##FastQC	0.11.5
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	S38_SantoTomePrincipe.sRNAs.15-35nt.Partitivirus_3_segment_1.reverse-mapped.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	35
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	15-35
%GC	50
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	36.65714285714286	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	36.31428571428572	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	35.57142857142857	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	35.22857142857143	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
5	35.57142857142857	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
6	36.65714285714286	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
7	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
8	36.25714285714286	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
9	34.82857142857143	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
10	36.25714285714286	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
11	36.65714285714286	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
12	34.82857142857143	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
13	36.65714285714286	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
14	35.91428571428571	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
15	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
16	35.529411764705884	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
17	36.21212121212121	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
18	35.90909090909091	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
19	36.61290322580645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
20	36.10344827586207	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
21	36.07692307692308	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
22	34.285714285714285	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
23	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
24	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
25	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
26	35.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
27	35.5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
28	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
29	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
30	35.285714285714285	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
31	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
32	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
33	34.6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
34	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
35	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
>>END_MODULE
>>Per tile sequence quality	pass
#Tile	Base	Mean
2149	1	0.0
2149	2	NaN
2149	3	0.0
2149	4	0.0
2149	5	0.0
2149	6	0.0
2149	7	0.0
2149	8	0.0
2149	9	NaN
2149	10	0.0
2149	11	0.0
2149	12	NaN
2149	13	0.0
2149	14	0.0
2149	15	0.0
2149	16	0.0
2149	17	0.0
2149	18	0.0
2149	19	0.0
2149	20	0.0
2149	21	-4.0
2149	22	-2.0
2149	23	-2.0
2149	24	-2.0
2149	25	-2.0
2149	26	-2.0
2149	27	-2.0
2149	28	-2.0
2149	29	-2.0
2149	30	-2.0
2149	31	-2.0
2149	32	-2.0
2149	33	-2.0
2149	34	-2.0
2149	35	-2.0
2211	1	0.0
2211	2	NaN
2211	3	0.0
2211	4	0.0
2211	5	0.0
2211	6	0.0
2211	7	0.0
2211	8	0.0
2211	9	NaN
2211	10	0.0
2211	11	0.0
2211	12	NaN
2211	13	0.0
2211	14	0.0
2211	15	0.0
2211	16	0.0
2211	17	0.0
2211	18	0.0
2211	19	0.0
2211	20	0.0
2211	21	2.0
2211	22	4.0
2211	23	4.0
2211	24	4.0
2211	25	4.0
2211	26	4.0
2211	27	4.0
2211	28	4.0
2211	29	4.0
2211	30	4.0
2211	31	4.0
2211	32	4.0
2211	33	4.0
2211	34	4.0
2211	35	4.0
2262	1	0.0
2262	2	NaN
2262	3	0.0
2262	4	0.0
2262	5	0.0
2262	6	0.0
2262	7	0.0
2262	8	0.0
2262	9	NaN
2262	10	0.0
2262	11	0.0
2262	12	NaN
2262	13	0.0
2262	14	0.0
2262	15	0.0
2262	16	0.0
2262	17	0.0
2262	18	0.0
2262	19	0.0
2262	20	0.0
2262	21	2.0
2262	22	-2.0
2262	23	-2.0
2262	24	-2.0
2262	25	-2.0
2262	26	-2.0
2262	27	-2.0
2262	28	-2.0
2262	29	-2.0
2262	30	-2.0
2262	31	-2.0
2262	32	-2.0
2262	33	-2.0
2262	34	-2.0
2262	35	-2.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
29	1.0
30	0.0
31	1.0
32	0.0
33	1.0
34	1.0
35	6.0
36	7.0
37	18.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	11.428571428571429	54.285714285714285	17.142857142857142	17.142857142857142
2	22.857142857142858	40.0	25.71428571428571	11.428571428571429
3	25.71428571428571	22.857142857142858	20.0	31.428571428571427
4	37.142857142857146	20.0	11.428571428571429	31.428571428571427
5	22.857142857142858	37.142857142857146	25.71428571428571	14.285714285714285
6	17.142857142857142	20.0	34.285714285714285	28.57142857142857
7	5.714285714285714	17.142857142857142	48.57142857142857	28.57142857142857
8	28.57142857142857	8.571428571428571	40.0	22.857142857142858
9	22.857142857142858	28.57142857142857	31.428571428571427	17.142857142857142
10	28.57142857142857	14.285714285714285	45.714285714285715	11.428571428571429
11	20.0	31.428571428571427	14.285714285714285	34.285714285714285
12	42.857142857142854	11.428571428571429	22.857142857142858	22.857142857142858
13	17.142857142857142	20.0	28.57142857142857	34.285714285714285
14	14.285714285714285	17.142857142857142	28.57142857142857	40.0
15	20.0	25.71428571428571	42.857142857142854	11.428571428571429
16	14.705882352941178	17.647058823529413	26.47058823529412	41.17647058823529
17	27.27272727272727	24.242424242424242	15.151515151515152	33.33333333333333
18	21.21212121212121	15.151515151515152	15.151515151515152	48.484848484848484
19	12.903225806451612	12.903225806451612	25.806451612903224	48.38709677419355
20	17.24137931034483	10.344827586206897	27.586206896551722	44.827586206896555
21	19.230769230769234	11.538461538461538	30.76923076923077	38.46153846153847
22	14.285714285714285	35.714285714285715	14.285714285714285	35.714285714285715
23	15.384615384615385	15.384615384615385	7.6923076923076925	61.53846153846154
24	9.090909090909092	27.27272727272727	18.181818181818183	45.45454545454545
25	27.27272727272727	9.090909090909092	18.181818181818183	45.45454545454545
26	22.22222222222222	22.22222222222222	33.33333333333333	22.22222222222222
27	37.5	25.0	37.5	0.0
28	0.0	57.14285714285714	28.57142857142857	14.285714285714285
29	0.0	42.857142857142854	42.857142857142854	14.285714285714285
30	14.285714285714285	0.0	28.57142857142857	57.14285714285714
31	28.57142857142857	28.57142857142857	14.285714285714285	28.57142857142857
32	42.857142857142854	0.0	28.57142857142857	28.57142857142857
33	20.0	40.0	0.0	40.0
34	25.0	25.0	25.0	25.0
35	0.0	0.0	50.0	50.0
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	fail
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	1.0
25	2.0
26	2.0
27	2.0
28	2.0
29	1.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
36	0.5
37	1.0
38	2.0
39	4.0
40	5.5
41	6.0
42	5.0
43	3.0
44	2.0
45	2.0
46	2.5
47	3.0
48	3.0
49	2.5
50	3.5
51	5.0
52	5.0
53	7.0
54	8.0
55	7.0
56	6.5
57	7.0
58	6.5
59	5.5
60	7.5
61	8.5
62	8.0
63	6.5
64	3.0
65	1.0
66	1.0
67	1.0
68	0.5
69	0.0
70	0.0
71	0.0
72	0.0
73	0.0
74	0.0
75	0.0
76	0.0
77	0.0
78	0.0
79	0.0
80	0.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
15	1.0
16	1.0
17	0.0
18	2.0
19	2.0
20	3.0
21	12.0
22	1.0
23	2.0
24	0.0
25	2.0
26	1.0
27	1.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	2.0
33	1.0
34	2.0
35	2.0
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	pass
#Total Deduplicated Percentage	82.85714285714286
#Duplication Level	Percentage of deduplicated	Percentage of total
1	82.75862068965517	68.57142857142857
2	13.793103448275861	22.857142857142858
3	3.4482758620689653	8.571428571428571
4	0.0	0.0
5	0.0	0.0
6	0.0	0.0
7	0.0	0.0
8	0.0	0.0
9	0.0	0.0
>10	0.0	0.0
>50	0.0	0.0
>100	0.0	0.0
>500	0.0	0.0
>1k	0.0	0.0
>5k	0.0	0.0
>10k+	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	fail
#Sequence	Count	Percentage	Possible Source
AAGGATTGATCGCCTGGCCCC	3	8.571428571428571	No Hit
AGCCTTCGTCAATCACCC	2	5.714285714285714	No Hit
AGCAGGCTATGGATATCTCGG	2	5.714285714285714	No Hit
CACATGTCTGAGCCTCTCCCT	2	5.714285714285714	No Hit
ATTGACAGTTTGATTAATC	2	5.714285714285714	No Hit
TACAGATCCATTCGTCCATGAACTTCTCAGAGAA	1	2.857142857142857	No Hit
CCAGGACACTGTTTACGAACAACCC	1	2.857142857142857	No Hit
ACATGTCTGAGCCTCTCCCT	1	2.857142857142857	No Hit
GATTGATCGCCTGGC	1	2.857142857142857	No Hit
ACGCCCGATGGACATCGACTCACCCT	1	2.857142857142857	No Hit
TTTCTCTTGGCCTTGTATTTG	1	2.857142857142857	No Hit
ATCCATTCGTCCATGAACTTCTCAGAGAACGGCT	1	2.857142857142857	No Hit
CTCCATCCTCAGTAGCAGGCTATGGATATCTCGGC	1	2.857142857142857	No Hit
CTCACCCTTTCCTAAA	1	2.857142857142857	No Hit
AAGGATTGATCGCCTGGCCCCTC	1	2.857142857142857	No Hit
TGTCTAATAGGTGCGTCCTATAACAGAATTACC	1	2.857142857142857	No Hit
CAAGATTCGACATGTATGGGG	1	2.857142857142857	No Hit
GAACACGTCGATAATACCGTCGGACTGTATGGACT	1	2.857142857142857	No Hit
AACGCCCGATGGACATCGACTCACCCTTTCCT	1	2.857142857142857	No Hit
ATGGACATCGACTCACCCTTTCC	1	2.857142857142857	No Hit
GGATTGATCGCCTGGCCCCT	1	2.857142857142857	No Hit
ATTCCATCTTCGCTGCAGAAT	1	2.857142857142857	No Hit
TTGGCCTTGTATTTGTTGTAACCCT	1	2.857142857142857	No Hit
GAAGGATTGATCGCCTGGCCC	1	2.857142857142857	No Hit
AGACTCTTCTTTGATCAATTTGGACTGACCCT	1	2.857142857142857	No Hit
AAGCTTCAAGACGCACACAGC	1	2.857142857142857	No Hit
TGAAGGATTGATCGCCTGGCCC	1	2.857142857142857	No Hit
AAGGATTGATCGCCTGGCCC	1	2.857142857142857	No Hit
TCTTAATTGAAGGATTGATCGCCTGGA	1	2.857142857142857	No Hit
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	SOLID Small RNA Adapter
1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
10	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
20	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Kmer Content	pass
>>END_MODULE
