FastQCFastQC Report
Wed 31 Mar 2021
S33.15-35nt.partitivirus.NODE_4444.forward-mapped.fq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameS33.15-35nt.partitivirus.NODE_4444.forward-mapped.fq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length15-33
%GC55

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TAAGGTACCCTCACCAAATAAGGCCCACT413.333333333333334No Hit
GCAGCATCGACCCATAGCCCCAG310.0No Hit
TGATCACTGCATTCGCCTTGCACGCGGGA26.666666666666667No Hit
TGGTCACTGCATTCGCCTTGCACGCGGGA26.666666666666667No Hit
CGGGGCCCACCTAGACTCGTGAGGAAAATAG26.666666666666667No Hit
GTTTTCGGGGCCCAC13.3333333333333335No Hit
TGTGACTGGCTGTTTTCGGGGCCCACCTAGCCT13.3333333333333335No Hit
ATTGGAGATATTGGAACATGAATTTGTAACA13.3333333333333335No Hit
TGCACATAGCGACCCGGTGCCAGCATT13.3333333333333335No Hit
CTACCCTGTGACTGGCTGTTTTCGG13.3333333333333335No Hit
GCAGCATCGACCCATAGCCCCAGACGGC13.3333333333333335No Hit
TCTGTGACTGTCTGTTTTCGGGGCCCACC13.3333333333333335No Hit
ACGGTCACTGCATTCGCCTTGCACGCGGGA13.3333333333333335No Hit
TTACTGGAGATATTGGAACATGAATTTGTAAC13.3333333333333335No Hit
ATGGTCACTGCATTCGCCTTGCACGCGGGA13.3333333333333335No Hit
TATAATAAGGTACCCTCACCAAATAAGGCCC13.3333333333333335No Hit
ATGGTCACTGCATTCGCCTTGCACGCGGG13.3333333333333335No Hit
AAATGCACATAGCGACCCGG13.3333333333333335No Hit
CTGCATTCGCCTTGCACGCGGGAGATCC13.3333333333333335No Hit
ATGGTCACTGCATTCGCCTTGCACGCGGGAG13.3333333333333335No Hit
AGCCTCGTGAGGAAAATAGGTAGCTATGAA13.3333333333333335No Hit
GTAAGGTACCCTCACCAAATAAGGCCCGGT13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)