##FastQC	0.11.5
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	S38_SantoTomePrincipe.sRNAs.15-35nt.Partitivirus_1_segment_1.reverse-mapped.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	18
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	15-29
%GC	55
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	32.77777777777778	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	35.55555555555556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
5	34.888888888888886	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
6	36.333333333333336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
7	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
8	35.55555555555556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
9	36.333333333333336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
10	36.333333333333336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
11	34.888888888888886	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
12	36.333333333333336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
13	36.333333333333336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
14	36.333333333333336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
15	34.333333333333336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
16	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
17	33.75	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
18	35.5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
19	36.142857142857146	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
20	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
21	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
22	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
23	32.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
24	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
25	31.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
26	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
27	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
28	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
29	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
>>END_MODULE
>>Per tile sequence quality	pass
#Tile	Base	Mean
2210	1	0.0
2210	2	0.0
2210	3	0.0
2210	4	0.0
2210	5	0.0
2210	6	0.0
2210	7	0.0
2210	8	0.0
2210	9	0.0
2210	10	0.0
2210	11	0.0
2210	12	0.0
2210	13	0.0
2210	14	0.0
2210	15	0.0
2210	16	0.0
2210	17	0.0
2210	18	0.0
2210	19	0.0
2210	20	0.0
2210	21	0.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
28	1.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	2.0
34	1.0
35	3.0
36	3.0
37	8.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	0.0	5.555555555555555	83.33333333333334	11.11111111111111
2	5.555555555555555	27.77777777777778	16.666666666666664	50.0
3	16.666666666666664	27.77777777777778	22.22222222222222	33.33333333333333
4	27.77777777777778	5.555555555555555	11.11111111111111	55.55555555555556
5	61.111111111111114	5.555555555555555	5.555555555555555	27.77777777777778
6	33.33333333333333	27.77777777777778	5.555555555555555	33.33333333333333
7	27.77777777777778	44.44444444444444	11.11111111111111	16.666666666666664
8	27.77777777777778	50.0	5.555555555555555	16.666666666666664
9	55.55555555555556	22.22222222222222	11.11111111111111	11.11111111111111
10	11.11111111111111	16.666666666666664	50.0	22.22222222222222
11	16.666666666666664	27.77777777777778	16.666666666666664	38.88888888888889
12	38.88888888888889	0.0	16.666666666666664	44.44444444444444
13	27.77777777777778	0.0	27.77777777777778	44.44444444444444
14	27.77777777777778	16.666666666666664	0.0	55.55555555555556
15	5.555555555555555	16.666666666666664	33.33333333333333	44.44444444444444
16	12.5	18.75	37.5	31.25
17	31.25	12.5	18.75	37.5
18	18.75	37.5	25.0	18.75
19	7.142857142857142	35.714285714285715	35.714285714285715	21.428571428571427
20	28.57142857142857	28.57142857142857	7.142857142857142	35.714285714285715
21	23.076923076923077	15.384615384615385	30.76923076923077	30.76923076923077
22	10.0	10.0	60.0	20.0
23	33.33333333333333	16.666666666666664	33.33333333333333	16.666666666666664
24	0.0	25.0	25.0	50.0
25	0.0	0.0	50.0	50.0
26	100.0	0.0	0.0	0.0
27	0.0	100.0	0.0	0.0
28	0.0	100.0	0.0	0.0
29	0.0	0.0	100.0	0.0
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	fail
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
36	0.0
37	0.0
38	0.0
39	0.0
40	0.5
41	1.5
42	2.0
43	1.5
44	1.0
45	1.0
46	0.5
47	0.0
48	1.5
49	3.0
50	6.0
51	9.0
52	8.0
53	7.0
54	6.0
55	3.5
56	2.0
57	1.5
58	1.0
59	1.0
60	1.0
61	1.0
62	1.0
63	0.5
64	0.0
65	0.5
66	1.5
67	2.0
68	2.5
69	3.5
70	3.5
71	3.0
72	3.0
73	2.5
74	2.0
75	1.0
76	0.0
77	0.0
78	0.0
79	0.0
80	0.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
15	2.0
16	0.0
17	0.0
18	2.0
19	0.0
20	1.0
21	3.0
22	4.0
23	2.0
24	2.0
25	1.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	1.0
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	pass
#Total Deduplicated Percentage	88.88888888888889
#Duplication Level	Percentage of deduplicated	Percentage of total
1	87.5	77.77777777777779
2	12.5	22.22222222222222
3	0.0	0.0
4	0.0	0.0
5	0.0	0.0
6	0.0	0.0
7	0.0	0.0
8	0.0	0.0
9	0.0	0.0
>10	0.0	0.0
>50	0.0	0.0
>100	0.0	0.0
>500	0.0	0.0
>1k	0.0	0.0
>5k	0.0	0.0
>10k+	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	fail
#Sequence	Count	Percentage	Possible Source
TCACGGAAGTCGGGTTCAACTT	2	11.11111111111111	No Hit
TCCCCGGAGCTCCCCTCA	2	11.11111111111111	No Hit
TATCGATCGAAGCCACTCCAG	1	5.555555555555555	No Hit
TATCGATCGAAGCCACTCCAGTC	1	5.555555555555555	No Hit
TAGGTCATCCAGTCCCATAGATTCTGAAT	1	5.555555555555555	No Hit
CCATCTGACTCTCCT	1	5.555555555555555	No Hit
CTCGAGCGTTCTTCC	1	5.555555555555555	No Hit
TTCGGCAGGTCCTCTAGATCTC	1	5.555555555555555	No Hit
TATCGCGGATGCGGCGAGTTCGGC	1	5.555555555555555	No Hit
ACCGGAAGAGACCAAGGGTAGAAAC	1	5.555555555555555	No Hit
TTGACAAAAGAGTCGAGTAGCTG	1	5.555555555555555	No Hit
TCTCCCCGGAGCTCCCCTCA	1	5.555555555555555	No Hit
TGCGGCGAGTTCGGCAGGTCCT	1	5.555555555555555	No Hit
TCGTGAACATCCCATTGCTGC	1	5.555555555555555	No Hit
TCACGGAAGTCGGGTTCAACT	1	5.555555555555555	No Hit
TAACGCCATCGTCACCTTGGACTT	1	5.555555555555555	No Hit
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	SOLID Small RNA Adapter
1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
10	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Kmer Content	pass
>>END_MODULE
