FastQCFastQC Report
Thu 12 Nov 2020
S33.22483.forward-mapped.fq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameS33.22483.forward-mapped.fq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length26-30
%GC48

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TCAAAGAAAAGCTTACTCGGCCTGTGCATC3334.375No Hit
TCGGCAACTTTTTCAGAGCGCGTGCGAAA77.291666666666667No Hit
TCAGGGGTCGGCAACTTTTTCAGAGCGC55.208333333333334No Hit
TCGGCAACTTTTTCAGAGCGCGTGCGAAAA33.125No Hit
TTCTGCTGCTAAGTCTGCTCGTACTGAAGG33.125No Hit
TACATAAGAAGCGCAATGGTTCCACCTAGG22.083333333333333No Hit
TTCTACAAATCCTACGGAATCAAGCTCAAC22.083333333333333No Hit
TCGTACTGAAGGAACTGGGGAAACTGTG22.083333333333333No Hit
TCGGCTAAGTCTACACCACCATATTTGTA22.083333333333333No Hit
TATGCCTGCCATGGCCGATCTTTTTCTTCT22.083333333333333No Hit
GCAAACAAGAAAAAGATCGGCCATGGCAG11.0416666666666665No Hit
TACCTCAATTAAATCCTTCCACCCAAGATC11.0416666666666665No Hit
TATAAAAAATCAAACTCCACCTTACCTTT11.0416666666666665No Hit
TCCCTAGGAAATTCGTCGGCCTCACAAGT11.0416666666666665No Hit
TCTATTGCAACGACTGCACGCAAACGAGGC11.0416666666666665No Hit
TGCACGTGCTCTGAAAAAGTTGCCGACCCC11.0416666666666665No Hit
TGGTCCCAACTGGTTTGTCTGATATGAGT11.0416666666666665No Hit
TCTATCGGCTAAGTCTACACCACCATATT11.0416666666666665No Hit
TACAACTGTGGAACGGAGCGATTGGGACGC11.0416666666666665No Hit
TGAAGGAACTGGGGAAACTGTGTCTGCT11.0416666666666665No Hit
ATGGTCCCAACTGGTTTGTCTGATATGAGT11.0416666666666665No Hit
TAGGAAATTCGTCGGCCACACAAGTGTG11.0416666666666665No Hit
AGGAAGCGTAAACCCAGAGAACCGTTGGC11.0416666666666665No Hit
ATCCCTAGGAAATTCGTCGGCCTCACAAGT11.0416666666666665No Hit
TTTGTTCAAAATATGACTGCGCACGCGAGC11.0416666666666665No Hit
TACTGAAGGAACTGGGGAAACTGTGTCT11.0416666666666665No Hit
TTCCTAGGGATACAGCACTCGCACCTCCT11.0416666666666665No Hit
TAGGAAATTCGTCGGCCACACAAGTGT11.0416666666666665No Hit
TTTCCTAGGGATACAGCACTCGCACCTCCT11.0416666666666665No Hit
CGGCGTCCCAATCGCCCCGTTCCACAG11.0416666666666665No Hit
TACAACTGTGGAACGGGGCGATTGGGAC11.0416666666666665No Hit
AATACAACTGTGGAACGGGGCGATTGGGA11.0416666666666665No Hit
TGCGGTACAGGGCAATCATTCTATCGGCC11.0416666666666665No Hit
TTGTTCAAAATATGACTGCGCACGCGAG11.0416666666666665No Hit
TCAGGGGTCGGCAACTTTTTCAGAGC11.0416666666666665No Hit
TAGGAAGCGTAAACCCAGAGAACCGTTGGC11.0416666666666665No Hit
TTACTCCTTTGTCGTATATACCTGTAGACT11.0416666666666665No Hit
TACATAAGAAGTGCAATGGTTCCACCTAGG11.0416666666666665No Hit
TCAAACTCCACCTTACCTTTTCGTCAATGG11.0416666666666665No Hit
GCGAGTGCTGTATCCCTAGGAAATTCGT11.0416666666666665No Hit
TACAAATCCTACGGAATCAAGCTCAACAGA11.0416666666666665No Hit
TAAATTTTGCGAGGTAGACGTAACGTCGGC11.0416666666666665No Hit
TATGCCTGCCATGGCCGATCTTTTTGTTCT11.0416666666666665No Hit
GTTCAAAATATGACTGCGCACGCGAGCTC11.0416666666666665No Hit
CCACAAGTTCATGTTGGTATCAGCGCTAT11.0416666666666665No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)