FastQCFastQC Report
Wed 31 Mar 2021
S33.15-35nt.partitivirus.NODE_29151.forward-mapped.fq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameS33.15-35nt.partitivirus.NODE_29151.forward-mapped.fq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length17-35
%GC42

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[WARN]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTCGATGACGGCAAAATAATTTTGAAATTCGGCAT45.333333333333334No Hit
TTTTTACGCTGGACGGGCTCGAGTCTTG34.0No Hit
TTTTGTTTTTACGCTGGACGGGCTCGAGT34.0No Hit
TTTTGAAATTTGGCATTTTGGGGCCCGAAA34.0No Hit
TTACGCTGGACGGGCTCGAGTCTTGATATAATATC34.0No Hit
TTTTACGCTGGACGGGCTCGAGTCTTG34.0No Hit
TAGGATTTTGTTTTTACGCTGGACGGGCT22.666666666666667No Hit
TTGAAATTTGGCATTTTGGGGACTTTGGGCCC22.666666666666667No Hit
CGGCAAAATAATTTTGAAATTTGGCATTTTGGGGC22.666666666666667No Hit
CTGGACGGGCTCGAGTC22.666666666666667No Hit
TTTAGGATTTTGTTTTTACGCTGGACGGGC22.666666666666667No Hit
TCGATGACGGCAAAATAATTTTGAAATTTGGC22.666666666666667No Hit
TTAGGATTTTGTTTTTACGCTGGACGGGC22.666666666666667No Hit
TAACGCTGGACGGGCTCGAGTCTTGATATAATGTC22.666666666666667No Hit
CGATGACGGCAAAATAATTTTGAAATTTGGCAT22.666666666666667No Hit
GTTTTTACGCTGGACGGGCTCGAGT22.666666666666667No Hit
GAAATTCGATGACGGCAAAATAATTTTGAAATT22.666666666666667No Hit
AATTTGGCATTTTGGGGC22.666666666666667No Hit
TTAGGATTTTGTTTTTACGCTGGACGGGCG11.3333333333333335No Hit
ACGCTGGACGGGCTCGAGTTTTGATATAATATCA11.3333333333333335No Hit
CGGCAAAATAATTTTGAAATTTGGCATTTTGGG11.3333333333333335No Hit
TGAAATTTGGCATTTTGGGGACTTTGGG11.3333333333333335No Hit
CGGGCTCGAGTCTTGATATAATATCATTGCAGTT11.3333333333333335No Hit
TTGAAATTTGGCATTTTGGGGCCTTTGGGC11.3333333333333335No Hit
TCTAATAGTGAAATTCGATGACGGCA11.3333333333333335No Hit
TTTGTTTTTACGCTGGACGGGCTCGAGTC11.3333333333333335No Hit
GTTTTGACGCTGGACGGGCTCGAGTCTTGATA11.3333333333333335No Hit
TTTGTTTTTACGCTGGACGGGCTCGAGT11.3333333333333335No Hit
CGGGCTCGAGTCTTGATATAATA11.3333333333333335No Hit
ATTTTAGGATTTTGTTTTTACGCTGGACGGGCTC11.3333333333333335No Hit
CGGCAAAATAATTTTGAAATTTGGCATCTTGGGGC11.3333333333333335No Hit
TTTGGCATTTTGGGGCCTTTGGGC11.3333333333333335No Hit
TGACGGCAAAATAATTTTGAAATT11.3333333333333335No Hit
CGATGACGGCAAAATAATTTTGAAATTTGGCATT11.3333333333333335No Hit
TTCGATGACGGCAAAATAATTTGGAAATTT11.3333333333333335No Hit
ATTTTAGGATTTTGTTTTTACGCTGGACGGGCTCG11.3333333333333335No Hit
TGACGGCAAAATAATTTTGAAATTTGGCA11.3333333333333335No Hit
TAATTTTGAAATTTGGCATTTTGGGGCCTTTGGGC11.3333333333333335No Hit
CGGCAAAATAATTTTGAAATT11.3333333333333335No Hit
TGACGGCAAAATAATTTTGAAATTTGGC11.3333333333333335No Hit
TTTTTACGCTGGACGGGCTCGAGTCTTGA11.3333333333333335No Hit
TAGGATTTTGTTTTTACGCTGGACGGGCTCGA11.3333333333333335No Hit
TACGCTGGACGGGCTCGAGTCTTGATATA11.3333333333333335No Hit
ACGCTGGACGGGCTCGAGTCTTGATGTAATATC11.3333333333333335No Hit
AATTCGATGACGGCAAAATAATTTTGAAATT11.3333333333333335No Hit
ACGGGCTCGAGTCTTGA11.3333333333333335No Hit
TTGTTTTTACGCTGGACGGGCTCGAGT11.3333333333333335No Hit
TTTGAAATTTGGCATTTTGGGGACTTTGGGC11.3333333333333335No Hit
TAACGCTGGACGGGCTCGAGTCTTGATATAAT11.3333333333333335No Hit
CAAATTCGATGACGGCAAAATAATTTTGAAAATTG11.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)