##FastQC	0.11.5
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	S38_SantoTomePrincipe.sRNAs.15-35nt.Partitivirus_2_segment_2.reverse-mapped.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	50
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	16-35
%GC	50
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	36.28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	35.72	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	36.76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	36.28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
5	36.48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
6	36.24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
7	35.72	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
8	36.04	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
9	36.52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
10	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
11	36.24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
12	36.76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
13	36.28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
14	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
15	36.48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
16	36.76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
17	36.755102040816325	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
18	36.755102040816325	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
19	36.48936170212766	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
20	36.744680851063826	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
21	36.73913043478261	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
22	36.41463414634146	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
23	36.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
24	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
25	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
26	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
27	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
28	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
29	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
30	35.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
31	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
32	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
33	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
34	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
35	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
>>END_MODULE
>>Per tile sequence quality	fail
#Tile	Base	Mean
2133	1	0.0
2133	2	0.0
2133	3	0.0
2133	4	0.0
2133	5	0.0
2133	6	0.0
2133	7	0.0
2133	8	0.0
2133	9	0.0
2133	10	0.0
2133	11	0.0
2133	12	0.0
2133	13	2.3999999999999986
2133	14	0.0
2133	15	0.0
2133	16	0.0
2133	17	0.0
2133	18	0.0
2133	19	0.0
2133	20	0.0
2133	21	0.0
2133	22	0.0
2133	23	0.0
2133	24	-14.8
2133	25	-14.8
2133	26	-14.8
2133	27	-7.4
2133	28	-7.4
2133	29	-7.4
2133	30	-7.4
2133	31	-7.4
2133	32	-7.4
2133	33	-7.4
2133	34	-7.4
2158	1	0.0
2158	2	0.0
2158	3	0.0
2158	4	0.0
2158	5	0.0
2158	6	0.0
2158	7	0.0
2158	8	0.0
2158	9	0.0
2158	10	0.0
2158	11	0.0
2158	12	0.0
2158	13	2.3999999999999986
2158	14	0.0
2158	15	0.0
2158	16	0.0
2158	17	0.0
2158	18	0.0
2158	19	0.0
2158	20	0.0
2158	21	0.0
2158	22	0.0
2158	23	0.0
2158	24	22.2
2158	25	22.2
2158	26	22.2
2158	27	-7.4
2158	28	-7.4
2158	29	-7.4
2158	30	-7.4
2158	31	-7.4
2158	32	-7.4
2158	33	-7.4
2158	34	-7.4
2178	1	0.0
2178	2	0.0
2178	3	0.0
2178	4	0.0
2178	5	0.0
2178	6	0.0
2178	7	0.0
2178	8	0.0
2178	9	0.0
2178	10	0.0
2178	11	0.0
2178	12	0.0
2178	13	2.3999999999999986
2178	14	0.0
2178	15	0.0
2178	16	0.0
2178	17	0.0
2178	18	0.0
2178	19	0.0
2178	20	0.0
2178	21	0.0
2178	22	0.0
2178	23	0.0
2178	24	-14.8
2178	25	-14.8
2178	26	-14.8
2178	27	-7.4
2178	28	-7.4
2178	29	-7.4
2178	30	-7.4
2178	31	-7.4
2178	32	-7.4
2178	33	-7.4
2178	34	-7.4
2241	1	0.0
2241	2	0.0
2241	3	0.0
2241	4	0.0
2241	5	0.0
2241	6	0.0
2241	7	0.0
2241	8	0.0
2241	9	0.0
2241	10	0.0
2241	11	0.0
2241	12	0.0
2241	13	-9.600000000000001
2241	14	0.0
2241	15	0.0
2241	16	0.0
2241	17	0.0
2241	18	0.0
2241	19	0.0
2241	20	0.0
2241	21	0.0
2241	22	0.0
2241	23	0.0
2241	24	22.2
2241	25	22.2
2241	26	22.2
2241	27	29.6
2241	28	29.6
2241	29	29.6
2241	30	29.6
2241	31	29.6
2241	32	29.6
2241	33	29.6
2241	34	29.6
2276	1	0.0
2276	2	0.0
2276	3	0.0
2276	4	0.0
2276	5	0.0
2276	6	0.0
2276	7	0.0
2276	8	0.0
2276	9	0.0
2276	10	0.0
2276	11	0.0
2276	12	0.0
2276	13	2.3999999999999986
2276	14	0.0
2276	15	0.0
2276	16	0.0
2276	17	0.0
2276	18	0.0
2276	19	0.0
2276	20	0.0
2276	21	0.0
2276	22	0.0
2276	23	0.0
2276	24	-14.8
2276	25	-14.8
2276	26	-14.8
2276	27	-7.4
2276	28	-7.4
2276	29	-7.4
2276	30	-7.4
2276	31	-7.4
2276	32	-7.4
2276	33	-7.4
2276	34	-7.4
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
30	1.0
31	1.0
32	1.0
33	0.0
34	0.0
35	5.0
36	7.0
37	35.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	6.0	2.0	84.0	8.0
2	16.0	8.0	57.99999999999999	18.0
3	28.000000000000004	24.0	24.0	24.0
4	6.0	20.0	44.0	30.0
5	36.0	12.0	24.0	28.000000000000004
6	20.0	24.0	22.0	34.0
7	12.0	26.0	34.0	28.000000000000004
8	26.0	10.0	24.0	40.0
9	16.0	26.0	38.0	20.0
10	14.000000000000002	20.0	36.0	30.0
11	42.0	10.0	24.0	24.0
12	40.0	4.0	30.0	26.0
13	38.0	20.0	18.0	24.0
14	32.0	16.0	36.0	16.0
15	30.0	10.0	34.0	26.0
16	16.0	8.0	40.0	36.0
17	44.89795918367347	12.244897959183673	22.448979591836736	20.408163265306122
18	16.3265306122449	32.6530612244898	24.489795918367346	26.53061224489796
19	21.27659574468085	21.27659574468085	23.404255319148938	34.04255319148936
20	31.914893617021278	27.659574468085108	19.148936170212767	21.27659574468085
21	19.565217391304348	45.65217391304348	15.217391304347828	19.565217391304348
22	26.82926829268293	19.51219512195122	9.75609756097561	43.90243902439025
23	8.333333333333332	38.88888888888889	19.444444444444446	33.33333333333333
24	26.31578947368421	36.84210526315789	10.526315789473683	26.31578947368421
25	20.0	13.333333333333334	33.33333333333333	33.33333333333333
26	0.0	8.333333333333332	8.333333333333332	83.33333333333334
27	22.22222222222222	22.22222222222222	22.22222222222222	33.33333333333333
28	22.22222222222222	11.11111111111111	33.33333333333333	33.33333333333333
29	66.66666666666666	11.11111111111111	0.0	22.22222222222222
30	44.44444444444444	22.22222222222222	11.11111111111111	22.22222222222222
31	0.0	50.0	37.5	12.5
32	0.0	16.666666666666664	16.666666666666664	66.66666666666666
33	0.0	20.0	60.0	20.0
34	66.66666666666666	33.33333333333333	0.0	0.0
35	0.0	0.0	100.0	0.0
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	fail
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	1.0
34	2.0
35	2.5
36	3.0
37	3.0
38	3.0
39	3.0
40	3.0
41	3.5
42	4.5
43	5.0
44	4.5
45	4.5
46	4.5
47	3.5
48	6.0
49	8.5
50	13.0
51	18.0
52	15.5
53	13.5
54	12.0
55	11.0
56	12.0
57	12.0
58	10.5
59	9.0
60	7.0
61	3.5
62	2.0
63	1.5
64	1.0
65	1.0
66	0.5
67	0.0
68	0.0
69	0.0
70	0.0
71	0.0
72	0.0
73	0.0
74	0.0
75	0.0
76	0.0
77	0.0
78	0.0
79	0.0
80	0.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
16	1.0
17	0.0
18	2.0
19	0.0
20	1.0
21	5.0
22	5.0
23	17.0
24	4.0
25	3.0
26	3.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	1.0
31	2.0
32	1.0
33	2.0
34	1.0
35	2.0
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	pass
#Total Deduplicated Percentage	78.0
#Duplication Level	Percentage of deduplicated	Percentage of total
1	76.92307692307693	60.0
2	20.51282051282051	32.0
3	0.0	0.0
4	2.564102564102564	8.0
5	0.0	0.0
6	0.0	0.0
7	0.0	0.0
8	0.0	0.0
9	0.0	0.0
>10	0.0	0.0
>50	0.0	0.0
>100	0.0	0.0
>500	0.0	0.0
>1k	0.0	0.0
>5k	0.0	0.0
>10k+	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	fail
#Sequence	Count	Percentage	Possible Source
TTTTGCAGTCGCGGGTGAAAACC	4	8.0	No Hit
TGACATCGTTGGGATCTGACGA	2	4.0	No Hit
TCTCGGACTGTTCTGGAACGACC	2	4.0	No Hit
TGCCGATCTCGGACTGTTCTGGA	2	4.0	No Hit
TTGAACCCTGGTCTCGGAAACGA	2	4.0	No Hit
TTAATTCCTTAGTGATGGTGACA	2	4.0	No Hit
TTCTGCTTAAGGATTACACAACCACC	2	4.0	No Hit
TGGTCCCCAATCCGTCCTTGCCGATCTCGGACTGT	2	4.0	No Hit
TCAAGCGGATGTGGCTCCCTA	2	4.0	No Hit
TTAACATCCTCAATCTGCACATC	1	2.0	No Hit
GTGACATCGTTGGGATCTGACGAAGCCTCCT	1	2.0	No Hit
TTTTCGGTTCCCGCCCTCGGTA	1	2.0	No Hit
TTTTTCTCATGTGGTTCTGGTCTGG	1	2.0	No Hit
TAACCAAGATCTCCGCTCTCGT	1	2.0	No Hit
TTGTCTCACTCGTTTTGCTGCGAC	1	2.0	No Hit
ACCCTGTCGTCCTTGTGA	1	2.0	No Hit
GGGTCTTCCACTTGGCGACTTCTCGTCGGTTT	1	2.0	No Hit
TCCGTCCTTGCCGATCTCGGACT	1	2.0	No Hit
CGCTGGATACGAAGATGCTCAGTTTAAGGAACA	1	2.0	No Hit
TTTTCTCATGTGGTTCTGGTCTGGCCAACA	1	2.0	No Hit
TCCTTGTGACATCGTTGGGA	1	2.0	No Hit
TTGCAGTCGCGGGTGAAAACC	1	2.0	No Hit
TTGCCGATCTCGGACTGTTCTG	1	2.0	No Hit
TTACCGTTGCTGTTGTGAGAACA	1	2.0	No Hit
TTACTAATGATGGTTCGACTGTTGAC	1	2.0	No Hit
TAAGGATTACACAACCACCGTCT	1	2.0	No Hit
TTGTCTCACTCGTTTTGCTGCGACTCGTGGTATA	1	2.0	No Hit
TTGTGACATCGTTGGGATCTGACGA	1	2.0	No Hit
TTCCGACTCTGCCTCC	1	2.0	No Hit
TAACCAAGATCTCCGCTCTCG	1	2.0	No Hit
TCGGAAACGAGTCACCATGGAGAA	1	2.0	No Hit
CTGTTCTGGAACGACCCTCAAACGTCGCACC	1	2.0	No Hit
CCTTGTGACATCGTTGGG	1	2.0	No Hit
TTTTTCAGACTGGCGCTGGTGAACC	1	2.0	No Hit
TTGATTTCCTCTTCACGCCAAAAT	1	2.0	No Hit
TTTCCGGTCTCGACGAGTTCTATC	1	2.0	No Hit
GACATCGTTGGGATCTGACGA	1	2.0	No Hit
TTCTTTTCCCTGAACCCTGGACC	1	2.0	No Hit
CTCTGATCGATTCTTTTCCCTGAACCCTGGACC	1	2.0	No Hit
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	SOLID Small RNA Adapter
1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
10	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
20	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Kmer Content	fail
#Sequence	Count	PValue	Obs/Exp Max	Max Obs/Exp Position
ATCCTCA	5	0.0	17.0	6
TCCTCAA	5	0.0	17.0	7
TGCACAT	5	0.0	17.0	16
AATCTGC	5	0.0	17.0	12
CATCCTC	5	0.0	17.0	5
CAATCTG	5	0.0	17.0	11
TCAATCT	5	0.0	17.0	10
ACATCCT	5	0.0	17.0	4
TCTGCAC	5	0.0	17.0	14
TAACATC	5	0.0	17.0	2
CCTCAAT	5	0.0	17.0	8
TTAACAT	5	0.0	17.0	1
CTGCACA	5	0.0	17.0	15
GCACATC	5	0.0	17.0	17
ATCTGCA	5	0.0	17.0	13
CTCAATC	5	0.0	17.0	9
AACATCC	5	0.0	17.0	3
>>END_MODULE
