##FastQC	0.11.9
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	S34.raw.28821.forward-mapped.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	50
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	11-54
%GC	16
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	36.48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	35.8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	36.76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	35.32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
5	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
6	36.48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
7	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
8	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
9	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
10	36.76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
11	36.76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
12	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
13	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
14	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
15	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
16	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
17	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
18	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
19	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
20	36.07692307692308	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
21	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
22	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
23	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
24	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
25	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
26	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
27	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
28	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
29	34.6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
30	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
31	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
32	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
33	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
34	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
35	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
36	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
37	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
38	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
39	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
40	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
41	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
42	25.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
43	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
44	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
45	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
46	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
47	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
48	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
49	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
50	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
51	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
52	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
53	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
54	37.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
>>END_MODULE
>>Per tile sequence quality	pass
#Tile	Base	Mean
1239	1	0.0
1239	2	0.0
1239	3	0.0
1239	4	0.0
1239	5	0.0
1239	6	0.0
1239	7	0.0
1239	8	0.0
1239	9	0.0
1239	10	NaN
1239	11	0.0
1239	12	0.0
1239	13	1.2000000000000002
1239	14	1.2000000000000002
1239	15	1.2000000000000002
1239	16	1.2000000000000002
1239	17	2.4
1239	18	2.4
1239	19	2.4
1239	20	3.6
1239	21	3.6
1239	22	3.6
1239	23	3.6
1239	24	3.6
1239	25	3.6
1239	26	4.8
1239	27	4.8
1239	28	4.8
1239	29	4.8
1239	30	4.8
1261	1	0.0
1261	2	0.0
1261	3	0.0
1261	4	0.0
1261	5	0.0
1261	6	0.0
1261	7	0.0
1261	8	0.0
1261	9	0.0
1261	10	NaN
1261	11	0.0
1261	12	0.0
1261	13	1.2000000000000002
1261	14	1.2000000000000002
1261	15	1.2000000000000002
1261	16	1.2000000000000002
1261	17	-3.6
1261	18	-3.6
1261	19	-3.6
1261	20	-2.4
1261	21	-2.4
1261	22	-2.4
1261	23	-2.4
1261	24	-2.4
1261	25	-2.4
1261	26	-1.2
1261	27	-1.2
1261	28	-1.2
1261	29	-1.2
1261	30	-1.2
2108	1	0.0
2108	2	0.0
2108	3	0.0
2108	4	0.0
2108	5	0.0
2108	6	0.0
2108	7	0.0
2108	8	0.0
2108	9	0.0
2108	10	NaN
2108	11	0.0
2108	12	0.0
2108	13	-4.8
2108	14	-4.8
2108	15	-4.8
2108	16	-4.8
2108	17	-3.6
2108	18	-3.6
2108	19	-3.6
2108	20	-2.4
2108	21	-2.4
2108	22	-2.4
2108	23	-2.4
2108	24	-2.4
2108	25	-2.4
2108	26	-1.2
2108	27	-1.2
2108	28	-1.2
2108	29	-1.2
2108	30	-1.2
2138	1	0.0
2138	2	0.0
2138	3	0.0
2138	4	0.0
2138	5	0.0
2138	6	0.0
2138	7	0.0
2138	8	0.0
2138	9	0.0
2138	10	NaN
2138	11	0.0
2138	12	0.0
2138	13	1.2000000000000002
2138	14	1.2000000000000002
2138	15	1.2000000000000002
2138	16	1.2000000000000002
2138	17	2.4
2138	18	2.4
2138	19	2.4
2138	20	-2.4
2138	21	-2.4
2138	22	-2.4
2138	23	-2.4
2138	24	-2.4
2138	25	-2.4
2138	26	-1.2
2138	27	-1.2
2138	28	-1.2
2138	29	-1.2
2138	30	-1.2
2270	1	0.0
2270	2	0.0
2270	3	0.0
2270	4	0.0
2270	5	0.0
2270	6	0.0
2270	7	0.0
2270	8	0.0
2270	9	0.0
2270	10	NaN
2270	11	0.0
2270	12	0.0
2270	13	1.2000000000000002
2270	14	1.2000000000000002
2270	15	1.2000000000000002
2270	16	1.2000000000000002
2270	17	2.4
2270	18	2.4
2270	19	2.4
2270	20	3.6
2270	21	3.6
2270	22	3.6
2270	23	3.6
2270	24	3.6
2270	25	3.6
2270	26	-1.2
2270	27	-1.2
2270	28	-1.2
2270	29	-1.2
2270	30	-1.2
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
34	1.0
35	6.0
36	3.0
37	40.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	6.0	80.0	8.0	6.0
2	10.0	78.0	6.0	6.0
3	4.0	88.0	4.0	4.0
4	8.0	84.0	4.0	4.0
5	16.0	74.0	4.0	6.0
6	2.0	82.0	12.0	4.0
7	6.0	74.0	20.0	0.0
8	4.0	80.0	8.0	8.0
9	8.0	86.0	6.0	0.0
10	12.0	86.0	2.0	0.0
11	2.0	84.0	8.0	6.0
12	4.081632653061225	81.63265306122449	6.122448979591836	8.16326530612245
13	0.0	81.57894736842105	5.263157894736842	13.157894736842104
14	0.0	84.84848484848484	6.0606060606060606	9.090909090909092
15	7.142857142857142	78.57142857142857	7.142857142857142	7.142857142857142
16	11.538461538461538	80.76923076923077	0.0	7.6923076923076925
17	18.75	68.75	0.0	12.5
18	12.5	68.75	12.5	6.25
19	12.5	62.5	18.75	6.25
20	15.384615384615385	46.15384615384615	15.384615384615385	23.076923076923077
21	0.0	69.23076923076923	30.76923076923077	0.0
22	16.666666666666664	50.0	16.666666666666664	16.666666666666664
23	22.22222222222222	44.44444444444444	11.11111111111111	22.22222222222222
24	22.22222222222222	22.22222222222222	44.44444444444444	11.11111111111111
25	33.33333333333333	22.22222222222222	11.11111111111111	33.33333333333333
26	25.0	50.0	25.0	0.0
27	0.0	33.33333333333333	33.33333333333333	33.33333333333333
28	33.33333333333333	0.0	16.666666666666664	50.0
29	20.0	0.0	0.0	80.0
30	25.0	0.0	0.0	75.0
31	0.0	100.0	0.0	0.0
32	0.0	100.0	0.0	0.0
33	100.0	0.0	0.0	0.0
34	0.0	0.0	0.0	100.0
35	0.0	100.0	0.0	0.0
36	0.0	0.0	100.0	0.0
37	0.0	0.0	0.0	100.0
38	0.0	100.0	0.0	0.0
39	0.0	0.0	100.0	0.0
40	0.0	0.0	100.0	0.0
41	100.0	0.0	0.0	0.0
42	0.0	100.0	0.0	0.0
43	0.0	0.0	100.0	0.0
44	100.0	0.0	0.0	0.0
45	0.0	0.0	0.0	100.0
46	0.0	100.0	0.0	0.0
47	0.0	100.0	0.0	0.0
48	100.0	0.0	0.0	0.0
49	100.0	0.0	0.0	0.0
50	0.0	0.0	0.0	100.0
51	0.0	0.0	0.0	100.0
52	0.0	0.0	100.0	0.0
53	100.0	0.0	0.0	0.0
54	100.0	0.0	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	fail
#GC Content	Count
0	37.0
1	37.0
2	35.0
3	26.5
4	10.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	1.0
14	2.0
15	2.0
16	2.0
17	1.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.5
30	1.0
31	1.0
32	1.0
33	1.0
34	1.0
35	1.0
36	1.0
37	1.0
38	0.5
39	0.0
40	0.0
41	0.0
42	0.0
43	0.0
44	0.0
45	0.5
46	1.0
47	1.0
48	2.5
49	4.0
50	5.5
51	7.0
52	5.5
53	4.0
54	3.5
55	3.5
56	4.0
57	3.0
58	2.0
59	1.0
60	0.0
61	0.0
62	0.0
63	0.0
64	0.0
65	0.0
66	0.0
67	0.0
68	0.0
69	0.0
70	0.0
71	0.0
72	0.0
73	0.0
74	0.0
75	0.0
76	0.0
77	0.0
78	0.0
79	0.0
80	0.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	0.0
12	0.0
13	0.0
14	0.0
15	0.0
16	0.0
17	0.0
18	0.0
19	0.0
20	0.0
21	0.0
22	0.0
23	0.0
24	0.0
25	0.0
26	0.0
27	0.0
28	0.0
29	0.0
30	0.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
36	0.0
37	0.0
38	0.0
39	0.0
40	0.0
41	0.0
42	0.0
43	0.0
44	0.0
45	0.0
46	0.0
47	0.0
48	0.0
49	0.0
50	0.0
51	0.0
52	0.0
53	0.0
54	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
11	1.0
12	11.0
13	5.0
14	5.0
15	2.0
16	10.0
17	0.0
18	0.0
19	3.0
20	0.0
21	1.0
22	3.0
23	0.0
24	0.0
25	1.0
26	2.0
27	0.0
28	1.0
29	1.0
30	3.0
31	0.0
32	0.0
33	0.0
34	0.0
35	0.0
36	0.0
37	0.0
38	0.0
39	0.0
40	0.0
41	0.0
42	0.0
43	0.0
44	0.0
45	0.0
46	0.0
47	0.0
48	0.0
49	0.0
50	0.0
51	0.0
52	0.0
53	0.0
54	1.0
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	36.0
#Duplication Level	Percentage of deduplicated	Percentage of total
1	50.0	18.0
2	22.22222222222222	16.0
3	5.555555555555555	6.0
4	0.0	0.0
5	11.11111111111111	20.0
6	0.0	0.0
7	0.0	0.0
8	0.0	0.0
9	0.0	0.0
>10	11.11111111111111	40.0
>50	0.0	0.0
>100	0.0	0.0
>500	0.0	0.0
>1k	0.0	0.0
>5k	0.0	0.0
>10k+	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	fail
#Sequence	Count	Percentage	Possible Source
AAAAAAAAAAAAAAAA	10	20.0	No Hit
AAAAAAAAAAAA	10	20.0	No Hit
AAAAAAAAAAAAAA	5	10.0	No Hit
AAAAAAAAAAAAA	5	10.0	No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAA	3	6.0	No Hit
ACTGGATTGAAAAAAAAAAAAAAAAA	2	4.0	No Hit
TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	2	4.0	No Hit
GTAAGTTCTGCCCCT	2	4.0	No Hit
AGACCTGAAGATCAAGGATGACCTCTTGCC	2	4.0	No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	1	2.0	No Hit
TGGACTTGTATGTACGGGGCTGAGT	1	2.0	No Hit
CTGTTATAAGTC	1	2.0	No Hit
CACGGTTCAGA	1	2.0	No Hit
GACATCTGGATACAAACTCTTAGTGAACGGAAGCATCATTGATGCAAGGCCTGG	1	2.0	No Hit
AGATGGGTGTTCACCCAGACATTGGGCC	1	2.0	No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	1	2.0	No Hit
CCAGGCTTAACTTTGCATGTTGATGGCTCC	1	2.0	No Hit
TGAAGATCAAGGATGACCTCTTGCCAACC	1	2.0	No Hit
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	SOLID Small RNA Adapter
1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
10	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
20	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
30	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
40	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
>>END_MODULE
