FastQCFastQC Report
Mon 17 Jun 2024
S34.15-35nt.284.reverse-mapped.fq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameS34.15-35nt.284.reverse-mapped.fq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length15-33
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[WARN]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTCCTGCTGATTCGTTGCACCCTTTGAA48.333333333333332No Hit
GTAAATGTTAAGGGCTATGTCGACAAAACAG48.333333333333332No Hit
TGGCGGCCTGTCCACGGGAAACGATTCAAA36.25No Hit
GAAACTAGTCGACTCCCTTGT24.166666666666666No Hit
ACCACGCTGACAAAAGAGTGATCCCCC24.166666666666666No Hit
TCTATCACATGTTGGACTTGACTGTCGTC24.166666666666666No Hit
AGCGAAACTAGTCGACTCCCT24.166666666666666No Hit
CTCCCTTGTATTTGTTGTAATTT24.166666666666666No Hit
AGAGTGATCCACCCACCCACTTGACAATG24.166666666666666No Hit
TGATGCATCCTGTAGGCTGAGTATTTGCT24.166666666666666No Hit
ACCACGCTGATAAAAGAGTGATCCACCCACC24.166666666666666No Hit
CCCTTTACTTGTGTGGACGA12.083333333333333No Hit
ATGATTTCTACTGTACTTGACAAAGTATCCC12.083333333333333No Hit
GACAAGAAGGTTGAT12.083333333333333No Hit
GTTCCTCGTTCCTCATG12.083333333333333No Hit
AACTAGTCGACTCCCTTGTATTTGT12.083333333333333No Hit
CGAAACTAGTCGACTCCCTTGG12.083333333333333No Hit
ACTAGTCGACTCCCTTGTATTTGT12.083333333333333No Hit
TCCTCGACGATTTGAGAAAGCAGCCAGTGGTT12.083333333333333No Hit
ATATCGATGAAAGTCTGTATGCTGCTGAC12.083333333333333No Hit
ACCACGCTGACAAAAGAGTGATCCACCC12.083333333333333No Hit
CGAGACACTTCTGCCACTTCTTTGGACAT12.083333333333333No Hit
CGACTGAGCGAACTAGGCTGG12.083333333333333No Hit
CTCTACCGACTGAGGTAACTAGGCTGG12.083333333333333No Hit
TCCCTTGTATTTGTTGTAATTTCCCTGTGT12.083333333333333No Hit
AAACTAGTCGACTCCCTTGTACC12.083333333333333No Hit
TCGTGTGTGATAACTGTCGGAAGATTGT12.083333333333333No Hit
AATAAGACGAGAGTCGGAAGTGGTAC12.083333333333333No Hit
TGCTCTACCGACTGAG12.083333333333333No Hit
GGTGCTCTACCGACTGAGCGAACTAGGCT12.083333333333333No Hit
TGGCGGCCTGTCCACGGGAAACGATTCTTCAAT12.083333333333333No Hit
ACCACGCTGACAAAAGAGTGATCCACCCAAA12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)