FastQCFastQC Report
Fri 29 Apr 2022
S38_SantoTomePrincipe.sRNAs.15-35nt.Totivirus.reverse-mapped.fq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameS38_SantoTomePrincipe.sRNAs.15-35nt.Totivirus.reverse-mapped.fq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences192
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length15-35
%GC56

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTCTGTCGGGCTGGGT31.5625No Hit
TACGCGATCGCAGTCCATAG21.0416666666666665No Hit
GACTCTGTCGGGCTGG21.0416666666666665No Hit
GGCATGCCTTGTAAGA21.0416666666666665No Hit
CATCTGAAGGCCTGTATATCT10.5208333333333333No Hit
GCTGTCAGAAACCGGGCTGGGAG10.5208333333333333No Hit
CATGAACGACTCTGCAGCTAGA10.5208333333333333No Hit
AAGGCCTGTATATCTGA10.5208333333333333No Hit
GCTACAGGGATACATCATTCGCAC10.5208333333333333No Hit
TAAAGGCCTGTATATC10.5208333333333333No Hit
CAGGCAATATATGGGAAGATAACGTGGGAGTGGGA10.5208333333333333No Hit
AGCCCGTCAAGGATGAGATGCACAT10.5208333333333333No Hit
ATGTTACTCGAAACTCCGGA10.5208333333333333No Hit
GAACGCTGCCTGCGGCACAAT10.5208333333333333No Hit
AGAGCTTTCCTGTTCCAGCCCGTCAAGGATGAG10.5208333333333333No Hit
TGAAGGCCTGTATATCTGAGA10.5208333333333333No Hit
AATGCCCCGGACGGA10.5208333333333333No Hit
CCTGTATATCTGAGAGCC10.5208333333333333No Hit
CCGGGCTGGGAGGCTC10.5208333333333333No Hit
AAACAGGGCTGCGCTTACGCGATC10.5208333333333333No Hit
TGCCACTAGATCAGTCGAA10.5208333333333333No Hit
GACTCTGTCGGGCTGGGTAAT10.5208333333333333No Hit
AAAGTACGGAATAGACGCGAAACGTT10.5208333333333333No Hit
CGGCCAGGCAGAGGCACCAGC10.5208333333333333No Hit
CGCCGAAGTTACGAAGTCGAC10.5208333333333333No Hit
GAAGAAGACCCGGAGAGCAAAACCTG10.5208333333333333No Hit
GTCAGAAACCGGGCTG10.5208333333333333No Hit
TAGGGCTATAGGTGATC10.5208333333333333No Hit
AAAAACATTAGACACCACTT10.5208333333333333No Hit
GGAACGCTGCCTGCGG10.5208333333333333No Hit
GGAGGAACCCTGTGA10.5208333333333333No Hit
GTCAACTTCCTCCGG10.5208333333333333No Hit
GACGCGAAACGTTGGGCCTCCGAC10.5208333333333333No Hit
CCCGTGCGGACGTAATGCTC10.5208333333333333No Hit
GACTCTGTCGGGCTGGGTAATGCCCCGGA10.5208333333333333No Hit
TCCTGTTCCAGCCCGTCAAGGATGAGATG10.5208333333333333No Hit
ATGCTGTCAGAAACCGGGCTGGATCG10.5208333333333333No Hit
AACCGGGCTGGGAGGCT10.5208333333333333No Hit
TATCGACCCCAACCTGATCAACGACCTCAAGACA10.5208333333333333No Hit
AGCCCGTCAAGGATGAGATGCACATAATGCAGA10.5208333333333333No Hit
CAGACTTTGCACTCACGCCT10.5208333333333333No Hit
GGAAAAGAAGCGGGTAGC10.5208333333333333No Hit
GGTTTAGAGCCCGACAGTGCCT10.5208333333333333No Hit
TACGCTCCGAGCGCAGGGACCGGA10.5208333333333333No Hit
CAAGAGGACGATACTGGCGGT10.5208333333333333No Hit
CGGGAACCCACGATCA10.5208333333333333No Hit
AGGCGACCTGCGGAAACGGA10.5208333333333333No Hit
CCACCTCGTAGGTACGA10.5208333333333333No Hit
ACGCCGTTCTCATGAACGACTCTGCAGCTAGAGGG10.5208333333333333No Hit
TATGCAGACGGATTGGCA10.5208333333333333No Hit
GATGGCAGGGGTAGA10.5208333333333333No Hit
CTTGGAATGTATGGTGCACCGGGTCAG10.5208333333333333No Hit
TCACCACCCGTGCGGACG10.5208333333333333No Hit
CGACCGGTAACCGCC10.5208333333333333No Hit
ACCACCCGTGCGGACGTAATGC10.5208333333333333No Hit
CCGGGCTGGGAGGCTCCGCTTACGGACT10.5208333333333333No Hit
GATTGTACAAGACCAAAAC10.5208333333333333No Hit
ATACACGGGACGTGCG10.5208333333333333No Hit
AGGGAAGCGGCCAGGCAGAGGCACCAG10.5208333333333333No Hit
GGCAACGAGGAGATAGAC10.5208333333333333No Hit
AACGTCCCGGCAACGGTTGGAGGACGACAGTTCG10.5208333333333333No Hit
CACCACTTTGATGAGGACCTG10.5208333333333333No Hit
AAGTCGACGGGCTACAGGGATGAT10.5208333333333333No Hit
AAGGAGTCGGAGTTATGGAGTAGGCCATGCT10.5208333333333333No Hit
AGGAGCCTGGCACAATG10.5208333333333333No Hit
ACAGGGATACATCAT10.5208333333333333No Hit
ATTCGCGGGCAGGATTTTCGGCC10.5208333333333333No Hit
GAGATCCTGAAGGTTGTACAAGACCA10.5208333333333333No Hit
GATGCAGAGCTGGTCGGGGCC10.5208333333333333No Hit
GAGGATAGGAGCCTGGCACAATGGGG10.5208333333333333No Hit
ACGACGAGGTCTGGAACGCTGCCTGCGGCA10.5208333333333333No Hit
GGTCCTCTGATCGCTTGGA10.5208333333333333No Hit
CGGACGGAATTGCGGAAGGAGAAC10.5208333333333333No Hit
CCCTTGGAATGTATGGTGCACCGGGTCAGATCA10.5208333333333333No Hit
AGCAGATGTGGCCATG10.5208333333333333No Hit
TCGGATATGAGGTCCATCCT10.5208333333333333No Hit
GACGCTATACACCGGACCCTCGCACT10.5208333333333333No Hit
TAGACTGTGAGATCCTGAAGG10.5208333333333333No Hit
GGCTGGGAGTTGCGAAGGAAGT10.5208333333333333No Hit
TTGAACGACTCTGCAGCTAGA10.5208333333333333No Hit
TATTCAAAGGGAGGGCTTTAAGAGGGGT10.5208333333333333No Hit
GAATATAGCGTCCTTCCGCATAATTACGAA10.5208333333333333No Hit
GGGTGCGGTCCGTATCTACGAGCGGCTTG10.5208333333333333No Hit
TCAACTTCCTCCGGAATGCCAGCA10.5208333333333333No Hit
ATCTTTACGAGTTGAACAATGACCGT10.5208333333333333No Hit
TCCAGGGGTATTGGAGGACACCTTGCA10.5208333333333333No Hit
CTCCGCTTACGGACT10.5208333333333333No Hit
TAGTAAGAATGCCTTCATCCA10.5208333333333333No Hit
TATGTGCGTAAGGACAAGTGGAGGGATATA10.5208333333333333No Hit
GACGATTGCACCGGACCCCTATTTCCAT10.5208333333333333No Hit
GTGCGCCTGCGGAGTCGTTAA10.5208333333333333No Hit
AGAACGACGAGGTCTGGAACGCTGCCTGCGGCA10.5208333333333333No Hit
TACACCGGACCCTCGCACTCA10.5208333333333333No Hit
AACCGTCTTCTGTGGGGA10.5208333333333333No Hit
CCTGATCAACGACCTCAAGACGTCCTTGA10.5208333333333333No Hit
AAGGTAAGGCCGGTGG10.5208333333333333No Hit
GGAACGCTGCCTGCGGCACA10.5208333333333333No Hit
CAGCTACTGCATCTACAGACTGGAGGATGCCCGC10.5208333333333333No Hit
GACGAGGTCTGGAACGCTGCCTGCG10.5208333333333333No Hit
CCGCAAGACCAGTCAGTTCTGA10.5208333333333333No Hit
GCTGAGGTCCTGACGTGTGCTGAT10.5208333333333333No Hit
CGCGAAACGTTGGGC10.5208333333333333No Hit
AGGACGCGGACGTTGGGAATCCGATA10.5208333333333333No Hit
CGTTATGCGCGCCCTTAC10.5208333333333333No Hit
ACCTAAGTTGATGGAGAGGGCCTGCC10.5208333333333333No Hit
GAGGCGGATCTACAACATTAAAGACATGT10.5208333333333333No Hit
CCACCAAAGCAAGAGGACGATAC10.5208333333333333No Hit
CCCCAGAATGTACGAGAGG10.5208333333333333No Hit
AACCGCCGGCCATGTATC10.5208333333333333No Hit
CGAGGACTACCACCACA10.5208333333333333No Hit
CCTTGCACATGGCAGG10.5208333333333333No Hit
AATAGACGCGAAACG10.5208333333333333No Hit
GGAGTCGGAGTTATGG10.5208333333333333No Hit
AAAGTACGGAATAGACGCGAAACGTTGGGC10.5208333333333333No Hit
TTCGAGCGTGGCTTCTTTT10.5208333333333333No Hit
TGTAAGAAGCGAACGATGGC10.5208333333333333No Hit
ATGGACGCCGTTCTCATGAACGACTCTGCAGCT10.5208333333333333No Hit
AAGACATGTCCCTGAAGAGAAT10.5208333333333333No Hit
TGCGGACGTAATGCTC10.5208333333333333No Hit
CACCCGTGCGGACGTAATGCTCATAGGAGCAGC10.5208333333333333No Hit
ACGACGAGGTCTGGAACGCTGCCTGCGGCACA10.5208333333333333No Hit
ATGCACGACGTCACATTGTCTTTG10.5208333333333333No Hit
GCCAGACTGGAGGAT10.5208333333333333No Hit
CCGGACCCCTATTTCCATGATCTTTACGAGTT10.5208333333333333No Hit
TGGCAGGGGTAGAGGCTGATAGGGTCTCATCAC10.5208333333333333No Hit
AGCAGTCGCGGCCGAGGTGGTGCCCGTCGCC10.5208333333333333No Hit
TTAAAGACATGTCCCTGAAGAGAAT10.5208333333333333No Hit
ACCTGCGGAAACGGATTAGTAAGAA10.5208333333333333No Hit
ACGACCTCAAGACATCCTTGAAGA10.5208333333333333No Hit
TGGACTATCCCCTGGGC10.5208333333333333No Hit
CGACCCCAACCTGATC10.5208333333333333No Hit
AGGTGCCACTAGATCAGTCGAGA10.5208333333333333No Hit
TTGCGGAAGGAGTCC10.5208333333333333No Hit
CACCAAAGCAAGAGGACGATACTGGCGGTGCT10.5208333333333333No Hit
TCTCATGAACGACTCTGCAGCTAGA10.5208333333333333No Hit
GGAGGCTCCGCTTACGGACTGGAATAGGT10.5208333333333333No Hit
CCCAACATAAAAACATTA10.5208333333333333No Hit
CCGGAGTTGGTGAGGACCG10.5208333333333333No Hit
GAAGTGCGGAAGATATTGCCTCGACGTGTCCCCT10.5208333333333333No Hit
ATGGAGGCATGGGGTCCCTAGCGGGTGGAGATGGA10.5208333333333333No Hit
GACGAGGTCTGGAACGCTGCC10.5208333333333333No Hit
TCCATACTGCGCTGACGACTACGCTGACCGG10.5208333333333333No Hit
AGTAGGCCATGCTGTCAGAA10.5208333333333333No Hit
AAGAACGACGAGGTCTGGAACGCTGCCTGC10.5208333333333333No Hit
TGGGGAGGATCAACATCTT10.5208333333333333No Hit
GGCACTAAAGTACGGAATAGACGCGAAACGTTG10.5208333333333333No Hit
GACGACTACGCTGACCGGATATATGAGGAGGTGAG10.5208333333333333No Hit
TCGGCCGCGACCGGTAACCGCCGG10.5208333333333333No Hit
CGAAGAACGACGAGGTCTGGAACGCTGCC10.5208333333333333No Hit
TGTAAGAAGCGAACGATGGCAGGGGTAGA10.5208333333333333No Hit
GGAAAGGTACGCTGAGGTGGGCACTA10.5208333333333333No Hit
ACTGGAGGATGCCCG10.5208333333333333No Hit
AACGACGAGGTCTGGAACGCTGCCTGCG10.5208333333333333No Hit
CTAAAGTACGGAATAGACGCGAAACGT10.5208333333333333No Hit
GCTCCCCCAGAATGTAC10.5208333333333333No Hit
GCAGGAGGAGAGAGACGCTATG10.5208333333333333No Hit
CGGCAACGGTTGGAGGAC10.5208333333333333No Hit
CAGCTCGCGGCCATC10.5208333333333333No Hit
ACGAGGAGATAGACTGTGAGATCC10.5208333333333333No Hit
GAGAGGCGGATCTAC10.5208333333333333No Hit
TTGACGATTGCACCGGA10.5208333333333333No Hit
CCGAGCGCAGGGACCGGAGTTGGTGAGGACC10.5208333333333333No Hit
GCAGGACGCGGACGT10.5208333333333333No Hit
GCACCACCACAACGA10.5208333333333333No Hit
AGCAGGCGATAGGCGGATACT10.5208333333333333No Hit
TAGCGCTGCCAGAGGCTT10.5208333333333333No Hit
GACTCTGTCGGGCTGGG10.5208333333333333No Hit
CATTGCAAAGGTACAGATGGCCAAAGGGT10.5208333333333333No Hit
GACGCTATACACCGGACCCT10.5208333333333333No Hit
GAGTATGCGTCGGCCGCGACCGGTAACCGCCGGC10.5208333333333333No Hit
TGAGGACCTGGGTGT10.5208333333333333No Hit
TATCCGCTGGAGGAACCCTGTGG10.5208333333333333No Hit
AGTCTGAACCTACAAAGG10.5208333333333333No Hit
GAGGTCTGGAACGCTGCCTGCGGCACAATTC10.5208333333333333No Hit
GGGAGGACAGGTGCACTCC10.5208333333333333No Hit
CAGGGCTGAGTTCCTTCGC10.5208333333333333No Hit
GGTGCGCCTGCGGAGTCGTT10.5208333333333333No Hit
GAGCCTGGCACAATGGGGCTGAGG10.5208333333333333No Hit
GAGGACCTGGGTGTC10.5208333333333333No Hit
TTTGGTCTCTTACAGCTCTTAGGGGCACGAGA10.5208333333333333No Hit
AATGTCAACTTCCTCCG10.5208333333333333No Hit
GGCGCTACGCGATGGGTTGGGGTTCGGGGAC10.5208333333333333No Hit
TATGCGATCGAGTCACGGAACATG10.5208333333333333No Hit
TGAACGACTCTGCAGCTAGA10.5208333333333333No Hit
TACGTGGGTATGAGA10.5208333333333333No Hit
TCTGAACCTACAAAG10.5208333333333333No Hit
AGAACGACGAGGTCTGGAACGCTGCCTGCG10.5208333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)