##FastQC	0.11.5
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	S38_SantoTomePrincipe.sRNAs.15-35nt.Partitivirus_3_segment_1.forward-mapped.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	15
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	21-32
%GC	53
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	35.4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
5	36.2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
6	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
7	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
8	34.46666666666667	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
9	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
10	35.4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
11	36.2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
12	31.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
13	35.266666666666666	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
14	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
15	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
16	36.2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
17	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
18	36.2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
19	36.2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
20	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
21	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
22	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
23	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
24	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
25	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
26	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
27	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
28	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
29	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
30	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
31	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
32	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
>>END_MODULE
>>Per tile sequence quality	pass
#Tile	Base	Mean
2228	1	0.0
2228	2	0.0
2228	3	0.0
2228	4	0.0
2228	5	0.0
2228	6	0.0
2228	7	0.0
2228	8	0.0
2228	9	0.0
2228	10	0.0
2228	11	0.0
2228	12	0.0
2228	13	0.0
2228	14	0.0
2228	15	0.0
2228	16	0.0
2228	17	0.0
2228	18	0.0
2228	19	0.0
2228	20	0.0
2228	21	0.0
2228	22	0.0
2228	23	0.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
32	1.0
33	0.0
34	1.0
35	2.0
36	5.0
37	6.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	6.666666666666667	20.0	33.33333333333333	40.0
2	33.33333333333333	26.666666666666668	40.0	0.0
3	33.33333333333333	20.0	20.0	26.666666666666668
4	26.666666666666668	20.0	13.333333333333334	40.0
5	60.0	6.666666666666667	13.333333333333334	20.0
6	20.0	40.0	26.666666666666668	13.333333333333334
7	33.33333333333333	26.666666666666668	13.333333333333334	26.666666666666668
8	33.33333333333333	33.33333333333333	26.666666666666668	6.666666666666667
9	60.0	20.0	13.333333333333334	6.666666666666667
10	40.0	33.33333333333333	6.666666666666667	20.0
11	33.33333333333333	26.666666666666668	13.333333333333334	26.666666666666668
12	40.0	20.0	40.0	0.0
13	46.666666666666664	20.0	26.666666666666668	6.666666666666667
14	33.33333333333333	26.666666666666668	26.666666666666668	13.333333333333334
15	20.0	26.666666666666668	46.666666666666664	6.666666666666667
16	26.666666666666668	53.333333333333336	13.333333333333334	6.666666666666667
17	20.0	40.0	20.0	20.0
18	46.666666666666664	20.0	20.0	13.333333333333334
19	40.0	20.0	26.666666666666668	13.333333333333334
20	20.0	33.33333333333333	33.33333333333333	13.333333333333334
21	13.333333333333334	13.333333333333334	13.333333333333334	60.0
22	37.5	25.0	0.0	37.5
23	0.0	62.5	0.0	37.5
24	0.0	40.0	40.0	20.0
25	80.0	0.0	20.0	0.0
26	0.0	50.0	0.0	50.0
27	50.0	25.0	0.0	25.0
28	100.0	0.0	0.0	0.0
29	50.0	0.0	0.0	50.0
30	66.66666666666666	0.0	0.0	33.33333333333333
31	0.0	0.0	0.0	100.0
32	0.0	0.0	0.0	100.0
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	fail
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
36	0.0
37	0.0
38	0.5
39	1.0
40	1.0
41	1.0
42	0.5
43	0.0
44	0.0
45	0.0
46	0.5
47	1.0
48	1.0
49	1.0
50	3.0
51	5.0
52	6.0
53	6.5
54	7.0
55	6.5
56	5.0
57	5.0
58	4.5
59	3.0
60	1.5
61	1.0
62	1.0
63	1.0
64	0.5
65	0.0
66	0.0
67	0.0
68	0.0
69	0.0
70	0.0
71	0.0
72	0.0
73	0.0
74	0.0
75	0.0
76	0.0
77	0.0
78	0.0
79	0.0
80	0.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
21	7.0
22	0.0
23	3.0
24	0.0
25	1.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	1.0
30	1.0
31	0.0
32	2.0
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	pass
#Total Deduplicated Percentage	80.0
#Duplication Level	Percentage of deduplicated	Percentage of total
1	75.0	60.0
2	25.0	40.0
3	0.0	0.0
4	0.0	0.0
5	0.0	0.0
6	0.0	0.0
7	0.0	0.0
8	0.0	0.0
9	0.0	0.0
>10	0.0	0.0
>50	0.0	0.0
>100	0.0	0.0
>500	0.0	0.0
>1k	0.0	0.0
>5k	0.0	0.0
>10k+	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	fail
#Sequence	Count	Percentage	Possible Source
ATCCGACAGCATGCATCTTTCAATGAGGGGCC	2	13.333333333333334	No Hit
CTGAGGATGGAGTGTAAGGGACC	2	13.333333333333334	No Hit
TGAGGATGGAGTGTAAGGGAC	2	13.333333333333334	No Hit
GAGGCTCAGACATGTGAACTC	1	6.666666666666667	No Hit
TATCCGACAGCATGCATCTTTCAAT	1	6.666666666666667	No Hit
AGCCGCCTGACGAAGGAAACC	1	6.666666666666667	No Hit
CGACGTGTTCTGGAGAGGTTC	1	6.666666666666667	No Hit
CTTGATGGAGTTGATAAGGACGCAGCCGCC	1	6.666666666666667	No Hit
TTGATAAGGACGCAGCCGCCT	1	6.666666666666667	No Hit
CAGTCCGACGGTATTATCGAC	1	6.666666666666667	No Hit
TACTGAGGATGGAGTGTAAGGGA	1	6.666666666666667	No Hit
CGTCTTGATGGAGTTGATAAGGACGCAGC	1	6.666666666666667	No Hit
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	SOLID Small RNA Adapter
1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
10	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
20	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Kmer Content	pass
>>END_MODULE
