##FastQC	0.11.5
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	S38_SantoTomePrincipe.sRNAs.15-35nt.Partitivirus_1_segment_2.reverse-mapped.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	34
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	15-35
%GC	52
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.94117647058823	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	36.294117647058826	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	35.88235294117647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	35.88235294117647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
5	35.88235294117647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
6	35.88235294117647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
7	36.64705882352941	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
8	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
9	35.11764705882353	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
10	35.94117647058823	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
11	36.294117647058826	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
12	35.88235294117647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
13	36.294117647058826	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
14	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
15	34.411764705882355	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
16	34.6875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
17	36.61290322580645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
18	36.61290322580645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
19	36.2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
20	36.172413793103445	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
21	35.53846153846154	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
22	35.916666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
23	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
24	35.8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
25	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
26	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
27	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
28	33.285714285714285	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
29	33.57142857142857	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
30	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
31	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
32	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
33	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
34	33.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
35	33.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
>>END_MODULE
>>Per tile sequence quality	fail
#Tile	Base	Mean
2128	1	0.0
2128	2	0.0
2128	3	0.0
2128	4	0.0
2128	5	0.0
2128	6	0.0
2128	7	0.0
2128	8	0.0
2128	9	0.0
2128	10	0.0
2128	11	4.0
2128	12	0.0
2128	13	0.0
2128	14	0.0
2128	15	-4.0
2128	16	0.0
2128	17	0.0
2128	18	-8.0
2128	19	-4.0
2128	20	-8.0
2128	21	-8.0
2128	22	-16.0
2128	23	-24.666666666666668
2128	24	-20.666666666666668
2128	25	-24.666666666666668
2128	26	-24.666666666666668
2128	27	-24.666666666666668
2128	28	-16.0
2128	29	-24.666666666666668
2128	30	-24.666666666666668
2128	31	-12.333333333333334
2128	32	-12.333333333333334
2209	1	0.0
2209	2	0.0
2209	3	0.0
2209	4	0.0
2209	5	0.0
2209	6	0.0
2209	7	0.0
2209	8	0.0
2209	9	0.0
2209	10	0.0
2209	11	4.0
2209	12	0.0
2209	13	0.0
2209	14	0.0
2209	15	8.0
2209	16	0.0
2209	17	0.0
2209	18	4.0
2209	19	8.0
2209	20	4.0
2209	21	4.0
2209	22	21.0
2209	23	12.333333333333332
2209	24	16.333333333333332
2209	25	12.333333333333332
2209	26	12.333333333333332
2209	27	12.333333333333332
2209	28	21.0
2209	29	12.333333333333332
2209	30	12.333333333333332
2209	31	24.666666666666664
2209	32	24.666666666666664
2260	1	0.0
2260	2	0.0
2260	3	0.0
2260	4	0.0
2260	5	0.0
2260	6	0.0
2260	7	0.0
2260	8	0.0
2260	9	0.0
2260	10	0.0
2260	11	-8.0
2260	12	0.0
2260	13	0.0
2260	14	0.0
2260	15	-4.0
2260	16	0.0
2260	17	0.0
2260	18	4.0
2260	19	-4.0
2260	20	4.0
2260	21	4.0
2260	22	-5.0
2260	23	12.333333333333332
2260	24	4.333333333333332
2260	25	12.333333333333332
2260	26	12.333333333333332
2260	27	12.333333333333332
2260	28	-5.0
2260	29	12.333333333333332
2260	30	12.333333333333332
2260	31	-12.333333333333334
2260	32	-12.333333333333334
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
27	1.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	1.0
32	0.0
33	2.0
34	2.0
35	3.0
36	8.0
37	17.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	5.88235294117647	14.705882352941178	64.70588235294117	14.705882352941178
2	14.705882352941178	14.705882352941178	32.35294117647059	38.23529411764706
3	11.76470588235294	23.52941176470588	29.411764705882355	35.294117647058826
4	29.411764705882355	14.705882352941178	23.52941176470588	32.35294117647059
5	20.588235294117645	26.47058823529412	23.52941176470588	29.411764705882355
6	20.588235294117645	26.47058823529412	23.52941176470588	29.411764705882355
7	32.35294117647059	20.588235294117645	20.588235294117645	26.47058823529412
8	38.23529411764706	23.52941176470588	20.588235294117645	17.647058823529413
9	14.705882352941178	17.647058823529413	17.647058823529413	50.0
10	17.647058823529413	20.588235294117645	26.47058823529412	35.294117647058826
11	35.294117647058826	20.588235294117645	17.647058823529413	26.47058823529412
12	26.47058823529412	11.76470588235294	32.35294117647059	29.411764705882355
13	23.52941176470588	14.705882352941178	23.52941176470588	38.23529411764706
14	23.52941176470588	5.88235294117647	35.294117647058826	35.294117647058826
15	29.411764705882355	8.823529411764707	26.47058823529412	35.294117647058826
16	25.0	18.75	31.25	25.0
17	35.483870967741936	22.58064516129032	25.806451612903224	16.129032258064516
18	25.806451612903224	0.0	45.16129032258064	29.03225806451613
19	23.333333333333332	10.0	43.333333333333336	23.333333333333332
20	31.03448275862069	13.793103448275861	34.48275862068966	20.689655172413794
21	19.230769230769234	19.230769230769234	38.46153846153847	23.076923076923077
22	45.83333333333333	20.833333333333336	25.0	8.333333333333332
23	13.636363636363635	36.36363636363637	18.181818181818183	31.818181818181817
24	20.0	20.0	50.0	10.0
25	33.33333333333333	22.22222222222222	22.22222222222222	22.22222222222222
26	11.11111111111111	22.22222222222222	11.11111111111111	55.55555555555556
27	12.5	50.0	25.0	12.5
28	0.0	28.57142857142857	57.14285714285714	14.285714285714285
29	14.285714285714285	42.857142857142854	28.57142857142857	14.285714285714285
30	14.285714285714285	0.0	42.857142857142854	42.857142857142854
31	66.66666666666666	0.0	16.666666666666664	16.666666666666664
32	16.666666666666664	50.0	0.0	33.33333333333333
33	0.0	40.0	20.0	40.0
34	33.33333333333333	0.0	66.66666666666666	0.0
35	0.0	0.0	33.33333333333333	66.66666666666666
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	fail
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
36	0.0
37	0.0
38	0.0
39	0.5
40	1.5
41	2.0
42	2.5
43	4.0
44	5.0
45	4.5
46	6.0
47	7.5
48	8.5
49	10.0
50	12.5
51	15.0
52	13.5
53	10.0
54	5.0
55	2.0
56	1.5
57	0.5
58	0.0
59	0.0
60	1.0
61	2.0
62	2.0
63	2.5
64	2.5
65	2.0
66	2.0
67	1.5
68	1.0
69	0.5
70	0.0
71	0.0
72	0.0
73	0.0
74	0.0
75	0.0
76	0.0
77	0.0
78	0.5
79	1.0
80	1.0
81	1.0
82	1.0
83	1.5
84	1.5
85	1.0
86	1.0
87	1.0
88	1.0
89	1.0
90	0.5
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
15	2.0
16	1.0
17	0.0
18	1.0
19	1.0
20	3.0
21	2.0
22	2.0
23	12.0
24	1.0
25	0.0
26	1.0
27	1.0
28	0.0
29	0.0
30	1.0
31	0.0
32	1.0
33	2.0
34	0.0
35	3.0
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	pass
#Total Deduplicated Percentage	85.29411764705883
#Duplication Level	Percentage of deduplicated	Percentage of total
1	82.75862068965517	70.58823529411765
2	17.24137931034483	29.411764705882355
3	0.0	0.0
4	0.0	0.0
5	0.0	0.0
6	0.0	0.0
7	0.0	0.0
8	0.0	0.0
9	0.0	0.0
>10	0.0	0.0
>50	0.0	0.0
>100	0.0	0.0
>500	0.0	0.0
>1k	0.0	0.0
>5k	0.0	0.0
>10k+	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	fail
#Sequence	Count	Percentage	Possible Source
ACGTGCAGCCGTCGTCATCACTGAGAATTCGAATC	2	5.88235294117647	No Hit
TTCTTTGTCCTCTCACGGCT	2	5.88235294117647	No Hit
TTCCAACACTGAGTCTGGTCTGA	2	5.88235294117647	No Hit
TTTGCTGACGACCTGGGCTTTGA	2	5.88235294117647	No Hit
TGAACGTGTTGGTCCTGCTGAGT	2	5.88235294117647	No Hit
AATGCTCTCGGAAGTATGTCTCGTGTTACTGG	1	2.941176470588235	No Hit
CACGCGACATCCATGGCGAAG	1	2.941176470588235	No Hit
CTCGGAAGTATGTCTCGTGTTAC	1	2.941176470588235	No Hit
TCCAAATGCTCTCGGAAGTATGTCTCGTGTTAC	1	2.941176470588235	No Hit
CGACACCCGCCGCCC	1	2.941176470588235	No Hit
TACTATGAACGTGTTGGTC	1	2.941176470588235	No Hit
CCCATGTGTTCTACT	1	2.941176470588235	No Hit
TTGCTGACGACATGGGCTTTGA	1	2.941176470588235	No Hit
AAATGCTCTCGGAAGTATGTCTCGTGTTAC	1	2.941176470588235	No Hit
TCACTGAGGATTCGAATCAGATCGACCCAGCCCGT	1	2.941176470588235	No Hit
TCAGCACTGAACGCTTCTGGCACTCCAAATGCT	1	2.941176470588235	No Hit
TCGGAAGTATGTCTCGTGTT	1	2.941176470588235	No Hit
TCTGATCGACACCCGAATGGCAA	1	2.941176470588235	No Hit
TCAGCACTGAACGCTTCTGGCACTCCA	1	2.941176470588235	No Hit
TCTTTCTGTGGTCTCGTTTCTTCT	1	2.941176470588235	No Hit
TTTCTCGACCCGCCGTGTCTGGC	1	2.941176470588235	No Hit
CGTGCAGCCGTCGTCATC	1	2.941176470588235	No Hit
TGCTGACGACCTGGGCTTTGATA	1	2.941176470588235	No Hit
GAACGTATCAAGCTCCATGGGGA	1	2.941176470588235	No Hit
TCTCACGGCTATTCCAACACTG	1	2.941176470588235	No Hit
TTTAGCTACCCGTACGTCGTACA	1	2.941176470588235	No Hit
TTCCCCGACCCGCGCC	1	2.941176470588235	No Hit
ACCCAGCCCGTCGTTTTCTCG	1	2.941176470588235	No Hit
GCTCTCGGAAGTATGTCTCGTGTTAC	1	2.941176470588235	No Hit
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	SOLID Small RNA Adapter
1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
10	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
20	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Kmer Content	pass
>>END_MODULE
