##FastQC	0.11.5
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	S38_SantoTomePrincipe.sRNAs.15-35nt.Partitivirus_1_segment_2.forward-mapped.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	22
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	15-31
%GC	49
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.90909090909091	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	34.81818181818182	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	35.27272727272727	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	34.72727272727273	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
5	35.81818181818182	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
6	35.90909090909091	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
7	35.81818181818182	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
8	36.45454545454545	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
9	35.81818181818182	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
10	35.81818181818182	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
11	36.45454545454545	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
12	35.27272727272727	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
13	35.27272727272727	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
14	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
15	35.90909090909091	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
16	33.55555555555556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
17	36.333333333333336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
18	36.333333333333336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
19	34.888888888888886	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
20	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
21	35.285714285714285	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
22	34.111111111111114	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
23	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
24	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
25	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
26	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
27	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
28	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
29	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
30	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
31	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
>>END_MODULE
>>Per tile sequence quality	pass
#Tile	Base	Mean
2140	1	0.0
2140	2	NaN
2140	3	NaN
2140	4	NaN
2140	5	NaN
2140	6	NaN
2140	7	0.0
2140	8	0.0
2140	9	0.0
2140	10	0.0
2140	11	0.0
2140	12	0.0
2140	13	0.0
2140	14	0.0
2140	15	0.0
2140	16	NaN
2140	17	NaN
2140	18	0.0
2140	19	NaN
2140	20	0.0
2140	21	0.0
2140	22	NaN
2140	23	0.0
2140	24	0.0
2140	25	-3.0
2140	26	-3.0
2140	27	-3.0
2140	28	-3.0
2140	29	-3.0
2140	30	-3.0
2140	31	-3.0
2241	1	0.0
2241	2	NaN
2241	3	NaN
2241	4	NaN
2241	5	NaN
2241	6	NaN
2241	7	0.0
2241	8	0.0
2241	9	0.0
2241	10	0.0
2241	11	0.0
2241	12	0.0
2241	13	0.0
2241	14	0.0
2241	15	0.0
2241	16	NaN
2241	17	NaN
2241	18	0.0
2241	19	NaN
2241	20	0.0
2241	21	0.0
2241	22	NaN
2241	23	0.0
2241	24	0.0
2241	25	3.0
2241	26	3.0
2241	27	3.0
2241	28	3.0
2241	29	3.0
2241	30	3.0
2241	31	3.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
29	2.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	1.0
34	1.0
35	1.0
36	8.0
37	9.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	18.181818181818183	0.0	77.27272727272727	4.545454545454546
2	13.636363636363635	50.0	18.181818181818183	18.181818181818183
3	27.27272727272727	31.818181818181817	22.727272727272727	18.181818181818183
4	31.818181818181817	18.181818181818183	22.727272727272727	27.27272727272727
5	27.27272727272727	22.727272727272727	9.090909090909092	40.909090909090914
6	31.818181818181817	50.0	9.090909090909092	9.090909090909092
7	18.181818181818183	45.45454545454545	13.636363636363635	22.727272727272727
8	36.36363636363637	45.45454545454545	13.636363636363635	4.545454545454546
9	50.0	22.727272727272727	22.727272727272727	4.545454545454546
10	13.636363636363635	22.727272727272727	36.36363636363637	27.27272727272727
11	27.27272727272727	36.36363636363637	13.636363636363635	22.727272727272727
12	50.0	22.727272727272727	9.090909090909092	18.181818181818183
13	27.27272727272727	13.636363636363635	40.909090909090914	18.181818181818183
14	45.45454545454545	27.27272727272727	0.0	27.27272727272727
15	40.909090909090914	45.45454545454545	9.090909090909092	4.545454545454546
16	27.77777777777778	27.77777777777778	33.33333333333333	11.11111111111111
17	11.11111111111111	11.11111111111111	44.44444444444444	33.33333333333333
18	50.0	16.666666666666664	11.11111111111111	22.22222222222222
19	33.33333333333333	16.666666666666664	5.555555555555555	44.44444444444444
20	33.33333333333333	16.666666666666664	22.22222222222222	27.77777777777778
21	7.142857142857142	28.57142857142857	50.0	14.285714285714285
22	22.22222222222222	22.22222222222222	44.44444444444444	11.11111111111111
23	14.285714285714285	14.285714285714285	42.857142857142854	28.57142857142857
24	20.0	40.0	0.0	40.0
25	33.33333333333333	33.33333333333333	0.0	33.33333333333333
26	100.0	0.0	0.0	0.0
27	0.0	100.0	0.0	0.0
28	0.0	100.0	0.0	0.0
29	0.0	0.0	0.0	100.0
30	0.0	0.0	0.0	100.0
31	0.0	100.0	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	fail
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
36	1.0
37	2.5
38	3.5
39	4.0
40	3.5
41	2.5
42	1.5
43	1.0
44	2.5
45	3.5
46	3.0
47	2.5
48	3.0
49	4.0
50	5.0
51	6.0
52	6.0
53	4.5
54	3.0
55	3.0
56	3.0
57	4.5
58	6.0
59	6.0
60	5.5
61	5.0
62	5.0
63	2.5
64	0.0
65	0.0
66	0.0
67	0.0
68	0.0
69	0.0
70	0.0
71	0.0
72	0.0
73	0.0
74	0.0
75	0.0
76	0.0
77	0.0
78	0.0
79	0.0
80	0.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
15	4.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	4.0
21	5.0
22	2.0
23	2.0
24	2.0
25	2.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	1.0
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	pass
#Total Deduplicated Percentage	72.72727272727273
#Duplication Level	Percentage of deduplicated	Percentage of total
1	75.0	54.54545454545454
2	18.75	27.27272727272727
3	0.0	0.0
4	6.25	18.181818181818183
5	0.0	0.0
6	0.0	0.0
7	0.0	0.0
8	0.0	0.0
9	0.0	0.0
>10	0.0	0.0
>50	0.0	0.0
>100	0.0	0.0
>500	0.0	0.0
>1k	0.0	0.0
>5k	0.0	0.0
>10k+	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	fail
#Sequence	Count	Percentage	Possible Source
GATGCACGTTCGTGG	4	18.181818181818183	No Hit
TGAGCCAGGTAAGATTTCCG	2	9.090909090909092	No Hit
TCATTAAAGAACGGACCAGTT	2	9.090909090909092	No Hit
TAGCGGAAACAGTGATTGCCATTC	2	9.090909090909092	No Hit
TAAAAAAACGGACAATCCCCATGGA	1	4.545454545454546	No Hit
TCGAGAAAACGACGGGCTGG	1	4.545454545454546	No Hit
TAGCAGGAATGAGCGGTACACG	1	4.545454545454546	No Hit
TCCAATCAAAGCCCAGGTCGTCA	1	4.545454545454546	No Hit
TTCTCAGTGATGACGACGGCT	1	4.545454545454546	No Hit
TTCTCAGTGATGACGACGGCTGCAC	1	4.545454545454546	No Hit
TAGAGGACGGGTGAAAAGAATTCAGGAACCA	1	4.545454545454546	No Hit
TTTCGTTGGGTCTCAAGGTTAAT	1	4.545454545454546	No Hit
TAACGGTTGCAGCAGTTGAG	1	4.545454545454546	No Hit
TTGGAATAGCCGTGAGAGGACA	1	4.545454545454546	No Hit
TGCCAGAAGCGTTCAGTGCTG	1	4.545454545454546	No Hit
CAATCGGGTTAGAACATCAGT	1	4.545454545454546	No Hit
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	SOLID Small RNA Adapter
1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
10	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Kmer Content	pass
>>END_MODULE
