##FastQC	0.11.5
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	S38_SantoTomePrincipe.sRNAs.15-35nt.Partitivirus_3_segment_2.reverse-mapped.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	9
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	15-23
%GC	58
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	34.333333333333336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	35.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
5	32.77777777777778	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
6	35.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
7	34.111111111111114	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
8	35.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
9	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
10	31.444444444444443	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
11	35.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
12	35.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
13	35.666666666666664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
14	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
15	34.111111111111114	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
16	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
17	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
18	35.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
19	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
20	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
21	34.6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
22	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
23	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
29	1.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	1.0
35	2.0
36	0.0
37	5.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	0.0	44.44444444444444	33.33333333333333	22.22222222222222
2	22.22222222222222	11.11111111111111	11.11111111111111	55.55555555555556
3	33.33333333333333	44.44444444444444	0.0	22.22222222222222
4	44.44444444444444	33.33333333333333	11.11111111111111	11.11111111111111
5	44.44444444444444	0.0	33.33333333333333	22.22222222222222
6	22.22222222222222	11.11111111111111	55.55555555555556	11.11111111111111
7	22.22222222222222	11.11111111111111	33.33333333333333	33.33333333333333
8	33.33333333333333	11.11111111111111	44.44444444444444	11.11111111111111
9	44.44444444444444	22.22222222222222	22.22222222222222	11.11111111111111
10	44.44444444444444	0.0	22.22222222222222	33.33333333333333
11	44.44444444444444	0.0	33.33333333333333	22.22222222222222
12	33.33333333333333	11.11111111111111	33.33333333333333	22.22222222222222
13	55.55555555555556	0.0	33.33333333333333	11.11111111111111
14	66.66666666666666	11.11111111111111	11.11111111111111	11.11111111111111
15	22.22222222222222	22.22222222222222	44.44444444444444	11.11111111111111
16	0.0	0.0	71.42857142857143	28.57142857142857
17	50.0	0.0	33.33333333333333	16.666666666666664
18	66.66666666666666	0.0	0.0	33.33333333333333
19	66.66666666666666	16.666666666666664	16.666666666666664	0.0
20	33.33333333333333	33.33333333333333	0.0	33.33333333333333
21	20.0	0.0	0.0	80.0
22	0.0	100.0	0.0	0.0
23	100.0	0.0	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	fail
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
36	0.0
37	0.0
38	0.0
39	0.0
40	0.0
41	0.5
42	1.0
43	1.5
44	2.0
45	2.0
46	2.0
47	1.5
48	1.0
49	1.0
50	1.0
51	1.0
52	1.0
53	1.0
54	1.0
55	1.0
56	1.0
57	0.5
58	0.0
59	0.5
60	2.5
61	4.0
62	4.0
63	4.0
64	3.0
65	2.0
66	2.0
67	2.0
68	1.5
69	0.5
70	0.0
71	0.0
72	0.0
73	0.0
74	0.0
75	0.0
76	0.0
77	0.0
78	0.0
79	0.0
80	0.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
15	2.0
16	1.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	1.0
21	4.0
22	0.0
23	1.0
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	pass
#Total Deduplicated Percentage	88.88888888888889
#Duplication Level	Percentage of deduplicated	Percentage of total
1	87.5	77.77777777777779
2	12.5	22.22222222222222
3	0.0	0.0
4	0.0	0.0
5	0.0	0.0
6	0.0	0.0
7	0.0	0.0
8	0.0	0.0
9	0.0	0.0
>10	0.0	0.0
>50	0.0	0.0
>100	0.0	0.0
>500	0.0	0.0
>1k	0.0	0.0
>5k	0.0	0.0
>10k+	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	fail
#Sequence	Count	Percentage	Possible Source
TCCGGTTTGGGTTGATGGGCC	2	22.22222222222222	No Hit
ACGGGTGTGCGGGTTTGCTG	1	11.11111111111111	No Hit
CGACCGCGATCCTGTTTGGAG	1	11.11111111111111	No Hit
ATGGCTCATTGAGCGCCCGGC	1	11.11111111111111	No Hit
ACAAGATCGGTTGGT	1	11.11111111111111	No Hit
TCATTGAGCGCCCGGCTGAACAG	1	11.11111111111111	No Hit
AGGATCCGTCTGGAT	1	11.11111111111111	No Hit
CAAATTGTACTGGGCT	1	11.11111111111111	No Hit
>>END_MODULE
>>Adapter Content	warn
>>END_MODULE
>>Kmer Content	pass
>>END_MODULE
