438:1:1,0,0:1:30:0,0:0,0:0,-0.30103,-2.99957,-0.30103,-2.99957,-2.99957	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:27.4454:1:1,0,0:1:40:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7100209	.	C	T	802.995	.	AB=0.165636;ABP=1415.93;AC=4;AF=0.157274;AN=24;AO=456;CIGAR=1X;DP=6812;DPB=6812;DPRA=3.30034;EPP=414.619;EPPR=686.302;GTI=135;LEN=1;MEANALT=1.0084;MQM=59.5175;MQMR=59.9459;NS=763;NUMALT=1;ODDS=0.00494255;PAIRED=0.995614;PAIREDR=0.773843;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=15023;QR=219988;RO=6354;RPL=10;RPP=908.248;RPPR=908.776;RPR=446;RUN=1;SAF=73;SAP=460.639;SAR=383;SRF=2493;SRP=642.567;SRR=3861;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:-0:1:0,1:0:0:1:31:-3.09945,-0.30103,0	0/0:47.0695:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.0695:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.0695:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.0695:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.0798:2:2,0:2:66:0:0:0,-0.60206,-6.26818	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.0695:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.0695:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.0695:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:47.0695:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.0695:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7101252	.	C	T	2327.83	.	AB=0.169822;ABP=1603.29;AC=2;AF=0.137076;AN=2;AO=518;CIGAR=1X;DP=6877;DPB=6877;DPRA=5.24262;EPP=19.1245;EPPR=2580.63;GTI=59;LEN=1;MEANALT=1.00552;MQM=59.8012;MQMR=59.8546;NS=383;NUMALT=1;ODDS=0.374049;PAIRED=0.996139;PAIREDR=0.88375;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=18199;QR=238886;RO=6357;RPL=280;RPP=10.405;RPPR=5016.34;RPR=238;RUN=1;SAF=508;SAP=1042.65;SAR=10;SRF=5797;SRP=9371.45;SRR=560;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:4.28485e-17:1:0,1:0:0:1:35:-3.49828,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7101310	.	C	T	399.552	.	AB=0.288288;ABP=46.2246;AC=2;AF=0.0265252;AN=2;AO=97;CIGAR=1X;DP=8324;DPB=8324;DPRA=3.48381;EPP=44.4026;EPPR=3002.38;GTI=9;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.5258;MQMR=59.8829;NS=377;NUMALT=1;ODDS=0.45348;PAIRED=0.824742;PAIREDR=0.705847;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=3142;QR=282471;RO=8227;RPL=62;RPP=19.3299;RPPR=3897.06;RPR=35;RUN=1;SAF=73;SAP=56.7598;SAR=24;SRF=6216;SRP=4670.09;SRR=2011;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:9.21919e-12:1:0,1:0:0:1:35:-3.49828,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7103934	.	G	A	2816.54	.	AB=0.6;ABP=4.74748;AC=6;AF=0.214425;AN=8;AO=230;CIGAR=1X;DP=5860;DPB=5860;DPRA=0.198585;EPP=3.04806;EPPR=59.2927;GTI=84;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9652;MQMR=59.9643;NS=513;NUMALT=1;ODDS=648.532;PAIRED=1;PAIREDR=0.974245;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=8350;QR=196819;RO=5630;RPL=1;RPP=493.801;RPPR=132.759;RPR=229;RUN=1;SAF=115;SAP=3.0103;SAR=115;SRF=2687;SRP=28.2873;SRR=2943;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:130.772:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02486	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:2:0,2:0:0:2:76:-7.21354,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:130.772:2:0,2:0:0:2:76:-7.21354,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:130.772:2:0,2:0:0:2:72:-6.83524,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7103942	.	C	T,G	1886.92	.	AB=0.571429,0.6;ABP=3.94093,3.87889;AC=6,0;AF=0.215116,0.00387597;AN=8;AO=230,6;CIGAR=1X,1X;DP=6079;DPB=6079;DPRA=0.171982,0.20916;EPP=3.16136,4.45795;EPPR=68.2775;GTI=80;LEN=1,1;MEANALT=1,1;MQM=59.9783,58.5;MQMR=59.955;NS=516;NUMALT=2;ODDS=434.48;PAIRED=0.995652,1;PAIREDR=0.97723;PAO=0,0;PQA=0,0;PQR=0;PRO=0;QA=8108,201;QR=207943;RO=5841;RPL=0,3;RPP=502.449,3.0103;RPPR=189.889;RPR=230,3;RUN=1,1;SAF=117,1;SAP=3.16136,8.80089;SAR=113,5;SRF=2787;SRP=29.513;SRR=3054;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:160.002:2:2,0,0:2:72:0,0:0,0:0,-0.60206,-6.83591,-0.60206,-6.83591,-6.83591	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:2:0,2,0:0:0:2,0:74,0:-7.02402,-0.60206,0,-7.02402,-0.60206,-7.02402	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:160.002:2:0,2,0:0:0:2,0:72,0:-6.83664,-0.60206,0,-6.83664,-0.60206,-6.83664	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:160.002:2:0,2,0:0:0:2,0:67,0:-6.35967,-0.60206,0,-6.35967,-0.60206,-6.35967	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7104809	.	G	A	120043	.	AB=0.439862;ABP=340.448;AC=17;AF=0.484902;AN=38;AO=5297;CIGAR=1X;DP=14604;DPB=14604;DPRA=1.40478;EPP=936.486;EPPR=242.982;GTI=66;LEN=1;MEANALT=1.00192;MQM=59.9403;MQMR=59.9441;NS=1424;NUMALT=1;ODDS=0.00466758;PAIRED=0.572211;PAIREDR=0.534501;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=183605;QR=328835;RO=9304;RPL=2519;RPP=30.5097;RPPR=121.327;RPR=2778;RUN=1;SAF=2187;SAP=352.253;SAR=3110;SRF=4113;SRP=274.231;SRR=5191;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:0.204716:2:1,1:1:35:1:31:-2.49739,0,-2.89657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:3.21387:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	0/1:0.204764:2:1,1:1:35:1:34:-2.79685,0,-2.89657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.204813:5:3,2:3:102:2:70:-5.14225,0,-8.01165	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.204811:4:1,3:1:35:3:104:-8.49897,0,-2.29451	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.2151:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29913	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.2151:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	1/1:3.21451:2:0,2:0:0:2:69:-6.55266,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.20481:3:1,2:1:35:2:54:-4.22583,0,-2.59554	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.204808:4:1,3:1:32:3:104:-8.49897,0,-1.99519	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.2151:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/1:0.204811:3:1,2:1:33:2:69:-5.64957,0,-2.39604	1/1:3.21376:1:0,1:0:0:1:29:-2.89966,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.204763:2:1,1:1:31:1:34:-2.79685,0,-2.49739	0/1:0.204774:2:1,1:1:35:1:35:-2.89657,0,-2.89657	0/0:3.2151:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.204813:7:3,4:3:105:4:137:-10.561,0,-7.68895	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.204813:5:2,3:2:70:3:103:-8.10487,0,-5.14225	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:3.2151:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7104851	.	C	T	64446.7	.	AB=0.347114;ABP=1662.95;AC=17;AF=0.455823;AN=40;AO=3365;CIGAR=1X;DP=11540;DPB=11540;DPRA=1.91677;EPP=872.839;EPPR=294.332;GTI=91;LEN=1;MEANALT=1.00374;MQM=59.8945;MQMR=59.9399;NS=1494;NUMALT=1;ODDS=0.00361974;PAIRED=0.739079;PAIREDR=0.568474;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=123502;QR=290470;RO=8171;RPL=3082;RPP=5058.64;RPPR=1237.18;RPR=283;RUN=1;SAF=821;SAP=1918.76;SAR=2544;SRF=3380;SRP=532.105;SRR=4791;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:1.76091:2:1,1:1:40:1:38:-3.19521,0,-3.39362	0/0:4.77121:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:4.77121:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	0/1:-0:3:2,1:2:73:1:30:-2.09648,0,-6.02801	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.76091:5:3,2:3:115:2:82:-6.27453,0,-9.21863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.76091:4:1,3:1:41:3:123:-10.2607,0,-2.89045	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:4.77121:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:4.77121:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	1/1:4.77121:2:0,2:0:0:2:79:-7.49724,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.76091:3:1,2:1:41:2:68:-5.55154,0,-3.19148	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.76091:4:1,3:1:41:3:120:-9.98319,0,-2.89045	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:4.77121:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/1:1.76091:3:1,2:1:41:2:80:-6.6887,0,-3.19148	1/1:4.77121:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.76091:2:1,1:1:40:1:37:-3.09577,0,-3.39362	0/1:1.76091:3:1,2:1:41:2:76:-6.31117,0,-3.19148	0/0:4.77121:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.76091:7:3,4:3:118:4:163:-12.9512,0,-8.89437	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:1.76091:5:2,3:2:80:3:118:-9.49736,0,-6.08664	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:4.77121:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7108000	.	C	T	92469.8	.	AB=0.395739;ABP=853.825;AC=8;AF=0.468137;AN=14;AO=3836;CIGAR=1X;DP=10954;DPB=10954;DPRA=3.17628;EPP=170.533;EPPR=28.6665;GTI=71;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9265;MQMR=59.8977;NS=612;NUMALT=1;ODDS=0.0275052;PAIRED=0.989312;PAIREDR=0.985389;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=141754;QR=251958;RO=7118;RPL=1062;RPP=1662.15;RPPR=330.438;RPR=2774;RUN=1;SAF=2198;SAP=180.532;SAR=1638;SRF=3809;SRP=79.2772;SRR=3309;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:21.7814:1:0,1:0:0:1:38:-3.79727,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:21.7814:1:0,1:0:0:1:38:-3.79727,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.4456:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:21.5086:1:0,1:0:0:1:34:-3.39891,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.4484:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.9831:2:0,2:0:0:2:82:-7.77968,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.4488:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7108043	.	C	T	91321.8	.	AB=0.396953;ABP=862.71;AC=8;AF=0.458949;AN=14;AO=3948;CIGAR=1X;DP=11680;DPB=11680;DPRA=2.37209;EPP=132.922;EPPR=55.4222;GTI=69;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9539;MQMR=59.9029;NS=609;NUMALT=1;ODDS=0.00447487;PAIRED=0.989362;PAIREDR=0.981376;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=141437;QR=281909;RO=7732;RPL=2878;RPP=1800.95;RPPR=937.366;RPR=1070;RUN=1;SAF=2313;SAP=255.845;SAR=1635;SRF=4232;SRP=153.492;SRR=3500;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:21.5088:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00682898:1:0,1:0:0:1:20:-1.99996,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.656:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:21.3944:1:0,1:0:0:1:34:-3.39891,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.658:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.9918:2:0,2:0:0:2:70:-6.6474,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.658:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7108574	.	A	G	58066	.	AB=0.276036;ABP=3282.83;AC=10;AF=0.476648;AN=16;AO=2770;CIGAR=1X;DP=9128;DPB=9128;DPRA=5.0055;EPP=177.656;EPPR=84.6911;GTI=138;LEN=1;MEANALT=1.00204;MQM=59.8155;MQMR=59.9915;NS=728;NUMALT=1;ODDS=0.0216293;PAIRED=0.762094;PAIREDR=0.510146;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=101698;QR=228738;RO=6357;RPL=2278;RPP=2503.57;RPPR=102.987;RPR=492;RUN=1;SAF=663;SAP=1637.6;SAR=2107;SRF=3120;SRP=7.68629;SRR=3237;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.022076:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:25.9669:2:0,2:0:0:2:74:-7.02402,-0.60206,0	1/1:0.022076:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:22.7266:1:0,1:0:0:1:38:-3.79727,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.6179:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.6286:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.11959	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:25.9674:2:0,2:0:0:2:81:-7.68573,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.6179:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7118319	.	T	C	129038	.	AB=0.406571;ABP=593.793;AC=16;AF=0.627389;AN=20;AO=4947;CIGAR=1X;DP=9843;DPB=9843;DPRA=9.79341;EPP=1959.1;EPPR=378.405;GTI=64;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.7556;MQMR=59.9971;NS=785;NUMALT=1;ODDS=0.0123834;PAIRED=0.432788;PAIREDR=0.974469;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=182591;QR=183165;RO=4896;RPL=1177;RPP=2954.34;RPPR=583.46;RPR=3770;RUN=1;SAF=1971;SAP=446.358;SAR=2976;SRF=2538;SRP=17.3803;SRR=2358;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:58.0255:4:2,2:2:68:2:68:-5.25278,0,-5.25381	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.6833:1:0,1:0:0:1:34:-3.39891,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.819:2:0,2:0:0:2:65:-6.17345,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.7089:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:35.0029:2:1,1:1:35:1:32:-2.59725,0,-2.89657	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:23.8962:1:0,1:0:0:1:25:-2.49986,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:36.7465:2:1,1:1:29:1:34:-2.79685,0,-2.2976	1/1:24.6112:1:0,1:0:0:1:32:-3.19931,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.4223:1:0,1:0:0:1:29:-2.89931,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:28.0454:2:1,1:1:34:1:25:-1.8978,0,-2.79685	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7120657	.	TA	TG,CG,CA	53250.7	.	AB=0.371441,0.171161,0.177522;ABP=1021.4,6516.71,710.264;AC=2,0,0;AF=0.367847,0.185286,0.0217984;AN=2;AO=2665,1257,139;CIGAR=1M1X,2X,1X1M;DP=7461;DPB=7544;DPRA=12.3059,16.4906,13.05;EPP=131.432,40.3399,100.508;EPPR=386.75;GTI=105;LEN=1,2,1;MEANALT=1.84806,1.95455,2.7;MQM=59.8608,59.7359,59.8777;MQMR=59.967;NS=367;NUMALT=3;ODDS=0.00527623;PAIRED=0.873171,0.989658,0.985612;PAIREDR=0.489381;PAO=53,35,28;PQA=91.5,81.5,41;PQR=51;PRO=46;QA=86485,43331,5097;QR=114538;RO=3390;RPL=1855,714,28;RPP=892.805,53.5242,110.631;RPPR=56.1403;RPR=810,543,111;RUN=1,1,1;SAF=2333,1243,137;SAP=3265.52,2612.3,287.723;SAR=332,14,2;SRF=1709;SRP=3.51249;SRR=1681;TYPE=snp,mnp,snp;technology.illumina=1,1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.5675:1:0,1,0,0:0:0:1,0,0:35,0,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7120706	.	C	T	449.448	.	AB=0.164095;ABP=2607;AC=2;AF=0.184211;AN=2;AO=580;CIGAR=1X;DP=5969;DPB=5969;DPRA=3.23092;EPP=1078.62;EPPR=445.649;GTI=102;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.719;MQMR=59.7498;NS=380;NUMALT=1;ODDS=0.0165452;PAIRED=1;PAIREDR=0.793059;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=17597;QR=188581;RO=5388;RPL=559;RPP=1086.66;RPPR=50.1491;RPR=21;RUN=1;SAF=579;SAP=1253.79;SAR=1;SRF=4377;SRP=4569.21;SRR=1011;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:3.60283e-14:1:0,1:0:0:1:27:-2.69978,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7129566	.	T	C,G	7209.89	.	AB=0.378788,0.1875;ABP=19.8557,16.582;AC=0,4;AF=0.114955,0.190848;AN=4;AO=347,95;CIGAR=1X,1X;DP=6249;DPB=6249;DPRA=1.07982,0.0723053;EPP=5.77001,124.818;EPPR=3.44265;GTI=130;LEN=1,1;MEANALT=1.01562,1;MQM=59.6282,60;MQMR=59.9843;NS=448;NUMALT=2;ODDS=1660.14;PAIRED=0.979827,1;PAIREDR=0.995005;PAO=0,0;PQA=0,0;PQR=0;PRO=0;QA=11919,3677;QR=200813;RO=5806;RPL=56,0;RPP=348.6,209.3;RPPR=297.93;RPR=291,95;RUN=1,1;SAF=155,11;SAP=11.5773,124.818;SAR=192,84;SRF=3005;SRP=18.5749;SRR=2801;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	2/2:-0:1:0,0,1:0:0:0,1:0,41:-4.09457,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	2/2:-0:1:0,0,1:0:0:0,1:0,41:-4.09457,-4.09457,-4.09457,-0.30103,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7129945	.	G	A	49639.1	.	AB=0.346021;ABP=62.5267;AC=2;AF=0.329965;AN=38;AO=1772;CIGAR=1X;DP=7281;DPB=7281;DPRA=0.72669;EPP=209.006;EPPR=402.716;GTI=260;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.9983;MQMR=59.9855;NS=1138;NUMALT=1;ODDS=0.00727195;PAIRED=0.962754;PAIREDR=0.971683;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=64880;QR=199524;RO=5509;RPL=659;RPP=255.592;RPPR=180.481;RPR=1113;RUN=1;SAF=1048;SAP=131.652;SAR=724;SRF=2947;SRP=61.4359;SRR=2562;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:36.8582:3:3,0:3:118:0:0:0,-0.90309,-11.0025	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8374:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8375:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.8582:3:3,0:3:118:0:0:0,-0.90309,-11.0022	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.8479:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.3082	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.8479:2:2,0:2:78:0:0:0,-0.60206,-7.40347	0/0:30.8375:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.8582:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.7238	0/0:30.8375:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:30.8374:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:30.8374:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:36.8582:3:3,0:3:115:0:0:0,-0.90309,-10.7249	0/0:39.8685:4:4,0:4:156:0:0:0,-1.20412,-14.4149	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8374:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:30.8374:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	0/0:30.8374:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	1/1:0.00551733:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:30.8374:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.8479:2:2,0:2:72:0:0:0,-0.60206,-6.83637	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7131096	.	T	C	26.7827	.	AB=0.5;ABP=3.0103;AC=1;AF=0.0182927;AN=10;AO=17;CIGAR=1X;DP=5681;DPB=5681;DPRA=1.46367;EPP=4.1599;EPPR=50.2516;GTI=10;LEN=1;MEANALT=1;MQM=58.1176;MQMR=59.9763;NS=492;NUMALT=1;ODDS=6.16484;PAIRED=1;PAIREDR=0.981988;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=583;QR=204297;RO=5663;RPL=0;RPP=39.9253;RPPR=144.292;RPR=17;RUN=1;SAF=10;SAP=4.1599;SAR=7;SRF=3122;SRP=132.448;SRR=2541;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:160.002:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:26.7827:2:1,1:1:37:1:39:-3.29251,0,-3.09577	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:160.002:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:160.002:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:160.002:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7131104	.	GT	GC	25.8442	.	AB=0.5;ABP=3.0103;AC=1;AF=0.0184426;AN=10;AO=15;CIGAR=1M1X;DP=5611;DPB=5670;DPRA=0.153835;EPP=4.31318;EPPR=3.02937;GTI=12;LEN=1;MEANALT=1;MQM=58;MQMR=59.9758;NS=488;NUMALT=1;ODDS=5.94824;PAIRED=1;PAIREDR=0.982434;PAO=38;PQA=68.5;PQR=68.5;PRO=78;QA=478;QR=193534;RO=5579;RPL=1;RPP=27.4756;RPPR=161.938;RPR=14;RUN=1;SAF=8;SAP=3.15506;SAR=7;SRF=3014;SRP=81.4779;SRR=2565;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:138.1:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:160.002:2:1,1:1:34:1:36:-2.99521,0,-2.79685	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:138.1:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:138.1:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:138.1:1:1,0:1:25:0:0:0,-0.30103,-2.49986	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7131429	.	TT	CC	2491.73	.	AB=0.311111;ABP=16.956;AC=2;AF=0.0915493;AN=2;AO=146;CIGAR=2X;DP=6030;DPB=6073.5;DPRA=0.444245;EPP=16.3961;EPPR=9.25144;GTI=36;LEN=2;MEANALT=1;MQM=59.4315;MQMR=59.9997;NS=355;NUMALT=1;ODDS=573.741;PAIRED=0.835616;PAIREDR=0.970918;PAO=9;PQA=25;PQR=59;PRO=76;QA=5102;QR=208764;RO=5880;RPL=145;RPP=311.419;RPPR=8.32819;RPR=1;RUN=1;SAF=89;SAP=18.2404;SAR=57;SRF=2919;SRP=3.66174;SRR=2961;TYPE=mnp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1:0:0:1:36:-3.59827,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7131550	.	G	T,A	9982.07	.	AB=0.5,0.242991;ABP=3.0103,64.4001;AC=2,0;AF=0.0552,0.0136;AN=14;AO=410,28;CIGAR=1X,1X;DP=6038;DPB=6038;DPRA=1.38977,0.746651;EPP=8.43368,34.0313;EPPR=35.1844;GTI=19;LEN=1,1;MEANALT=1,1;MQM=60,59.8214;MQMR=59.9795;NS=625;NUMALT=2;ODDS=1.24648;PAIRED=0.990244,0.964286;PAIREDR=0.968739;PAO=0,0;PQA=0,0;PQR=0;PRO=0;QA=14325,987;QR=197746;RO=5598;RPL=210,27;RPP=3.53993,55.4358;RPPR=90.1624;RPR=200,1;RUN=1,1;SAF=201,25;SAP=3.34926,40.5458;SAR=209,3;SRF=2863;SRP=9.36568;SRR=2735;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:64.3773:3:0,3,0:0:0:3,0:116,0:-10.8163,-0.90309,0,-10.8163,-0.90309,-10.8163	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.9787:1:1,0,0:1:41:0,0:0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.9787:1:1,0,0:1:41:0,0:0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.9787:1:1,0,0:1:41:0,0:0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.9787:1:1,0,0:1:41:0,0:0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.9787:1:1,0,0:1:41:0,0:0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.9892:2:2,0,0:2:79:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.49763,-0.60206,-7.49763,-7.49763	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7356968	.	GT	TA	129.396	.	AB=0.177616;ABP=374.036;AC=2;AF=0.0718623;AN=4;AO=174;CIGAR=2X;DP=5316;DPB=5365.5;DPRA=2.35216;EPP=22.9779;EPPR=281.075;GTI=54;LEN=2;MEANALT=1.04587;MQM=59.6667;MQMR=59.7744;NS=494;NUMALT=1;ODDS=0.00682056;PAIRED=1;PAIREDR=0.833496;PAO=10;PQA=29;PQR=115;PRO=89;QA=5533;QR=173035;RO=5111;RPL=163;RPP=291.342;RPPR=428.723;RPR=11;RUN=1;SAF=106;SAP=21.031;SAR=68;SRF=3305;SRP=957.677;SRR=1806;TYPE=mnp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:6.96737e-11:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.2239:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7357007	.	A	G	8411.2	.	AB=0.179755;ABP=2986.29;AC=2;AF=0.363785;AN=10;AO=876;CIGAR=1X;DP=5389;DPB=5389;DPRA=5.6458;EPP=448.648;EPPR=378.998;GTI=168;LEN=1;MEANALT=1.02;MQM=59.6632;MQMR=59.9871;NS=613;NUMALT=1;ODDS=0.0637438;PAIRED=0.988584;PAIREDR=0.993338;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=30916;QR=154811;RO=4503;RPL=65;RPP=1382.53;RPPR=394.483;RPR=811;RUN=1;SAF=269;SAP=286.204;SAR=607;SRF=2231;SRP=3.82093;SRR=2272;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:46.0772:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.0779:1:1,0:1:32:0:0:0,-0.30103,-3.19931	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0193894:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.0792:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.0789:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7357035	.	G	A	4149.84	.	AB=0.148184;ABP=3318.59;AC=2;AF=0.287097;AN=10;AO=677;CIGAR=1X;DP=6387;DPB=6387;DPRA=4.04573;EPP=127.49;EPPR=7.86711;GTI=151;LEN=1;MEANALT=1.00339;MQM=59.6662;MQMR=59.9835;NS=620;NUMALT=1;ODDS=0.0493514;PAIRED=1;PAIREDR=0.995271;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=25057;QR=208089;RO=5709;RPL=549;RPP=571.509;RPPR=71.0676;RPR=128;RUN=1;SAF=166;SAP=384.782;SAR=511;SRF=2388;SRP=334.109;SRR=3321;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:52.5864:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:52.5862:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0263589:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:52.5864:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:52.5864:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7357347	.	CG	CA,TA	4343.57	.	AB=0.148905,0.217631;ABP=2886.38,254.405;AC=8,0;AF=0.335189,0.0556793;AN=8;AO=664,109;CIGAR=1M1X,2X;DP=5989;DPB=6059;DPRA=3.42162,1.02018;EPP=16.4054,4.62396;EPPR=238.526;GTI=176;LEN=1,2;MEANALT=1.02239,1.11111;MQM=59.7259,59.6514;MQMR=59.9743;NS=449;NUMALT=2;ODDS=0.0355594;PAIRED=1,1;PAIREDR=0.976601;PAO=31,0;PQA=75,0;PQR=75;PRO=109;QA=23801,3714;QR=185736;RO=5214;RPL=132,39;RPP=526.257,22.1551;RPPR=284.412;RPR=532,70;RUN=1,1;SAF=172,22;SAP=337.888,87.1798;SAR=492,87;SRF=2365;SRP=100.571;SRR=2849;TYPE=snp,mnp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0184099:1:0,1,0:0:0:1,0:40,0:-3.99568,-0.30103,0,-3.99568,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0184099:1:0,1,0:0:0:1,0:41,0:-4.08923,-0.30103,0,-4.08923,-0.30103,-4.08923	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0184099:1:0,1,0:0:0:1,0:40,0:-3.99568,-0.30103,0,-3.99568,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0118647:1:0,1,0:0:0:1,0:35,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7357369	.	C	A	1640.96	.	AB=0.149128;ABP=1903.21;AC=8;AF=0.29955;AN=8;AO=561;CIGAR=1X;DP=6143;DPB=6143;DPRA=3.29521;EPP=100.866;EPPR=4.65418;GTI=154;LEN=1;MEANALT=1.00392;MQM=59.7112;MQMR=59.9751;NS=444;NUMALT=1;ODDS=377.844;PAIRED=0.998217;PAIREDR=0.978498;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=19201;QR=202722;RO=5581;RPL=511;RPP=825.619;RPPR=34.1716;RPR=50;RUN=1;SAF=165;SAP=209.556;SAR=396;SRF=2749;SRP=5.69069;SRR=2832;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1:0:0:1:26:-2.59983,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1:0:0:1:33:-3.29828,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1:0:0:1:31:-3.09945,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7357398	.	A	G	1020.36	.	AB=0.147568;ABP=1311.67;AC=4;AF=0.310219;AN=4;AO=469;CIGAR=1X;DP=5711;DPB=5711;DPRA=2.74108;EPP=363.415;EPPR=146.803;GTI=140;LEN=1;MEANALT=1.01271;MQM=59.6695;MQMR=59.992;NS=411;NUMALT=1;ODDS=234.948;PAIRED=1;PAIREDR=0.977858;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=16810;QR=183374;RO=5239;RPL=469;RPP=1021.43;RPPR=54.6585;RPR=0;RUN=1;SAF=95;SAP=363.415;SAR=374;SRF=2678;SRP=8.68415;SRR=2561;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1:0:0:1:35:-3.49727,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:-0:1:0,1:0:0:1:27:-2.69978,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7357405	.	A	G	12823	.	AB=0.217923;ABP=342.348;AC=2;AF=0.357143;AN=2;AO=671;CIGAR=1X;DP=5005;DPB=5005;DPRA=1.86624;EPP=82.7787;EPPR=444.883;GTI=134;LEN=1;MEANALT=1.00467;MQM=59.7973;MQMR=59.9958;NS=392;NUMALT=1;ODDS=0.0762537;PAIRED=0.991058;PAIREDR=0.978537;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=24181;QR=148487;RO=4333;RPL=588;RPP=828.315;RPPR=3.0108;RPR=83;RUN=1;SAF=264;SAP=69.1868;SAR=407;SRF=2241;SRP=14.1363;SRR=2092;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00174585:1:0,1:0:0:1:29:-2.89931,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7357858	.	T	A,C	11209.8	.	AB=0.156499,0.279835;ABP=3094.04,105.32;AC=4,0;AF=0.332599,0.0947137;AN=4;AO=749,323;CIGAR=1X,1X;DP=7268;DPB=7268;DPRA=3.51931,0.902753;EPP=5.4485,20.4964;EPPR=63.3786;GTI=187;LEN=1,1;MEANALT=1.03114,1.15094;MQM=59.8238,59.8266;MQMR=59.9961;NS=454;NUMALT=2;ODDS=0.00156991;PAIRED=0.99733,0.965944;PAIREDR=0.976271;PAO=0,0;PQA=0,0;PQR=0;PRO=0;QA=27520,11581;QR=224546;RO=6195;RPL=33,165;RPP=1355.44,3.33972;RPPR=79.4549;RPR=716,158;RUN=1,1;SAF=383,177;SAP=3.84816,9.47093;SAR=366,146;SRF=3050;SRP=6.17374;SRR=3145;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0100739:1:0,1,0:0:0:1,0:35,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00800528:1:0,1,0:0:0:1,0:34,0:-3.39891,-0.30103,0,-3.39891,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7379385	.	C	A	3919.21	.	AB=0.351153;ABP=186.598;AC=11;AF=0.18429;AN=46;AO=478;CIGAR=1X;DP=5701;DPB=5701;DPRA=0.682155;EPP=947.628;EPPR=740.789;GTI=137;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.931;MQMR=59.986;NS=1324;NUMALT=1;ODDS=0.0761786;PAIRED=0.991632;PAIREDR=0.996362;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=18788;QR=193055;RO=5222;RPL=4;RPP=1006.52;RPPR=2643.71;RPR=474;RUN=1;SAF=469;SAP=964.273;SAR=9;SRF=4132;SRP=3851.02;SRR=1090;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:44.1609:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:47.1723:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.3082	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.4251:2:0,2:0:0:2:78:-7.40278,-0.60206,0	0/0:50.1826:3:3,0:3:121:0:0:0,-0.90309,-11.28	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:27.3534:2:1,1:1:30:1:37:-3.09577,0,-2.39751	0/0:50.1826:3:3,0:3:119:0:0:0,-0.90309,-11.095	0/1:25.4072:3:2,1:2:68:1:38:-2.89418,0,-5.55479	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:54.8256:4:2,2:2:82:2:81:-6.48161,0,-6.57556	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:28.3802:3:2,1:2:82:1:41:-3.19148,0,-6.87659	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:28.3802:3:2,1:2:82:1:41:-3.19148,0,-6.87659	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:53.1929:4:4,0:4:153:0:0:0,-1.20412,-14.1395	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.1611:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0202955:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.1611:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:44.1611:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/1:22.3596:5:4,1:4:158:1:41:-2.58942,0,-13.0935	0/0:47.1723:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.30883	0/0:44.1594:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	0/1:29.3993:2:1,1:1:40:1:39:-3.2945,0,-3.39362	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.1606:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	0/0:53.1929:4:4,0:4:152:0:0:0,-1.20412,-14.0477	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:53.1929:4:4,0:4:158:0:0:0,-1.20412,-14.5999	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.1614:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7379390	.	T	G,C	4711.99	.	AB=0.351852,0.395833;ABP=178.015,7.5342;AC=11,0;AF=0.179593,0.0267319;AN=46;AO=465,124;CIGAR=1X,1X;DP=5671;DPB=5671;DPRA=0.673535,0.842068;EPP=952.859,20.9425;EPPR=767.958;GTI=192;LEN=1,1;MEANALT=1,1;MQM=59.9419,59.8629;MQMR=59.9896;NS=1328;NUMALT=2;ODDS=0.047353;PAIRED=0.993548,0.967742;PAIREDR=0.997639;PAO=0,0;PQA=0,0;PQR=0;PRO=0;QA=18017,4570;QR=186310;RO=5082;RPL=1,44;RPP=1004.08,25.7057;RPPR=2162.31;RPR=464,80;RUN=1,1;SAF=457,112;SAP=944.453,178.129;SAR=8,12;SRF=4029;SRP=3787.31;SRR=1053;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:45.8095:1:1,0,0:1:40:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568	0/0:48.8203:2:2,0,0:2:74:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.02402,-0.60206,-7.02402,-7.02402	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:24.0909:2:0,2,0:0:0:2,0:80,0:-7.59157,-0.60206,0,-7.59157,-0.60206,-7.59157	0/0:51.8306:3:3,0,0:3:113:0,0:0,0:0,-0.90309,-10.536,-0.90309,-10.536,-10.536	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:25.7911:2:1,1,0:1:36:1,0:38,0:-3.19521,0,-2.99621,-3.49624,-3.29724,-6.42371	0/0:51.8306:3:3,0,0:3:121:0,0:0,0:0,-0.90309,-11.28,-0.90309,-11.28,-11.28	0/1:0.00829671:3:2,1,0:2:67:1,0:33,0:-2.39604,0,-5.45995,-2.9981,-5.76098,-8.42751	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:53.007:4:2,2,0:2:82:2,0:82,0:-6.57556,0,-6.57556,-7.17762,-7.17762,-13.9458	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:24.7767:3:2,1,0:2:82:1,0:40,0:-3.09259,0,-6.87659,-3.69465,-7.17762,-10.4694	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:24.7767:3:2,1,0:2:82:1,0:40,0:-3.09259,0,-6.87659,-3.69465,-7.17762,-10.4694	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:54.8409:4:4,0,0:4:158:0,0:0,0:0,-1.20412,-14.6,-1.20412,-14.6,-14.6	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.8095:1:1,0,0:1:40:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0144971:1:0,1,0:0:0:1,0:40,0:-3.99568,-0.30103,0,-3.99568,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.8096:1:1,0,0:1:41:0,0:0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	0/0:45.8092:1:1,0,0:1:38:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.79727,-0.30103,-3.79727,-3.79727	0/1:0.00328163:5:4,1,0:4:153:1,0:35,0:-1.99348,0,-12.6319,-3.1976,-12.9329,-15.7742	0/0:48.8203:2:2,0,0:2:77:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.30883,-0.60206,-7.30883,-7.30883	0/0:45.8083:1:1,0,0:1:35:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.49863,-0.30103,-3.49863,-3.49863	0/1:28.7671:2:1,1,0:1:41:1,0:41,0:-3.49251,0,-3.49251,-3.79354,-3.79354,-7.17762	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.8095:1:1,0,0:1:40:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568	0/0:54.8409:4:4,0,0:4:147:0,0:0,0:0,-1.20412,-13.587,-1.20412,-13.587,-13.587	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:54.8409:4:4,0,0:4:152:0,0:0,0:0,-1.20412,-14.0463,-1.20412,-14.0463,-14.0463	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.8097:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7398283	.	T	A	11508.5	.	AB=0.567839;ABP=18.9199;AC=24;AF=0.433581;AN=38;AO=789;CIGAR=1X;DP=6080;DPB=6080;DPRA=0.261117;EPP=1698.97;EPPR=154.397;GTI=319;LEN=1;MEANALT=1.00212;MQM=58.9252;MQMR=59.9618;NS=941;NUMALT=1;ODDS=0.000602384;PAIRED=1;PAIREDR=0.975024;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=31362;QR=192894;RO=5285;RPL=0;RPP=1716.3;RPPR=45.3472;RPR=789;RUN=1;SAF=787;SAP=1698.97;SAR=2;SRF=3171;SRP=462.06;SRR=2114;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:51.3301:3:1,2:1:38:2:74:-6.11585,0,-2.89418	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.4838:3:0,3:0:0:3:123:-11.4648,-0.90309,0	0/0:48.5621:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00818699:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	1/1:0.00818699:1:0,1:0:0:1:38:-3.79457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:31.0609:2:1,1:1:41:1:40:-3.38936,0,-3.49251	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:27.4838:3:0,3:0:0:3:122:-11.3625,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:54.3179:4:2,2:2:82:2:79:-6.29312,0,-6.57556	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.5766:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21354	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.566:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:56.2067:3:1,2:1:41:2:80:-6.68848,0,-3.19148	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00818699:1:0,1:0:0:1:38:-3.79457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:32.0383:2:1,1:1:41:1:41:-3.48717,0,-3.49251	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00818699:1:0,1:0:0:1:40:-3.99142,-0.30103,0	0/0:54.5869:3:3,0:3:97:0:0:0,-0.90309,-9.04763	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00818699:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00818699:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	1/1:0.00818699:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:83.2079:5:2,3:2:80:3:123:-9.95465,0,-6.08642	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7398308	.	GTTGTC	TTTGTC,GCTGTC	8677.57	.	AB=0.566138,0.40604;ABP=17.3719,25.8618;AC=24,7;AF=0.42895,0.145281;AN=38;AO=777,289;CIGAR=1X5M,1M1X4M;DP=5375;DPB=5561;DPRA=0.246425,0.79751;EPP=1664.29,85.8493;EPPR=18.2985;GTI=526;LEN=1,1;MEANALT=1.17204,1.37173;MQM=58.9228,59.8512;MQMR=59.9405;NS=943;NUMALT=2;ODDS=0.000697997;PAIRED=1,0.972318;PAIREDR=0.990481;PAO=41.5,61.5;PQA=297.5,161;PQR=1517;PRO=249;QA=28652,9693;QR=145274;RO=4202;RPL=773,252;RPP=1655.68,350.333;RPPR=455.751;RPR=4,37;RUN=1,1;SAF=776,212;SAP=1681.57,139.948;SAR=1,77;SRF=2646;SRP=616.986;SRR=1556;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/2:29.8864:3:0,2,1:0:0:2,1:72,39:-9.44889,-3.59553,-2.99347,-6.23304,0,-5.93201	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:29.1261:3:0,3,0:0:0:3,0:112,0:-10.4459,-0.90309,0,-10.4459,-0.90309,-10.4459	2/2:0.00122338:1:0,0,1:0:0:0,1:0,34:-3.39891,-3.39891,-3.39891,-0.30103,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00569257:1:0,1,0:0:0:1,0:39,0:-3.89656,-0.30103,0,-3.89656,-0.30103,-3.89656	1/1:0.00384058:1:0,1,0:0:0:1,0:30,0:-2.99914,-0.30103,0,-2.99914,-0.30103,-2.99914	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/2:28.0149:2:0,1,1:0:0:1,1:37,39:-6.61057,-3.59553,-3.2945,-3.39465,0,-3.09362	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:29.1261:3:0,3,0:0:0:3,0:111,0:-10.3502,-0.90309,0,-10.3502,-0.90309,-10.3502	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/2:3.12653e-05:4:1,2,1:1:38:2,1:65,39:-4.99973,-0.0992955,-2.60878,-2.07327,0,-4.90706	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:53.5562:2:2,0,0:2:73:0,0:0,0:0,-0.60206,-6.9313,-0.60206,-6.9313,-6.9313	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.545:1:1,0,0:1:36:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.59827,-0.30103,-3.59827,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:49.398:3:1,2,0:1:37:2,0:72,0:-5.93282,0,-2.79474,-6.23385,-3.3968,-9.2642	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00569257:1:0,1,0:0:0:1,0:34,0:-3.39783,-0.30103,0,-3.39783,-0.30103,-3.39783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/2:28.0149:2:0,1,1:0:0:1,1:37,39:-6.61057,-3.59553,-3.2945,-3.39465,0,-3.09362	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00569257:1:0,1,0:0:0:1,0:39,0:-3.89317,-0.30103,0,-3.89317,-0.30103,-3.89317	0/2:45.5229:3:1,0,2:1:36:0,2:0,60:-4.79609,-5.09712,-8.05449,0,-3.29724,-2.69518	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00569257:1:0,1,0:0:0:1,0:39,0:-3.89656,-0.30103,0,-3.89656,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00569257:1:0,1,0:0:0:1,0:37,0:-3.69783,-0.30103,0,-3.69783,-0.30103,-3.69783	1/1:0.00569257:1:0,1,0:0:0:1,0:34,0:-3.39891,-0.30103,0,-3.39891,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:48.2867:5:1,3,1:1:35:3,1:112,30:-8.92255,0,-1.9696,-6.84327,-0.499063,-9.38418	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7398321	.	G	A	3307.18	.	AB=0.40708;ABP=28.4338;AC=10;AF=0.155413;AN=38;AO=298;CIGAR=1X;DP=5030;DPB=5030;DPRA=0.45201;EPP=78.8224;EPPR=383.934;GTI=115;LEN=1;MEANALT=1.00532;MQM=59.8993;MQMR=59.7489;NS=933;NUMALT=1;ODDS=0.0484178;PAIRED=0.996644;PAIREDR=0.97992;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=9873;QR=170485;RO=4731;RPL=276;RPP=473.127;RPPR=1365.62;RPR=22;RUN=1;SAF=194;SAP=62.0335;SAR=104;SRF=3327;SRP=1700.32;SRR=1404;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:19.2922:3:2,1:2:66:1:34:-2.49582,0,-5.3638	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.3094:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	1/1:0.00355588:1:0,1:0:0:1:21:-2.09995,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.2882:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:42.2872:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:24.2909:2:1,1:1:35:1:36:-2.99621,0,-2.89521	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.3094:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79362	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:18.2756:4:3,1:3:93:1:36:-2.39415,0,-7.47324	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0258441:2:0,2:0:0:2:76:-7.21354,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.2882:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.3094:3:3,0:3:100:0:0:0,-0.90309,-9.33037	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.2882:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:24.2909:2:1,1:1:35:1:36:-2.99621,0,-2.89521	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.2882:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49727	0/1:34.2057:3:1,2:1:35:2:49:-3.75154,0,-2.59554	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.2882:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.2882:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:42.2882:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.00112463:5:4,1:4:140:1:21:-0.594796,0,-11.4385	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7398341	.	G	A	442.162	.	AB=0.541667;ABP=3.37221;AC=1;AF=0.015778;AN=38;AO=37;CIGAR=1X;DP=4476;DPB=4476;DPRA=1.01669;EPP=10.1116;EPPR=957.699;GTI=14;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.6757;MQMR=59.7247;NS=919;NUMALT=1;ODDS=0.0631724;PAIRED=1;PAIREDR=0.979275;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=1250;QR=154494;RO=4439;RPL=27;RPP=19.9713;RPPR=778.401;RPR=10;RUN=1;SAF=24;SAP=10.1116;SAR=13;SRF=3052;SRP=1359.13;SRR=1387;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:43.9977:3:3,0:3:103:0:0:0,-0.90309,-9.6087	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:43.9977:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79616	0/0:37.9771:1:1,0:1:31:0:0:0,-0.30103,-3.09945	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9771:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:37.9771:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29828	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.9874:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45706	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:43.9977:3:3,0:3:105:0:0:0,-0.90309,-9.79362	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:47.008:4:4,0:4:129:0:0:0,-1.20412,-11.9286	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.9874:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21354	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9771:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:43.9977:3:3,0:3:90:0:0:0,-0.90309,-8.3974	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9771:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:10.2909:2:1,1:1:35:1:35:-2.89657,0,-2.89521	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9771:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49727	0/0:43.9977:3:3,0:3:82:0:0:0,-0.90309,-7.65181	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9771:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:37.9771:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	0/0:37.9771:1:1,0:1:29:0:0:0,-0.30103,-2.89966	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.0183:5:5,0:5:164:0:0:0,-1.50515,-15.0816	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7398821	.	CGAC	TGAT	9198.62	.	AB=0.592593;ABP=21.1059;AC=19;AF=0.37156;AN=32;AO=711;CIGAR=1X2M1X;DP=3844;DPB=3921.25;DPRA=0.394403;EPP=1546.93;EPPR=1268.81;GTI=227;LEN=4;MEANALT=1.01948;MQM=59.8748;MQMR=59.9167;NS=763;NUMALT=1;ODDS=0.00201207;PAIRED=1;PAIREDR=0.939189;PAO=0.5;PQA=0;PQR=277.5;PRO=119;QA=23951;QR=110430;RO=3108;RPL=0;RPP=1546.93;RPPR=194.849;RPR=711;RUN=1;SAF=0;SAP=1546.93;SAR=711;SRF=1533;SRP=4.24276;SRR=1575;TYPE=complex;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.9694:1:1,0:1:34:0:0:0,-0.30103,-3.39891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.9799:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:80.0654:6:2,4:2:70:4:139:-11.0465,0,-4.84115	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:79.2338:6:2,4:2:65:4:138:-10.9542,0,-4.36711	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:56.1764:4:1,3:1:35:3:105:-8.59204,0,-2.29315	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00782847:1:0,1:0:0:1:27:-2.69966,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00782847:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.9799:2:2,0:2:57:0:0:0,-0.60206,-5.41388	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.9682:1:1,0:1:26:0:0:0,-0.30103,-2.59983	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00782847:1:0,1:0:0:1:34:-3.39891,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00782847:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.9799:2:2,0:2:68:0:0:0,-0.60206,-6.45793	1/1:21.2116:3:0,3:0:0:3:103:-9.60997,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.2425:6:0,6:0:0:6:209:-19.1511,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0156711:2:0,2:0:0:2:70:-6.6474,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00782847:1:0,1:0:0:1:35:-3.49863,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7398838	.	C	A	77.3655	.	AB=0.388889;ABP=4.9405;AC=2;AF=0.0141753;AN=32;AO=19;CIGAR=1X;DP=4053;DPB=4053;DPRA=0.982512;EPP=3.12459;EPPR=3.11586;GTI=11;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.6842;MQMR=59.9013;NS=776;NUMALT=1;ODDS=0.0593662;PAIRED=1;PAIREDR=0.908978;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=683;QR=147687;RO=4032;RPL=14;RPP=12.2676;RPPR=14.1779;RPR=5;RUN=1;SAF=4;SAP=16.8392;SAR=15;SRF=1913;SRP=25.8646;SRR=2119;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.1049:1:1,0:1:39:0:0:0,-0.30103,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.1152:2:2,0:2:75:0:0:0,-0.60206,-7.1201	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:59.1667:7:7,0:7:251:0:0:0,-2.10721,-22.9375	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:56.1564:6:6,0:6:215:0:0:0,-1.80618,-19.6974	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:50.1358:4:4,0:4:143:0:0:0,-1.20412,-13.2202	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.1049:1:1,0:1:33:0:0:0,-0.30103,-3.29863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.1049:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.1152:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9307	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.1049:1:1,0:1:21:0:0:0,-0.30103,-2.09995	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.1049:1:1,0:1:35:0:0:0,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.1049:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:8.09279e-10:2:0,2:0:0:2:75:-7.1201,-0.60206,0	0/0:47.1255:3:3,0:3:100:0:0:0,-0.90309,-9.33053	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:56.1564:6:6,0:6:210:0:0:0,-1.80618,-19.2425	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:44.1152:2:2,0:2:70:0:0:0,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.1049:1:1,0:1:36:0:0:0,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7398840	.	AGGG	AG,AGGA	8697.05	.	AB=0.601562,0.391304;ABP=25.9465,5.3706;AC=19,0;AF=0.364286,0.0136364;AN=32;AO=718,20;CIGAR=1M2D1M,3M1X;DP=3995;DPB=3730.25;DPRA=0.381576,1.26362;EPP=1544.8,4.74748;EPPR=319.706;GTI=220;LEN=2,1;MEANALT=1.00645,1.11765;MQM=59.8593,59.65;MQMR=59.914;NS=770;NUMALT=2;ODDS=0.0214095;PAIRED=1,1;PAIREDR=0.865438;PAO=31.3333,46.3333;PQA=74.3333,144.333;PQR=218.333;PRO=94.3333;QA=24306,695;QR=116531;RO=3255;RPL=716,17;RPP=1544.8,24.2907;RPPR=450.488;RPR=2,3;RUN=1,1;SAF=0,5;SAP=1562.13,13.8677;SAR=718,15;SRF=1935;SRP=255.331;SRR=1320;TYPE=del,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.7108:1:1,0,0:1:40:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.99568,-0.30103,-3.99568,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.7213:2:2,0,0:2:74:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.02543,-0.60206,-7.02543,-7.02543	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:77.3945:7:2,5,0:2:74:5,0:162,0:-12.7913,0,-4.91822,-13.3934,-6.42337,-19.4601	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:78.4168:6:2,4,0:2:78:4,0:132,0:-10.3995,0,-5.59729,-11.0016,-6.80141,-17.4333	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:56.1094:4:1,3,0:1:35:3,0:105,0:-8.59197,0,-2.29315,-8.893,-3.19624,-11.7395	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00306856:1:0,1,0:0:0:1,0:21,0:-2.09991,-0.30103,0,-2.09991,-0.30103,-2.09991	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00776245:1:0,1,0:0:0:1,0:36,0:-3.59827,-0.30103,0,-3.59827,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.7213:2:2,0,0:2:73:0,0:0,0:0,-0.60206,-6.93007,-0.60206,-6.93007,-6.93007	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.7038:1:1,0,0:1:23:0,0:0,0:0,-0.30103,-2.29991,-0.30103,-2.29991,-2.29991	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00776245:1:0,1,0:0:0:1,0:35,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00776245:1:0,1,0:0:0:1,0:35,0:-3.49863,-0.30103,0,-3.49863,-0.30103,-3.49863	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:41.7213:2:2,0,0:2:75:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.11959,-0.60206,-7.11959,-7.11959	1/1:0.0311334:3:0,3,0:0:0:3,0:99,0:-9.23744,-0.90309,0,-9.23744,-0.90309,-9.23744	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.6124:6:0,6,0:0:0:6,0:213,0:-19.5163,-1.80618,0,-19.5163,-1.80618,-19.5163	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0155388:2:0,2,0:0:0:2,0:70,0:-6.6474,-0.60206,0,-6.6474,-0.60206,-6.6474	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00776245:1:0,1,0:0:0:1,0:36,0:-3.59827,-0.30103,0,-3.59827,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7398855	.	T	C	11964.2	.	AB=0.614108;ABP=30.2663;AC=19;AF=0.374342;AN=32;AO=724;CIGAR=1X;DP=3747;DPB=3747;DPRA=0.403199;EPP=1575.16;EPPR=50.8719;GTI=193;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8633;MQMR=59.9159;NS=760;NUMALT=1;ODDS=0.00836399;PAIRED=1;PAIREDR=0.810927;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=27068;QR=109796;RO=3020;RPL=724;RPP=1575.16;RPPR=215.797;RPR=0;RUN=1;SAF=0;SAP=1575.16;SAR=724;SRF=1973;SRP=619.562;SRR=1047;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.1687:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.1791:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.3082	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:79.6096:7:2,5:2:76:5:185:-14.8979,0,-5.10705	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:88.9793:6:2,4:2:82:4:146:-11.6872,0,-5.9735	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:54.2645:4:1,3:1:36:3:119:-9.89127,0,-2.39244	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00843422:1:0,1:0:0:1:32:-3.19891,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00843422:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.1688:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.1608:1:1,0:1:21:0:0:0,-0.30103,-2.09995	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00843422:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00843422:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.1791:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9311	1/1:20.9585:3:0,3:0:0:3:110:-10.2596,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:29.9894:6:0,6:0:0:6:238:-21.7942,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0168849:2:0,2:0:0:2:78:-7.40347,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00843422:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7398861	.	G	T	3086.94	.	AB=0.385;ABP=25.9845;AC=12;AF=0.171916;AN=30;AO=249;CIGAR=1X;DP=3653;DPB=3653;DPRA=0.62503;EPP=81.7153;EPPR=337.588;GTI=120;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8795;MQMR=59.9039;NS=762;NUMALT=1;ODDS=0.0114108;PAIRED=0.967871;PAIREDR=0.799824;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=8788;QR=122545;RO=3402;RPL=248;RPP=535.056;RPPR=248.37;RPR=1;RUN=1;SAF=78;SAP=78.4363;SAR=171;SRF=1894;SRP=98.1134;SRR=1508;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0232427:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0466104:2:0,2:0:0:2:73:-6.9311,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:45.2303:7:5,2:5:192:2:72:-4.72943,0,-15.5403	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:48.4958:6:4,2:4:154:2:78:-5.59712,0,-12.425	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.8693:4:4,0:4:151:0:0:0,-1.20412,-13.9549	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.838:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0232427:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00657921:1:0,1:0:0:1:21:-2.09995,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.838:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.8382:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0466104:2:0,2:0:0:2:73:-6.9311,-0.60206,0	0/0:48.859:3:3,0:3:118:0:0:0,-0.90309,-11.0016	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:57.8899:6:6,0:6:234:0:0:0,-1.80618,-21.4294	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:45.8487:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.30883	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.8382:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7398865	.	G	A	13608.6	.	AB=0.596;ABP=23.0226;AC=19;AF=0.381014;AN=32;AO=739;CIGAR=1X;DP=3690;DPB=3690;DPRA=0.409784;EPP=1607.73;EPPR=10.5166;GTI=193;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8444;MQMR=59.9149;NS=769;NUMALT=1;ODDS=0.0434941;PAIRED=0.987821;PAIREDR=0.722806;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=28680;QR=103742;RO=2951;RPL=730;RPP=1530.51;RPPR=14.1429;RPR=9;RUN=1;SAF=9;SAP=1530.51;SAR=730;SRF=1997;SRP=803.496;SRR=954;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.0293:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.0397:2:2,0:2:76:0:0:0,-0.60206,-7.21354	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:80.1041:7:2,5:2:75:5:198:-16.0904,0,-5.01238	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:92.5723:6:2,4:2:82:4:152:-12.2415,0,-5.9735	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:60.418:4:1,3:1:41:3:122:-10.1684,0,-2.88511	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00941744:1:0,1:0:0:1:35:-3.49783,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00941744:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.0397:2:2,0:2:65:0:0:0,-0.60206,-6.17077	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:35.0269:1:1,0:1:25:0:0:0,-0.30103,-2.49986	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00941744:1:0,1:0:0:1:39:-3.89656,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00941744:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:38.0397:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02402	1/1:21.6622:3:0,3:0:0:3:116:-10.8163,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:30.6931:6:0,6:0:0:6:241:-22.0663,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0188554:2:0,2:0:0:2:79:-7.49724,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00941744:1:0,1:0:0:1:41:-4.09457,-0.30103,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7398871	.	GTTC	TTTC,CTTC	2660.19	.	AB=0.384211,0.40625;ABP=25.1365,5.45321;AC=12,0;AF=0.166881,0.00385109;AN=32;AO=233,15;CIGAR=1X3M,1X3M;DP=3846;DPB=3979.75;DPRA=0.547603,2.35571;EPP=122.013,35.5824;EPPR=65.1217;GTI=136;LEN=1,1;MEANALT=1.00621,1;MQM=59.8712,59.7333;MQMR=59.9126;NS=779;NUMALT=2;ODDS=0.000682072;PAIRED=0.974249,0.933333;PAIREDR=0.703352;PAO=62.3333,92.3333;PQA=92.3333,183.333;PQR=109.333;PRO=85.3333;QA=8782,580;QR=125559;RO=3580;RPL=232,15;RPP=500.315,35.5824;RPPR=3.5562;RPR=1,0;RUN=1,1;SAF=59,0;SAP=126.262,35.5824;SAR=174,15;SRF=2003;SRP=113.086;SRR=1577;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0223528:1:0,1,0:0:0:1,0:40,0:-3.99568,-0.30103,0,-3.99568,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0448212:2:0,2,0:0:0:2,0:76,0:-7.21354,-0.60206,0,-7.21354,-0.60206,-7.21354	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.0107841:6:5,1,0:5:193:1,0:40,0:-2.16368,0,-15.6303,-3.66883,-16.2324,-19.6305	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:47.539:6:4,2,0:4:149:2,0:82,0:-5.9735,0,-11.9652,-7.17762,-12.5673,-19.3479	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:55.4311:4:4,0,0:4:161:0,0:0,0:0,-1.20412,-14.8703,-1.20412,-14.8703,-14.8703	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.3989:1:1,0,0:1:32:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.19891,-0.30103,-3.19891,-3.19891	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.3998:1:1,0,0:1:38:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.79727,-0.30103,-3.79727,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0448212:2:0,2,0:0:0:2,0:79,0:-7.49763,-0.60206,0,-7.49763,-0.60206,-7.49763	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0223528:1:0,1,0:0:0:1,0:36,0:-3.59827,-0.30103,0,-3.59827,-0.30103,-3.59827	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.4:1:1,0,0:1:41:0,0:0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.4:1:1,0,0:1:41:0,0:0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.0448212:2:0,2,0:0:0:2,0:76,0:-7.21354,-0.60206,0,-7.21354,-0.60206,-7.21354	0/0:52.4208:3:3,0,0:3:118:0,0:0,0:0,-0.90309,-11.0029,-0.90309,-11.0029,-11.0029	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:61.4517:6:6,0,0:6:244:0,0:0,0:0,-1.80618,-22.3386,-1.80618,-22.3386,-22.3386	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:49.4105:2:2,0,0:2:82:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.77968,-0.60206,-7.77968,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.4:1:1,0,0:1:41:0,0:0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7402977	.	T	C	365585	.	AB=0.862069;ABP=36.0317;AC=52;AF=0.999054;AN=52;AO=11306;CIGAR=1X;DP=11315;DPB=11315;DPRA=7.14268;EPP=1069.11;EPPR=6.91895;GTI=2;LEN=1;MEANALT=1.00189;MQM=59.9631;MQMR=60;NS=1585;NUMALT=1;ODDS=10.6061;PAIRED=0.982487;PAIREDR=0.8;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=409607;QR=174;RO=5;RPL=3008;RPP=5377.74;RPPR=6.91895;RPR=8298;RUN=1;SAF=7127;SAP=1672.18;SAR=4179;SRF=3;SRP=3.44459;SRR=2;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:85.5526:5:0,5:0:0:5:187:-17.1905,-1.50515,0	1/1:76.5218:2:0,2:0:0:2:75:-7.11581,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:76.5218:2:0,2:0:0:2:75:-7.11959,-0.60206,0	1/1:91.5727:7:0,7:0:0:7:263:-24.0244,-2.10721,0	1/1:76.5218:2:0,2:0:0:2:63:-5.98364,-0.60206,0	1/1:94.5823:8:0,8:0:0:8:305:-27.8055,-2.40824,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:100.599:10:0,10:0:0:10:365:-33.1925,-3.0103,0	1/1:79.5321:3:0,3:0:0:3:117:-10.9086,-0.90309,0	1/1:88.5627:6:0,6:0:0:6:220:-20.1522,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:97.5913:9:0,9:0:0:9:338:-30.7682,-2.70927,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:88.5627:6:0,6:0:0:6:216:-19.7832,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:88.5627:6:0,6:0:0:6:203:-18.6002,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:91.5727:7:0,7:0:0:7:253:-23.1162,-2.10721,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:103.604:11:0,11:0:0:11:424:-38.5074,-3.31133,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:82.5424:4:0,4:0:0:4:158:-14.6,-1.20412,0	1/1:73.5115:1:0,1:0:0:1:40:-3.99568,-0.30103,0	1/1:73.5115:1:0,1:0:0:1:33:-3.29913,-0.30103,0	1/1:88.5627:6:0,6:0:0:6:219:-20.0595,-1.80618,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:79.5321:3:0,3:0:0:3:123:-11.4648,-0.90309,0	1/1:103.604:11:0,11:0:0:11:403:-36.6054,-3.31133,0	1/1:88.5627:6:0,6:0:0:6:221:-20.2446,-1.80618,0	1/1:76.5218:2:0,2:0:0:2:81:-7.68573,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:100.599:10:0,10:0:0:10:375:-34.0975,-3.0103,0	1/1:79.5321:3:0,3:0:0:3:110:-10.2563,-0.90309,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:94.5823:8:0,8:0:0:8:307:-27.9867,-2.40824,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:85.5526:5:0,5:0:0:5:183:-16.8202,-1.50515,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7402984	.	T	G	60569.7	.	AB=0.549654;ABP=12.2829;AC=2;AF=0.138977;AN=52;AO=2208;CIGAR=1X;DP=12378;DPB=12378;DPRA=1.3597;EPP=77.9261;EPPR=469.436;GTI=147;LEN=1;MEANALT=1;MQM=59.8591;MQMR=59.9878;NS=1583;NUMALT=1;ODDS=0.00836402;PAIRED=0.968297;PAIREDR=0.99528;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=78934;QR=370477;RO=10170;RPL=1115;RPP=3.48629;RPPR=9365.94;RPR=1093;RUN=1;SAF=1461;SAP=504.373;SAR=747;SRF=5762;SRP=394.455;SRR=4408;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:40.0925:6:6,0:6:226:0:0:0,-1.80618,-20.6985	1/1:0.0014128:2:0,2:0:0:2:76:-7.21055,-0.60206,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:28.0513:2:2,0:2:73:0:0:0,-0.60206,-6.9311	0/0:49.1234:9:9,0:9:329:0:0:0,-2.70927,-29.9498	0/0:28.0513:2:2,0:2:74:0:0:0,-0.60206,-7.02486	0/0:46.1131:8:8,0:8:303:0:0:0,-2.40824,-27.6232	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:55.144:11:11,0:11:412:0:0:0,-3.31133,-37.4232	0/0:31.0616:3:3,0:3:117:0:0:0,-0.90309,-10.9086	0/0:40.0925:6:6,0:6:223:0:0:0,-1.80618,-20.4249	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:52.1337:10:10,0:10:372:0:0:0,-3.0103,-33.8227	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:49.1234:9:9,0:9:329:0:0:0,-2.70927,-29.9518	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:43.1028:7:7,0:7:247:0:0:0,-2.10721,-22.5701	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.1131:8:8,0:8:287:0:0:0,-2.40824,-26.1707	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:70.1955:16:16,0:16:597:0:0:0,-4.81648,-54.0593	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.1131:8:8,0:8:299:0:0:0,-2.40824,-27.2617	0/0:25.041:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:28.0513:2:2,0:2:67:0:0:0,-0.60206,-6.36208	0/0:40.0925:6:6,0:6:225:0:0:0,-1.80618,-20.6086	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:40.0925:6:6,0:6:215:0:0:0,-1.80618,-19.6918	0/0:55.144:11:11,0:11:409:0:0:0,-3.31133,-37.1498	0/0:46.1131:8:8,0:8:283:0:0:0,-2.40824,-25.8075	0/0:34.0719:4:4,0:4:145:0:0:0,-1.20412,-13.4032	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:52.1337:10:10,0:10:383:0:0:0,-3.0103,-34.8204	0/0:34.0719:4:4,0:4:152:0:0:0,-1.20412,-14.0463	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:55.144:11:11,0:11:405:0:0:0,-3.31133,-36.7904	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:46.1131:8:8,0:8:282:0:0:0,-2.40824,-25.715	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7407889	.	CCA	CCG,TCG	2065.86	.	AB=0.184074,0.375;ABP=841.331,5.18177;AC=2,0;AF=0.119277,0.00722892;AN=6;AO=307,12;CIGAR=2M1X,1X1M1X;DP=4099;DPB=4205.67;DPRA=4.08002,1.28021;EPP=16.0886,5.9056;EPPR=165.115;GTI=55;LEN=1,3;MEANALT=1.0155,1.16667;MQM=59.6547,60;MQMR=59.9523;NS=415;NUMALT=2;ODDS=0.0823734;PAIRED=0.990228,0.75;PAIREDR=0.892243;PAO=59.5,0;PQA=135,0;PQR=228;PRO=134.5;QA=10606,382;QR=132034;RO=3777;RPL=289,6;RPP=522.473,3.0103;RPPR=27.1713;RPR=18,6;RUN=1,1;SAF=159,2;SAP=3.86616,14.5915;SAR=148,10;SRF=1192;SRP=1118.61;SRR=2585;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:42.5752:1:1,0,0:1:39:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.89656,-0.30103,-3.89656,-3.89656	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:0.00204855:1:0,1,0:0:0:1,0:41,0:-4.09457,-0.30103,0,-4.09457,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:42.5752:1:1,0,0:1:37:0,0:0,0:0,-0.30103,-3.69783,-0.30103,-3.69783,-3.69783	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
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SL2.50ch00	7408024	.	CATGCCA	AATGCCA	998845	.	AB=0.216503;ABP=1711.93;AC=58;AF=0.852506;AN=58;AO=34517;CIGAR=1X6M;DP=39116;DPB=39403.3;DPRA=2.89353;EPP=11712.6;EPPR=22.3388;GTI=143;LEN=1;MEANALT=1.08537;MQM=59.8775;MQMR=59.9483;NS=1756;NUMALT=1;ODDS=0.0631332;PAIRED=0.985659;PAIREDR=0.54619;PAO=119;PQA=653.5;PQR=3519;PRO=426;QA=1262977;QR=149076;RO=4449;RPL=34155;RPP=71844.4;RPPR=5.07244;RPR=362;RUN=1;SAF=10429;SAP=11740.1;SAR=24088;SRF=2228;SRP=3.03422;SRR=2221;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:33.4148:31:0,31:0:0:31:1163:-104.963,-9.33193,0	1/1:33.4148:35:0,34:0:0:34:1196:-107.719,-10.235,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4148:22:0,22:0:0:22:821:-74.1999,-6.62266,0	1/1:33.4148:19:0,19:0:0:19:718:-64.9485,-5.71957,0	1/1:33.4148:28:0,28:0:0:28:995:-89.8563,-8.42884,0	1/1:33.4148:22:0,22:0:0:22:824:-74.4671,-6.62266,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4148:48:1,47:1:35:47:1684:-148.314,-10.9508,0	1/1:33.4148:14:0,14:0:0:14:526:-47.6777,-4.21442,0	1/1:33.4148:24:0,24:0:0:24:878:-79.3286,-7.22472,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4148:55:1,54:1:34:54:2030:-179.526,-13.1577,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4148:37:0,37:0:0:37:1369:-123.485,-11.1381,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4148:29:0,29:0:0:29:1076:-97.1438,-8.72987,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4148:35:0,35:0:0:35:1295:-116.835,-10.5361,0	1/1:33.4148:9:0,9:0:0:9:344:-31.313,-2.70927,0	1/1:33.4148:19:0,19:0:0:19:711:-64.3187,-5.71957,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4148:25:0,25:0:0:25:956:-86.3453,-7.52575,0	1/1:33.4148:7:0,7:0:0:7:250:-22.8419,-2.10721,0	1/1:33.4148:7:0,7:0:0:7:255:-23.2996,-2.10721,0	1/1:33.4148:32:0,32:0:0:32:1206:-108.821,-9.63296,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4148:28:0,28:0:0:28:1049:-94.7111,-8.42884,0	1/1:33.4148:29:1,28:1:30:28:1010:-88.2023,-5.73042,0	1/1:33.4148:45:0,45:0:0:45:1646:-148.408,-13.5464,0	1/1:33.4148:17:0,17:0:0:17:631:-57.1155,-5.11751,0	1/1:33.4148:12:0,12:0:0:12:452:-41.0198,-3.61236,0	1/1:33.4148:15:0,15:0:0:15:534:-48.3863,-4.51545,0	1/1:33.4148:13:0,12:0:0:12:430:-38.7721,-3.61236,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4148:21:0,21:0:0:21:730:-66.0062,-6.32163,0	1/1:33.4148:30:0,29:0:0:29:1079:-97.1826,-8.72987,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:33.4148:43:1,41:1:35:41:1530:-134.49,-9.46954,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7408034	.	CCGG	CCGA,GCGA	1.00266e+06	.	AB=0.216385,0.768293;ABP=1904.79,54.2782;AC=58,0;AF=0.861793,0.0105654;AN=58;AO=34259,661;CIGAR=3M1X,1X2M1X;DP=38474;DPB=38664.5;DPRA=3.73043,1.57877;EPP=11897.8,10.8979;EPPR=116.255;GTI=163;LEN=1,4;MEANALT=1.01556,1.4;MQM=59.8804,59.9289;MQMR=59.9637;NS=1751;NUMALT=2;ODDS=0.0091305;PAIRED=0.984734,0.585477;PAIREDR=0.552848;PAO=108.333,52.6667;PQA=275.5,111.667;PQR=284.833;PRO=150.667;QA=1258211,20828;QR=119814;RO=3529;RPL=34205,385;RPP=73927.2,42.041;RPPR=4.14803;RPR=54,276;RUN=1,1;SAF=10256,287;SAP=11981.3,27.8755;SAR=24003,374;SRF=1732;SRP=5.61004;SRR=1797;TYPE=snp,complex;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	1/1:34.1935:31:0,30,0:0:0:30,0:1138,0:-102.358,-9.0309,0,-102.358,-9.0309,-102.358	1/1:34.1935:35:0,35,0:0:0:35,0:1269,0:-114.488,-10.5361,0,-114.488,-10.5361,-114.488	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1935:22:0,22,0:0:0:22,0:801,0:-72.3951,-6.62266,0,-72.3951,-6.62266,-72.3951	1/1:34.1935:19:0,19,0:0:0:19,0:710,0:-64.2189,-5.71957,0,-64.2189,-5.71957,-64.2189	1/1:34.1935:27:0,27,0:0:0:27,0:1009,0:-91.1086,-8.12781,0,-91.1086,-8.12781,-91.1086	1/1:34.1935:23:0,23,0:0:0:23,0:835,0:-75.4466,-6.92369,0,-75.4466,-6.92369,-75.4466	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1935:48:1,47,0:1:32:47,0:1757,0:-155.168,-11.2501,0,-155.469,-14.1484,-158.046	1/1:34.1935:14:0,14,0:0:0:14,0:531,0:-48.1274,-4.21442,0,-48.1274,-4.21442,-48.1274	1/1:34.1935:24:0,24,0:0:0:24,0:863,0:-77.975,-7.22472,0,-77.975,-7.22472,-77.975	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1935:55:1,54,0:1:30:54,0:2054,0:-182.071,-13.5571,0,-182.372,-16.2556,-184.769	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1935:37:0,37,0:0:0:37,0:1335,0:-120.42,-11.1381,0,-120.42,-11.1381,-120.42	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1935:30:0,30,0:0:0:30,0:1119,0:-100.999,-9.0309,0,-100.999,-9.0309,-100.999	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1935:34:0,34,0:0:0:34,0:1258,0:-113.502,-10.235,0,-113.502,-10.235,-113.502	1/1:34.1935:9:0,9,0:0:0:9,0:354,0:-32.219,-2.70927,0,-32.219,-2.70927,-32.219	1/1:34.1935:19:0,19,0:0:0:19,0:728,0:-65.8437,-5.71957,0,-65.8437,-5.71957,-65.8437	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1935:25:0,25,0:0:0:25,0:960,0:-86.7056,-7.52575,0,-86.7056,-7.52575,-86.7056	1/1:34.1935:7:0,7,0:0:0:7,0:252,0:-23.0227,-2.10721,0,-23.0227,-2.10721,-23.0227	1/1:34.1935:7:0,7,0:0:0:7,0:254,0:-23.207,-2.10721,0,-23.207,-2.10721,-23.207	1/1:34.1935:32:0,32,0:0:0:32,0:1227,0:-110.705,-9.63296,0,-110.705,-9.63296,-110.705	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1935:28:2,26,0:2:74:26,0:944,0:-78.2322,-1.40341,0,-78.8343,-7.82678,-84.8884	1/1:34.1935:29:1,28,0:1:23:28,0:1044,0:-91.958,-6.42998,0,-92.2591,-8.42884,-94.023	1/1:34.1935:45:0,45,0:0:0:45,0:1667,0:-150.282,-13.5464,0,-150.282,-13.5464,-150.282	1/1:34.1935:17:0,17,0:0:0:17,0:616,0:-55.7621,-5.11751,0,-55.7621,-5.11751,-55.7621	1/1:34.1935:12:0,12,0:0:0:12,0:440,0:-39.9325,-3.61236,0,-39.9325,-3.61236,-39.9325	1/1:34.1935:15:0,15,0:0:0:15,0:540,0:-48.9246,-4.51545,0,-48.9246,-4.51545,-48.9246	1/1:34.1935:12:0,12,0:0:0:12,0:415,0:-37.6692,-3.61236,0,-37.6692,-3.61236,-37.6692	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1935:22:0,22,0:0:0:22,0:774,0:-69.9629,-6.62266,0,-69.9629,-6.62266,-69.9629	1/1:34.1935:30:0,30,0:0:0:30,0:1107,0:-99.9219,-9.63296,0,-100.524,-9.63296,-99.3198	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:34.1935:43:1,42,0:1:35:42,0:1579,0:-138.87,-9.44566,0,-139.171,-12.6433,-142.018	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7408046	.	G	A	636712	.	AB=0.75622;ABP=13915.7;AC=37;AF=0.555587;AN=58;AO=24892;CIGAR=1X;DP=33442;DPB=33442;DPRA=2.33806;EPP=21599;EPPR=2642.14;GTI=415;LEN=1;MEANALT=1.0019;MQM=59.9797;MQMR=59.9677;NS=1754;NUMALT=1;ODDS=0.0267138;PAIRED=0.980837;PAIREDR=0.785422;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=954047;QR=315196;RO=8547;RPL=24866;RPP=53829.7;RPPR=4834.85;RPR=26;RUN=1;SAF=4555;SAP=21731;SAR=20337;SRF=1947;SRP=5503.57;SRR=6600;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/1:29.4337:25:6,19:6:237:19:727:-58.2251,0,-14.1766	0/1:29.4337:32:5,27:5:190:27:1006:-81.2067,0,-7.82787	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:32.4428:18:1,17:1:39:17:651:-55.0206,-1.52198,0	0/1:29.4337:18:5,13:5:202:13:503:-40.1947,0,-13.143	0/1:29.4337:26:5,21:5:202:21:797:-64.2175,0,-10.7347	1/1:32.4428:15:1,14:1:41:14:553:-46.0155,-0.420883,0	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.4337:41:6,35:6:233:35:1336:-108.164,0,-8.99608	0/1:29.4337:11:3,8:3:112:8:305:-24.492,0,-7.13358	0/1:29.4337:20:3,17:3:114:17:647:-52.5364,0,-4.61069	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.4337:49:7,42:7:282:42:1632:-132.367,0,-11.001	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.4337:29:6,23:6:235:23:900:-72.5757,0,-12.7899	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.4337:27:4,23:4:159:23:877:-71.1127,0,-6.56414	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:-0:27:3,24:3:116:24:923:-75.2462,0,-2.68973	1/1:32.4428:9:0,9:0:0:9:359:-32.6698,-2.70927,0	0/1:29.4337:17:5,12:5:200:12:468:-37.3511,0,-13.2609	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:32.4428:20:1,19:1:41:19:748:-63.5473,-1.92603,0	0/1:-0:6:1,5:1:41:5:193:-15.9322,0,-2.28839	1/1:32.4428:5:0,5:0:0:5:194:-17.8294,-1.50515,0	0/1:-0:25:2,23:2:82:23:907:-74.4105,0,-0.253928	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:-0:23:2,21:2:82:21:795:-64.9397,0,-0.855988	0/1:29.4337:25:4,21:4:158:21:806:-65.3276,0,-7.07452	0/1:29.4337:40:5,35:5:182:35:1347:-109.461,0,-4.68926	0/1:-0:12:1,11:1:39:11:418:-34.3549,0,-0.284204	1/1:32.4428:9:0,9:0:0:9:346:-31.4947,-2.70927,0	1/1:32.4428:14:1,13:1:41:13:483:-39.7112,-0.119853,0	0/1:-0:9:1,8:1:36:8:302:-24.8242,0,-0.889005	.:.:.:.:.:.:.:.:.	1/1:32.4428:18:0,18:0:0:18:674:-60.98,-5.41854,0	0/1:29.4337:26:5,21:5:198:21:807:-65.1191,0,-10.3697	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:29.4337:38:10,28:10:386:28:1075:-85.6004,0,-23.6523	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7409933	.	G	A	45.3192	.	AB=0.177033;ABP=192.365;AC=1;AF=0.0143354;AN=32;AO=122;CIGAR=1X;DP=9264;DPB=9264;DPRA=7.3461;EPP=100.477;EPPR=1091.42;GTI=30;LEN=1;MEANALT=1.22353;MQM=59.6148;MQMR=59.7602;NS=1151;NUMALT=1;ODDS=0.44296;PAIRED=1;PAIREDR=0.992398;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=4565;QR=327382;RO=9077;RPL=23;RPP=105.817;RPPR=78.3004;RPR=99;RUN=1;SAF=119;SAP=242.513;SAR=3;SRF=5820;SRP=1574.49;SRR=3257;TYPE=snp;technology.illumina=1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.8204:2:2,0:2:82:0:0:0,-0.60206,-7.77968	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:0.0144244:5:4,1:4:153:1:27:-1.19442,0,-12.6351	0/0:48.8101:1:1,0:1:38:0:0:0,-0.30103,-3.79727	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:66.8719:7:7,0:7:270:0:0:0,-2.10721,-24.662	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.8204:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59179	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.8101:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.8101:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.8101:1:1,0:1:27:0:0:0,-0.30103,-2.69978	0/0:51.8204:2:2,0:2:80:0:0:0,-0.60206,-7.59179	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.8101:1:1,0:1:40:0:0:0,-0.30103,-3.99568	0/0:48.8101:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	0/0:54.8307:3:3,0:3:122:0:0:0,-0.90309,-11.3725	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.8204:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.30883	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:51.8204:2:2,0:2:77:0:0:0,-0.60206,-7.3082	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:48.8101:1:1,0:1:41:0:0:0,-0.30103,-4.09457	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:60.8513:5:5,0:5:179:0:0:0,-1.50515,-16.4577	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.
SL2.50ch00	7409967	.	C	T,A	3609.69	.	AB=0.165394,0.275;ABP=5353.6,20.5992;AC=1,0;AF=0.0491346,0.00111669;AN=58;AO=1189,12;CIGAR=1X,1X;DP=22271;DPB=22271;DPRA=4.91895,3.87672;EPP=1532.04,29.068;EPPR=15657;GTI=74;LEN=1,1;MEANALT=1.01163,1.2;MQM=59.619,59.9167;MQMR=59.844;NS=1791;NUMALT=2;ODDS=0.0274874;PAIRED=0.929352,1;PAIREDR=0.98253;PAO=0,0;PQA=0,0;PQR=0;PRO=0;QA=39813,400;QR=781766;RO=21065;RPL=1125,0;RPP=2058.92,29.068;RPPR=24080.4;RPR=64,12;RUN=1,1;SAF=1108,0;SAP=1929.26,29.068;SAR=81,12;SRF=17957;SRP=22732.4;SRR=3108;TYPE=snp,snp;technology.illumina=1,1	GT:GQ:DP:AD:RO:QR:AO:QA:GL	0/0:33.5005:7:7,0,0:7:272:0,0:0,0:0,-2.10721,-24.8442,-2.10721,-24.8442,-24.8442	0/0:33.5005:6:6,0,0:6:236:0,0:0,0:0,-1.80618,-21.6119,-1.80618,-21.6119,-21.6119	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.5005:2:2,0,0:2:78:0,0:0,0:0,-0.60206,-7.40347,-0.60206,-7.40347,-7.40347	0/0:33.5005:9:9,0,0:9:349:0,0:0,0:0,-2.70927,-31.7688,-2.70927,-31.7688,-31.7688	0/0:33.5005:12:12,0,0:12:475:0,0:0,0:0,-3.61236,-43.1018,-3.61236,-43.1018,-43.1018	0/0:33.5005:7:7,0,0:7:278:0,0:0,0:0,-2.10721,-25.3902,-2.10721,-25.3902,-25.3902	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/1:-0:11:10,1,0:10:391:1,0:41,0:-0.777897,0,-32.2291,-3.7882,-32.5302,-35.9111	0/0:33.5005:7:7,0,0:7:279:0,0:0,0:0,-2.10721,-25.479,-2.10721,-25.479,-25.479	0/0:33.5005:10:10,0,0:10:370:0,0:0,0:0,-3.0103,-33.6453,-3.0103,-33.6453,-33.6453	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.5005:25:25,0,0:25:963:0,0:0,0:0,-7.52575,-86.9736,-7.52575,-86.9736,-86.9736	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.5005:25:25,0,0:25:944:0,0:0,0:0,-7.52575,-85.2691,-7.52575,-85.2691,-85.2691	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.5005:8:8,0,0:8:306:0,0:0,0:0,-2.40824,-27.8967,-2.40824,-27.8967,-27.8967	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.5005:10:10,0,0:10:391:0,0:0,0:0,-3.0103,-35.5441,-3.0103,-35.5441,-35.5441	0/0:33.5005:6:6,0,0:6:211:0,0:0,0:0,-1.80618,-19.3278,-1.80618,-19.3278,-19.3278	0/0:33.5005:12:12,0,0:12:472:0,0:0,0:0,-3.61236,-42.83,-3.61236,-42.83,-42.83	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.5005:10:10,0,0:10:397:0,0:0,0:0,-3.0103,-36.0895,-3.0103,-36.0895,-36.0895	0/0:33.5005:3:3,0,0:3:122:0,0:0,0:0,-0.90309,-11.3725,-0.90309,-11.3725,-11.3725	0/0:33.5005:10:10,0,0:10:398:0,0:0,0:0,-3.0103,-36.1781,-3.0103,-36.1781,-36.1781	0/0:33.5005:10:10,0,0:10:392:0,0:0,0:0,-3.0103,-35.6374,-3.0103,-35.6374,-35.6374	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.5005:9:9,0,0:9:347:0,0:0,0:0,-2.70927,-31.5844,-2.70927,-31.5844,-31.5844	0/0:33.5005:7:7,0,0:7:269:0,0:0,0:0,-2.10721,-24.5729,-2.10721,-24.5729,-24.5729	0/0:33.5005:10:10,0,0:10:398:0,0:0,0:0,-3.0103,-36.1785,-3.0103,-36.1785,-36.1785	0/0:33.5005:1:1,0,0:1:41:0,0:0,0:0,-0.30103,-4.09457,-0.30103,-4.09457,-4.09457	0/0:33.5005:4:4,0,0:4:157:0,0:0,0:0,-1.20412,-14.5061,-1.20412,-14.5061,-14.5061	0/0:33.5005:2:2,0,0:2:73:0,0:0,0:0,-0.60206,-6.9311,-0.60206,-6.9311,-6.9311	0/0:33.5005:6:6,0,0:6:238:0,0:0,0:0,-1.80618,-21.7887,-1.80618,-21.7887,-21.7887	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.5005:5:5,0,0:5:190:0,0:0,0:0,-1.50515,-17.4642,-1.50515,-17.4642,-17.4642	0/0:33.5005:4:4,0,0:4:156:0,0:0,0:0,-1.20412,-14.4158,-1.20412,-14.4158,-14.4158	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	0/0:33.5005:25:25,0,0:25:976:0,0:0,0:0,-7.52575,-88.1434,-7.52575,-88.1434,-88.1434	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.	.:.:.:.:.:.:.:.:.